$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Kleine niet-codering-RNA's zijn belangrijke spelers in cellulaire genregulatie. Deze moleculen zijn samengesteld uit 20-25 nucleotiden die binden aan een specifiek doelmRNA, wat leidt tot de blokkering van de translatie of tot mRNA-afbraak 1 , 2 . Het genregulerende proces dat wordt uitgevoerd door kleine RNA's, zoals miRNA en siRNA, is een zeer geconserveerd mechanisme dat in veel verschillende soorten 3 is gevonden. In het bijzonder zijn miRNA moleculen van cruciaal belang voor een verscheidenheid aan fysiologische processen, waaronder proliferatie, differentiatie en regeneratie 4 , 5 . Daarnaast wordt de dysregulatie van miRNA expressie toegeschreven aan veel pathologische aandoeningen. Overeenkomstig is aangetoond dat miRNAs geschikt zijn als biomarkers voor diagnose en als therapeutische middelen voor gentherapie 6 , 7 .
Gap junctions (GJs) zijn gespecialiseerde eiwitstructuren in het plasmamembraan van twee aangrenzende cellen die de diffusieuitwisseling van moleculen met een molecuulgewicht van tot 1 kD mogelijk maken. Ze zijn aangetoond dat ze belangrijk zijn voor weefselontwikkeling, differentiatie, celdood en pathologische stoornissen zoals kanker of hart- en vaatziekten 8 , 9 , 10 . Verscheidene moleculen zijn beschreven om GJ kanalen te kunnen overschrijden, met inbegrip van ionen, metabolieten en nucleotiden. Interessant, werden ook GJs gevonden om een weg te geven voor de intercellulaire beweging van kleine RNA's 11 , 12 . Zo kunnen miRNAs niet alleen handelen in de cel waarin ze worden geproduceerd, maar ook binnen de ontvanger cellen. Dit wijst op de rol van miRNAs in het intercellulaire signaaltransductiesysteem. Tegelijkertijd tonen de gegevens aanDie kloof intercellulaire communicatie is nauw verbonden met de miRNA functie. Door de significante invloed van miRNA en GJ's op homeostase, pathologie en diagnose van het weefsel, zal een uitgebreid begrip van de functie van GJ's en de daarmee verband houdende intercellulaire dynamiek van miRNA de mechanismen van miRNA-gebaseerde aandoeningen verduidelijken en nieuwe strategieën ontwikkelen voor MiRNA therapieën.
Afhankelijk van de mate van gap junctionele koppeling kan de overdracht van miRNA moleculen tussen cellen een zeer snel proces zijn. Daarom is een methodologie die het visualiseren en kwantificeren van de snelle intercellulaire beweging van deze regulerende signaalmoleculen mogelijk maakt. In het algemeen zijn stromingscytometrie en moleculaire biologische technieken toegepast om de shuttling van kleine RNA's 11 , 12 , 13 , 14 aan te tonen . Echter, in tegenstelling tot FRAP microsKopiëren, deze benaderingen ontbreken hoge temporale resolutie, die verplicht is bij het analyseren van de uitwisseling van miRNA via GJs. Bovendien is FRAP microscopie minder invasieve en vertegenwoordigt daarom een krachtige en nieuwe live-cell imaging techniek om de GJ-afhankelijke uitwisseling van moleculen in verschillende celtypen 15 , 16 , 17 te evalueren.
Hier presenteren we een gedetailleerd protocol waarin de toepassing van 3D-FRAP wordt beschreven om miRNA shuttling tussen cardiomyocyten te beoordelen. Hiervoor werden cardiomyocyten getransfecteerd met fluorescent gelabelde miRNA. Een cel gemarkeerd met dit miRNA werd gefabriceerd, en de gap-junctionele miRNA re-instroom van aangrenzende cellen werd op tijdsafhankelijke wijze geregistreerd. De hoge temporale resolutie van FRAP-experimenten biedt de mogelijkheid kinetische studies uit te voeren voor de nauwkeurige evaluatie van de intercellulaire overdracht van miRNA en siRNA tussen levende cellen. MoreoVer, omdat kleine RNA's kunnen worden uitgewisseld via verschillende mechanismen met zeer verschillende kinetica, kan FRAP-microscopie bijdragen tot het verduidelijken van de mate waarin GJ's betrokken zijn bij de respectieve shuttling-processen 18 . Daarnaast kan 3D-FRAP worden gebruikt om fysiologische en pathologische veranderingen in GJ permeabiliteit te onderzoeken en de invloed ervan op kleine RNA transfer 15 , 19 .