$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Ethiek Verklaring: De studie werd uitgevoerd in overeenstemming met internationale richtlijnen en goedgekeurd door de Institutional Animal Care en gebruik Comite (IACUC) van National Chiayi University, goedkeuring ID: 99022. De walvisachtige steekproef gebruik werd toegestaan door de Raad van Landbouw van Taiwan (Research Permit 100M-02.1-C-99).
1. Muscle Monstervoorbereiding en SDS-PAGE
Opmerking: Muscle-monsters van 23 soorten, waaronder 16 soorten zeezoogdieren, 5 soorten landzoogdieren, tonijn en kip werden gebruikt in deze studie (tabel 1). De walvisachtige spier monsters werden verkregen van gestrande personen, visserij bijvangst, en confiscatie. Konijn, ratten, honden en kippen spierweefsel werden verkregen uit Animal Disease Diagnostisch Centrum van de Nationale Chiayi University. Monsters van rundvlees, varkensvlees, lamsvlees, tonijn en werden gekocht bij een supermarkt. De spier steekproef van gewone zeehond (Phoca vitulina ) werd verstrekt door Farglory Ocean Park. Natrium dodecylsulfaat polyacrylamide gelelektroforese (SDS-PAGE) werd toegepast voor oplosbare eiwitten scheiden met verschillende molecuulgewichten in de spieren monsters.
- Bewaar alle monsters bij -20 ° C tot gebruik.
- Pre-cool mortel bij -20 ° C. Dan zet 3 g bevroren spier monster in.
- Homogeniseer het monster met 10 ml koud fosfaat gebufferde zoutoplossing (PBS) met een weefselhomogenisator.
- Centrifugeer het gehomogeniseerde monster bij 10.000 xg gedurende 10 min bij 4 ° C. Verzamel de bovenstaande vloeistof en het op -20 ° C tot gebruik.
- Bereid 5 ml van 5% stacking gel (3,07 ml gedestilleerd water, 1,25 ml van 4x bovenste gel buffer van pH 6,8, 625 ui 40% acrylamide, 50 ui 10% ammoniumpersulfaat (APS) en 5 gl tetramethylethyleendiamine ( TEMED)) en 10 ml 15% scheiden gel (3,65 ml gedestilleerd water, 2,5 ml van 4x lagere gel buffer van pH 8,8, 3,75 ml 40% acrylamide, 100 pl 10% APS,en 4 pl TEMED).
- In de elektroforesecel, pour stapelgel (5% acrylamide) bovenop de scheidende gel (15% acrylamide) nadat dit gestold. Plaats een gel kam in het stapelen gel.
- Voer PAGE volgens de volgende voorwaarden: eerste run conditie: 100 volt, 20 min en laatste voorwaarde: 120 volt, 40 min.
- Vlekken op de gel met Coomassie brilliant blauw bij kamertemperatuur gedurende 30 minuten totdat de gel gelijkmatig blauwe kleur.
Opmerking: Kleuring is voltooid wanneer de gel niet meer zichtbaar is in de kleurstofoplossing. - Ontkleuring met azijnzuuroplossing (10%) bij kamertemperatuur gedurende 1 uur. Bands zullen beginnen te verschijnen. Doorgaan ontkleuren wordt uitgevoerd bij 4 ° C gedurende de nacht, totdat de achtergrond is duidelijk.
2. Peptide Synthese en productie van monoklonale antistoffen
- Haal de aminozuursequenties van Mb van GenBank waaronder tonijn, kip, struisvogel, gedomesticeerde zoogdieren, afdichting en 18 soortenvan walvisachtigen (tabel 2).
- Lijn de sequenties met de juiste software 16:
- Start de Alignment Explorer door de optie Align: Bewerken / Build Alignment op de startbalk; selecteer Create New Alignment en klik op OK. Er verschijnt een dialoogvenster de vraag "Bent u het bouwen van een DNA of proteïne sequence alignment? '
- Klik op de knop "Protein"; kies Data: Open: Ophalen sequenties uit bestand en selecteer volgorde file; selecteer de Edit: Kies Alle menu-opdracht om alle sites voor elke rij in de voor het creëren van een multiple sequence alignment gegevens te selecteren.
- Kies Alignment: Lijn door ClustalW in het hoofdmenu om de geselecteerde sequenties gegevens met behulp van de ClustalW algoritme af te stemmen; selecteer "BLOSUM" als de Protein Weight Matrix en klik op de knop OK.
- Analyseer de sequence alignment:
- Focus op 5 antigene reactieve sites 17: plaats 1 (AKVEADVA, 15-22), site 2 (KASEDLK, 56-62), plaats 3 (ATKHKI, 94-99), plaats 4 (HVLHSRH, 113-119) en plaats 5 (KYKELGY, 145- 151) en vind het fragment geconserveerd onder walvisachtigen. Een * (asterisk; consensus symbool in de uitlijning (Protocol 2.2.3)) geeft aan posities die een enkele, volledig geconserveerde resten te hebben. De volgende geconserveerde fragmenten in walvisachtigen werden gevonden: opeenvolging KASEDLKKHG (welke site 2 bevat) en de volgorde HVLHSRHP (welke site 4 bevat).
- Synthetiseren kandidaat sequentiefragmenten volgens de sequentieanalyse en conjugaat met ovalbumine eiwit (OVA) als dragereiwit via andere voorzieningen.
- Voeg hydrofobe aminozuren (bijvoorbeeld methionine) aan de N-terminus van antigene reactieve plaats te voorkomen dat het peptide van ontleding (bijvoorbeeld M-KASEDLKKHG).
- Verleng de C-terminus van antigene reactieve plaats voor het belichten van de belangrijkste antigene plaats op de immunocyt. Bovendien conjupoort het peptide OVA door toevoeging van een cysteïne (Cys, C) aan de C-terminale (bijvoorbeeld M-KASEDLKKHG-NTVL-C).
- Emulgeren compleet Freund's adjuvans immunogeen voor 1 of incompleet Freund's adjuvans immunogeen voor 2 met een gelijk volume van elk synthetisch peptide in PBS (3 ml, eindconcentratie 30-50 ug / 100 pl).
- Inoculeren immunogeen 1 (0,1 mg) subcutaan in elk van 5 BALB / c muizen.
- Voer subcutane booster injecties vijfmaal behulp immunogeen 2 bij tussenpozen van twee weken en laat testsera door staart clip bemonstering van de muizen voor elke booster.
- Bepaal sera titer voor de eerste screening.
- Oplossen 100 ug vrij peptide in 25 ml reactiebuffer en aliquot 50 ul van de oplossing in elk putje van een 96-wells plaat. Voeg 10 ul koppelingsreagens oplossing in elk putje en meng de plaat. Incubeer de plaat gedurende 2 uur bij kamertemperatuur geroerd.
- Verwijder de inhoud van de put,wassen elk putje 3 keer met gedestilleerd water, en blokkeert de plaat door toevoeging van 200 ul van blokkeeroplossing. Incubeer gedurende 1 uur bij kamertemperatuur geroerd. Verwijder de inhoud en was elk putje 3 keer met gedestilleerd water.
- Voer indirecte ELISA (Protocol 5,1-5,7) voor het bepalen sera titer voor de eerste screening. Kies de muis met de hoogste titer (hoogste optische dichtheid) voor de milt collectie.
- Drie dagen vóór de milt verzamelen, enten 0,1 mg immunogeen 1 subcutaan in de muis met het hoogste titer.
- Verzamel de miltcellen van de geïmmuniseerde muizen en geselecteerde zekering murine myeloomcellen F0 (SP2 / 0-Ag14) om hybridoma cellen te verkrijgen voor mAb productie 18.
- 14 dagen na de fusie, selecteert u de positieve klonen door het screenen van de reactiviteit van hybridomasupernatanten in de richting van vrije synthetisch peptide met behulp van indirecte ELISA (Protocol 5,1-5,7).
- Verdun de cellen om een geschikt aantal per goed voor maximizing het aantal putjes dat slechts één enkele kloon (verdunning klonering) bevatten.
- Voeg 100 pi celkweekmedium alle putjes in 96-well plaat, behalve goed A1 die leeg wordt gelaten.
- Voeg 200 ul van de celsuspensie goed A1. Vervolgens snel 100 ui overbrengen van A1 naar B1 en meng door voorzichtig pipetteren. Herhaal deze 1: 2 verdunningen over de gehele kolom, en verwijder vervolgens 100 pl van H1 zodat het eindigt met hetzelfde volume als de putjes erboven.
- Een extra 100 ul medium naar kolom 1 met een 8-kanaals micropipet. Vervolgens snel overbrengen 100 gl van elk van de wells in kolom 1 die in kolom 2 met dezelfde pipet en meng door voorzichtig pipetteren.
- Met behulp van dezelfde tips, herhaalt u deze 1: 2 verdunningen over de gehele plaat. Gooi 100 gl van elk van de putten in de laatste kolom.
- Breng het uiteindelijke volume van 200 pl putten door toevoegen van 100 ul medium in elk putje. Incubate plate ongestoord bij 37 ° C in een bevochtigde CO2 incubator.
- Controleer elke goed en markeer alle putten die slechts een enkele kolonie bevatten. Voer twee of meer kloneringen totdat> 90% van de putjes die enkelvoudige klonen positief antilichaamproductie zijn.
- Zeef de klonen door western blot en dot blot (protocol 3,1-4,6). Vervolgens subcultuur kolonies van de putjes in grotere vaten cellen voor het verkrijgen mAb breiden. Meestal elke kloon overgebracht naar een enkel putje in een 12- of 24-well plaat.
- Meet de verwantschap tussen de mAb's en de spier uittreksels van koe, geit, varken, hond, konijn, tonijn, kip, seal, en vier representatieve soorten walvisachtigen door western blot en dot blot (protocol 3,1-4,6).
- Inoculeren geselecteerde hybridoma cellen (maximaal 3 x 10 6) intraperitoneaal in muizen om ascites te induceren. Zwelling van de buik is meestal duidelijk binnen 7-10 dagen na hybridoma injectie. Verzamel vloeistof met behulp van een injectienaald(Minder dan 20 gauge).
- Centrifuge ascitesvloeistof (10.000 g gedurende 10 min) om cellen en resten te verwijderen. Filtreer door een 0,45 pm filter. Voeg 1 tot 20 ml monster, 15 ml bindingsbuffer, en 3-5 ml elutiebuffer in het proteïne G Sepharose-kolom. Verzamel de elutie fractie die gezuiverd antilichaam uit muizen ascitesvloeistof.
- Bepaal het antilichaam isotype van antilichaam Isotypering Kit middels instructies van de fabrikant.
3. Western Blot
- Bereid 2x laadbuffer bevattende β-mercaptoethanol (BME) door mengen van 950 ui van 2 x Laemmli monsterbuffer met 50 pl BME. Verdun de spier supernatanten (protocol 1,1-1,4) bij het laden buffer met geschikte verhouding voor het verkrijgen van een goede signalen: 01:50 (walvisachtigen en seal) en 1: 5 (huisdieren en tonijn) bij het gebruik van polyklonaal konijn anti-humaan antilichaam Mb, en 1: 1 (varken, konijn, kip en tonijn), 1: 5 (koe, geit en hond) en 01:25 (walvisachtigen en seal) wanneer eenntibody is van hybridoma supernatant.
- Warmte monster bij 95 ° C gedurende 5 minuten. samples in de putjes van SDS-PAGE gel (4% acrylamide stapelen en 12% acrylamide scheidende) met molecuulgewicht merkers. Voer de elektroforese gedurende 5 minuten bij 50 V verhogen dan de spanning tot 150 V aan de punt af in ongeveer 1 uur.
- Plaats de gel in 1x overdracht buffer gedurende 15 min. Breng de gescheiden eiwitten naar nitrocellulose (NC) membranen nadat ze zijn gescheiden door PAGE. Transfer kan worden gedaan bij 100 V gedurende 60-90 min.
- Bereid blokkeeroplossing: 1x PBS met 0,1% Tween 20 met 5% magere melkpoeder. Blokkeer de NC membraan in 25 ml blokkeeroplossing bij kamertemperatuur gedurende 1 uur. Was driemaal gedurende 5 minuten elk met 15 ml fosfaatgebufferde zoutoplossing met Tween 20 (PBST).
- Incubeer het membraan en primaire antilichaam (ascitesvloeistof of hybridoma supernatant) in 10 ml antilichaam verdunningsbuffer verdund met 5% blokkeeroplossing bij 4 ° C overnacht.
- Was de membraame driemaal opnieuw met PBST schoon te maken uit overmatige antilichaam.
- Incubeer het membraan met alkalische fosfatase geconjugeerd geit anti-muis IgG 1: 1250 in blokkerende oplossing onder zacht schudden gedurende 1 uur bij kamertemperatuur geroerd.
- Was het membraan opnieuw en incubeer in het 5-broom-4-chloor-3-indolyl fosfaat / p-nitroblauwtetrazolium chloride (BCIP / NBT) fosfatase substraat mengsel gedurende 10 tot 20 minuten tot kleurontwikkeling.
- Stop de reactie door het wassen van het membraan verscheidene veranderingen gedestilleerd water.
4. Dot Blot
- Verdun de spier supernatanten (protocol 1.1-1.4) in 5% runderserumalbumine (BSA) in PBST met geschikte verhouding voor het verkrijgen van goede signalen: 1: 5 voor huisdieren en tonijn en 1:25 voor walvissen en afdichting. Spot 5 pl van de monsters op het membraan. Minimaliseren het gebied dat de oplossing doordringt (gewoonlijk 3-4 mm diameter) door langzaam toe te passen.
- Droog de membraan bij kamertemperatuur (bijvoorbeeld </ Em> in een laminaire stroom gedurende 30-60 min), blokkeren met blokkeeroplossing petrischaal gedurende 1 uur bij kamertemperatuur en wassen met PBST.
- Incubeer het membraan met primair antilichaam (mAb van hybridoma supernatant bij 1: 10.000 of ascitesvloeistof op 1: 100.000 verdund in 5% blokkeeroplossing) gedurende 1 uur bij kamertemperatuur geroerd.
- Gebruik PBST het membraan drie keer wassen gedurende 5 minuten elk om overmaat antilichaam te verwijderen en daarna geïncubeerd met secundair antilichaam (aan alkalische fosfatase geconjugeerd geit anti-muis IgG 1: 1250 in 5% blokkeeroplossing) gedurende 1 uur bij kamertemperatuur geroerd .
- Was het membraan opnieuw en incubeer in de BCIP / NBT fosfatase substraatmengsel binnen 10 tot 20 minuten tot kleurontwikkeling.
- Stop de reactie door het wassen van het membraan verscheidene veranderingen gedestilleerd water.
5. Indirecte ELISA
- Bereid wasbuffer (0,002 M imidazool gebufferde zoutoplossing met 0,02% Tween 20). Was de plaat 3 keer met het wassenbuffer tussen elke volgende stap (protocol 5,2-5,5).
- Bereid 1:25 verdunning van de spier supernatanten (protocol 1,1-1,4) in coating buffer. Coat een 96-well ELISA-plaat met 100 gl verdunde supernatant bij 4 ° C gedurende de nacht en geblokkeerd met blokkeerbuffer (1% BSA in PBS) gedurende 1 uur bij kamertemperatuur geroerd.
- Bereid 1: 2000 verdunning van het gezuiverde mAb met verdunde buffer en voeg 100 pl verdund mAb aan elk putje. Incubeer de plaat gedurende 1 uur bij kamertemperatuur geroerd.
- Add geit anti-muis IgG geconjugeerd met mierikswortel peroxidase (1: 200 verdunning in buffer verdund) voor verdere incubatie.
- Voeg peroxidase substraat aan elke well (100 ul / well) en geïncubeerd gedurende 10-15 min.
- Stop de reactie door het enzym peroxidase stopoplossing (100 gl / putje) bij kleurontwikkeling waargenomen.
- Lees de optische dichtheid bij 450 nm met behulp van een microplaat spectrofotometer.
6. Bereiding van colloïdaal goud-gelabelde mAb
Opmerking: De kleur van colloïdaal goud oplossing en het mengsel altijd rood. Stel de pH, concentratie van mAb, centrifuge snelheid bij het zwarte neerslag wordt opgemerkt. 6.1 en 6.2 zijn optimalisatie stappen.
- Voeg detecteren gezuiverde mAb (50 ug / ml, 3 ui) aan 100 ui colloïdaal goud oplossing met een pH variërend van 5-9. De minimale pH dat de kleur rood blijft gedurende twee uur wordt beschouwd als de optimale pH. Opmerking: In deze studie werd 0,1 M kaliumcarbonaat gebruikt colloïd goud (40 nm) tot pH 8,0 (optimale pH) passen.
- Voeg verschillende hoeveelheid gezuiverde mAb detecteren (500 ug / ml, 1-20 ul) aan 100 ui colloïdaal goud oplossing bij pH 8,0. Opmerking: De optimale concentratie in deze studie is 6 ug / ml (geen zwarte neerslag).
- Volgens de bovenstaande resultaten, voeg 60 ug gezuiverd detecteren mAb druppelsgewijs aan 10 ml colloïdale goudoplossing. Emulgeren van het mengsel langzaam bij kamertemperatuur gedurende 10 min. Advertentied 2 ml 5% BSA-oplossing in PBS (pH 7,4) aan het mengsel en emulgeren voorzichtig bij kamertemperatuur gedurende 15 min achtergrondinterferentie verminderen.
- Centrifugeer het mengsel bij 10.000 xg gedurende 30 min bij 4 ° C.
- Verwijder het supernatant met ongeconjugeerde antilichaam zorgvuldig en schorten de verkregen pellets in 4 ml PBST dat 1% BSA en 0,1% Tween 20, en herhaal centrifugeren en suspensie meerdere malen.
- Schorsen de laatste neerslag in 1 ml PBST en het op 4 ° C tot gebruik.
7. Bouw van Immune Strip
Opmerking: Figuur 1 toont het immuunsysteem strip ontwerp. Voorbereiden en monteren van de strips in een lage luchtvochtigheid laboratorium milieuconditie (<20% relatieve vochtigheid) voor langere houdbaarheid (> 1 jaar). De afmetingen van de pads en het membraan zijn: conjugaatpad 300 mm x 10 mm, absorberend kussen 300 mm x 24 mm, sample pad 300 mm x 24 mm, NC membraan 300 mm x 25 mm, plakbord 300mm x 80 mm.
- Add colloïdaal goud gelabelde mAb oplossing van stap 6.6 met een micropipet op het conjugatiekussentje verzadigen en vervolgens drogen bij 37 ° C gedurende 1 uur vóór montage.
- Verdeel het specifieke antigeen vangen mAb (500 ug / ml) op de testzone, en konijn anti-muis IgG (500 ug / ml) op de controlezone voor het detecteren van mAb op het NC-membraan met behulp van een pipet of immunostrip printer. Afstand bewaren (> 5 mm) tussen de twee zones om interferentie te voorkomen.
- Plak de geconjugeerde pad, absorberend en NC membraan op het plakbord met dubbelzijdig tape.
Opmerking: Overlap de elektroden aan weerszijden van het NC-membraan met ongeveer 2 mm. Ongepaste strip bouw zal leiden tot een onvolledige proef. - Het monster pad over het conjugaat pad (2 mm) en plak het op het plakbord.
- Maak 6 mm brede stroken met een papieren cutter. Verpak de stroken in de aluminium folie zak met droogmiddel en bewaar ze bij 4 ° C tot gebruik.
8. Cross-reactiviteit Test
- Homogeniseren 0,03 g ruwe spier monster met 1 ml PBS (met 0,1% BSA) in een 1,5 ml centrifugebuis met een bamboestok of malen staaf.
- Houd de strip aan het eind tegenover de testgebieden en dompel de sample pad gedeelte in het model voor 5-10 min en direct waar te nemen van het resultaat.
- Optioneel: Verzamel 500 ul supernatant en overbrengen naar een nieuwe centrifugebuis.
Opmerking: Deze stap wordt voorgesteld als het signaal niet duidelijk wanneer de strook direct geweekt in de supernatant.
- Test verschillende spier monsters in drievoud.
Opmerking: Hier hebben we getest tonijn, kip, seal, 15 soorten walvisachtigen en 5 soorten landzoogdieren. - Hebben vijf onafhankelijke inspecteurs herhalen 8.3 voor vijf keer, dat wil zeggen, gebruik maken van 575 strips in totaal.