Een methode voor de productie van één domein antilichamen van alpaca's, met inbegrip van immunisatie, bloedinzameling, B-cel isolatie en selectie wordt beschreven.
Methodenartikel
Een methode voor de productie van één domein antilichamen van alpaca's, met inbegrip van immunisatie, bloedinzameling, B-cel isolatie en selectie wordt beschreven.
In dit manuscript, is een methode voor de immunisatie van alpaca en het gebruik van moleculaire biologiemethodes om één domein van antigeen-specifieke antilichamen te produceren beschreven en gedemonstreerd. Kameelachtigen, zoals alpacas en lamas, zijn uitgegroeid tot een waardevolle bron voor biomedisch onderzoek aangezien zij produceren een nieuwe soort zware alleen-keten antilichamen die kan worden gebruikt om enkel domein antilichamen te produceren. Omdat het immuunsysteem zeer flexibel is, kunnen één domein antilichamen aan vele verschillende eiwit antigenen, en zelfs verschillende conformaties van het antigeen, worden gemaakt met een zeer hoge mate van specificiteit. Deze functies, o.a. maken enkel domein antilichamen een waardevol instrument voor biomedisch onderzoek. Een methode voor de productie van één domein antilichamen van alpaca's is gemeld. Een protocol voor immunisatie, bloedinzameling, en isolatie van de B-cel wordt beschreven. De B-cellen worden gebruikt voor de bouw van een geïmmuniseerde library, die wordt gebruikt bij de selectie van specifieke enkel domein antilichamen via de pannen. Vermeende specifieke enkel domein antilichamen verkregen via pannen worden bevestigd door de pull-down, ELISA, of gel-shift testen. De resulterende enkel domein antilichamen kunnen vervolgens rechtstreeks of als onderdeel van een gemanipuleerde reagens worden gebruikt. Het gebruik van één domein antilichaam en enkel domein antilichamen gebaseerde regenten bevatten structurele, biochemische, cellulaire, in vivo en therapeutische toepassingen. Enkel domein antilichamen kunnen in grote hoeveelheden worden geproduceerd zoals recombinante eiwitten in prokaryotische expressiesystemen, gezuiverd, en direct gebruikt of kan worden ontworpen om specifieke markers of tags die kunnen worden gebruikt als verslaggevers in cellulaire studies of bevatten diagnostiek.
Alpaca's, en andere leden van de familie kameelachtige geworden een populaire bron voor het genereren van antilichamen voor biomedisch onderzoek1,2,3. Kameelachtigen hebben een unieke immuunsysteem dat zij produceren zowel normale antilichamen evenals de enige antilichamen zware-keten, waardoor de productie van veel kleinere enkel domein antilichamen, met behoud van hoge specificiteit en hoge affiniteit. Dus, kameelachtige antistoffen bieden een veelzijdige reagens nuttig is voor allerlei doeleinden. Een methode om te immunizeren alpaca en enkel domein antilichamen aan een verscheidenheid van eiwit antigenen produceren wordt hier beschreven. Deze antilichamen kunnen worden geproduceerd in kameelachtigen via een relatief eenvoudig proces dat alleen de immunisatie via kleine injecties van de doel-eiwitten (antigeen) en een bloed trekken4 vereist. Vervolgens wordt bibliotheek bouw, M13 phage display5 en panning versus de recombinante antigeen6 gebruikt om te isoleren en enkel domein antilichamen met de gewenste kenmerken te produceren. Omdat het proces maakt gebruik van de kracht van de technologie van de vertoning van de bacteriofaag, vijf of meer antigenen kunnen gelijktijdig worden gebruikt per dier, waardoor het aantal dieren gebruikt en daarmee verband houdende kosten.
Typische zoogdieren antilichamen of immunoglobulinen zijn grote moleculen bestaande uit twee soorten kettingen (2 zware kettingen en 2 lichte kettingen), die met elkaar zijn verbonden via disulfide bindingen. Deze antilichamen zijn relatief groot, exposeren molecuulgewicht van ~ 140-190 kDa voor de meer overvloedig IgG-soorten van mensen, muizen, geiten en konijnen. Als gevolg van hun meerdere subeenheid structuur ultrahoog moleculair gewicht en disulfide bindingen kunnen immunoglobulinen vrij uitdagend om te produceren in grote hoeveelheden, waardoor hun hoge kosten. In de jaren negentig, werd ontdekt dat kameelachtigen, waaronder kamelen, Lama's en Alpaca's maken, naast de typische zoogdieren type immunoglobuline, een nieuwe vorm van immunoglobuline dat is eenvoudiger in structuur, bezitten alleen zware kettingen7. Deze unieke kameelachtige antilichamen beschikken over het zelfde vermogen te specifiek vreemde stoffen met hoge affiniteit binden, maar slechts zijn samengesteld uit één eiwit ketting8. Bovendien kunnen kameelachtige antilichamen experimenteel worden afgekapt tot een nog kleinere eenheid de VHH-fragment, een afkorting voor een enkel domein antilichamen9. Vanwege hun kleine omvang, enkel domein antilichamen zijn nuttig voor een brede waaier van toepassingen van biomedisch onderzoek en zijn verkrijgbaar bij verschillende academische en commerciële bronnen1,10. Een uitzondering schijnt te zijn westelijke bevlekken aangezien enkel domein antilichamen vaker gericht zijn tegen conformatie afhankelijke epitopes, die meestal onder het denatureren voorwaarden gebruikt in Western blots verloren zijn.
Omdat ze zijn samengesteld uit een één polypeptide ketting, kunnen specifieke enkel domein antilichamen worden geselecteerd en gemakkelijk in grote hoeveelheden geproduceerd als recombinant eiwitten bij bacteriën. Enkel domein antilichamen kunnen ook worden genetisch gemanipuleerde bevatten specifieke markers of tags die kunnen worden gebruikt als 'verslaggever groepen' voor de diagnose van ziekten11. Dit gemak van manipulatie in combinatie met hun flexibiliteit van gebruik maakt enkel domein antilichamen een belangrijke hulpbron voor onderzoekers aan universiteiten en elders.
Als onderdeel van een National Institutes of Health ondersteund kern, zijn bestaande methoden aangepast om enkel domein antilichamen van alpaca's3,4te produceren. Alpaca's hebben aanzienlijke voordelen in beide gebruiksgemak ten opzichte van grotere kameelachtige familieleden evenals toegankelijkheid. Alpaca's zijn sterk verhoogd voor vezels en vlees en aldus kunnen regionaal worden verkregen van lokale alpaca boeren, die kunnen worden geïdentificeerd via hun websites of via staat Fokker verenigingen. Twee rassen van alpaca's zijn beschikbaar, Suri en Huacaya. Huacaya komen vaker voor en werden gebruikt voor dit protocol, maar het protocol is algemeen toepasbaar voor beide rassen en ook meer algemeen van toepassing op andere kameelachtigen.
Alle procedures met de alpaca's werden verricht overeenkomstig de protocollen (2627-2017 en 2018-2925) goedgekeurd door de Universiteit van Kentucky institutionele Animal Care en gebruik Comité (IACUC).
1. generatie van antigeen-specifieke Alpaca antilichamen
2. het zuiveren van lymfocyten voor één domein antilichaam bibliotheek bouw
3. enkel domein antilichamen pannen
Het hier gepresenteerde protocol werd gebruikt voor het genereren van één domein antilichamen tegen een aantal eiwit antigenen. Vijf antigenen werden gebruikt per alpaca. Immuun toezicht aangegeven dat de meerderheid van de antigenen robuuste reactie vanaf drie weken (Figuur 1 toonde). Productie aflopen en bibliotheek bouw na ongeveer zes weken geeft de beste balans voor de dieren dat hebben meerdere antigenen geïnjecteerd. Twee rondes van pannen werden uitgevoerd voor elk antigeen en geïsoleerde kolonies gescreend (Figuur 2). Sequentiebepaling van positieve kolonies geïdentificeerd divers enkel domein antilichamen sequenties voor de verschillende antigenen. Bijvoorbeeld werden drie unieke klonen geïsoleerd voor het referentieantigeen Maltose bindend proteïne (MBP) (figuur 3A). Zoals vaak wordt waargenomen, wordt de enkel domein antilichamen bevatten aanzienlijke reeks diversiteit en zeer variabele CDR3 lengte (Figuur 3). Deze functies zijn vooral belangrijk in één domein antilichaam/antigeen interacties zoals gezien in de verwijzing enkel domein antilichamen/CX3CL1 complexe17 (figuur 3B).
De meerderheid van de full-length enkel domein antilichamen sequenties kan worden uitgedrukt en gezuiverd op 1-10 mg/L van cultuur (figuur 4A). Vanwege de diversiteit in CDR3 lengte, heeft verschillende enkel domein antilichamen lichte variatie in moleculair gewicht weergeven. Bevestiging van directe binding en toepassing bestaan specifieke prestatie is van cruciaal belang. Bijvoorbeeld na twee rondes van de selectie tegen antigeen B, een panel van één domein antilichamen werden geïdentificeerd (Figuur 2). Meerdere identieke sequenties werden geïdentificeerd, en het antilichaam van één domein werd geproduceerd en gezuiverd. Het was vervolgens getest via directe pull down met antigeen affiniteit hars en toonde robuuste dosisafhankelijk bindende (figuur 4B). Nog belangrijker is, toonde het antilichaam van één domein geen binding met het controleren van de hars. Deze gegevens tonen een direct bindende interactie, en dat is zeer geschikt voor het vastleggen van de affiniteit in zowel pull-down en ELISA gebaseerde formaten.

Figuur 1 : Representatief immuun toezicht op twee verschillende antigenen, tonen de belangrijke specifieke immuunrespons aan verschillende antigenen in hetzelfde dier. Veel antigenen Toon robuust antwoord zo spoedig drie weken na het begin van immunisatie, met de meerderheid die het weergeven van maximale reactie na zes weken. Zes weken ook zorgt voor affiniteit rijping en is de aanbevolen tijd voor de afloop van de productie en de B-cel isolatie. Klik hier voor een grotere versie van dit cijfer.

Figuur 2 : Bevestiging van positieve klonen PCR-gebaseerde. Inleidingen omspannen de MCS-server van het pMES4 vector, en een positieve nanobody kloon produceert een amplicon van ~ 500 bp (gemarkeerd met *). Klik hier voor een grotere versie van dit cijfer.

Figuur 3 : Antigeen-specifieke opeenvolgingen Markeer alpaca enkel domein antilichamen diversiteit. (A) aanpassing van Selecteer één domein antilichaam sequenties geïsoleerd te MBP met een referentie één domein antilichaam 4XT1, met kader en complementariteit-bepalen regio's (Kabat) hieronder. (B) structuur van alpaca één domein antilichaam 4XT1 gebonden aan CX3CL1 (VOB 4XT1), nadruk op de cruciale rol van variabele CDR loops in specifieke antigeen bindende. Klik hier voor een grotere versie van dit cijfer.

Figuur 4 : Zuivering en validatie van één domein antilichamen. (A) SDS-pagina van IMAC gezuiverd enkel domein antilichamen, divers enkel domein antilichamen te vergelijken. Verschillende molecuulgewichten zijn voornamelijk te wijten aan de wisselende lengte van de lus van de CDR3. Verschillende niveaus van meningsuiting zijn ook waargenomen, met een minderheid van één domein antilichamen tonen van slechte oogsten van de gezuiverde eiwit. (B) keuring van directe binding met behulp van een antigeen affiniteit pull-down. Robuuste dosisafhankelijk enkel domein antilichamen bindende wordt waargenomen met antigeen-coupled hars maar niet met het besturingselement hars. Klik hier voor een grotere versie van dit cijfer.
Zoals opgemerkt, de hoge affiniteit en de specificiteit van één domein antilichamen, gecombineerd met hun facile expressie en stabiliteit, maak hen ideaal reagentia voor de toepassingen in biomedisch onderzoek, als kritische biochemische reagentia, diagnostische hulpprogramma's, of therapeutische agenten18. Voor commerciële toepassingen zijn er sommige kwesties verband houden met intellectuele eigendom die moet worden beschouwd. Bovendien, kunnen één domein antilichamen worden ontworpen om te bevatten specifieke markers of tags die kunnen worden gebruikt als verslaggevers in cellulaire assays of diagnostiek. De sleutel tot deze toepassingen is de mogelijkheid om specifiek één domein antilichamen tegen de antigenen van belang te produceren. Een methode is hier beschreven voor de productie van één domein antilichamen met behulp van alpaca's, die een robuuste immuunrespons tegen een breed scala aan eiwit antigenen produceert. Overwegingen bij het dier verwerking en naleving van regelgeving worden beschreven. Dit zijn de sleutel tot het succes in dit deel van het proces.
Er zijn andere strategieën voor het produceren van één domein antilichamen die vereisen geen de immunisatie, maar in plaats daarvan semisynthetic bibliotheken gebruiken met verschillende systemen voor de selectie en iteratieve optimalisatie van affiniteiten19,20 . Het voordeel van het gebruik van bibliotheken die zijn afgeleid van geïmmuniseerde dieren is echter de mogelijkheid om op een betrouwbare manier isoleren zeer verrijkt, divers, en hoge-affiniteit enkel domein antilichamen. Daarnaast, niet alleen aanzienlijke reeks variaties wordt voldaan, maar een aanzienlijke meerderheid van specifieke enkel domein antilichamen geïsoleerd had unieke ingevoegde en verwijderde items, met name in CDR3.
Verder, enkel domein antilichamen geproduceerd kunnen worden via een eenvoudig proces dat alleen kleine injecties van het antigeen en na dit proces vereist, de dieren kunnen worden teruggebracht naar de kudde. Van de nota, het dier kan vrij worden gebruikt voor de productie van de vezel, maar moet worden uitgesloten van het gebruik als vlees (menselijke voedselketen) als gevolg van het gebruik van de test antigenen en niet-FDA goedgekeurde hulpstof voor de productie van het antilichaam van de één domein. Nadat de procedure is voltooid, kunnen de dieren moeten worden gecontroleerd voor één week, gegeven een veterinaire eindexamen, en vervolgens worden keerde terug naar hun huis boerderij of rustte gedurende zes maanden voorafgaand aan een andere ronde van de productie van het antilichaam van de één domein.
Drs. Whiteheart en Hersh zijn aan de Universiteit van Kentucky en opereren van een kern in het centrum voor moleculaire geneeskunde die geen enkel domein antilichamen aanmaakt in alpaca als een vergoeding voor de service.
Dit werk werd gesteund door de National Institutes of Health (P30GM103486).
| Naam | Bedrijf | Catalogusnummer | Opmerkingen |
|---|---|---|---|
| GERBU FAMA adjuvant | Biotechnik, Heidelberg, Duitsland | 3003,6001 | |
| Serum opvangbuis | Becton Dickinson | 367983 | |
| Bloedopvangbuis | Becton Dickinson | 366643 | |
| Vacutainer bloedopvangset | Becton Dickinson | 368652 | |
| Maxisorp Immuno platen | Nunc | 439454 | |
| BSA | Sigma-Aldrich | A7906 | |
| HRP-geconjugeerd geit anti-lama IgG antilichaam | Bethyl Labs | A160-100P | |
| TMB reagens chromogeen peroxidase substraat | KPL | 50-76-03 | |
| Plate Reader | Spectramax | M5 | Elke UV/VIS-capabele lezer is acceptabel |
| Uni-SepMAXI+ lymfocytscheidingsbuis | Novamed | U-17 | |
| RNeasy Mini Kit | Qiagen | 74104 | |
| QIAshredder kolom | Qiagen | 79654 | |
| Superscript IV reverse transcriptase | Invitrogen | 18064014 | |
| AEBSF oplossing | Biosynth | A-5440 | |
| TG1 phage display competente cellen | Lucigen | 60502 |