Hier presenteren we een gedetailleerd protocol voor een cel-gebaseerde contractility assay met behulp van een Drosophila weefselkweek cellijn (S2R + cellen), die niet-spier myosin II vernauwing als reactie op de mist ondergaat signalering. Deze test is nuttig voor het onderzoeken van de mist weg, evenals de mechanismen die regelen niet-spier myosin II contractility.
Cel-kweken overwegingen:
De voorwaarden onder welke S2R + cellen worden onderhouden is cruciaal voor het bereiken van betrouwbare gegevens uit deze test. Bij de planning voor het uitvoeren van de bepaling van de contractility, het beste om S2R + cellen in Shield en zong M3 insect medium. Terwijl S2R + cellen in andere insecten cel-cultuur-media gedijen kunnen (bijvoorbeeldSF900 of Schneiders insect medium), zij vaak verliezen hun reactievermogen op mist. S2R + cellen met een hoge passage nummer, over het algemeen meer dan 20-25 passages, beginnen te verliezen van gevoeligheid aan RNAi. Het is best om vroeg-passage cellen gebruiken voor alle experimenten. Een ander belangrijk aspect RNAi uitputting experimenten is het kiezen van passende controles. Gemeenschappelijke negatieve controles omvatten dsRNA targeting EGFP of pBlueScript, noch van die homologie aan het vliegen genoom hebben. Gericht op eiwitten in de mist-traject (Rho, Rok, enz.), die als verarmd, te voorkomen dat de activering van niet-spier myosin contractility, zijn ook nuttig besturingselementen. S2:Fog-Myc cellen kunnen worden gehandhaafd in een kweekmedium alternatieve cel zoals SF900 aangevuld met 100 eenheden/mL penicilline, 100 µg/mL streptomycine, en 0,25 amfotericine B. opmerking dat FBS is niet verplicht bij het kweken van cellen in de SF900. Celdichtheid is ook een essentieel onderdeel voor alle aspecten van Drosophila weefselkweek cellen. In tegenstelling tot zoogdieren weefselkweek cellen, Drosophila-afgeleide weefselkweek cellen gedijen beste onder hogere dichtheden van de cel (dichtheden niet lager zijn dan 5 x 105 cellen/mL). Bij het uitvoeren van deze test, is het echter kritiek dat de cellen niet zijn verguld op con-A-coated glassbottom gerechten boven 80% samenvloeiing, zoals de kwantificering van de gecontracteerde versus niet-gecontracteerde cellen uiterst vervelend wordt.
Kritieke aspecten en alternatieve benaderingen van de cellulaire Contractility-test:
De productie van mist, de ligand die als trigger niet-spier myosin II contractility fungeert, is een essentieel onderdeel van deze test. Het mist gen codeert een eiwit van 730 aminozuren met een voorspelde molecuulgewicht van ~ 78 kDa26. Hydropathy analyse bleek een stuk van 12 hydrofobe residuen in mist de amino-terminus die als een reeks secretie signaal functioneren kon. Bovendien, bevat de codering reeks ook meerdere sites voor potentiële N - en O-gebonden glycosylatie, verder suggereren dat mist is een secreted eiwit26. Ter ondersteuning van dit, was de mist gelokaliseerd op secretoire blaasjes in vermoedelijke epidermale cellen ondergaan apicale vernauwing16. Mist-Myc expressie was geïnduceerd na toevoeging van kopersulfaat aan het medium en antilichamen tegen mist of Myc herkend een 150-kD eiwit uit kweekmedium geoogst uit geïnduceerde culturen maar niet van geïnduceerde media uit S2 cellen ontbreken de mist-Myc constructie. Deze moleculair gewicht was hoger dan de voorspelde 80-kD molecuulgewicht van mist en suggereert dat de secretoire machines van S2 cellen kan glycosylate het eiwit vóór exocytose. Vanwege de potentiële variabiliteit in mist zuivering is het raadzaam te gebruiken dezelfde batch van mist-geconditioneerd media voor alle experimenten. Maken van grote hoeveelheden van geconcentreerde mist-Myc media zal helpen bij het handhaven van de consistentie in de gehele rondes van experimenten.
Het succes van deze test is ook afhankelijk van vertrouwen die de cellen die vernauwing hebben ondergaan aangeeft. Terwijl vernauwde cellen kunnen worden waargenomen door fluorescentie microscopie, door kleuring voor actine of niet-spier myosin II, is de meest betrouwbare manier voor het identificeren en kwantificeren van vernauwde cellen door fase contrast of DIC microscopie. Nauwkeurige graven kunnen worden bereikt met behulp van 20 X - 40 X vergroting op de meeste standaard lichte microscopen. Hoewel het protocol geschreven hier glassbottom gerechten gebruikt, kan ook de bepaling worden uitgevoerd met behulp van standaard 1.5 glas coverslips bekleed met con-A. De toevoeging van mist kan worden gedaan in 35 mm voor weefselkweek op een dekglaasje aan geplaatst op parafilm, ter beperking van het bedrag van de mist gebruikt voor elke assay. De kwaliteit van fixatie is een essentieel onderdeel van de bepaling, zoals slecht vaste cellen tot valse positieven leiden kunnen. Met behulp van verse fixatie oplossing en ervoor zorgen dat zal de cellen nooit droog eenmaal vaste leiden tot meer betrouwbare resultaten. Tot slot is het belangrijk om te tellen van een groot aantal cellen. Meestal, slechts 30% - 50% van onbehandeld of besturingselement RNAi-behandelde cellen samentrekken na de perfusie van mist. Er is echter een basale niveau van vernauwing dat zich in S2R + cellen, voordoet zodat een groot aantal cellen is nodig om ervoor te zorgen dat elke wijziging in de Fractie van vernauwde cellen is te wijten aan behandelingen. Bovendien, de uitputting van bepaalde eiwitten die betrokken zijn bij de regulering van niet-spier myosin II contractility kan leiden tot hyper-contractility, zelfs in de afwezigheid van mist. De hier gepresenteerde gegevens is meer dan 3600 cellen die werden geteld in drie opeenvolgende RNAi behandelingen met de dezelfde batch van mist-geconditioneerd media.
Toepassingen van de cellulaire Contractility bepaling:
Deze contractility assay, wanneer in combinatie met RNAi screeningmethoden, biedt een krachtig systeem om te studeren cel signalering, genuitdrukking en cellulaire contractility. Eerder, is het gebruikt om te identificeren tot twee mist co receptoren21. Een gerichte scherm van 138 G-proteïne-gekoppelde receptoren (GPCRs) is uitgeput door RNAi in S2R + cellen, en zijn vermogen om te reageren op mist was bepaald zoals beschreven in het protocol hier gepresenteerd. Van de 138 GPCRs, een honkslag, werd eerder genfunctieonderzoek gen, nu bekend als Mist, ontdekt. Verder onderzoek naar de functie van Mist aangetoond dat niet alleen was het nodig voor mist-geïnduceerde cellulaire contractility in S2R + cellen, maar het was ook essentieel voor gastrulatie bij de ontwikkeling van Drosophila21. Bovendien, deze bepaling werd gebruikt om aan te tonen dat Ric-8, een niet-canonieke GEF, is ook een component in de mist signalering traject27. Een reeks Epistasie RNAi experimenten in combinatie met de bepaling van de contractility aangetoond dat Ric-8 met de Gα12/13 subeenheid Cta en functies omgaat te lokaliseren het binnen de cel, die essentieel zijn voor mist-geïnduceerde cellulaire contractility31 .
Drosophila weefselkweek is zeer geschikt voor beginners, zoals de cellen gemakkelijk te op kamertemperatuur onderhouden zijn, geen CO2 vereisen of gebufferd cel kweekmedium en robuust zijn, zolang juiste cel cultuur dichtheden worden gehandhaafd. De cellulaire contractility assay werd met succes uitgevoerd door het laboratorium deel van een undergraduate cel biologie cursus, waar de studenten had weinig tot geen ervaring met kweken cellen of microscopie. De bepaling van de cellulaire contractility hier gepresenteerd staat voor een krachtige, cel-gebaseerde hulpmiddel dat kan worden ingezet in de ontdekking van het gen, of om te ondervragen de mist signalering traject, ontwikkelings processen, zoals apicale vernauwing helpt ons om beter te begrijpen en niet-spier myosin II contractility, in het algemeen.