Een abonnement op JoVE is vereist om deze inhoud te bekijken. Log in of start vandaag met uw gratis proefperiode.

Methodenartikel

Rapid One-step enzymatische synthese en All-waterige Zuivering van Trehalose analogen

9.8K weergaven

DOI:

10.3791/54485

17 februari 2017

In dit artikel

Samenvatting

Trehalose-analogen duiken op als belangrijke moleculen voor bio(techno)logische en biomedische toepassingen. We beschrijven een geoptimaliseerd protocol voor het enzymatisch synthetiseren en zuiveren van trehalose-analogen dat eenvoudig, efficiënt, snel en milieuvriendelijk is. De toepassing ervan voor de snelle productie en toediening van een sonde voor de detectie van mycobacteriën wordt gedemonstreerd.

Samenvatting

Chemisch gemodificeerde versies van trehalose, trehalose of analoga hebben toepassingen in de biologie, biotechnologie en farmaceutische wetenschappen, onder andere gebieden. Zo hebben trehalose analogen richting detecteerbare labels gebruikt om Mycobacterium tuberculosis te detecteren en kunnen applicaties tuberculose diagnostische beeldvormingsmiddelen hebben. Hydrolytisch stabiele versies van trehalose worden ook nagestreefd vanwege hun potentieel voor toepassing als niet-calorische zoetstoffen en bioprotectieve middelen. Ondanks de aantrekkingskracht van deze klasse van verbindingen voor verschillende toepassingen, in potentie groot onvervulde door het ontbreken van een solide route voor hun productie. Hier melden wij een gedetailleerd protocol voor de snelle en efficiënte one-step biokatalytische synthese van trehalose analogen dat de problemen in verband met chemische synthese omzeilt. Door gebruikmaking van de thermostabiele trehalose synthase (TRUE) enzym uit Thermoproteus tenax, kan trehalose analogen generated in een enkele stap uit glucose analogen en uridine difosfaat glucose in hoge opbrengst (tot kwantitatieve conversie) in 15-60 min. Een eenvoudige en snelle niet-chromatografische zuivering protocol waarbij spin dialyse en ionenuitwisseling veel trehalose analogen van bekende concentratie te leveren in waterige oplossing in slechts 45 minuten. Wanneer ongereageerde glucose-analoog blijft, kan chromatografische zuivering van het trehalose analoge product worden uitgevoerd. Over het algemeen is deze methode zorgt voor een "groene" biokatalytische platform voor de versnelde synthese en zuivering van trehalose analogen die efficiënt en toegankelijk voor niet-chemici. Om de toepasbaarheid van deze methode illustreren, beschrijven we een protocol voor de synthese volledig waterige zuivering en toediening van trehalose-gebaseerde click chemie probe mycobacteriën, hetgeen alles minder dan 1 uur nodig fluorescentiedetectie van mycobacteriën. In de toekomst voor ogen dat we, onder OTHer toepassingen Dit protocol kan worden toegepast op de snelle synthese van trehalose-probes voor tuberculose diagnostiek. Bijvoorbeeld kortlevende radionuclide trehalose gemodificeerde analogen (bijvoorbeeld 18 F-gemodificeerde trehalose) kunnen worden gebruikt voor geavanceerde klinische beeldvormingsmodaliteiten zoals positron emissie tomografie-computed tomografie (PET-CT).

Inleiding

Trehalose is een symmetrische niet-reducerende disaccharide bestaande uit twee glucose eenheden die zijn verbonden door een 1,1-α, α-glycosidische binding (Figuur 1A). Terwijl trehalose ontbreekt in mensen en andere zoogdieren wordt aangetroffen bij bacteriën, schimmels, planten en invertebraten 1. De primaire rol van trehalose in de meeste organismen te beschermen tegen milieu-invloeden, zoals uitdroging 1. Bovendien hebben sommige humane pathogenen vereist trehalose voor virulentie, waaronder tuberculose veroorzaakt Mycobacterium tuberculosis, die trehalose gebruikt als een mediator van celwa....

Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.

Protocol

1. Expressie en zuivering van Tret van Top10 E. coli

LET OP: Neem contact op met de auteurs van de Tret-uiting van E. coli-stam te vragen (pBAD Tret plasmide, met daarin de T. tenax tret gen onder de controle van de AraC proteïne, getransformeerd in Top10 E. coli 19) en de bijbehorende materiaal overeenkomst tot overdracht . Het volgende protocol geeft kenmerkend een eiwit opbrengst van ongeveer 4 mg / l.

  1. Bereid een 3 ml overnacht cultuur van Tret expressie E. coli.
    1. Streak Top10 E. coli getransformeerd met pBAD-Tret expressievector op lysogenie bouillon (LB) agar....

Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.

Resultaten

T. tenax Tret werd verkregen van E. coli in een opbrengst van ongeveer 4 mg / l gebruikt standaard eiwitexpressie en zuiveringstechnieken. Eén nikkel affiniteitschromatografiestap volstond om Tret zuiveren uit E. coli-lysaat (vertegenwoordiger FPLC spoor wordt getoond in figuur 4). Zoals vermeld in onze eerste publicatie op Tret synthesewerkwijze, recombinante T. tenax Tret is in staat om een brede variatie glucose-analoga waarvan vele.......

Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.

Discussie

Trehalose analogen hebben het potentieel om verschillende gebieden beïnvloeden, van conservering van voedsel en medicijnen tot diagnose en behandeling van microbiële infecties 6. Bestaande meerstaps chemische synthese werkwijzen bruikbaar voor het produceren van complexe trehalose afgeleiden met meerdere plaatsen van modificatie (bijvoorbeeld natuurlijk voorkomende complexe mycobacteriële glycolipiden). Deze werkwijzen zijn steevast lang en inefficiënt, zelfs wanneer toegepast op de synt.......

Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.

Openbaarmakingen

De auteurs hebben niets te onthullen.

Dankbetuigingen

Dit werk werd gefinancierd door een subsidie van de National Institutes of Health (R15 AI117670) aan B.M.S en P.J.W, evenals een Cottrell College Scholar Award van de Research Corporation (20185) aan P.J.W. L.M.M. werd ondersteund door een Provost's Fellowship van CMU.

....

Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.

Materialen

Lijst van materialen gebruikt in dit artikel
NaamBedrijfCatalogusnummerOpmerkingen
LB agarResearch Products InternationalL24021
Ampicillin sodium saltSigma AldrichA9518
Luria brothResearch Products InternationalL24045
Terrific BrothResearch Products InternationalT15050
L-(+)-ArabinoseSigma AldrichA3256
Phosphate-buffered SalineGE HealthcareSH30256
ImidazoleSigma AldrichI5513
Sodium chlorideBDHBDH9286
Sodium phosphate, monobasicFisher ScientificS374
Syringe filter, 0.45 µmFisher Scientific09719D
Protease Inhibitor mini-tablets, EDTA-freeThermo Scientific88666
HisTrap HP nickel affinity column, 5 mLGE Healthcare17-5248-02
TRIS base ultrapureResearch Products InternationalT60040
Dialysis tubing, MWCO 12–14,000Fisher Scientific21-152-16
Glucose analoguesCarboSynth, Sigma Aldrich, Santa Cruz Biotechnology, American Radiolabeled ChemicalsVoorbeelden van leveranciers die talrijke glucose-analogen aanbieden
6-Azido-6-deoxy glucopyranose (6-GlcAz)CarboSynthMA02620
UDP-Glucoseabcam Biochemicalsab120384
Magnesium chloride hexahydrate Fisher ScientificM33
Amicon Ultra-15 centrifugal filter unitEMD MilliporeUFC901008
Bio-Rex RG 501-X8 mixed-bed ion-exchange resinBio-Rad444-9999
Extra-Fine Bio-Gel P2 mediaBio-Rad150-4118
Glass-backed silica gel thin-layer chromatography platesEMD Millipore1056280001
n-ButanolFisher ScientificA399
EthanolFisher ScientificS25310A
Sulfuric acidFisher ScientificA300
AcetonitrileEMD MilliporeAX0145
Deuterium oxide, 99.8%Acros Organics351430075
Aminopropyl HPLC columnSigma Aldrich58338
Bovine serum albuminSigma Aldrich5470
Para-formaldehydeTed Pella18505
Alkyne-488Sigma Aldrich761621
Sodium ascorbateSigma AldrichA7631
Tris[(1-benzyl-1H-1,2,3-triazol-4-yl)methyl]amine (TBTA)Click Chemistry Tools1061
tert-ButanolSigma Aldrich360538
DimethylsulfoxideSigma AldrichW387520
Copper(II) sulfateSigma AldrichC1297
Fluoromount-G mounting mediumSouthern Biotechnology10001

Referenties

  1. Elbein, A. D., Pan, Y. T., Pastuszak, I., Carroll, D. New insights on trehalose: a multifunctional molecule. Glycobiology. 13, 17-27 (2003).
  2. Tournu, H., Fiori, A., Van Dijck, P. Relevance of trehalose in pathogenicity: some general rules, yet many exceptions. PLoS Pathog....

Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.

Herprints en machtigingen

Trefwoorden

TreT enzymspindialyseionenuitwisselingglucose analoogUDP glucoseclickchemie sondeMycobacterium tuberculosisniet chromatografische zuivering