De sample collectie werd goedgekeurd door de Universiteit van Pittsburgh institutionele Review Board (IRB # PRO16060443, PRO10110387). Alle experimenten worden uitgevoerd onder een kast met de juiste persoonlijke beschermingsmiddelen bioveiligheid.
1. apparaat fabricage en zachte lithografie
Opmerking: Standaard zachte lithografie technieken15,16 werden gebruikt voor het maken van de microchannel Polydimethylsiloxaan (PDMS).
- Meng de PDMS voorloper in een verhouding 10:1 voor basis en genezen agent.
- Giet 30 g van het PDMS voorloper mengsel op de micro-gefreesd aluminium mal (Zie Figuur 1 voor afmetingen) en 20 g van het PDMS voorloper mengsel over de 100 mm petrischaal.
Opmerking: De petrischaal wordt gebruikt voor het maken van de dikke film voor PDMS (~ 3 mm) voor de ondersteunende laag. De ondersteunende laag van PDMS biedt uniforme fysieke oppervlakte-eigenschappen in de microfluidics. U kunt ook kan een dunne film van het PDMS op het glasplaatje worden gebruikt. De meester mal met specifiek kanaal afmetingen is ontworpen en gefabriceerd door micro-frezen op het blad aluminium. De spiraal-kanaal dat wordt gebruikt in deze studie werd een 8-lus spiraal microchannel met één ingang en twee uitgangen, met de straal steeg van 8 mm tot 24 mm voor efficiënte formaat gebaseerde scheiding.
- Plaats de schimmel en de petrischaal in een vacuüm exsiccator tot ontgas zolang geen luchtbellen niet zichtbaar op het oppervlak, meestal 5 tot 10 minuten gebruik een huis-vacuüm voor de exsiccator zijn.
- Laat het vacuüm en de schimmel en de petrischaal plaats in een oven van 90 ° C gedurende 1 uur.
Opmerking: Een kookplaat of andere verwarming hulpmiddelen kunnen worden gebruikt in plaats van een oven.
- Verwijder de schimmel en de petrischaal uit de oven en laat ze afkoelen bij kamertemperatuur gedurende 10 minuten.
- Zorgvuldig uitgesneden van de omtrek en de vloeistof toegang gaten op het apparaat met behulp van een 2 mm perforatie punch.
Opmerking: De grootte van de stoot kan variëren afhankelijk van de grootte van de buizen of vloeibare gids.
- Houden van een tape naar de kant van het kanaal van het apparaat en dikke film voor PDMS en schil zorgvuldig met een tang om stof te verwijderen.
- Behandelen zowel de kanaal kant van het apparaat en de gewone PDMS met lucht plasma en band met de bereid ondersteunende laag van gewone PDMS (figuur 1A).
- Plaatsen van een chip op het glasplaatje 50 x 70 mm en plaats deze in een oven van 70 ° C voor minstens 30 min ter verbetering van de sterkte van de binding.
2. De tracheale secretie collectie van mechanisch geventileerde patiënten
Opmerking: Tracheale afscheidingen kunnen worden verkregen bij mechanisch geventileerde patiënten tijdens normale routine airway zorg met behulp van een protocol aangepast ten opzichte van conventionele methodes om de standaard, volwassen geventileerde patiënt tegemoet te komen. Monsters waren-geïdentificeerd en onmiddellijk worden teruggestuurd voor verwerking.
- Als tracheale aspiratie wordt vermeld, gebruikt u een katheter uitpakken airway afscheidingen.
- Vooraf de katheter zorgvuldig halverwege in de Endotracheale tube en 5 mL van de steriele normale zoutoplossing 0,9% van een vooraf ingevulde 10 mL spuit inboezemen.
- Wanneer de katheter is volledig gevorderd of weerstand wordt voldaan, de afscheidingen gecombineerd en verzamelen in een steriele sputum collectie container.
- 10 mL van de tracheale afscheidingen in een steriele sputum container verzamelen en plaats deze op het ijs. Verzenden van monsters onmiddellijk voor verwerking.
3. De tracheale secretie monstervoorbereiding
Opmerking: Alle experimenten moeten worden uitgevoerd onder een kast met de juiste persoonlijke beschermingsmiddelen bioveiligheid.
- 1 mL van de luchtweg secretie monsters in 9 mL-fosfaatgebufferde zoutoplossing (PBS) met behulp van een kunststof 10 mL spuit (voor een 10 x verdunning) verspreiden. Gebruik een botte pipet te homogeniseren van het slijm monster.
- Stam de verdunningsmiddel met een 40 µm nylon cel zeef grote brokken of bloedstolsels, die de microfluidics toegang gat of het kanaal blokkeren kan te verwijderen. Leg het monster op het ijs na verwerking.
- Verspreiden de verdunningsmiddel van elk monster met behulp van een 100 x volume van PBS buffer, wat resulteert in een 1.000 x verdunde schorsing. Leg het monster op het ijs tijdens het gehele dissociatie.
4. experimentele opstelling
Opmerking: Alle experimenten moeten worden uitgevoerd onder een kast met de juiste persoonlijke beschermingsmiddelen bioveiligheid.
- Monteer de PDMS chip met de vloeistof gids voor uniforme stroming toepassen op elk van de vier spiraal microchannels (figuur 1B).
Opmerking: Vier kanalen werden gebruikt om de doorvoer te verhogen door paralellisatie, alsmede de optimalisatie van de dichtheid van het volume en de cel van de resulterende schorsing. De vloeistof gids is ontworpen en gemaakt met een stereolithography type 3D-printer met heldere hars. De inlaat en de uitlaat-poort van de vloeistof gids gebruiken vrouwelijke Luer-aansluitingen voor het gemak van de verbinding en stabiele afdichting tijdens de operatie.
- Sluit een 1/16-inch male Luer connector aan de inlaat, het innerlijke stopcontact (IW) en de buitenmuur (OW) retourzijde van de vloeistof gids en een silicone slangen tot de schorsing van de steekproef.
- Invoegen van botte tips aan elk uiteinde van de inlaat- en uitlaatopeningen te bereiken van de bodem van het reservoir van de steekproef.
- Sluit de peristaltische pomp met de inlaat buis.
- Plaats van het einde van de inlaat buizen en IW uitlaat slang in het monster reservoir en plaats het einde van de OW uitlaat slang in het afval reservoir (Figuur 1 c, D).
- Plaats de tube 50 mL van gefilterde PBS zonder calcium en magnesium aan het monster reservoir.
- Beginnen met pompen in een laag debiet (~ 1 mL/min) naar het apparaat prime.
Opmerking: Wanneer bubbels worden vastgelegd in het kanaal, druk op de top van het kanaal met de pincetten te destabiliseren en te elimineren luchtbellen. Wanneer het apparaat is volledig gevuld met bufferoplossing, wijzigen de PBS buis ter voorbereiding van de luchtweg secretie monsterbuisje.
- Wanneer het monster wordt geplaatst in het reservoir van de steekproef, zet de peristaltische pomp en het debiet vastgesteldop 4 mL/min (Figuur 1 c, D).
- Wanneer het monstervolume bereikt het aangewezen volume (~ 1 mL), de operatie stoppen en koppel de Siliconen slang.
Opmerking: De voorgestelde methode is efficiënter om een grote hoeveelheid oplosmiddel (> 50 mL) tot een micro-centrifuge buis volume (~ 1 mL) (Figuur 2).
5. Stroom Cytometry analyse
Opmerking: Om te vergelijken de dissociatie-methoden (microfluidics en lysis), stroom cytometry met immunofluorescentie werd gebruikt.
- Voeg fluoresceïne-isothiocyanaat (FITC) - geconjugeerd muis anti-menselijke CD66b monoklonaal antilichaam en allophycocyanin (APC) - geconjugeerd muis anti-menselijke CD45 monoklonaal antilichaam aan de initiële schorsingen (stap 3.3) en de resulterende schorsingen (stap 4.9) (200 µL van elke antilichaam) in een verhouding van 1:25 v/v.
- Incubeer de monsters bij 4 ° C in het donker gedurende 30 minuten.
- Het analyseren van beide monsters op een cytometer van de stroom te kwantificeren van de PMNs.
Opmerking: De bevolking thats FITC-APC dubbele positief, CD66b positieve en CD45 positief werd beschouwd als neutrofiele granulocyten. Herstel werd berekend door de verhouding van de cel totaal getallen voor de input en de resulterende schorsing.
6. NE Release analyse
Opmerking: Als u wilt vergelijken de functionaliteit van de geïsoleerde neutrofiele door de microfluidics en de lysis methode, een NE assay kit werd gebruikt.
- PMA (meegeleverd in de kit assay) toevoegen aan elke resulterende schorsing (verkregen bij stap 4.9) om een eindconcentratie van 50 nM.
- Incubeer de monsters bij 37 ° C gedurende 2 uur.
- Centrifugeer de schorsingen bij 300 x g gedurende 10 minuten.
- 10 µL van elke supernatans overbrengen in een 96-wells-plaat (waarin de assay kit).
Opmerking: Een 96-Wells-microplate met een vlakke bodem en een zwarte polystyreen kan ook worden gebruikt.
- Voeg 90 µL van verdunde assay buffer (meegeleverd in de kit assay) toe aan elk putje.
- Voeg 10 µL van het elastase substraat (Z-Ala-Ala-Ala-Ala 2Rh110, waarin de assay kit).
- Incubeer gedurende 1,5 uur bij 37 ° C.
- Lees de 96-wells-plaat met behulp van een Fluorimeter bij een golflengte van de excitatie van 485 nm en een golflengte van de emissie van 525 nm.
Opmerking: Het niveau van NE werd gedeeld door de PMN-graaf van de stroom cytometry analyse.