Onze ervaring met dit protocol in de afgelopen 10 jaar geleid tot de identificatie van de kritieke methodologische kwesties. Ten eerste, snelle hersenen dissectie in een petrischaal op gemalen ijs belangrijk prepareerkwaliteit handhaven. Ten tweede dient men zich te realiseren dat weefsel sonicatie korter de cerebrale amygdala vergelijking met andere typen weefsels, zoals het hart (10 sec) en nieren (20 sec). Ten derde moet grote zorg worden genomen om het substraat nauwkeurig te mengen voordat het aan de monsters. We tegenkwamen variabele signalen wanneer het mengen volgorde was onvoldoende. Ten vierde moeten geen bellen in de kwarts cel bij het lezen van de monsters. Anders kan het signaal worden veranderd.
We hebben een verandering in de afgelopen jaren de reproduceerbaarheid van de resultaten te vergroten: verhoging substraatvolume volume minder dan 1 pi voorkomen. Toch kunnen kleine verschillen optreden tussen opeenvolgende testen en tenminste 3 controlemonsters worden gebruiktcontrol variaties. Fluorescentie metingen van deze controles worden gemiddeld en het gemiddelde wordt gesteld op 100%. Fluorescentie maatregelen experimentele monsters worden omgezet in percentage van de controlemonsters.
Een andere beperking van deze techniek is dat slechts een deel van het weefsel wordt toegepast en derhalve kan caspase-3 activiteit wordt onderschat. Inderdaad, het tijdvenster van apoptose kort in een bepaalde cel en kan worden gemist hoewel het voorkomt in aangrenzende gebieden op het moment van bemonstering 1,4,15. Het omgekeerde is ook mogelijk: apoptosis kan bijzonder intens in porties van weefsel, wat resulteert in een overschatting van caspase-3 activiteit. Wij raden het gebruik van de resterende weefsels (amygdala) voor aanvullende technieken, zoals TUNEL testen of Bax / Bcl2 ratio (zie inleiding).
Spectrofluorimetrie ten minste twee voordelen boven Western blotting. Ten eerste genereert direct kwantitatieve gegevens. Ten tweede, het meet enzymatische eenctivity zelf in plaats van eiwit of RNA-expressie, die geen verband kan zijn, en het is bekend dat eiwit expressie kan worden verhoogd zonder wijziging van enzymatische activiteit. Bovendien kan spectrofluorimetrie worden uitgevoerd op andere weefsels of met andere diersoorten en kunnen worden aangepast voor andere caspase subtypen, met verschillende substraten, zodat veilig vergelijkingen kunnen worden gemaakt.
Concluderend dit document wordt het gebruik van spectrofluorimetrie met caspase-3 activiteit te meten in de amygdala, waarin wordt aangetoond dat apoptose optreedt in deze regio van het limbische systeem 3 dagen na MI.