$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Veel cellulaire processen zijn uitvoerig bestudeerd in 2 dimensies, waardoor een collectieve kennis van basismechanismen van celsignalering is ontstaan. Deze studies negeren echter belangrijke cellulaire signalen die worden ontvangen van de structurele en mechanische eigenschappen van de lokale cellulaire micro-omgeving en extracellulaire matrix (ECM). Om beter te begrijpen hoe cellen interageren binnen een fysiologisch context, is het belangrijk om ze te bestuderen in 3-dimensionale (3D) assays. De ECM voor deze 3D-assays kan ofwel cel-afkomstig zijn of worden gereconstrueerd uit gezuiverde eiwitten. Ongeacht de bron van de ECM, zijn 3D-matrix assays onmisbaar gebleken voor het begrijpen hoe cellen navigeren en interageren binnen de fysiologische wereld. Bijvoorbeeld, cellen gekweekt in 3D-matrices vertonen verschillende bewegingsmodi die afhankelijk zijn van de mechanische aard van hun omringende ECM, wat niet wordt waargenomen in 2D-experimenten4-6. Bovendien hebben cellen gekweekt in 3D minder en minder uitgesproken stressvezels en focale adhesies dan hun tegenhangers die op harde oppervlakken zoals glas of plastic worden gekweekt7.
De belangrijkheid van contextuele 3D-assays is echter niet beperkt tot celmigratie. Sommige andere celsignaleringsgebeurtenissen kunnen alleen worden onderzocht door het gebruik van 3D-assays. Gedurende weefsel- en celdifferentiatie, geeft de stijfheid van de extracellulaire omgeving en ECM signalen die morfologische gebeurtenissen kunnen beïnvloeden. Bijvoorbeeld, tubulogênes van borstpiteel vindt alleen plaats in 3D-matrices met lage stijfheid, maar niet in stijve matrices of op 2D-substraten8,9. Wanneer gekweekt binnen stijve 3D-matrices, nemen dezezelfde epitheelcellen een abnormaal fenotype aan met verhoogde proliferatie en celmembraanuiteinden, gedreven door veranderde FAK en ERK-signalering10. Veel andere signaalroutes en cellulaire processen zijn bekend om op een vergelijkbare manier te worden beïnvloed door de stijfheid van de lokale cellulaire omgeving, en deze signaalcascades benadrukken het belang van het onderzoeken van signaalgebeurtenissen en cellulair fenotype in de context van geschikte lokale mechanische eigenschappen van een 3D-ECM.
Collagene I is een bijzonder relevant eiwit om te gebruiken voor in vitro studies, aangezien het de meest voorkomende component van de ECM is en verantwoordelijk is voor veel van de mechanische eigenschappen van de cellulaire micro-omgeving. Hoewel het oorspronkelijk werd beschouwd als slechts een structureel eiwit, is zijn rol nu bekend als veel complexer. Collagevezelsamenstelling, architectuur, oriëntatie, dichtheid en stijfheid bieden allemaal een geconcentreerd milieu van signaalinformatie5. Tijdens de progressie van bepaalde ziekten, zoals chronische ontsteking en tumorigenesis, wordt het collagevetweewerking dramatisch geremodelleerd2,11. Meer specifiek in borstkanker, begeleiden verhoogde collageenafzetting en weefselstijfheid en dragen waarschijnlijk bij aan tumorprogressie. In deze vroege tumoren lijkt het verstijfd collagevetweewerking gespannen en meer gealigneerd te zijn, zodat de meeste vezels het groeiende tumor omsluiten2. Terwijl de tumor progressieert, blijft het collageen reorganiseren, en gebieden van het fibrillaire netwerk worden loodrecht op de tumorgrens georiënteerd2,12. Loodrechte uitlijning dient als een prognostische biomarker waarbij deze patiënten een slechtere ziektevrije progressie en algemene overleving hebben1. Een verklaring voor deze correlatie is dat de slechte resultaten een gevolg zijn van verhoogde verspreiding van tumorcellen via aanhoudende celmigratie in uitgelijnde collageennetwerken3.
Om te begrijpen hoe cellen specifiek reageren op de uitlijning en organisatie die wordt waargenomen in tumorprogressie, is het noodzakelijk om zowel willekeurige als uitgelijnde 3D-collagene matrices voor experimenten te genereren. Er zijn drie basismethodologieën om uitlijning binnen fibrillaire netwerken te induceren. De eerste techniek maakt gebruik van een spannings-inducerend apparaat waarbij het collageen tussen twee punten wordt samengetrokken of uitgerekt om uitlijning te genereren. Vezels parallel aan de krachtas worden strak getrokken terwijl vezels loodrecht op de as worden samengedrukt en gebogen. Hoewel spannings-geïnduceerde technieken typisch een uitstekende uitlijning bieden, vereist deze aanpak omvangrijke apparatuur die niet gemakkelijk kan worden aangepast aan veel platforms3,13. Als alternatief kan cel-geïnduceerde spanning worden gecreëerd door gelocaliseerde pluggen van cellen te plaatsen die vervolgens samentrekken en het collageen uitlijnen13. Deze methode heeft het probleem dat deze variabel is, aangezien veel parameters kunnen veranderen. De tweede methode maakt gebruik van magnetische kralen en een magnetisch veld tijdens polymerisatie om collageenuitlijning te induceren13,14. Goede resultaten kunnen worden verkregen met deze methode met ongesofisticeerd apparatuur, maar het vereist wel het gebruik van antilichamen of een andere methode om het polymeer te magnetiseren. Daarom kan het enigszins duur zijn om te gebruiken, en de stijfheid van het collageengel is mogelijk gewijzigd door de verhoogde verbindingen in het netwerk. Bovendien zijn de magnetische kralen die in dit proces worden gebruikt vaak autofluorescent, wat problematisch is voor beeldvormingsexperimenten. Ten slotte kan uitlijning worden gegenereerd door PDMS-microfluidische kanalen3,15,16. In deze methode wordt collageenuitlijning bereikt door polymeriserend collageen door kleine microfluïdische kanalen te laten stromen. Deze microfluïdische kanalen kunnen in een groot aantal ontwerpen worden gemaakt en zijn gemakkelijk aanpasbaar aan veel platforms. Bovendien zijn ze zeer economisch omdat zeer kleine hoeveelheden collageen en andere reagentia worden gebruikt vanwege hun kleine afmetingen.
Hier wordt een eenvoudig protocol gepresenteerd voor het inbedden van cellen binnen een 3-dimensionale, fibrillaire collageenhydrogel. Bovendien wordt een meer geavanceerde techniek