Een protocol voor de synthese van met alkyl gemodificeerde guanidinen gebaseerd op het gebruik van de overeenkomstige precursors gepresenteerd.
Method Article
* These authors contributed equally
Een protocol voor de synthese van met alkyl gemodificeerde guanidinen gebaseerd op het gebruik van de overeenkomstige precursors gepresenteerd.
De guanidine groep is een van de belangrijkste farmacofore groepen in medicinale chemie. De enige aminozuren die een guanidine groep van arginine. In dit artikel wordt een eenvoudige werkwijze voor de modificatie van de guanidinegroep in peptidische liganden voorzien, een voorbeeld van RGD bindende integrine liganden. Recent werd aangetoond dat het sterke modificatie van de guanidinegroep in deze liganden maakt de selectieve modulatie van het subtype (bijvoorbeeld tussen de subtypes av en α5). Bovendien is een voorheen onbekende strategie voor de functionalisering via de guanidine groep werd aangetoond, en de synthetische benadering wordt beoordeeld in dit document. De beschreven modificaties omvatten eindstandig (N ω) gealkyleerd en geacyleerd guanidinegroepen. Voor de synthese worden op maat precursor moleculen gesynthetiseerd, die vervolgens worden onderworpen aan een reactie met een orthogonaal ontschermd amine om de pre overdragen-gemodificeerde guanidinegroep. Voor de bereiding van gealkyleerde guanidinen, precursors basis van N worden N'-di-Boc-1H-pyrazool-1-carboxamidine gebruikt geacyleerde verbindingen, de voorloper gekozen dat een overeenkomstige geacyleerde derivaat van N-Boc-S synthetiseren - methylisothioureum, die in één of twee stappen reacties worden verkregen.
Onder de meest voorkomende farmacofore groepen in natuurlijke liganden is de guanidinegroep, dat betrokken is bij meervoudige interacties 1, 2. Zo dient het als een potentiële viervoudige waterstofdonor in waterstofbinding interacties en is betrokken bij elektrostatische interacties, zoals zoutbruggen of kation-π interacties. In medicinale chemie, wordt deze groep vaak drugs en geneesmiddelkandidaten 4, hoewel zeer vaak guanidine mimetica 5, 6. De reden voor de ontwikkeling van guanidine nabootsers is de verwijdering van de alomtegenwoordige, positief geladen guanidinegroep, en de aanpassing van de lipofiliciteit van het ligand. In peptidische liganden, alleen guanidine-bevattend aminozuur arginine, die daarom vaak in het biologisch actieve gebied van peptidische liganden.
Een zeer prominent voorbeeld voor een arginine bevattend ligand familie is de onderfamilie van de RGD-bindende integrines. In het algemeen zijn integrinen zijn een klasse van celadhesie receptoren, die in de loop belangrijke functies aan alle hogere organismen. Sommige van deze functies omvatten celadhesie, migratie en overleving cel. Zo zijn ze ook betrokken bij pathologische indicaties, zoals kanker en fibrose. Integrinen zijn heterodimere transmembraan eiwitten die bestaan uit een α- en β-subeenheid dat integrine 24 bekende subtypen vormen; 8 herkennen het tripeptide Arg-Gly-Asp (RGD =) in hun liganden 7. De bindende gebied zich op het grensvlak tussen beide subtypen in het extracellulaire deel, de zogenaamde integrine kopgroep 8. RGD wordt herkend door twee gemeenschappelijke interacties: de metaalionen-afhankelijke adhesieplaats (MIDAS) gebied, dat zich in de beta-subeenheid en waarbij het carbonzuur in de liganden bindt (side chain of Asp); en guanidine-groep van de liganden, die zich in de alfa-subeenheid. De meeste integrine subtypen promiscue en tenminste een deel van hun natuurlijke extracellulaire matrix (ECM) liganden 9 delen. Daarmee voor de ontwikkeling van kunstmatige integrine liganden, het hoofddoel is, naast een hoge bindingsaffiniteit het subtype selectiviteit. Onlangs waren we in staat om een belangrijk element voor het genereren van subtype-selectieve liganden onthullen: de guanidine-groep. Door verschillende modificaties, biselective liganden voor av en α5-bevattend integrine subtypes kunnen worden omgezet in verbindingen selectief door eenvoudige modificaties van de guanidinegroep, die vervolgens kunnen onderscheiden van de verschillende α-subeenheden 10.
In de zak van av, de guanidinegroep interactie zijdelingse via een bidentaat zoutbrug van Asp218 11, 12. Deze interactie ceen eveneens worden waargenomen in α5β1 (hier met Asp227 in α5), maar bovendien wordt een end-on interactie van de guanidinegroep een Gin rest (Gln221) er 13 waargenomen. Zo hebben we wijzigde de guanidinegroep in twee tegengestelde manieren in een geval blokkeert de zijdelingse interactie met de methylering van het N δ guanidine-groep, en in het andere geval met de methylering van de guanidine N ω, blokkeren van het einde-wisselwerkingen. Verrassenderwijs dit kleine modificatie leidde tot een volledige selectiviteit verschuiving van de liganden. In aanvulling op de alkylering werd een nieuwe functionalisering methode geïntroduceerd in deze publicatie. De klassieke werkwijze voor functionalisering dergelijke pentapeptidic ligand via de zijketen conjugatie van een aminozuur niet betrokken bij binding (bijvoorbeeld K c (RGDfK)) 14, 15. Hier,laten we zien dat functionalisering mogelijk door aanpassing van de guanidine - die cruciaal is voor binding - met een acyl- of gealkyleerd linker. De positieve lading die essentieel is voor binding behouden en modellen suggereren dat de langketenige punten uit de bindende pocket, waardoor een ideale mogelijkheid voor de bevestiging van verdere linkers en etiketteeraggregaten (bijvoorbeeld een fluorescent label of een chelator voor moleculaire in beeld brengen).
In dit werk concentreren we ons op de voorbereidende stappen voor de modificatie van de guanidinegroep van arginine-bevattende liganden. Dit omvat de synthese van N- ω -methylated species, alsook guanidinen met meer verbindingseenheden. De verschillende modificaties omvatten acylgroepen en alkylgroepen.
Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.
Opmerking: Alle reagentia en oplosmiddelen werden verkregen van commerciële leveranciers en werden gebruikt zonder verdere zuivering.
Let op: Neem contact op met alle relevante veiligheidsinformatiebladen (VIB) voor gebruik. Gebruik alle passende veiligheidsuitrusting bij het uitvoeren van chemische synthese (bijvoorbeeld, zuurkast, een veiligheidsbril, handschoenen, laboratoriumjas, full-length broek en dichte schoenen).
1. Synthese van de Guanidinylation Precursors
2. Synthese van cyclische peptideprecursors
3. Guanidinylation en Deprotectie in Solution
4. analytische gegevens en parameters voor de zuivering
Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.
Het cyclische peptide precursor werd gesynthetiseerd als een lineair peptide gecycliseerd en orthogonaal Dde-bescherming ontdaan. Na de precipitatie werd de zuiverheid van de verbinding geanalyseerd met HPLC-MS (figuur 1). De voortgang van de reactie te volgen, werd een HPLC-analyse uitgevoerd na de 2-uur reactietijd (figuur 2).
Voor grotere resten op de guanidinegroep, de reactietijd van 2 uu...
Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.
De voorloper voor guanidinylation een orthogonaal ontschermd cyclisch peptidederivaat, (c (OrnD (OtBu) Gf (N Me) V)), dat wordt gesynthetiseerd door een standaard protocol van Fmoc vaste-fase peptidesynthese (SPPS). Ornithine werd gebruikt als orthogonaal beschermde derivaat (Fmoc-Orn (Dde) -OH), die met hydrazine kan worden ontschermd in DMF na de cyclisatie van het peptide scaffold. Het peptide precursor wordt gezuiverd door de precipitatie van de verbinding en de daaropvolgende lyofiliserin...
Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.
De auteurs hebben niets te onthullen.
TGK erkent de International Graduate School for Science and Engineering (IGGSE) van de Technische Universität München voor hun financiële steun. HK erkent het Center for Integrated Protein Science München (CIPSM) voor hun steun.
Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.
| Name | Company | Catalog Number | Comments |
|---|---|---|---|
| N,N′-Di-Boc-1H-pyrazole-1-carboxamidine, 98% | Sigma Aldrich | 434167 ALDRICH | |
| Trifenylfosfine, 99% | Sigma Aldrich | T84409 SIGMA-ALDRICH | |
| Tetrahydrofuran, >99,5% | Carl Roth | 4745 | |
| Tetrahydrofuran anhydrous, 99,8% | Carl Roth | 5182 | |
| Methanol anhydrous, 99,8% | Sigma Aldrich | 322415 SIGMA-ALDRICH | |
| Diisopropyl azodicarboxylaat, 98% | Sigma Aldrich | 225541 ALDRICH | |
| Dichloormethaan, voor synthese, 99,5% | Carl Roth | 8424 | |
| Silica gel voor flitschromatografie | Sigma Aldrich | 60738 SIGMA-ALDRICH | |
| n-Pentaan, 99% | Carl Roth | 8720 | |
| n-Hexaan, 99% | Carl Roth | CP47 | |
| Ethylacetaat, 99,5% | Carl Roth | 7338 | |
| Aminohexanol, 95% | Sigma Aldrich | A56353 ALDRICH | |
| S-Methylisothioureum hemisulfaat, 98% | Sigma Aldrich | M84445 ALDRICH | |
| Di-tert-butyl dicarbonaat, 99% | Sigma Aldrich | 205249 ALDRICH | |
| N,N-Dimethylformamide, 99,8% | Carl Roth | A529 | |
| N,N-Diisopropylethylamine, 99,5% | Carl Roth | 2474 | |
| Acetanhydriet, 99% | Carl Roth | 4483 | |
| Chloretryylhars | Carbolution | CC11006 | |
| Fmoc-Gly-OH, 98% | Carbolution | CC05014 | |
| Piperidine, 99% | Sigma Aldrich | 104094 SIGMA-ALDRICH | |
| Fmoc-Orn(Dde)-OH | Iris-Biotech | FAA1502 | |
| HATU, 99% | Carbolution | CC01011 | |
| HOAt, 99% | Carbolution | CC01004 | |
| Fmoc-Val-OH | Carbolution | CC05028 | |
| 2-Nitrobenzeensulfonylchloride, 97% | Sigma Aldrich | N11507 ALDRICH | |
| 2,4,6-Collidine, 99% | Sigma Aldrich | 27690 SIGMA-ALDRICH | |
| Mercaptoethanol, 99% | Sigma Aldrich | M6250 ALDRICH | |
| Diazabicycloundeceen, 98% | Sigma Aldrich | 139009 ALDRICH | |
| Fmoc-D-Phe-OH, 98% | Sigma Aldrich | 47378 ALDRICH | |
| Fmoc-Asp(OtBu)-OH, 98% | Carbolution | CC05008 | |
| Hexafluorisopropanol | Carbolution | CC03056 | |
| Difenylfosforylazide, 97% | Sigma Aldrich | 178756 ALDRICH | |
| TFA, 99,9% | Carl Roth | P088 | |
| Triisopropylsilaan, 98% | Sigma Aldrich | 233781 ALDRICH | |
| Acetonitril, HPLC-kwaliteit | Carl Roth | HN44 |
Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.
Request permission to reuse the text or figures of this JoVE article
Request Permission