De UQAM ethische commissie heeft deze protocollen, die in overeenstemming zijn met de richtlijnen van de ethische commissie van St-Luc ziekenhuis van het Centre Hospitalier Universitaire de Montréal (Montréal, Canada) goedgekeurd. De deelnemers tekenden een informed consent formulier.
1. Medium Voorbereiding en isolatie van Primary Villous cytotrofoblasten
- Bereid kweekmedium voor humane primaire villous cytotrofoblasten aanvulling Dulbecco's gemodificeerd Eagle's medium (DMEM) met 25 mM HEPES, 10% foetaal runderserum (FBS) en 1% penicilline / streptomycine. Filter de voorbereide medium door steriel 0,22 pm filter en op te slaan in een -20 ° C vriezer in porties van 50 ml.
- Isoleer primaire villous cytotrofoblasten van verse placenta volgende standaard protocollen 3.
- Met behulp van een tang, verwijder de vliezen uit het weefsel door voorzichtig te krabben het uit, terwijl ze voorzichtig villous weefsel niet te verwijderen. Snij deresterende placenta villi in blokjes van ongeveer 3 x 3 cm met behulp scalpel en schaar. Grondig wassen met water dat 0,9% NaCl maternale bloed te verwijderen.
- Het houden van elke kubus met een tang voorzichtig de villous weefsel te verwijderen van de resterende schepen en vezelig weefsel met een schaar.
- 15 tot 30 mg villus weefsel verteren viermaal Hank's gebalanceerde zoutoplossing (HBSS) met trypsine (van 9,6 x 10 5-1,8 x 10 6 U; eindconcentratie 1,2 mg / ml) en deoxyribonuclease I (DNase I) ( eindconcentratie 200 gg / ml) gedurende 30 min bij 37 ° C in een waterbad onder voortdurend schudden.
Opmerking: gebruik 150 ml totaal volume van de eerste digestie, 100 ml voor de tweede digestie en 75 ml voor de twee overige digesties.
- Verzamel de bovenstaande vloeistof die gedispergeerde cellen en centrifugeer bij 1250 xg gedurende 15 min zonder remmen. Verwijder het supernatant en resuspendeer de cellen in 1 ml voorverwarmde DMEM bevattende1% penicilline / streptomycine.
- Laag het gedispergeerde cellen op een discontinue 5% - 70% polyvinylpyrrolidon-gecoate silica gradiënt (zie Tabel 1 voor de bereiding gradiënt) en centrifugeer gedurende 23 minuten bij 507 xg zonder rem. Verwijder de dichtheid laag tussen 1,017-1,033 door afzuigen en laat de lagen tussen 40% en 50% in het verloop met een nieuwe pipet. Was de cellen uitvoerig met 10 ml voorverwarmde DMEM bevattende 1% penicilline / streptomycine.
Opmerking: De verzamelde fractie stemt overeen met dichtheden tussen 1,048 en 1,062, wat trophoblasts herbergt. - Tel de cellen met een hemocytometer. In het kort cellen meng en voeg 10 ul in een nieuwe microcentrifugebuis. Voeg 10 ul van trypan blauw en voorzichtig weer mengen. Het opstellen van de celsuspensie en vul de hemocytometer kamers. Tel de cellen onder 10X objectief.
- Plaats 1 x 10 6 en 4,5 x 10 6 cellen in afzonderlijke buizen voor gebruik in secties 1.3 en 2, respectievelijkly. Zaad de overige cellen in een dichtheid van 1,5 x 10 6 cellen / well in DMEM aangevuld medium en kweek bij 37 ° C en 5% CO2 gedurende maximaal 4 dagen voor de andere experimenten.
- Evaluatie van de zuiverheid van geïsoleerde primaire villous cytotrofoblasten
- Spin 1 x 10 6 van de vers geïsoleerde cytotrofoblasten in microcentrifugebuizen bij 300 x g. Verwijder het supernatant en voeg 1 ml voorverwarmd fosfaatgebufferde zoutoplossing (PBS). Centrifugeer cellen op 300 xg en verwijder PBS door aspiratie.
- Voeg 1 ml koude methanol om cellen en incuberen bij -20 ° C gedurende 20 min. Centrifugeer cellen op 300 xg gedurende 5 minuten en verwijder methanol door aspiratie.
Let op: Gebruik bus masker, veiligheidsbril en rubberen handschoenen tijdens het hanteren methanol. - Voeg 1 ml PBS bij kamertemperatuur cellen gecentrifugeerd hydrateren bij 300 xg en verwijder PBS door afzuigen.
- Incubeer cellen in PBS bevattende FBS (01:50 [v / v] verdunning) en een FcRblokkeringsreagens (01:10) gedurende 45 minuten bij kamertemperatuur om niet-specifieke binding te elimineren.
- Was tweemaal met 500 pl PBS kamertemperatuur Centrifugeer cellen bij 300 g gedurende 5 minuten en verwijder PBS door afzuigen. Resuspendeer cellen in 100 ul PBS kamertemperatuur.
- Incubeer cellen met een muis monoklonaal fluoresceïne isothiocyanaat (FITC) geconjugeerd anti-humaan cytokeratine 7-antilichaam kloon LP5K (1: 200) of een controle isotype-gematched non-specifiek antilichaam in PBS met 0,2% BSA gedurende 45 minuten bij kamertemperatuur in het donker. Was de cellen in PBS.
- Analyseer de cellen door flowcytometrie 3. Gebruik celpreparaten die ten minste 96% CK-7-positieve cellen vertonen door flowcytometrie voor verdere experimenten.
2. siRNA Transfectie van humane primaire Villous cytotrofoblasten
- Transfectie van primaire menselijke villi cytotrofoblasten met een microporatie-inrichting
- Bereid 6-well platen met2 ml DMEM aangevuld medium voor incubatie van microporated cellen.
- Na isolatie van de primaire cytotrofoblasten (zie paragraaf 1.2), neemt een monster van cellen in suspensie en het bepalen van het aantal cellen met behulp van een hemocytometer.
- Transfer 1,5 x 10 6 cellen om een microcentrifugebuis en pellet cellen door centrifugeren bij 300 g gedurende 5 minuten bij kamertemperatuur. Was de cellen met 1 ml Dulbecco's PBS (DPBS) (Mg2 +, Ca2 + -vrij) en pellet van de cellen door centrifugatie bij 300 xg gedurende 5 minuten bij kamertemperatuur.
- Verwijder het supernatant en resuspendeer de cellen voorzichtig in 100 pl resuspensiebuffer.
Opmerking: vermijden om celsuspensie langer dan 15-30 min bij kamertemperatuur levensvatbaarheid van de cellen en transfectie-efficiëntie te maximaliseren. - Voeg 300 ng Syncytin-2 siRNA (of control scrambled siRNA) aan de 1,5 ml microcentrifugebuis en zuig de cel-siRNA mengsel met behulp van een pipet 100 ul transfectie. invoegende pipet in het station (zie lijst van materialen) en de onderwerpen van de cellen aan een 1300 V enkele puls van 30 ms.
- Onmiddellijk over de cellen 6-well platen (bereid in stap 2.1.1) die 37 ° C voorverwarmd medium aangevuld tot celbeschadiging voorkomen.
- Herhaal stap 2.1.5 en 2.1.6 voor de overige monsters.
- Schud de plaat gedurende 30 seconden om een gelijkmatige verdeling van de cellen te waarborgen. Incubeer de plaat bij 37 ° C in een bevochtigde CO2 incubator gedurende 24 tot 48 uur. Vernieuwen kweekmedium 24 uur na transfectie.
- Evalueer transfectie-efficiëntie door Western blot-analyse (zie stappen 3-6).
- Lipofectie van siRNA in de menselijke primaire cytotrofoblasten
- Na isolatie van de villi cytotrofoblasten, zaad de cellen bij een dichtheid van 1,5 x 10 6 cellen per putje in 6-wells platen in 2 ml kweekmedium en incubeer 18 uur.
- Verdun 300 ng Syncytin-2-specifieke siRNA (of control-scrambledsiRNA) en 5 gl van lipide-gebaseerde transfectie reagens in afzonderlijke 1,5 ml buizen in een totaal volume van 10 pl en antibiotica-serumvrij medium. Incubeer gedurende 5 min.
- Meng de verdunde reagentia en incubeer gedurende nog 20 minuten bij kamertemperatuur om de transfectie te vormen. Voeg 90 ul van antibiotica-en serumvrij medium aan het mengsel tot een eindvolume van 100 pl.
- Verwijder kweekmedium uit de 6-well platen (stap 2.2.1). Voeg 2 ml vers medium en 100 pi transfectiemengsel aan elk putje. Incubeer de cellen bij 37 ° C in een CO2 incubator gedurende 24 tot 48 uur. Vernieuwen kweekmedium 24 uur na transfectie.
- Evalueer transfectie-efficiëntie door Western blot-analyse (zie stappen 3-6).
3. Voorbereiding van lysaten van Whole Cell Culture
- Verwijder de media en spoel elk putje (van stap 2.1.8 en 2.2.4) met behulp van voorverwarmde DPBS (Mg 2+, Ca 2+ gratis). Zuig het DPBS en voeg 500 ul van 0,25% trypsine / ethyleendiaminetetra-azijnzuur (EDTA). Incubeer gedurende 1-3 minuten bij 37 ° C in een CO2 incubator. Stop trypsine behandeling door toevoeging van 500 pl serum bevattende groeimedia.
Opmerking: Gebruik de juiste media volume afhankelijk van de aard van de kolf / gerecht: 1 ml per 10 7 cellen / 100 mm schaal / 150 cm2 fles; 0,5 ml per 5 x 10 6 cellen / 60 mm schaal / 75 cm 2 kolf. - Overdracht cellen om een 1,5 ml microcentrifugebuis, pellet cellen door centrifugeren bij 300 xg gedurende 2 minuten bij kamertemperatuur. Was de cellen met DPBS (Mg2 +, Ca2 + -vrij) en pellet cellen door centrifugeren bij 300 xg gedurende 2 minuten bij kamertemperatuur.
- Verwijder voorzichtig bovenstaande vloeistof zonder de pellet te verstoren. Plaats de buis op ijs. Resuspendeer de pellet in 50-200 ul ijskoude Radio-immunoprecipitatie assay (RIPA) buffer (zie tabel 2 voor buffer compositie) met daarin vers toe te voegened protease en fosfatase remmers bij een 1x uiteindelijke concentratie. In het kort vortex de kolf en laat op ijs gedurende 30 min.
- Spin bij 16.000 xg gedurende 20 min bij 4 ° C. Plaats de buis voorzichtig op ijs. Met behulp van een pipet het supernatant naar een nieuwe pre-gekoelde microcentrifugebuis op ijs bewaard. Gooi de pellet.
4. Voorbereiding van de Nuclear Uittreksels uit gekweekte cellen
- Voor elk putje (stap 1.2.5), was gekweekt cytotrofoblasten tweemaal met 1 ml voorverwarmde DPBS (Mg2 +, Ca2 + vrij). Aspireren DPBS en voeg 500 ul van 0,25% trypsine / EDTA. Incubeer gedurende 1-3 minuten bij 37 ° C in een CO2 incubator en stop trypsine behandeld door toevoeging van 500 pl serum bevattende groeimedia.
- Overdracht cellen om een 1,5 ml microcentrifugebuis, pellet cellen door centrifugeren bij 300 xg gedurende 2 minuten bij kamertemperatuur. Was de cellen met DPBS (Mg 2+, Ca 2+ -vrij) en pellet cellen door centrifugerenbij 300 xg gedurende 2 minuten bij kamertemperatuur. Verwijder voorzichtig alle bovenstaande vloeistof zonder verstoring van de pellet en plaats de buis op ijs.
- Extract nucleair eiwit volgens de instructies van de fabrikant. Bepaal eiwitconcentratie van elk monster met behulp van eiwit kwantificatie assay (Bradford assay of bicinchoninezuur (BCA)).
5. Monstervoorbereiding en elektroforese
- Bepaal de eiwitconcentratie voor elk celextract met een kwantificering eiwit assay (bijvoorbeeld 8 Bradford of BCA 9).
- Volgens de instructies van de fabrikant (indien antilichamen kunnen worden gebruikt bij reductie en denaturatie omstandigheden), voeg een gelijk volume van 2x Laemmli monsterbuffer (tabel 2) 20-30 ug totaal eiwit.
- Kook cellysaten bij 100 ° C gedurende 5 minuten. Aliquot 50-100 pl lysaat aan herhaalde vries / ontdooi cycli te voorkomen en uit de resterende buizen bij -20 ° C voor toekomstig gebruik.
- Terwijl de monsters verwarmen, bereiden 1 liter 1 x loopbuffer (tabel 2).
- Spin de monsters bij 16.000 xg gedurende enkele seconden en plaats ze op ijs.
- Laad gelijke hoeveelheid eiwit in elke well van een 12% SDS-PAGE-gel (zie Tabel 2 voor gelsamenstelling), samen met een molecuulgewicht merker. Voer de elektroforese gedurende 1-2 uur bij 100 V.
6. overbrengen van het eiwit uit de gel naar het membraan
- Activeren polyvinylideenfluoride (PVDF) membraan met methanol gedurende 1 min en spoel met 1x overdracht buffer / 10% methanoloplossing. Volgens de instructies van de fabrikant, transfer voor 30 minuten tot 1 uur, afhankelijk van de eiwitgrootte.
Opmerking: Transfer efficiëntie kan worden beoordeeld met behulp van Ponceau rode vlekken voordat de blokkerende stap.
7. antilichaamkleuring
- Blokkeer het membraan gedurende 1 uur bij kamertemperatuur of overnacht bij 4 ° C met 5% blokkeeroplossing.
- Incubeer het membraan met anti-Syncytin-2 antilichamen (4 ug / ml; 1: 5000) 6 of anti-glyceraldehyde-3-fosfaat dehydrogenase (GAPDH, 0,4 gg / ml; 1: 500) in 5% blokkeeroplossing overnacht bij 4 ° C (anti-Syncytin-2) of gedurende 45 minuten bij kamertemperatuur. Was het membraan drie maal in Tris-gebufferde zoutoplossing Tween (TBST zie Tabel 2 voor buffersamenstelling) gedurende 5 min.
- Incubeer het membraan met geschikte mierikswortelperoxidase (HRP) geconjugeerd anti-konijn of anti-muis antilichaam (1: 10.000) in 5% blokkerende buffer in TBST bij kamertemperatuur gedurende 1 uur. Was het membraan drie keer in TBST gedurende 5 minuten en spoel in TBS. Signalen detecteren met behulp van de chemiluminescentie gebaseerde blotting substraat.
8. Radioactief merken van enkelstrengs oligonucleotide
- fosforyleringsreactie
- In een microcentrifuge buis, voeg 50 ng een voorwaartse oligonucleotide met 1x T4 polynucleotide kinase buffer, 1 UT4 polynucleotidekinase en 20 uCi (γ- 32 P) ATP en deel uitmaken van de reactie volume tot 20 pi met nuclease-vrij water.
- Incubeer bij 37 ° C gedurende 30 minuten. Stop de reactie door toevoeging van 5 pl 0,5 M EDTA. Maak het volume tot 50 pi met nuclease-vrij water.
- Verwijdering van niet opgenomen nucleotiden van oligonucleotiden
- Bereid een G-25 kolom geëquilibreerd met TE buffer (tabel 2) volgens de instructies van de fabrikant. Plaats de kolom in een frisse DNase-vrij 1,5 ml microcentrifugebuis.
- Voeg langzaam 50 pl probe (uit stap 8.1.2) via hars voorzichtig het harsbed niet te verstoren. Spin gedurende 2 minuten bij 350 xg om het gezuiverde monster in 1,5 ml microcentrifugebuis verzamelen. Was de kolom G-25 met 36 ul nuclease-vrij water en draaien gedurende 2 minuten bij 350 xg om het te verzamelen in de microcentrifugebuis.
- Hybridisatie met de complementaire streng oligonucleotide
- Breng de radioactief gemerkte probe (86 pi) van een 1,5 ml microcentrifugebuis en voeg 200 ng omgekeerde oligonucleotide en 1x annealen buffer (tabel 2). Verhit 5 min bij 95 ° C en laat een nacht bij kamertemperatuur koelen.
- Bereid niet-radioactieve dubbelstrengs oligonucleotiden door toevoeging van 50 ng niet-gelabelde voorwaartse en achterwaartse oligonucleotiden en 1x annealen buffer in een 1,5 ml microcentrifugebuis. Maak het volume tot 100 ul met nuclease-vrij water. Warmte en laten kamertemperatuur zoals beschreven in stap 8.3.1.
9. Bereiding van een niet-denaturerende polyacrylamidegelelektroforese EMSA
- Bereid een 4% natieve gel (10 x 12 cm) met een 1,5 mm ruimte-kam (zie Tabel 2 voor gelsamenstelling). Reinig alle glazen platen met behulp van gedestilleerd water.
Let op: Het is essentieel dat de platen zijn volledig vrij van ionische detergent, zoals SDS. - onmiddellijk pons de acrylamide oplossing tussen de platen en laat polymerisatie te gaan (ongeveer 30 min).
- Monteer de elektroforese apparatuur en vul de tank met 0.5x TBE. Pre-run de gel gedurende 30 minuten tot 1 uur bij 150 V voordat monster laden.
10. DNA bindingsreactie
- In een 1,5 ml microcentrifugebuis, voeg 10 ug van nucleair extract (stap 4.3) in 1x Gel Shift Binding buffer (tabel 2) en vul het uiteindelijke volume tot 10 pi met nuclease-vrij water. Als controle werd een buis bereiden zonder nucleair extract. Voor de competitiereactie, voeg 1 pl koud aspecifieke of specifieke dubbelstrengs oligonucleotide (stap 8.3.2).
- Voeg 1 pl radioactieve probe uit stap 8.3.1 aan elke reactie. Incubeer het reactiemengsel bij kamertemperatuur gedurende 20 min. Voeg 1 ul van 10x gel laadbuffer per reactie en laadt elk monster op de gel bereid in hoofdstuk 9.
- Voer de elektroforese gedurende 1 1/2 tot 2 uur bij 150 V. Na de migratie, wikkel de gel en het glas in een plastic wrap en positie in een blootstelling cassette onder een fosforscherm. Reactie cassette bij 4 ° C gedurende 24 uur.
- Verwijder het scherm van blootstelling cassette, plaats in de fosfor afbeeldingsinrichting gescand.