Het doel van dit protocol is bedoeld als een stapsgewijze handleiding om uit te voeren van de experimenten van de 3-D "lever-on-a-chip" infectie met het hepatitis B-virus.
Methodenartikel
Het doel van dit protocol is bedoeld als een stapsgewijze handleiding om uit te voeren van de experimenten van de 3-D "lever-on-a-chip" infectie met het hepatitis B-virus.
Ondanks de uitzonderlijke infectiviteit van het hepatitis B-virus (HBV) in vivo, waar slechts drie virale genoom in een chroniciteit van experimenteel geïnfecteerde chimpansees resulteren kunnen, vereisen meest in vitro modellen verschillende honderden tot duizenden virale genoom per cel in om te beginnen een voorbijgaande infectie. Bovendien kunnen statische 2D culturen van primaire menselijke hepatocyten (PHH) alleen op korte termijn studies als gevolg van hun snelle dedifferentiation. Hier beschrijven we 3D lever-on-a-chip culturen van PHH, monoculturen of in cocultures met andere cellen van de lever-ingezetene nonparenchymal. Deze bieden een significante verbetering aan het bestuderen van langdurige HBV infecties met fysiologische host cel reacties. Naast het vergemakkelijken van de drug werkzaamheid studies, toxicologische analyse en onderzoek naar pathogenese, inschakelen deze microfluidic cultuur systemen de evaluatie van genezende therapieën voor HBV-infectie ter opheffing van covalent gesloten, circulaire (ccc) DNA. Dit gepresenteerd methode beschrijft de set-up van PHH monoculturen en co celculturen PHH/Kupffer, hun infectie met gezuiverde HBV en de analyse van de antwoorden van de gastheer. Deze methode geldt met name voor de evaluatie van de effecten op lange termijn van HBV-infectie behandeling combinaties en pathogenese.
De studie van HBV is door de slechte gevoeligheid van cultuur systemen, waarvoor honderden tot duizenden HBV genoom kopieën per cel tot de infectie1is ingewikkeld. Bovendien, primaire menselijke hepatocyten zijn over het algemeen bijzonder kwetsbaar en snel dedifferentiate tijdens conventionele culturen2. Dit is voornamelijk te wijten aan het feit dat de vlakke en harde kunststof oppervlakken niet na te de natuurlijke extracellulaire omgevingen binnen de lever en het algemene gebrek aan oxygenatie van de culturen in de afwezigheid van microfluidic circulatie gevonden bootsen doen. Conventionele statische hepatocyte culturen op collageen beklede platen snel dedifferentiate en verliezen hun gevoeligheid voor HBV-infectie3. Hier beschrijven we de set-up en besmetting van PHH gegroeid in 3D lever-on-a-chip culturen, die enorm voordelig voorbij conventionele 2D statische PHH culturen op collageen beklede platen als gevolg van hun uitgebreide metabole en functionele bevoegdheid zijn, te vergemakkelijken op lange termijn culturen van ten minste 40 dagen4. In dit systeem worden PHH overgeënt op collageen beklede steigers, die voortdurend zijn geperfundeerd met groeimedium voor de levering van zuurstof en voedingsstoffen naar de cellen. Hoewel alternatieve cultuur systemen voor PHH gebaseerd op complexe cocultures van lymfkliertest fibroblasten of 3D groei in spheroïden zijn gevalideerd en vatbaar zijn voor HBV-infectie met behulp van multipliciteit van infectie van 500 genoom equivalenten (GE) van HBV per cel, 3D lever-on-a-chip culturen blijven de enige in vitro modelsysteem die vatbaar zijn voor 0.05 GE van HBV per cel4. Dit wordt bovendien ondersteund door de noodzaak van het gebruik van hoge concentraties van dimethylsulfoxide (DMSO) en polyethyleenglycol (PEG) om vast te stellen van de HBV-infectie in deze culturen, die is overbodig voor de infectie van 3D lever-on-a-chip cultuur systemen 4. onder de belangrijke kenmerken van HBV-infectie is het zwembad van cccDNA, die als de transcriptionele sjabloon voor alle de novo-geproduceerd virionen5,6 fungeert. Hoewel cccDNA kan worden opgespoord in conventionele hepatocyte culturen7,8, het blijft onduidelijk of de regulering van cccDNA en eventuele therapeutische benaderingen, gericht op de afschaffing zijn gerecapituleerd gedeeltelijk of volledig dedifferentiated hepatocyten. We hebben aangetoond dat cccDNA functioneel wordt gevormd in 3D lever-on-a-chip culturen, reageert op fysiologische stimuli, en kan worden gericht door te interfereren met de toegankelijkheid van de transcriptionele machine de cccDNA genoom4.
Host-Reacties op HBV-infectie in 3D lever-on-a-chip mimic die bij HBV-geïnfecteerde patiënten waargenomen, zodat de identificatie van biomarkers voor infectie, evenals therapeutisch succes. Onder de unieke kenmerken van de culturen van de lever-on-a-chip is de mogelijkheid om op lange termijn host reacties tussen PHH en andere cellen van de nonparenchymal binnen de lever, met inbegrip van Kupffer cellen4Notti cellen9en lever sinusvormige evalueren endotheliale cellen10,11. Dit biedt de unieke kans om te evalueren van de cel/interacties in een complexe 3D communicatie.
De periode van de uitgebreide cultuur van dit platform vergemakkelijkt bovendien de beoordeling van de sequentiële drug behandelingen en hun impact op HBV persistentie, die niet mogelijk met behulp van conventionele hepatocyte cultuur systemen.
Dit protocol beschrijft hoe 3D-lever-on-a-chip culturen worden gegenereerd, monocultuur van PHH of voor cocultures van PHH met Kupffer cellen. Daarnaast beschrijven we de productie van gezuiverde HBV voor lage-multipliciteit-van-infectie studies, evenals de daaropvolgende analyse van host en virale reacties.
1. assemblage- en evenwichtsinstelling van platen
2. ontdooien en zaaien van hepatocyten voor monoculturen
3. ontdooien en zaaien van Kupffer cellen en hepatocyten voor co culturen
4. productie van een infectueus Hepatitis B-Virus voor infectie Studies
5. infectie van 3D culturen met HBV
6. kwantificering van extracellulaire HBV-DNA
7. kwantificering van intracellulaire HBV Pregenomic (pg) RNA
8. immunofluorescentie kleuring van virusantigeen
9. menselijke albumine ELISA
10. Interleukine (IL) 6 en Tumor necrose factoren (TNF) α productie in 3D co culturen
Beschrijven we een eenvoudig en veelzijdig platform voor de langetermijnkweek van primaire menselijke cellen van de Kupffer en/of hepatocyten en hun infectie met HBV. Primaire menselijke cellen worden overgeënt op collageen beklede polystyreen steigers binnen een microfluidic plaat vergadering, die voortdurend het perfuses van de cellen met groeimedium (Figuur 1a).
PHH, die meestal alleen stabiel voor een beperkte hoeveelheid tijd in conventionele cultuur systemen, kan functioneel worden gehandhaafd voor langere tijd. Menselijke albumine, die is afgescheiden door functionele hepatocyten en wordt beschouwd als de beste teller voor de evaluatie van hepatische metabolisme, is stabiel en sterk uitgedrukt door 3D culturen tot dag 40 na zaaien (Figuur 2). Voor cocultures, kunnen Kupffer cel functionaliteit en levensvatbaarheid worden geëvalueerd door de afscheiding van bepaalde cytokinen (bijvoorbeeld IL6 en TNFα). Voor het meten van cytokine productie, verdient het gebruik van vangst gebaseerde detectie technieken op LPS-stimulatie van de cocultures (Figuur 3).
Cellen vormen hepatische microtissues, meestal binnen 3 dagen na het zaaien van PHH, demonstreren van functionele gal canaliculi en volledige cel polarisatie (Figuur 2). Naast het behoud van hun fysiologische cellulaire metabolisme, worden deze culturen uitzonderlijk vatbaar voor HBV-infectie. HBV-DNA en andere virale markers, in tegenstelling tot andere systemen van cultuur, worden gemakkelijk opspoorbaar vanaf dag 2 na infectie (Figuur 4). Naast secreted markers van virale infectie, hepatocyte-bevattende steigers kunnen worden opgehaald van de culturen en gebruikt voor de immunofluorescentie opsporing van virale antigenen (bijvoorbeeld, HBsAg, HBcAg) (Figuur 4). Waar conventionele hepatocyte culturen vereisen inoculatie met ten minste 500 HBV GE per cel en de toevoeging van 2% DMSO en 4% PEG, zo weinig als 0,05 HBV GE zijn kunnen initiëren infectie in 3D-culturen zonder de eis van DMSO of PEG (Figuur 4).

Figuur 1: opzet van 3D-lever-on-a-chip culturen. (een) Dit is een schematische lay-out voor de montage van de cultuur-plaat met het oog op de oprichting van microfluidic verkeer. (b) dit paneel toont een vergrote weergave van de putten van de cultuur, met inbegrip van het filtreerpapier, steiger en borgring. (c) dit paneel toont het proces van plaat evenwichtsinstelling vóór het zaaien van de culturen. De volgende twee panelen tonen het proces van zaaien voor (d) hepatocyte monoculturen en (e) hepatocyte/Kupffer-cel cocultures. (f) dit paneel toont de stappen wassen die betrokken zijn bij de middellange wijzigingen. (g) dit paneel toont de HBV-infectie set-up, met inbegrip van de verwijdering van entmateriaal. S.M. = seeding medium, M.M. = onderhoud medium. Klik hier voor een grotere versie van dit cijfer.

Figuur 2: vorming en hepatocyte levensvatbaarheid van hepatische microtissue. (een) dit paneel toont longitudinale helderveld beelden van 3D hepatocyte monoculturen demonstreren microtissue formatie na zaaien. (b) dit paneel toont immunofluorescentie beeldvorming van culturen voor kernen (blauw) en menselijke albumine (groen). (c) dit paneel toont longitudinale totale albumine, evenals per cel aangepast albumine productie, gedurende 40 dagen van hepatocyte monoculturen, zoals bepaald door ELISA. De gegevens zijn gemiddelde ± SD. Dit percentage is aangepast van Ortega-Prieto et al.4. Klik hier voor een grotere versie van dit cijfer.

Figuur 3: Kupffer cel functionaliteit in de 3D-cocultures. Deze panelen tonen de secretie van (een) IL6 en (b) TNFα in hepatocyte monoculturen en hepatocyte/Kupffer cel 11 dagen na zaaien in reactie op exogenously toegevoegde LPS op dag 9 post zaaien, zoals bepaald met behulp van menselijke magnetische cocultures Luminex assay. Dit percentage is aangepast van Ortega-Prieto et al.4. Klik hier voor een grotere versie van dit cijfer.

Figuur 4: HBV-infectie in de lever-on-a-chip culturen. (een) dit paneel toont de immunofluorescentie microscopie detectie van HBcAg (rood), HBsAg (groen) en kernen (blauw) 10 dagen na de infectie van de culturen met HBV. (b) dit paneel toont de gevoeligheid van de culturen voor HBV-infectie met behulp van verschillende multipliciteit van infectie, zoals bepaald door een kwantificering van HBV-DNA in het supernatant van cultuur. (c) dit paneel toont de kwantificering van de longitudinale accumulatie van HBV pgRNA ten opzichte van het huishouden gen RPS11. De gegevens zijn gemiddelde ± SD. Dit percentage is aangepast van Ortega-Prieto et al.4. Klik hier voor een grotere versie van dit cijfer.
De uitdagingen bij het handhaven van langdurige culturen van PHH verdreven de ontwikkeling van verschillende cultuur modellen met verbeterde functionaliteit en levensduur, elk exposeren differentiële voor- en nadelen. Het wordt nu algemeen erkend dat statische 2D culturen van PHH zijn het nabootsen van bepaalde aspecten van de hepatocyte biologie voor zeer beperkte hoeveelheid tijd. Zo micropatterned12,13, sferoïde culturen14,15, cocultures en 3D lever-on-a-chip culturen16,17 zijn snel ter vervanging van deze meer basissystemen. Vooral bij de studie van besmettelijke ziekten, die coevolved hebben met hun gastheer voor het gebruiken van specifieke microenvironments, wordt de eis voor het verstrekken van fysiologische omgevingen geschraagd door de vaak uitdagend aard van het kweken van de mens-tropic besmettelijke ziekten, zoals hepatitis C-virus, HBV en malaria.
De meest kritische stap in het uitvoeren van 3D lever-on-a-chip culturen is de kwaliteit van het aanvankelijk afkomstige primaire celtypes. Deze cellen dienen te worden getest op hun naleving van capaciteit en alleen vezinkbaar PHH veel moeten worden gebruikt met het oog op succesvolle weefsel vorming en cultuur generatie. Hoewel vers geïsoleerde PHH kan worden gebruikt, hun cryopreservatie is meestal complex en vereist speciale tarief-gecontroleerde diepvriezers.
In tegenstelling tot conventionele statische 2D culturen, de genetische achtergrond van gastheer is te verwaarlozen met betrekking tot de gevoeligheid voor HBV-infectie, en alle hij-tot nu toe geteste hepatocyte donoren kunnen vast te stellen van de HBV-infectie4.
Hoewel de patiënt afkomstige HBV vaststelt infecties van 3D culturen, het is noodzakelijk om gebruik maken van PEG-neergeslagen en sacharose kussen-gezuiverd HBV wanneer met behulp van afleidbare HBV producent cel voor de generatie van virale entmateriaal lijnen. Cel cultuur supernatant direct toegepast op de 3D lever-on-a-chip culturen, of door de aanwezigheid van remmende factoren of als gevolg van een incompatibiliteit van huidige groeifactoren met hepatocyten, niet gemakkelijk leiden tot infectie. Bovendien, bij het selecteren van virale entmateriaal patiënt afkomstige, moet alleen serum worden gebruikt, aangezien plasma onvermijdelijk stolt en verstopping van de microfluidic verspreiding van de cultuur-platform.
Ongeacht de virale entmateriaal gebruikt, is cellulaire levensvatbaarheid en differentiatie, evenals het zorgen voor volledige verwijdering van de eerste HBV entmateriaal, sleutel tot succesvolle langetermijnstudies infectie. De handigste manier om dit te doen is bemonstering culturen volgend op het verwijderen van de virale entmateriaal, evenals het meten van menselijk serum albumine niveaus gedurende de cultuur. Van de nota, ook voor alle andere beschreven platformen, HBV-infectie, als tot stand gebracht, is niet gemakkelijk verspreid naar niet-geïnfecteerde cellen. Het onderliggende mechanisme hiervoor blijft ongrijpbaar aangezien HBV-infectie in vivo gemakkelijk de meerderheid van de hepatocyten binnen de lever infecteert.
Met betrekking tot cocultures PHH en Kupffer cellen is het raadzaam voor het uitvoeren van veel tests van Kupffer cellen te evalueren IL6 en TNFα secretie in reactie op de stimulatie van de LP's, aangezien niet alle verkrijgbare Kupffer cel donoren een gelijke responsiviteit hebben.
Nog belangrijker is, voor alle drugs behandelingen of eerste infectie van culturen met HBV, moet het totale volume van de put (1,4 mL), evenals vanaf het microfluidic kanaal (0,2 mL), men in aanmerking voor de berekening van de drug of entmateriaal concentraties. Om te verzekeren nauwkeurige dosering, wordt een wassen stap met medium dat HBV of drugs uitgevoerd om het kanaal microfluidic prime.
Het gebruikte platform maakt gebruik van 600.000 PHH per putje, waarbij meerdere lagen hepatocyten binnen de steigers. Hoewel het nummer van de cel kan worden gevarieerd, de concentratie van de gekozen cel zorgt voor optimale resultaten. De indeling van de plaat behaalde een totaal van 12 steigers, die kan worden opgewaardeerd tot 36 steigers. Als gevolg van de eisen van de microfluidic is opschalen naar hoge goed cijfers echter niet mogelijk is tot nu toe.
Met behulp van deze benaderingen, kunnen culturen worden gehandhaafd met optimale mobiele prestaties voor ten minste 40 dagen, die tot dusver ongekende mogelijkheden biedt te evalueren van de roman drugkandidaten, evenals het bestuderen van de complexe wisselwerking tussen verschillende hepatische cel populaties tijdens HBV-infectie.
De auteurs hebben niets te onthullen.
Dit werk werd gefinancierd door een subsidie van de Starter van de European Research Council (637304), een Wellcome Trust Investigator Award (104771/Z/14/Z), en door CN Bio innovaties.
| Naam | Bedrijf | Catalogusnummer | Opmerkingen |
|---|---|---|---|
| Reagents | |||
| William's E Medium, no phenol red | GIBCO | A12176-01 | |
| Hepatocyte Thaw Medium | GIBCO | CM7500 | |
| Primary Hepatocyte Thawing and Plating Supplements | GIBCO | CM3000 | |
| Primary Hepatocyte Maintenance Supplements | GIBCO | CM4000 | |
| DMEM/F-12 | GIBCO | 11320-033 | |
| Advanced DMEM | GIBCO | 12491023 | |
| DPBS, no calcium, no magnesium | GIBCO | 14190-144 | |
| MEM Non-Essential Amino Acids (NEAA) 100x | GIBCO | 11140050 | |
| Penicillin-Streptomycin (10,000 U/mL) | GIBCO | 15140-122 | |
| Fetal Bovine Serum, USA origin, Heat Inactivated, sterile-filtered, suitable for cell culture | SIGMA | 12106C | |
| Hydrocortisone | SIGMA | H0888 | |
| Trypan blue | Merck | T8154 | |
| Collagen from calf skin | Merck | C9791 | |
| G418 | SIGMA | G418-RO | |
| Tetracycline | SIGMA | T3258 | |
| Polyethylene glycol 8000 | SIGMA | P2139 | |
| Sucrose | SIGMA | SO389 | |
| Sodium carbonate anhydrous | SIGMA | 451614-25G | |
| Sodium bicarbonate | SIGMA | S5761 | |
| Sodium azide | SIGMA | S2002-5G | |
| Sulfuric acid, 99.999% | SIGMA | 339741 | |
| 4% Paraformaldehyde | SIGMA | 252549 | |
| Triton-X 100 | SIGMA | X100 | |
| Tween 20 | SIGMA | P1379 | |
| DAPI | SIGMA | D9564 | |
| Albumin (human) | SIGMA | A9731 | |
| Fisher BioReagent Bovine Serum Albumin, Fraction V, Heat Shock Treated | Fisher Scientific | BP9701-100 | |
| ProLong Gold Antifade Mountant | Invitrogen | P36930 | |
| TaqMan Universal Master Mix II, no UNG | Applied Biosystems | 4440040 | |
| SYBR Select Master Mix | Applied Biosystems | 4472903 | |
| Lipopolysaccharide from Escherichia coli K12 | InvivoGen | tlrl-eklps | |
| Name | Company | Catalog Number | Comments |
| Kits/Consumables | |||
| Sterile membrane | CN Bio innovations | LC-SC | |
| LiverChip Perfusion cell culture plate | CN Bio innovations | LC12 | |
| LiverChip culture plate lid | CN Bio innovations | LC-SC | |
| Sterile round filter paper | CN Bio innovations | LC-SC | |
| Cell attachment scaffold | CN Bio innovations | LC-SC | |
| Retaining ring | CN Bio innovations | LC-SC | |
| Sterile plunger | CN Bio innovations | LC-ST | |
| Dneasy blood & tissue kit | Qiagen | 69506 | |
| Rneasy mini kit | Qiagen | 74106 | |
| Human Magnetic Luminex assay | R&D Systems | ||
| 1-Step Ultra TMB-ELISA Substrate Solution | ThermoFisher Scientific | 34028 | |
| High Capacity cDNA Reverse Transcription Kit | ThermoFisher Scientific | 4368814 | |
| QIAamp Viral RNA Mini Accessory Set | Qiagen | 1048147 | Bevat RNA-drager |
| Millicell HY 5-layer cell culture flask, T-1000, sterile | Millipore (Merck) | PFHYS1008 | |
| MicroAmp Optical 384-Well Reaction Plate with Barcode | Life technologies | 4309849 | |
| MicroAmp Optical Adhesive Film | Life technologies | 4311971 | |
| Clear Flat-Bottom Immuno Nonsterile 96-Well Plates | ThermoFisher Scientific | 442404 | |
| Sealing Tape for 96-Well Plates | ThermoFisher Scientific | 15036 | |
| Nalgene Rapid-Flow Sterile Disposable Bottle Top Filters with PES Membrane | ThermoFisher Scientific | 295-3345 | |
| Fisherbrand Microscopic Slides with Ground Edges, Twin Frost | Fisher Scientific | FB58628 | |
| Tube, Thinwall, Ultra-Clear, 38.5 mL, 25 x 89 mm | Beckman Coulter | 344058 | |
| Name | Company | Catalog Number | Comments |
| Primary cells / Cell lines | |||
| Human Plateable Hepatocytes, Transporter Qualified | Thermo Fisher Scientific | HMCPTS | |
| Cryopreserved Human Kupffer Cells | Thermo Fisher Scientific | HUKCCS | |
| HepDE19 cell line | Haitao Guo (Indiana University, IN, USA) | ||
| Name | Company | Catalog Number | Comments |
| Primers/Probes/Standards | |||
| HBV DNA forward primer | Invitrogen | 5'-GTGTCTGCGGCGTTTTATCA-3' | |
| HBV DNA reverse primer | Invitrogen | 5'-GACAAACGGGCAACATACCTT-3' | |
| HBV DNA probe | Invitrogen | 5'FAM-CCTCTKCATCCTGCTGCTATGCCTCATC-3'TAMRA | |
| pgRNA forward primer | Invitrogen | 5'-GAGTGTGGATTCGCACTCC-3' | |
| pgRNA reverse primer | Invitrogen | 5'-GAGGCGAGGGAGTTCTTCT-3' | |
| RPS11 forward primer | Invitrogen | 5'-GCCGAGACTATCTGCACTAC-3' | |
| RPS11 reverse primer | Invitrogen | 5'-ATGTCCAGCCTCAGAACTTC-3' | |
| pCMV-HBV | Professor Christoph Seeger (Fox Chase Cancer Centre, PA, USA) | ||