Onderzoek van Host Phenotypes in<em&gt; Gambusia affinis</em&gt; Na een behandeling met antibiotica

Samenvatting

Deze studie omvat werkwijzen effecten op een modelvis gastheer na verandering van de huid en darmen microbiome gemeenschappen compositie van een antibioticum onthullen.

Samenvatting

De veelvuldige toepassing van antibiotica in de geneeskunde betekent dat het begrijpen van de resulterende gevolgen voor de gastheer van vitaal belang is. Antibiotica verminderen vaak de diversiteit van de microbioomgemeenschap van de gastheer en veranderen de samenstelling van de microbiële gemeenschap. Veel ziekten zoals antibiotica-geassocieerde enterocolitis, inflammatoire darmziekte en metabole stoornissen zijn gekoppeld aan een verstoord microbioom. De complexe wisselwerking tussen gastheer, microbioom en antibiotica vereist een hanteerbaar model voor het bestuderen van gastheer-microbioom interacties. Onze zoetwaterwerveldiervis dient als een nuttig model voor het onderzoeken van de universele aspecten van de structuur en functie van het mucosale microbioom, evenals het analyseren van gevolgde gastheerefecten door het veranderen van de microbiële gemeenschap. Methoden omvatten gastheeruitdagingen zoals infectie door een bekende vispathogeen, blootstelling aan fecale of bodemmicroben, osmotische stress, nitraattoxiciteit, groeianalyse en meting van darmmotiliteit. Deze technieken demonstreren een flexibel en nuttig modelsysteem voor snelle bepaling van gastheerfenotypen.

Inleiding

Er is vastgesteld dat antibiotica het menselijk microbiome leidt tot dysbiosis kunnen verstoren, wat betekent dat een microbiële gemeenschap onbalans. Compositionele veranderingen microbiota na antibiotica is aangetoond dat de diversiteit van de gemeenschap te verlagen, verlagen belangrijke leden, en veranderen door metabolisme, met name in de darm ^{1, 2.} Antibioticum verstoring van de darm microbiome kan kolonisatieweerstand verminderen Clostridium difficile ^{3, 4} en ⁵ Salmonella.

D....

Protocol

Alle dierproeven werden uitgevoerd in het kader van de goedkeuring van IACUC protocollen, genummerd 14-05-05-1018-3-01, 13-04-29-1018-3-01 en 14-04-17-1018-3-01.

1. Dierlijke Collection, Handling, en ethische zorg

1. Verzamel Gambusia affinis uit het veld website (identificatie gids op http://www.sms.si.edu/irlspec/Gambusia_affinis.htm) met behulp van een kleine dip net en plaats in een 19 L emmers. Gebruik visuele inspectie om soorten te identificeren.
2. Rest vis voor 1-2 d in een emmer met vijverwater. Daarna overdracht vis in 76 of 189 L aquarium tanks gevuld met een half vijverwater / half kraanwater bij 25 ° C, belucht met een bo....

Resultaten

Een algemeen schema van het experimentele systeem om vis ontvangende effecten van antibiotica blootstelling ¹³ studie is weergegeven in figuur 1A en omvat de techniek voor het extraheren van de huid (Figuur 1B) en dierlijke (figuur 1C) microbiomes uit de vis. Drie dagen werd geselecteerd als het antibioticum periode van blootstelling omdat eerdere gegevens blijkt dat, terwijl de totale huid kweekbare aantal in het.......

Discussie

Sommige uitdagingen vereisen een rustperiode in schone APW na behandeling met antibiotica voor de drug te worden uitgeput in vis weefsels. Indien de rusttijd wordt overgeslagen dan antibioticum aanwezig kan verwarren de resultaten, vooral wanneer de bepaling omvat blootstelling aan bacteriën. Om de effecten van een veranderde microbiome samenstelling zonder grote veranderingen in het aantal microben op de host, voorlopige experimenten controle microbiome samenstelling (16S profiling of volledige genoomsequenties) en bev.......

Materialen

Lijst van materialen gebruikt in dit artikel

Naam	Bedrijf	Catalogusnummer	Opmerkingen
Rifampicin	Calbiochem	557303-1GM
Natriumnitraat	Sigma Aldrich	S5506
Fluoresceïne-gelabeld 70 kDa anionisch dextran	ThermoFisher Scientific	D1823
Fosfaat-gebufferde zoutoplossing (PBS) tabletten	Calbiochem	6500-OP	tabletten oplossen in water om PBS te maken