Het A. rhizogenes -transformatie-protocol werd aangepast en gewijzigd van Horn et al.7 en het genotype getest was S. tuberosum ssp. tuberosum (cv. Désirée). Het A. tumefaciens transformatie protocol werd aangepast en gewijzigd van Banerjee et al.22 en de genotypen getest werden S. tuberosum ssp. tuberosum (cv. Désirée) en S. tuberosum ssp. andigena. De belangrijkste stappen van beide procedures worden samengevat in Figuur 1 en figuur 2, respectievelijk.
Opmerking: In alle stappen van de procedure uitvoeren in vitro overdrachten, snel doen, en indien mogelijk, houden de platen of potten gesloten, dus het minimaliseren van plant blootstelling aan de lucht om verwelking en besmetting te voorkomen. Anders vermeld, werden alle incubations van de plant gedaan in kasten onder de voorwaarden van 12u van 24 ° C licht/12 h van 20 ° C van donkere en 67 µmol m-1 s-1. Anders vermeld, alle de bacteriën manipulatie en in vitro plant transfers uitvoeren onder aseptische omstandigheden in een laminaire flow-kap. Alle media recepten voor Agrobacterium en in vitro culturen van de plant zijn opgenomen in Tabel S1.
Let op: Alle genetisch gemodificeerde bacteriën en planten naar de geëigende afval container storten.
1. Agrobacterium culturen gebruikt voor transformatie
Opmerking: De gebruikte voor A. rhizogenes transformatie stam was de C58C1:Pri15837 (vriendelijk geleverd door Dr. Inge Broer) en dat voor de A. tumefaciens was de GV2260 (vriendelijk geleverd door Dr. Salomé Prat). A. rhizogenes werd omgevormd met het binaire vector PK7GWIWG2_II-RedRoot (VIB-Plant Systems Biology aan de Universiteit Gent Vakgroep; http://gateway.psb.ugent.be) met een T-DNA een transformatie marker te voeren om te controleren de harige wortel vorming. Om te vergelijken de getransformeerde wortels gegenereerd door A. rhizogenes en A. tumefaciens, werden beide omgevormd met het binaire vector pKGWFS7 waarin een T-DNA uitvoering van de promotor van de FHT rijden de β-glucoronidase (GUS) verslaggever gen en het kanamycine resistentie gen als een selecteerbaar marker15.
- Kies een kolonie van Agrobacterium en groeien het 's nachts (O/N) in 5 mL YEB voedingsbodem aangevuld met antibiotica (Tabel S1) in een centrifugebuis 50 mL bij 28 ° C met schudden bij 200 omwentelingen per minuut.
- Voor A. tumefaciens transformatie, meet de optische dichtheid, die OD600 moet = 0.6-1.0.
- Als de optische dichtheid hoger is, moet een subcultuur verlagen tot OD600 = 0,3 met verse media en wacht totdat de cultuur OD600 bereikt = 0,6-1.
- Centrifugeer 1 mL Agrobacterium cultuur bij 3000 x g in een bench-top centrifuge gedurende 10 minuten bij kamertemperatuur.
- Verwijder het supernatant door pipetteren en resuspendeer de cellen in 1 mL verse YEB medium zonder antibiotica. Herhaal deze stap om ervoor te zorgen de volledige verwijdering van antibiotica.
- Voor A. tumefaciens transformatie, in de laatste resuspensie toevoegen het juiste YEB volume te verkrijgen van een definitieve optische dichtheid van OD600 = 0,8.
- Cellen op ijs houden bij de voorbereiding van de planten te worden besmet.
2. plantmateriaal voor transformatie
- Maken van een of twee knooppunt houtstekken ofwel met de apicale of de ondersteunende toppen van steriele in vitro aardappelplanten (donor planten); groeien ze in solide 2MS medium in de potten voor 3 tot 4 weken (figuur 1A en figuur 2A).
3. plant transformatie met behulp van A. rhizogenes (Figuur 1)
Opmerking: Deze procedure maakt het mogelijk het verkrijgen van getransformeerde harige wortels. Om te beoordelen de transgenic expressie, is een negatieve controle nodig. Volg de procedure met behulp van een stam van de A. rhizogenes niet-getransformeerde of getransformeerd met de lege vector waarin de transformatie marker gene ter voorbereiding van de negatieve controle.
- Gebruik verse media platen; Als alternatief, de platen kunnen worden bewaard bij 4 ° C met het deksel naar boven, strak verzegelde met doorzichtige folie om uitdroging van de media. Ter voorbereiding van de vierkante media platen, helling hen ~ 15°, vullen met 40 mL van MS, en laten stollen. Dit zal het minimaliseren van het contact van de antenne deel van de plant met het medium.
- Overdracht zeer zorgvuldig een donor plant van het 2MS medium naar een vierkante plaat van 120 x 120 mm.
- Injecteer aan één stengel stengellid 3 μL van de cultuur van de A. rhizogenes met behulp van een chirurgische naald en herhaal het tweemaal per plant in verschillende stengelleden indien mogelijk.
Opmerking: Overwegen elke injectie als een onafhankelijke modificatie (figuur 1B).
- Transfer onmiddellijk de hele plant naar een vierkante plaat met solide MS medium aangevuld met 0,1 mM acetosyringone. Geschikt voor 2 planten per plaat.
Opmerking: De 1 M acetosyringone stockoplossing wordt bereid in DMSO en kan worden opgeslagen bij-20 ° C.
- Afdichting van de plaat met behulp van chirurgische tape en regelen het verticaal binnen een kabinet groei voor 4 dagen.
- De plant overbrengen in een nieuwe vierkante plaat met MS medium aangevuld met cefotaxime natrium [500 µg Mo/mL] om te doden van A. rhizogenes.
- Na 10-12 dagen, zal harige wortels beginnen te verschijnen (Figuur 1 c,1 D). Vervolgens accijnzen van de eigen wortels van de plant en de plant overbrengen in een nieuwe vierkante plaat met MS medium aangevuld met cefotaxime natrium [500 µg Mo/mL].
Opmerking: Getransformeerde harige wortels kunnen worden gecontroleerd door rode fluorescentie bij het gebruik van een DsRed transformation marker (figuur 3D).
- Voor het verkrijgen van een samengestelde plant (figuur 1E), laat de transgene harige wortels groeien voor 3-4 weken in MS medium aangevuld met cefotaxime natrium [500 μg/mL] (wekelijks veranderen het medium).
- Afhankelijk van het doel, de transgene harige wortels en de negatieve controles als volgt worden doorgegeven.
- De hele samengestelde plant overbrengen in een hydrocultuur (Tabel S2) of de bodem medium toe te staan voor enorme ontwikkeling.
- Als u wilt individueel propageren de getransformeerde harige wortels, met behulp van een scalpel snijden de wortels uiting geven aan de rode fluorescerende transformatie markering (DsRed eiwit) wanneer ze zijn 4-8 cm lang (figuur 1E) en ze vervolgens overbrengen naar een petrischaal met Gamborg B5 solide medium aangevuld met 2% sucrose en cefotaxime natrium [500 μg/mL]. Zegel van de platen met plastic laboratorium film en ze groeien in het donker bij 20 ° C.
Opmerking: De wortels kunnen worden gemanipuleerd onder een stereomicroscoop uitgerust om te ontdekken de fluorescentie onder steriele omstandigheden (Zie Tabel van materialen).
- Voor de productie van biomassa (dat wil zeggen, gen expressie analyse), snijd een 5 cm lang harige root en het doorgeven in een 150 mL conische kolf met 20 mL Gamborg B5 opgietvloeistof aangevuld met 2% sucrose en cefotaxime natrium [500 µg Mo/mL]. Het kweken voor 6 weken in het donker bij 20 ° C en 60 rpm.

Figuur 1: Tijdlijn te verkrijgen aardappel transgene harige wortels met behulp van A. rhizogenes. De cumulatieve weken te bereiken van elk stadium van het transformatieproces en de daaropvolgende stappen de harige wortels groeien worden weergegeven. Representatieve beelden van verschillende stadia worden afgebeeld: de opening van het proces met behulp van 3 weken oude in vitro planten (A), vervolgens infectie van de planten door het injecteren van A. rhizogenes (B), de vorming van de proliferatieve weefsel (C, pijlen) met opkomende harige wortels (D), en de ontwikkelde harige wortels uiting geven aan de rode fluorescerende transformatie markering DsRed (E). Klik hier voor een grotere versie van dit cijfer.
4. plant transformatie met behulp van A. tumefaciens (Figuur 2)
Opmerking: Deze procedure maakt het mogelijk het verkrijgen van getransformeerde planten. Om te beoordelen van de transgenic effect, is een negatieve controle nodig. Een optie is de procedure met behulp van een A. tumefaciens getransformeerd met de lege vector te volgen. Wild type planten kunnen als alternatief worden gebruikt.
- Knippen en deze plaatsen een blad van de 3-4-week-oude planten (figuur 2A) in een petrischaal. Met behulp van een scalpel uitsluiten van de bast en snoeien dwarse (1-3 afhankelijk van de grootte van het blad) vanaf het midden van het blad aan de randen te vermijden ze afsnijden (figuur 2B).
- Onmiddellijk plaats van het blad drijvend op 10 mL verse 2MS vloeibare media in een petrischaal met de abaxial kant omhoog en sluit de plaat. Herhaal de stap die plaats bieden aan maximaal 15 vertrekt voor cv. Désirée en 25 verlaat voor ssp. eenndigena (afhankelijk van de grootte van het blad).
- Voeg onmiddellijk 80 µL van A. tumefaciens cultuur bij OD600 = 0,8 in de vloeibare media en meng de plaat handmatig voor 1 min voor het distribueren van de bacteriële oplossing.
- Zorgvuldig verzegelen met het afdichten van de film, dek af met aluminiumfolie en incubeer gedurende 2 dagen in een zaal bij 24 ° C te laten de transformatie zich voordoen.
- Breng de bladeren abaxial kant tot CIM medium (figuur 2B) te houden en hen Incubeer gedurende één week in een kabinet groei.
- Schraap het CIM-medium met de pincet, zodat de bladeren beter kunnen worden ondergebracht op de media.
- Breng de bladeren abaxial kant tot SIM-medium (figuur 2C) houden en broeden ze in een groei kabinet, vernieuwen van het medium om 7-10 dagen, tot de scheuten zijn ongeveer 2 cm hoog.
- Schraap het SIM-medium met de pincet, zodat de bladeren kunnen volledig worden omgeven door de media. Wanneer de naar voren gekomen scheuten het deksel bereikt, werken met hoge petrischalen (100 x 20 mm, hoogte x diameter).
Opmerking: De eelt zullen vormen na 2-3 weken in SIM-medium (figuur 2D) en de scheuten na 6-7 weken (figuur 2E). De scheuten zal worden beschouwd als onafhankelijke modificaties als zij uit eelt gevormd uit onafhankelijke wonden voortkomen.
- Knip drie schiet naar voren gekomen uit elke callus (beschouwd als "transformation event" de dezelfde) (figuur 2E), wroeten, overdracht kunnen cultuur kolven met MG medium aangevuld met cefotaxime natrium [250 mg/L] om de subset label met een nummer en Incubeer in een behuizing voor 3-4 weken of totdat de scheuten krachtige (figuur 2F zijn) groei.
Opmerking: Wanneer de scheuten, snijden verwijdert ook de eelt anders de wortel niet maakt.
- Herhaal de stap zo vaak als onafhankelijke regels zijn nodig. Tot 5 verschillende transformatie kunnen gebeurtenissen worden geplaatst in een maatkolf van cultuur met een diameter van 8 cm te werken in het volste vertrouwen dat het planten van verschillende gebeurtenissen worden niet gemengd.
- Selecteer het gezondste bedrijf van elke gebeurtenis, knippen het apicale segment van het schieten met 3-4 stengelleden en breng dit in een nieuwe cultuur-kolf met 2MS medium aangevuld met cefotaxime natrium [250 mg/L].
Opmerking: 3-6 weken die de plant efficiënt zal groeien, ontwikkelen van een krachtige shoot en wortels.
- Terugbrengen naar de kamer de niet-geselecteerde scheuten totdat de geselecteerde plant volledig heeft ontwikkeld.
- Segmenten van de stengel van de plant met ten minste één stengellid of met de apicale bud knippen en deze overbrengen naar nieuwe 2MS medium aangevuld met cefotaxime [250 mg/L]. Broeden ze in de kast groei.
- Elke 3-4 weken om de regels in vitro getransformeerd worden gerepliceerd.
Opmerking: De cefotaxime natrium is nodig in ten minste drie daaropvolgende overdrachten naar 2MS medium om zeker te zijn om te doden van de A. tumefaciens; Daarna, als A. tumefaciens begroeiing wordt waargenomen, overbrengen in de planten weer 2MS media aangevuld met cefotaxime natrium.
- Karakteriseren het fenotype van de plant, planten voor de bodem voor hun volledige karakterisering of naar overbrengen hydrocultuur cultuur voor inspectie van de wortel.
- De knollen geproduceerd in de bodem te verspreiden en onderhouden van de vastgestelde regels te houden.

Figuur 2: Tijdlijn te verkrijgen van de aardappel omgezet planten met behulp van A. tumefaciens. De cumulatieve weken te bereiken van elk stadium van het transformatieproces en de volgende stappen om de planten groeien worden weergegeven. Representatieve beelden van verschillende stadia worden afgebeeld: de opening van het proces met behulp vertrekt vanuit 3 - weken oude in vitro planten (A), de overdracht van de gewonde en geïnfecteerde verlaat aan de CIM-media (B), de bladeren toen overgedragen aan SIM-media (C), de visualisatie van de eelt rond de gewonde gebieden na 2-3 weken in SIM-media (D), de vorming van de shoot na 9-11 weken in SIM-media (E) en de scheuten na wordt overgedragen aan MG media (F). Klik hier voor een grotere versie van dit cijfer.
5. hydroponic cultuur
- Voorbereiden van de Hoagland oplossing voor een halve sterkte (0,5 x) (Tabel S2) in een 10 L emmer.
- Dompel een aquarium pomp teneinde homogeniteit en goede zuurstof voorwaarden te behouden.
- Betrekking hebben op de muren van de emmer met aluminiumfolie om te groeien van de wortels in donkere omstandigheden.
- Het vermijden van wortel schade, overbrengen in in vitro planten hydrocultuur cultuur.
Opmerking: Verwijder eventuele resterende in vitro medium uit wortels om te voorkomen dat micro-organisme proliferatie tijdens de incubatie door zorgvuldig schudden van de wortels ondergedompeld in water.
- De planten met transparante film als een kas te maken voldoende acclimatisatie en broeden in de groeiende zaal bedekken.
- Maak gaten in de film na 3 dagen en volledig één week na verwijderen.
- Vervangen door verse media elke 10 dagen.
6. GUS histochemische reporter gene assay
Opmerking: In ons geval de GUS analyse werd uitgevoerd met wortels van 2-3 weken in hydrocultuur of in vitrogekweekt.
- Herstellen van de wortels met 90% gekoeld aceton (v/v) en Incubeer het gedurende 20 minuten op ijs.
- Het uitvoeren van twee wasbeurten met gedestilleerd water.
- Toevoegen van verse GUS kleurstofoplossing (tabel 1) en de toepassing van vacuüm (-70 Pa) voor 20 min.
- Incubeer bij 37 ° C in het donker te beschermen van de lichtgevoelige GUS voor 4 uur of totdat een blauwe kleur zichtbaar is.
Opmerking: De aanwezigheid van ferri- en ferrocyanide in GUS oplossing minimaliseren de verspreiding van reactieproducten en bieden meer precieze lokalisatie.
Let op: Gebruik een zuurkast en Draag beschermende kleding bij hantering van de giftige cyanide derivaten in GUS oplossing (kalium Hexacyanoferraat en kaliumferrocyanide). Het substraat GUS en het materiaal ter beschikking moeten veilig worden afgevoerd.
- GUS kleurstofoplossing Verwijder en verwerp het in geschikte containers.
- Het uitvoeren van twee wasbeurten met ethanol 70% (v/v).
- Onder een Microscoop helder veld observeren.
Opmerking: GUS kleuring is stabiel voor een paar weken; tijdens de eerste week was het signaal GUS is echter duidelijk en diffundeert minder in aangrenzende cellen. Voor langere opslag, verzegelen van de buis en op te slaan bij 4 ° C.

Tabel 1: GUS kleuring oplossing recept.