De beschreven protocol voorziet in de gelijktijdige weergave van meerdere transcript patronen in verschillende kleuren. MC-WISH biedt het voordeel voor de expressiepatronen van verschillende genen vergelijken in hetzelfde embryo. Als voorbeeld, de expressiepatronen van lege spiracles (EMS) 19, fushi tarazu (FTZ) 20 en slordig gepaarde 1 (SLP1) 21 zijn direct vergeleken in Drosophila melanogaster blastoderm embryo's en gevisualiseerd in diverse kleurschakeringen (figuur 4) .
Verschillende AP substraat combinaties zijn verkrijgbaar voor een panel van contrasterende kleur precipitaten (Tabel 1) te verkrijgen. De rode kleur neerslag geproduceerd door Fast Rood en de paarse neerslag geproduceerd door BCIP / NBT kan gemakkelijk te onderscheiden en worden daarom gebruikt meest voorkomendely in twee kleuren experimenten (Figuur 4A). Echter, de BCIP / NBT vlek snel omslaan in een vrij donkere kleur, zodat de Fast Rode kleur is vermomd in het geval van een gedeeltelijke co-distributie van transcripten. Daarom kan de toepassing van Fast Blue van voordeel, die blauw, groen en violet producten leidt in combinatie met NAMP, NAGP en NABP respectievelijk (tabel 1). De combinatie van Fast Blauw met NAMP geeft een lichtblauwe kleur die gemakkelijk te onderscheiden van de Fast Red product in aangrenzende of overlappende expressie-domeinen zoals hier getoond EMS en SLP1 expressie plaatsen gevisualiseerd in rood en blauw respectievelijk (Figuur 4B). De Fast Blue NAGP combinatie geeft een vergelijkbaar sterk contrast met de Fast Red vlek, zodat de groene EMS domein duidelijk onderscheidend van de rode SLP1 expressie (figuur 4C). Echter, als ems en SLP1 meningsuiting sites zijn debeschermd door Fast Blue NABP en Fast Red respectievelijk de resulterende violette en rode kleur precipitaten minder waarneembaar (figuur 4D). Zoals hierboven vermeld, Fast Red en Fast Blue NAGP gemakkelijk te onderscheiden zoals getoond door SLP1 en FTZ expressie in rood en groen, respectievelijk (figuur 4D).
MagentaPhos in combinatie met INT produceert een geel neerslag, dat wordt gebruikt om de expressie van segmentale FTZ (figuur 4C, E) onthullen. De geel gekleurde neerslag genereert goed contrast met de blauw gekleurde substraten zoals bijvoorbeeld de detectie van SLP1 en FTZ met Fast Blue NAMP en MAG / INT respectievelijk (figuur 4E). De gele neerslag minder gemakkelijk waarneembaar uit de Fast Red product. De gele gebrandschilderde expressie domein van ems kan nauwelijks Disti worden nguished van de rostrale uitdrukking van SLP1 in het rood weergegeven (Figuur 4F). Daarom is de combinatie van kleuren substraten moet zorgvuldig gekozen worden voor elk experiment.

Figuur 1. Stroomdiagram van de MC-WISH. Voor veelkleurige visualisatie van drie unieke transcript patronen, kiezen tussen verschillende antilichaam-AP conjugaten en kleur substraat combinaties in elke detectie cyclus. Afkortingen: AP, alkalische fosfatase; BIO, biotine; DIG, digoxigenine; FLUO, fluoresceïne. Voor andere afkortingen zie legendes naar figuur 4 en tabel 1. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.
s / ftp_upload / 53.830 / 53830fig2.jpg "/>
Figuur 2. Inserts als embryo dragers. (A) Voegt aangebracht aan de onderkant met polyester membranen van 15 mm diameter en 74 urn maaswijdte worden gebruikt als Drosophila embryo dragers. (B) De inzetstukken zijn gemonteerd in 12-well platen, die functioneren als reservoir trays voor de verschillende oplossingen. (C) beschikbare dragers en handvatten laten verwerken van (D) 12 inserts / embryo monsters tegelijk. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.

Figuur 3. Bevestiging van gekleurde embryo. Embryo's worden gemonteerd in een daling van 70% glycerol tussen twee stapels dekglaasjes, die fungeren als afstandhouders. Zachte beweging van de appgelogen groot dekglaasje helpt om de gemonteerde embryo's te draaien in de gewenste richting voor observatie en fotografie. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.

Figuur 4. Multicolor visualisatie van mRNA-transcripten in Drosophila embryo's. Voorbeelden van MC-WISH experimenten in Drosophila embryo's worden getoond van een zijdelings uitzicht. De mRNA expressie patronen van lege siphonen (ems), Fushi tarazu (FTZ) en slordig Gekoppelde 1 (SLP1) worden gevisualiseerd door verschillende kleuren AP substraat combinaties, die zijn aangegeven op elk paneel. Transcripten werden gedetecteerd door (A) FTZ FLUO en ems DIG, ( B) SLP1 FLUO, ems BIO en FTZ DIG, (C) ems BIO, SLP1 FLUO en FTZ DIG, (D) FTZ BIO, SLP1 FLUO, en ems DIG, (E) SLP1 FLUO, ems DIG, en FTZ BIO, (F) FTZ BIO, SLP1 FLUO, en ems DIG gemerkte probes. De hapteen-gelabelde probes werden immunohistochemisch gedetecteerd na elkaar in de genoemde orders. Afkortingen: FB Fast Blue; FR, Fast Red tablet. Voor andere afkortingen zie legendes figuur 1 en tabel 1. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.
| Substraat combinatie | Voeg toe aan 1 ml AP buffer | Concentratie [ug / ml] | AP buffer | Kleur | Signaalgevoeligheid |
| BCIP NBT | 3,5 ul 4,5 pl | 175 337,5 | SB9.5 | purper | +++ |
| MAG INT | 5 pi 5 gl | 250 250 | SB9.5 | geel | + |
| BCIP / INT stockoplossing | 7,5 pl | 250 250 | SB9.5 | geel | + |
| Fast Blue NAMP | 5 pi 5 gl | 250 250 | SB8.2 | blauw | ++ |
| Fast Blue NABP | 20 ul 10 ul | 1000 500 | SB8.2 | violet | ++ |
| Fast Blue NAGP | 10 ul 10 ul | 500 500 | TT8.2 | groen | + |
| Fast Red NAMP | 1 tablet | 1000 400 | TT8.2 | rood | ++ |
Tabel 1. Ondergrond combinaties Afkortingen: +++, sterk;. ++, Medium; +, Zwak NBT, 4-nitro-blauw-tetrazolium chloride; BCIP, 5-broom-4-chloor-3-indolyl-fosfaat; INT, 2- (4-joodfenyl) -3- (4-nitrofenyl) -5-fenyl-tetrazolium chloride; MAG, Magenta-Phos, 5-broom-6-chloor-3-indolyl-fosfaat, NAMP, naftol-AS-MX-fosfaat; NABP, Naftol-AS-BI-fosfaat; NAGP, Naftol-AS-GR-fosfaat; SB9.5, kleuring buffer bij pH 9,5; SB8.2, kleuring buffer bij pH 8,2; TT8.2, Tris-Tween-buffer bij pH 8,2.