$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
De patiënt verstrekte schriftelijke geïnformeerde toestemming en het project werd goedgekeurd door de ethische commissie van onderzoek van de Juntendo Universiteit faculteit geneeskunde. De muis experimenten werden ook goedgekeurd door het dier onderzoek ethisch comité van de Juntendo faculteit van geneeskunde.
1. oprichting van CRC PDXs in immunodeficiëntie muizen
Experimentele procedures voor de vaststelling van CRC PDXs (stap 1) worden beschreven in figuur 1A.
- Bereid het primaire CRC weefsel onmiddellijk na chirurgische resectie van de tumor van de patiënt.
- Wash de primaire CRC weefsel door zachte agitatie meerdere malen in 30 mL ijskoud steriele fosfaat gebufferde zoutoplossing (PBS) in een conische tube van 50 mL en bewaar deze op ijs.
- Plaats het weefsel op een 10 cm petrischaal met steriel pincet, verwijderen van necrotisch gebieden zo uitgebreid mogelijk met behulp van steriele schaar en de solide tumor weefsels op kleine stukjes (5 x 5 x 5 mm3 in grootte) gesneden met behulp van steriele Scheermesjes.
Opmerking: Necrotic gebieden zijn vaak meer brokkelige dan de omliggende gebieden, witter en zachter.
- Leg de kleine stukjes van de tumor met steriel pincet in 2 mL zuiver ijskoude steriel PBS op een plaat van 6-well.
- Fokken van 6 weken oude knik/Shi-scid IL2Rγ null (NOG) zeer immunodeficiëntie muizen voorwaarden kiem-gratis en specifieke pathogen-gratis.
- Anesthetize van de muizen met Isofluraan inhalatie met behulp van het kleine dierlijke inademing verdoving apparaat en desinfecteren van de huid met 70% ethanol. Verzekeren van het normale tarief en de diepte van de ademhaling en het ontbreken van een teen snuifje reflex voor juiste afstomping. Dierenarts zalf op de ogen is een optie, om te voorkomen dat oogbeschadigingen en/of droogheid terwijl onder verdoving.
- Alle chirurgische instrumenten met behulp van droge hitte sterilisatie steriliseren en vervolgens met deze hulpmiddelen voor alle procedures ter voorkoming van infecties van de wond in ontvangende muizen.
- Plaats de narcose muis in een liggend op de Bank laboratorium. Maak een kleine incisie op de onderste delen van de rechter en linker flank van de ontvangende muis voor het genereren van subcutane zakken voor weefsel implantatie met behulp van steriele schaar. Wees voorzichtig niet te doorprikken de peritoneale membraan. Moet er weinig bloeden met deze procedure.
- Voorzichtig Dompel het bovenstaande bereid tumor fragmenten in 50 µL van kunstmatige extracellulaire matrix en implantaat hen vervolgens in de onderste delen van de rechter en linker subcutane zakken.
- Sutuur (geologie) de incisie met wond clips in de muizen chirurgische ingrepen ondergaan. Zorg ervoor dat de tumor van de geïmplanteerde weefsels zich op enige afstand van de incisie onder de huid bevinden.
Opmerking: Overeenkomstig het minimaliseren van chirurgische ingrepen, geen behandelingen voor post chirurgische pijn en infectie werden toegediend in deze studie.
- Plaats de muis op een warme pad en de sternale ligfiets positie handhaven totdat voldoende bewustzijn is hersteld. Eenmaal volledig herstelde en kundig voor zitten op alle vier poten, kunnen de muizen worden teruggebracht naar hun huis kooien. Voorkom predatie en laat niet fokken met dieren niet bediende in de dezelfde kooi.
- Controleer op lekkage van de hechtdraad en bevestigen dat de muizen in stabiele toestand de volgende dag, in de chirurgisch behandelde groep. Controleer de muizen op tekenen van ziekte en meet de grootte van de tumor in elke muis, eenmaal per week, met remklauwen.
2. dissectie van CRC PDXs van muizen
Experimentele procedures voor dissectie van CRC PDXs (stap 2) worden beschreven in figuur 1B.
- Toestaan dat de tumor groeien subcutaan tot ~ 1 cm3 in grootte, die meestal ongeveer 1-3 maanden duurt.
- Anesthetize van de muis met Isofluraan inhalatie met behulp van het kleine dierlijke inademing verdoving apparaat en desinfecteren van de huid met 70% ethanol.
- Hiermee plaatst u de muisaanwijzer in een liggend op de Bank laboratorium. Incise van de huid, bloot van de tumor en zorgvuldig het loskoppelen van de huid van de tumor met behulp van steriele schaar. Na het verwijderen van de tumor, plaatst u deze op een 10 cm petrischaal en grove necrotische regio's verwijderen van de tumor, dan spoel tweemaal met 5 mL PBS.
Opmerking: Necrotic gebieden zijn vaak meer brokkelige dan de omliggende gebieden, witter en zachter.
-
Plaats van de tumor op ijs en gelijkelijk verdelen in ten minste 4 delen voor verschillende toepassingen, met inbegrip van 1) de CRC organoid cultuur, 2) transplantatie in secundaire muizen, 3) histopathologisch onderzoek en 4) invriezen en opslag van de fragmenten van de tumor.
- Voor de generatie van de CRC organoids, de solide tumor weefsel op een 6 cm petrischaal met 1 mL steriele PBS te plaatsen. Houd het weefsel op ijs totdat zij verwerkt (stap 3).
- Om vast te stellen het PDX-model voor menselijke CRC, passage de verse CRC PDXs in een secundaire muis. Snijd de tumor weefsel in kleine stukjes (5 x 5 x 5 mm3 formaat) met behulp van steriele scheermesjes en voorzichtig Dompel deze fragmenten weefsel in 50 µL van kunstmatige extracellulaire matrix. Vervolgens implantaat deze fragmenten in de onderste delen van de rechter en linker subcutane zakken van de muis NOG, zoals beschreven in stap 1.8 – 1.11.
- Voor histologisch analyse, bevestigen de monsters in 5 mL 10% neutraal gebufferde formaline in een conische tube van 15 mL bij kamertemperatuur voor 2 dagen.
- Voor cryopreservatie, snijd de tumor weefsel in kleine stukjes (5 x 5 x 5 mm3 in grootte) en voorzichtig Dompel de monsters in 500 µL van cel bevriezing oplossing in 1-1.5 mL cryovial buizen. Breng de buis naar een vriezer-80 ° C.
3. extractie van PDXs in de celsuspensie voor de CRC Organoid cultuur
Experimentele procedures voor dissociatie van CRC PDXs (stap 3) worden beschreven in figuur 1B.
- Plaats de bovenstaande (stap 2.4.1) bereid tumor fragmenten op een 10 cm petrischaal.
- Mince de fragmenten met behulp van steriele scheermesjes en ze vervolgens overbrengen naar een conische tube van 15 mL, met 8 mL 10% foetaal kalfsserum (FCS)-Dulbecco van bewerkt Eagle's Medium (DMEM) met 80 µL van collagenase enzym materieel (Zie Tabel van materialen).
- Sluit de buis strak en wikkel het GLB met parafilm ter voorkoming van lekkage. Om zich te distantiëren van de gehakt tumor fragmenten in de celsuspensie, doorroeren het zachtjes gedurende 2 uur bij 37 ° C. Er rekening mee dat er nog steeds vele fragmenten van onverteerd weefsel blijft in de buis.
- Centrifugeer de buis bij 300 x g gedurende 5 min bij 4 ° C en verwijder de bovendrijvende substantie. Lossen van de pellet van de cel met behulp van 10 mL 10% FCS-DMEM te maken van de celsuspensie.
- Filteren om te elimineren onverteerd weefsel puin, de celsuspensie tweemaal met behulp van de 40 µm cel zeef instellen op een conische buis van 50 mL. Vervolgens Centrifugeer de doorstroming bij 300 x g gedurende 5 min bij 4 ° C. Verwijder het supernatant en houd van de pellet op ijs.
4. generatie van de CRC Organoids gekweekt op kunstmatige extracellulaire Matrix
Experimentele procedures voor de CRC organoid cultuur van de dikke darm PDXs (stap 4) worden beschreven in figuur 1B.
- Stellen een kweekmedium geschikt voor het PDX-afgeleide CRC organoids (Zie Tabel van materialen, "de voedingsbodem van de CRC-organoid") dienst media eerder beschreven voor menselijke Colón organoids11.
- Breng 150 µL van kunstmatige extracellulaire matrix (Zie Tabel van materialen) per goed op een 12-well plaat op ijs en het vervolgens Incubeer gedurende 30-60 min. in een 37 ° C, 5% CO2 incubator te stollen de gels.
- Opschorten van de pellet van de cel uit stap 3.5 met het CRC organoid kweekmedium (uit stap 4.1) met 5% FCS tot aanpassing aan de 3 x 105 cellen/mL. Beënt vervolgens 1 mL van het medium op de kunstmatige extracellulaire matrix beklede plaat bereid in stap 4.2. en na een nacht bebroeden bij 37 ° C minder dan 5% CO2. Gebruik een hemocytometer voor het tellen van het aantal tumorcellen met inbegrip van afzonderlijke cellen en meercellige clusters (een groep van Adherente cellen) in de celsuspensie.
Opmerking: FCS van 5% wordt gebruikt voor het doven van de resterende enzymatische activiteit van collagenase in deze studie.
- Zorgvuldig verzamelen het kweekmedium, met inbegrip van zwevende cellen die hebben losgemaakt van de kunstmatige extracellulaire matrix beklede plaat, in een 1,5 mL Centrifugeer buis op de volgende dag samen en Centrifugeer het bij 1.400 x g gedurende 5 min. Vervolgens Verwijder het supernatant en resuspendeer de pellet in 70 µL van kunstmatige extracellulaire matrix op ijs.
- Het vergroten van de levensvatbaarheid van de cellen van de CRC, bedekken de tumor cel-bevattende kunstmatige extracellulaire matrix op de organoid van de tumor cellen gekoppeld aan de kunstmatige extracellulaire matrix beklede plaat en incubeer gedurende 30 min. in een 37 ° C, 5% CO2 incubator te stollen de kunstmatige extracellulaire matrix coating. Vervolgens, Incubeer het met 1 mL van het CRC organoid cel kweekmedium met 1% FCS bij 37 ° C onder 5% CO2.
- Wijzig het kweekmedium elke tweede dag. Zoals de CRC organoids het medium vullen, kan het nodig zijn om te veranderen het medium dagelijks geworden.
5. generatie en verrijking van GFP lentivirale deeltjes
Experimentele procedures voor generatie en verrijking van GFP lentivirale deeltjes (stap 5) worden beschreven in Figuur 1 c.
- HEK293T cellen met Roswell Park Memorial Instituut (RPMI) 1640 gemiddeld met 10% FCS cultuur en zes gerechten van 10 cm (2 x 106 cellen per schotel) voorbereiden op de volgende transfectie procedure.
- Voor Transfectie per schotel, bereiden 500 µL van het mengsel met inbegrip van 20 µL van het transfectiereagens in DMEM met een PRRL-GFP vector (5 µg)12 en twee lentivirale verpakking plasmiden, zoals pCMV-VSV-G (1 µg) en pCMV-dR8.2 dvpr (5 µg), in een steriele 1,5 mL microtube. Houd het mengsel bij kamertemperatuur gedurende 20 minuten en vervolgens bedekken op elk van de 10-cm schotels en hen Incubeer gedurende 18 h.
- Verwijderen van het medium, voeg 5 mL van vers 10% FCS-RPMI 1640 medium aan elk gerecht en laat staan gedurende 24 uur.
- Het geconditioneerde medium van elk gerecht in een tube van 50 mL centrifuge verzamelen en opslaan van een totaal van 30 mL van het medium bij 4 ° C's nachts. Voeg 5 mL van de verse RPMI 1640 op elk gerecht en laat staan gedurende 24 uur.
- Het geconditioneerde medium van elk gerecht in een tube van 50 mL centrifuge en blijven, in totaal, 30 mL van het medium op ijs verzamelen. Gooi vervolgens de cellen.
- 60 mL van het medium (uit stap 5.4-5.5) wordt gefiltreerd door een 0,45 µm filter te verwijderen van de cellen en deze hoeveelheid verdelen in twaalf 5 mL polypropyleen centrifuge buizen voor ultracentrifugatie.
- Te concentreren virus, centrifugeer ze met behulp van een swingende emmer rotor (Zie Tabel van materialen) 85,327 x g gedurende 1,5 uur bij 4 ° C.
- Onmiddellijk verwijderen van het medium. Voor het oplossen van de geconcentreerde virus pellet, plaats van 250 µL van de nutriënt Ham mengsel F-12 (F12) / DMEM medium zonder FCS in elk van de twaalf buizen en onderhouden bij 4 ° C's nachts. Merk op dat het virus pellet is vaak onzichtbaar.
- Pipetteer zachtjes het medium voor het verzamelen van 3 mL van de geconcentreerde 5 x GFP lentivirus voorraad, in totaal, vermoedelijk met inbegrip van de lentivirale deeltjes GFP met 10 transducing8 -eenheden per mL (TU/mL). Sla de twaalf 1,5 mL slangen (inclusief 250 µL per buis) onder steriele omstandigheden bij-80 ° C gedurende maximaal een jaar. Veel kleine porties van de oorspronkelijke oplossing om te voorkomen dat meerdere freeze-dooi cycli voor te bereiden.
6. etikettering van CRC Organoid cellen met GFP lentivirale deeltjes gekweekte op kunstmatige extracellulaire Matrix
Experimentele procedures voor de etikettering van de CRC organoid cellen met GFP lentivirus (stap 6) worden beschreven in Figuur 1 c.
- De CRC organoids bereid in stap 4.6 te groeien zonder interferentie voor 7-10 dagen en te oogsten hen mechanisch met behulp van een steriele cel schraper ze dan vervolgens overbrengen naar een 1,5 mL microtube toestaan.
Opmerking: De groei van CRC organoids in cultuur hangt af van de aard van de oorspronkelijke tumoren van patiënten. Vermijd overmatige groei van de CRC organoids, door hen bij 60-70% samenvloeiing voorafgaand aan de overdracht met een onderlinge splitsingsverhouding van 1:2, op een nieuwe kunstmatige extracellulaire matrix beklede 12-well bord.
- Centrifugeer het microtube gedurende 3 minuten op 1.400 x g, het kweekmedium verwijderen en oplossen van de cel pellet in 500 µL van PBS door zacht te onttrekken.
- Centrifugeer het microtube gedurende 3 minuten op 1.400 x g en elimineren van PBS.
- Om zich te distantiëren van het aanhangend CRC organoids, voeg 500 µL van een mobiele-detachement oplossing van Proteolytische en collagenolytic enzymen naar de cel pellet in de buis en meng het door zacht te onttrekken. Vervolgens laat de buizen te vestigen gedurende 10 minuten bij kamertemperatuur.
- Pipetteer heel voorzichtig de celsuspensie met een extra 500 µL van 1% FCS-DMEM meerdere malen in een 1,5 mL microtube aan ongeveer distantiëren van de cellen. Generatie van afzonderlijke cellen van de CRC organoids door harde pipetteren vermindert aanzienlijk levensvatbaarheid van de cellen. Het is dus essentieel om de massa van cellen visueel waarneembaar in de celsuspensie door heel zachtjes in een 1,5 mL microtube pipetteren.
- De celsuspensie gedurende 3 minuten op 1.400 x g centrifugeren en verwijder de bovendrijvende substantie.
- Lossen van de cel pellet met een mengsel van de 100 µL van 5 x GFP lentivirus voorraad (> 108 TU/mL) en 400 µL van de CRC organoid voedingsbodem in een 1,5 mL microtube door zacht te onttrekken aan te passen aan een concentratie van 5 x 10,5 losgekoppeld tumorcellen per 500 µL . Gebruik een hemocytometer voor het tellen van het aantal tumorcellen, met inbegrip van afzonderlijke cellen en groepen van cellen in de celsuspensie, zoals eerder beschreven (stap 4.3).
- Bereiden een kunstmatige extracellulaire matrix beklede 12-well plaat, zoals beschreven in stap 4.2. Vervolgens plaatst u 500 µL van de celsuspensie bereid in stap 6.7 op de plaat en laat het gedurende 18 uur bij 37 ° C onder 5% CO2.
- Het verzamelen van het medium met de zwevende cellen los van de kunstmatige extracellulaire matrix beklede plaat in een tube van 1,5 mL centrifugeren. Centrifugeer het bij 1.400 x g en vervolgens Verwijder het supernatant en resuspendeer de pellet in 70 µL van kunstmatige extracellulaire matrix op ijs.
- Het vergroten van de levensvatbaarheid van de cellen van de CRC, bedekken de tumor cel-bevattende kunstmatige extracellulaire matrix op de tumor organoids gekoppeld aan de kunstmatige extracellulaire matrix beklede 12-well plaat, zoals beschreven in stap 4.5. Volgende, Incubeer de plaat gedurende 30 min. in een 37 ° C, 5% CO2 incubator stollen de kunstmatige extracellulaire matrix coating en vervolgens cultuur het met 1 mL van het CRC organoid kweekmedium met 1% FCS bij 37 ° C onder 5% CO2.
- 3 dagen na infectie onder een fluorescentie Microscoop te bevestigen van bijna 100% GFP positiviteit als gevolg van het gebruik van een hoge titer van lentivirale deeltjes (Zie figuur 2A) de cellen worden nageleefd.
- Cultuur de CRC organoids voor periodes van 7-10 dagen uit te breiden van de celgroei vóór injectie in ontvangende muizen.
7. generatie van metastasen door GFP-geëtiketteerden CRC Organoids in ontvangende muizen
Experimentele procedures voor generatie van metastasen met behulp van het GFP-gelabelde CRC organoids (stap 7) worden beschreven in Figuur 1 c.
- Om zich te distantiëren van het GFP-geëtiketteerden CRC organoids in de celsuspensie, oogst hen mechanisch met behulp van een steriele cel schraper en ze vervolgens overbrengen naar een 1,5 mL microtube, zoals eerder beschreven (stap 6.1).
- Centrifugeer het microtube gedurende 3 minuten op 1.400 x g, het kweekmedium verwijderen en oplossen van de cel pellet in 500 µL van PBS door zacht te onttrekken.
- Centrifugeer het microtube gedurende 3 minuten op 1.400 x g en elimineren van PBS.
- Overlay 500 µL van de mobiele-detachement oplossing op de cel pellet in de buis en meng het door zacht te onttrekken. Vervolgens laat het mengsel gedurende 10 minuten bij kamertemperatuur enzymatisch verwerpen het aanhangend CRC organoids, zoals eerder beschreven (stap 6.4).
- Pipetteer heel voorzichtig de celsuspensie met een extra 500 µL van 1% FCS-DMEM meerdere malen in een 1,5 mL microtube aan ongeveer distantiëren van de cellen, zoals eerder beschreven (stap 6.5). Generatie van afzonderlijke cellen van de CRC organoids door harde pipetteren vermindert aanzienlijk levensvatbaarheid van de cellen. Dus, laat de massa van cellen visueel waarneembaar in de celsuspensie door heel zachtjes in een 1,5 mL microtube pipetteren.
- De celsuspensie gedurende 3 minuten op 1.400 x g centrifugeren en verwijder de bovendrijvende substantie.
-
Om een spontane metastase muismodel van CRC PDXs:
- Bereid een celsuspensie, met inbegrip van 5 x 105 cellen in 50 µL van PBS met 50% kunstmatige extracellulaire matrix per muis. De opschorting op ijs vóór gebruik te handhaven. Gebruik een hemocytometer voor het tellen van de kankercellen, zoals aangegeven in stap 4.3.
- Anesthetize van een muis met Isofluraan inhalatie met behulp van het kleine dierlijke inademing verdoving apparaat en desinfecteren van de huid met 70% ethanol, zoals aangegeven in stap 1.6.
- Plaats de muis NOG in een liggende positie op de laboratorium-Bank. Pak de rectale mucosa met een steriel pincet en trek het voorzichtig uit de anus. Vervolgens onmiddellijk het injecteren van de celsuspensie bereid in stap 7.7.1 in de rectale submucosa van de muis met een injectiespuit (Maat breinaald: 22 G). Routinematig, worden 4 – 6 muizen per groep gebruikt om de resultaten te evalueren.
-
Om een model van de experimentele metastase van CRC PDXs:
- Bereid een celsuspensie van de CRC organoid met inbegrip van 4 x 104 cellen in 50 µL van PBS per muis. De opschorting op ijs vóór gebruik te handhaven. Gebruik een hemocytometer voor het tellen van de kankercellen (stap 4.3).
- Anesthetize van een muis met Isofluraan inhalatie met behulp van het kleine dierlijke inademing verdoving apparaat en desinfecteren van de huid met 70% ethanol, zoals aangegeven in stap 1.6.
- Plaats de narcose NOG muis in een liggend op de Bank laboratorium. Maken een kleine snede in het onderste gedeelte van de linkerflank en dan snijd het buikvlies om zorgvuldig de milt met behulp van steriele schaar en pincet bloot te stellen. Begrijpen van het vetweefsel, gekoppeld aan de milt met een steriel pincet en langzaam 50 µL van de celsuspensie (opgesteld zoals hierboven, stap 8.1) te injecteren in de milt. Er zeker van zijn dat de celsuspensie op passende wijze wordt geïnjecteerd zonder uiterlijke lekkage, van de milt. Routinematig, worden 4 muizen per groep gebruikt om de resultaten te evalueren.
- Plaats alle muizen op een warme pad na de operatie en een sternale ligfiets positie handhaven totdat voldoende bewustzijn is hersteld, zoals beschreven in stap 1.11. Zodra de muizen hebben volledig hersteld, terugsturen naar hun thuis kooien. Voorkom predatie en laat niet fokken met dieren niet bediende in de dezelfde kooi.
- Sutuur (geologie) lekkage controleren en te bevestigen dat de muizen in leven, in de chirurgisch behandelde groep, de volgende dag zijn. Controleer de muizen op tekenen van ziekte en maatregel tumor maten, remklauwen, in alle muizen eenmaal per week in dienst.
- Observeren muizen om spontane metastase (voor periodes van maximaal 2,5 maanden) en experimentele metastase (1 maand) te detecteren na injectie.
- Offeren de muizen via de narcose en cervicale dislocatie op de aangegeven dagen. Ontleden primaire tumoren en verschillende weefsels, met inbegrip van de lever en de longen. Plaats de ontleed tumoren en organen in 5 mL ijskoud PBS op een 10 cm petrischaal en sla deze op het ijs.
- U wilt opsporen GFP-positieve CRC organoid cellen, observeren de ontleed weefsels onder een stereo-fluorescentie Microscoop. Verwerven van beelden met een CCD-camera en voor te bereiden met behulp van standaard beeldverwerking software.