De zijpopulatie analyse maakt gebruik van het verbeterde vermogen van bepaalde cellen in een weefsel om de DNA bindende kleurstof Hoechst 33342 uit te vloeien als gevolg van hoge niveaus van de ATP bindende cassette (ABC) transporteur eiwitten op het celmembraan. De cellen die de Hoechst 33342-kleurstof uitstromen kunnen worden geïdentificeerd met behulp van dual-wavelengte-cytometrische analyse nadat de kleurstof opgewonden is door een UV-laser. Deze test werd eerst gebruikt om muizen hematopoietische stamcellen (HSCs) 1 te identificeren, maar is sindsdien gebruikt om stam- / stamcellenpopulaties in veel weefsels en kanker te identificeren (in referentie 2 onderzocht). Echter, niet alle populaties van cellen hebben een zijpopulatie, en niet alle zijpopulaties zijn verrijkt voor stam- / stamcellen.
De zebravis is een krachtig vertebrat genetisch model systeem voor het bestuderen van menselijke kanker 3 , 4 , met een aantal voordelen boven de traditionele murine moDelen van kanker. Zebravis embryo's zijn extern bevrucht en zijn optisch duidelijk, het faciliteren van transgenese en de in vivo waarneming van pathologische processen, waaronder kankerinitiatie en progressie. Tot op heden is de zijkampbevestiging om potentiële stam- of stamcellen te detecteren alleen toegepast op de niermerg in zebravis om HSC's te identificeren, en niet voor zebraviskankermodellen 5 , 6 .
Het zebravismodel van T-cel acute lymfoblastische leukemie (T-ALL) is morfologisch en genetisch vergelijkbaar met de menselijke T-ALL 7 , 8 , 11 . T-ALL is een agressieve maligniteit die bij mensen 10-15% van de pediatrische en 25% van de volwassen ALLE gevallen 9 vertegenwoordigt. Terwijl de behandeling van T-ALL is verbeterd, is de terugval nog steeds gebruikelijk en wordt er gepaard gegaan met een slechte prognose. T-ALL tumoren zijn heterogeenOus en bevatten veel verschillende tumorcel subpopulaties, waaronder leukemie initiatiefcellen (LIC's). LIC's worden gedefinieerd door hun vermogen om de gehele tumor van een enkele cel te hergroeien en de frequentie van LIC's binnen een tumorcelpopulatie kan worden berekend door verschillende celdoses in recipiënten te transplanteren via een limietverdunningstransplantatie-analyse (LDA). Terwijl LDA-experimenten zijn uitgevoerd in zebravis om de frequentie van LICs 8 , 10 , 11 te berekenen, wordt deze bepaling achteraf gemaakt en staat de toekomstige isolatie van LIC's niet toe. Daarom ontbreekt een methode voor het prospectief isoleren van een populatie verrijkt voor kankercellen. Het identificeren en isoleren van bevolkingscellen van zebravis T-ALL's is de eerste stap om deze tekort aan te pakken.
Het hier beschreven protocol beschrijft hoe T-ALL tumoren efficiënt kunnen worden genereerd in zebrVerdovende gebruik maken van tol2-gemedieerde transgenese, oogst de T-ALL tumorencellen, en vlek ze met Hoechst 33342 om de zijbevolking van cellen te identificeren. Toekomstige in vivo experimenten met zebravis T-ALL kunnen omvatten of de zijbevolkingscellen verrijkt zijn voor LIC's of andere stam- of stamvaderachtige eigenschappen hebben.