Thuiskopieerheffingen generatie
De generatie van Thuiskopieerheffingen kan worden onderverdeeld in vier essentiële stappen: chirurgische Long weefsel resectie, agarose vulling vibratome gebaseerde Thuiskopieerheffingen generatie en cultuur van Thuiskopieerheffingen. De gereseceerd longweefsel is gevuld met lage-smelten punt agarose, die de vereiste stijfheid voegt aan het longweefsel voor het snijden en behoudt de native Long structuur en architectuur. Van de nota, Thuiskopieerheffingen generatie is zeer tijdrovend, dus vaak 's nachts opslag van de gevulde longweefsel in DMEM F-12 medium kan worden opgenomen als een extra stap en Thuiskopieerheffingen generatie is gestart op de volgende dag. Afhankelijk van de volgende experimentele opzet, kan gegenereerde Thuiskopieerheffingen 's nachts worden geïncubeerd in standaard cel kweekmedium dat van de foetale runderserum 0,1% (g/v), voordat de experimentele omstandigheden worden toegepast. 3D-LTCs waren levensvatbare en cellulaire functionaliteit (zoals de secretie van de eiwitten van de oppervlakteactieve stof) tentoongesteld voor maximaal 120 h22 in de kweekomstandigheden in dit protocol (Figuur 1 uiteengezet) en kan worden geoptimaliseerd op verdere verbetering daarvan.
Agarose vulling
Voor agarose invulling van het weefsel, was een canule van een perifere veneuze katheter met een diameter van de 1.3 mm aangesloten op de agarose gevulde spuit een bronchiën aan het oppervlak van het gesneden weefsel (figuur 2A) ingevoegd. Bronchiën zijn vaak gelokaliseerd in de buurt van een longslagader. Terwijl de slagaders dunner muren hebben en de neiging om samen te vouwen, tentoongesteld bronchiën een goed zichtbare lumen. Afhankelijk van het weefsel van de integriteit, kan de katheter worden bevorderd door meerdere generaties van de respiratoire boom in de periferie van de longen. De gepenetreerd bronchiën was verzegeld rond de canule met behulp van pincet (figuur 2B). De longslagader kan worden geklemd met de pincet op hetzelfde moment. Daarna het weefsel is opgetild en vloeibare agarose is zachtjes ingeprent in de luchtwegen.
Afhankelijk van de positie van de katheter, kan een meerderheid van het weefsel worden gevuld met vloeibare agarose (figuur 2D). Optioneel, misschien kegel zoals delen van het longweefsel, die van de Long parenchym geventileerd door de gepenetreerd bronchiën weerspiegelen, krijgen gevuld met de agarose (figuur 2C). In beide scenario's, een karakteristiek patroon van stevig gevulde weefsel regio's kan worden waargenomen: ten eerste een groot deel van het weefsel in wiggen (figuur 2D) is gevuld, of in de tweede, kleinere uitsteekt ronde gebieden van grondig gevulde weefsel gebieden weergegeven ( Figuur 2C). Als delen van de luchtwegen als gevolg van agarose stolsels of andere oorzaken, verhindert kunnen delen van het weefsel niet worden goed gevuld met agarose. Dus, slechts een deel van het weefsel kunnen gelden voor het snijden. In geval van lekkage tijdens de agarose vullen procedure, delen van de gevulde respiratoire tree kunnen krijgen geperforeerd en vullen van het longweefsel krijgt echter bijna onmogelijk, mogelijke oplossingen omvatten het vullen via een meer perifere bronchiën, een diepere penetratie van de canule in de distale luchtwegen (Figuur 2 g), of potentiële klemmen van de lekkage ruimte (Figuur 2 H).
Precisie-cut Long snijden
Weefsel blokken op een lengte en breedte van 1-1,5 cm werden weggesneden uit weefsel regio's, die waren helemaal gevuld met gestold agarose ()figuur 3A-3B). Hierna waren de individuele weefsel blokken gelijmd op de houder van het weefsel van de vibratome (Figuur 3 c). 500 µm dik Thuiskopieerheffingen werden gegenereerd, overwegende dat het weefsel blok op de vibratome was bevordering van vooruit met snelheden tussen 3-12 µm/s. (figuur 3D-3F). Ten slotte waren de Thuiskopieerheffingen ondergedompeld in cel kweekmedium dat 0,1% (g/v) foetale runderserum en gekweekt op standaard cel kweekomstandigheden, als overzicht stap 7.
Experimentele uitlezingen van menselijke 3D-LTC na 48u van kweken
Een representatieve immunofluorescentie kleuring, zoals eerder beschreven door Alsafadi et al.25, wordt weergegeven in figuur 4A-4 C. Immunolabeling van fibronectine (rood) en celkernen (DAPI, blauw), toegestaan voor beeldvorming van de bewaarde alveolaire structuur in de menselijke 3D-LTC ex vivo. Behandeling van de mens Thuiskopieerheffingen stoten met een profibrotic cytokine cocktail (met inbegrip van transformerende groeifactor bèta 1, bloedplaatjes afgeleid groeifactor AB, lipophosphatidyl zuur en tumornecrosefactor alfa) voor 48u geleid tot fibrose-achtige veranderingen in de mens 3D-LTCs. Door qPCR, werd een belangrijke inductie van de fibrose-relevante extracellulaire matrix onderdelen collageen type 1 en fibronectine genen in 3D-LTC stoten waargenomen op een behandeling met de profibrotic cocktail (Figuur 4 d). Bovendien eiwitniveaus voor de mesenchymale marker vimentin bleken upregulated in 3 van de 4 patiënten na behandeling van 3D-LTC stoten (figuur 4E).

Figuur 1: Workflow van Thuiskopieerheffingen generatie. Tumor-vrije gebieden van Long resections worden grondig geïnspecteerd als gevolg van hun integriteit van weefsel. Als het weefsel is gescoord is geschikt voor verder gebruik (scoren is uitvoerig besproken in de sectie materiaal en methoden), het volgende is gevuld met vloeibare agarose. Weefsel blokken gevuld met gestold agarose worden vervolgens gesneden met een vibratome. Ondergedompeld in cel kweekmedium, worden 3D-LTC gekweekt tot 120 h na hun generatie. Stroomafwaarts analyses van de 3D-LTCs betrekken - of RNA-eiwituitdrukking, live-weefsel fluorescentie imaging, evenals immunofluorescentie kleuring na fixatie van het weefsel. Klik hier voor een grotere versie van dit cijfer.

Figuur 2: het longweefsel vullen met lage-melting point agarose. Het longweefsel is gecanuleerd met een perifere veneuze katheter die is ingevoegd in een bronchiën grenzend aan de longslagader (figuur 2A). Pincet zijn gebruikt de canule oplossen in de bronchiën en klem de longslagader Voorkom lekken van de vloeibare agarose. Vloeibare agarose bij 42 ° C wordt gegoten in het longweefsel met een 30 mL spuit (figuur 2B). Een distale positionering van de canule tijdens het vullen zal resulteren in kleine gebieden van gevulde weefsel (figuur 2C), terwijl het proximale positionering zorgt voor het vullen van een groter volume van weefsel (figuur 2D). Eventuele obstakels voor de luchtwegen zal verminderen het bedrag van weefsel volume die kan worden gevuld (figuur 2E). In het geval van het agarose lekken, een distale canule positionering en/of klemmen van de kant van de lekkage kan goede agarose vullen van het longweefsel ()figuur 2F-2 H). Klik hier voor een grotere versie van dit cijfer.

Figuur 3: precisie-cut Long snijden. Een succesvol op agarose gevulde longweefsel wordt gebruikt een stuk van een weefsel blok accijnzen (1 x 1,5 cm x 1 cm) met een scalpel (figuur 3A). Naast het verwijderde weefsel blok is gelijmd aan de houder van het weefsel, schaal balk geeft aan 1 cm (figuur 3B). Het weefsel is bij voorkeur gelijmd met zijn pleurale oppervlakte op het oppervlak van de houder van het weefsel zoals aangegeven in Figuur 3 c. 500 µm dikke plakjes worden gesneden door de vibratome met een sapphire mes in een hoek van 10° - 15° ten opzichte van het weefsel (figuur 3D en 3E). Het snijden procedure resulteert in 2-3 cm3 grote intact Long segmenten, schaal bar = 5 mm (figuur 3F). Bovendien, met behulp van een biopsie perforatie, kunnen kleine reproduceerbare stoten met een diameter van 4 mm worden gegenereerd. Klik hier voor een grotere versie van dit cijfer.

Figuur 4: experimentele uitlezingen van menselijke 3D-LTCs na 48u van cultuur. Een menselijke 3D-LTC punch diameter van 4 mm immunostained voor fibronectine (in rood) en de DAPI (in blauw) was ()figuur 4A-4C). Schaal bars = 1.000 µm. figuur 4C shows de samengevoegde afbeelding. RNA analyse van Thuiskopieerheffingen door kwantitatieve RT-PCR blijkt significante toenames van de genexpressie van COL1A1 en FN1 door de profibrotic cocktail25. Figuur 4E toont een immunoblot van hele eiwit lysates van Thuiskopieerheffingen, die werden behandeld met een fibrotische cocktail25. Indringende voor Vimentin en β-actine aangetoond een verhoogd eiwit expressie van de mesenchymale markering (vimentin) na behandeling met profibrotic in patiënt monsters 1, 3 en 4 factoren. Klik hier voor een grotere versie van dit cijfer.
| Criterium | Punten |
| Het weefsel monster heeft intact pleurale oppervlakte. | 20 |
| Het weefsel monster lijkt macroscopisch intact, ontbreekt insnijdingen, pletten, scheuren en vervormingen. | 20 |
| Het weefsel monster bevat ten minste één bronchiën met een diameter > 1mm. | 20 |
| Het weefsel monster bevat geen of slechts weinig bedraagt van bloed. | 4 |
| Het monster weefsel volledig was opgeslagen in medium en vertoont geen voor de hand liggende atelectase. | 4 |
| Het weefsel monster was gereseceerd binnen de laatste vier uur. | 4 |
| Het weefsel monster is groter dan de grootste diameter van 5cm. | 4 |
| Score in de som: | |
Tabel 1: Lung Agarose vullen Score. De Long Agarose vullen Score (LAFS) correleert met de succes-tarief te vullen de resectie van een weefsel met agarose voor zijn volgende vibratome gebaseerde Thuiskopieerheffingen productie. De score vat alle punten van de criteria voldaan door het weefsel. Een LAFS gelijk zijn aan of boven 72 voorspelt goed agarose vullen eigenschappen, een score lager dan 60 voorspelt een zeer waarschijnlijk gebrek agarose vullen van het weefsel.