Wordt uitgebreid gebruikt, Sum Frequency Generation (sfg) Vibrationele spectroscopie kan helpen om te onthullen keten conformationele order en secundaire structurele verandering gebeurt op polymeer en biomacromolecule interfaces.
Methodenartikel
Wordt uitgebreid gebruikt, Sum Frequency Generation (sfg) Vibrationele spectroscopie kan helpen om te onthullen keten conformationele order en secundaire structurele verandering gebeurt op polymeer en biomacromolecule interfaces.
Als een tweede-orde niet-lineaire optische spectroscopie, is Sum Frequency Generation (SFG) Vibrationele spectroscopie op grote schaal gebruikt bij het onderzoeken van verschillende oppervlakken en interfaces. Deze niet-invasieve optische techniek kan de lokale informatie op moleculair niveau bieden met monolaag of submonolayer gevoeligheid. We bieden hier een experimentele methodologie voor het selectief detecteren van de begraven interface voor zowel macromoleculen als biomacromoleculen. Met dit in gedachten, worden interfaciaal secundaire structuren van zijde aan en water structuren rond model korte-keten oligonucleotide duplex besproken. De eerste toont een keten overlapping of ruimtelijke opsluiting effect en de laatste toont een bescherming functie tegen de CA2 + ionen die voortvloeien uit de chirale wervelkolom bovenbouw van water.
Ontwikkeling van de som frequentie generatie (sfg) Vibrationele spectroscopie kan worden gedateerd terug naar het werk van Shen et al. dertig jaar geleden1,2. De uniciteit van de Interfaciale selectiviteit en sub-monolayer gevoeligheid maakt sfg Vibratie spectroscopie gewaardeerd door een groot aantal onderzoekers op het gebied van fysica, chemie, biologie, en materiaalkunde, etc3,4 ,5. Momenteel wordt een breed scala aan wetenschappelijke vraagstukken met betrekking tot oppervlakken en interfaces onderzocht met behulp van SFG, met name voor complexe interfaces met betrekking tot polymeren en biomacromoleculen, zoals de ketting structuren en structurele ontspanning in de begraven polymeer interfaces, de eiwit secundaire structuren, en de Interfaciale water structuren9,10,11,12,13,14, 15,16,17,18,19,20,21,22,23, 24,25,26.
Voor polymeer oppervlakken en interfaces worden dun-film samples over het algemeen bereid door een spin coating om de gewenste oppervlakken of interfaces te verkrijgen. Het probleem ontstaat door de signaalstoring van de twee interfaces van de as-prepared films, wat leidt tot ongemak voor het analyseren van de verzamelde sfg Spectra27,28,29. In de meeste gevallen is het trillationeel signaal alleen van een enkele interface, hetzij film/substraat of film/het andere medium, wenselijk. Eigenlijk is de oplossing voor dit probleemvrij eenvoudig, namelijk om de licht velden op de wenselijke interface te maximaliseren en de licht velden op de andere interface te minimaliseren. Vandaar dat de Fresnel-coëfficiënten of de lokale veld coëfficiënten moeten worden berekend via het dunne film model en moeten worden gevalideerd met betrekking tot de experimentele resultaten3,9,10,11, 12,13,14,15,30.
Met de bovenstaande achtergrond in het achterhoofd, kunnen sommige polymeer-en biologische interfaces worden onderzocht om de fundamentele wetenschap van het moleculaire niveau te begrijpen. In het volgende, het nemen van drie interfaciaal problemen als voorbeelden: indringende poly (2-hydroxyethyl methacrylaat) (phema) oppervlak en begraven interface met substraat9, vorming van zijde aan (SF) secundaire structuren op het polystyreen (PS) oppervlak en water structuren omringende model korte-keten oligonucleotide duplex16,21, we zullen laten zien hoe de sfg Vibrationele spectroscopie helpt om de interfaciaal moleculaire structuren te onthullen in verband met de onderliggende wetenschap.
Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.
1. SFG experimentele
2. Fresnel coëfficiënten
1
de effectieve tweede-orde niet-lineaire gevoeligheids tensor wordt aangeduid.
bestaat uit drie delen, namelijk de prisma/polymeer-interface, de polymeer/onderste medium interface (onderste medium omvat gas, vloeibaar of vast) en de niet-resonante achtergrond, zoals getoond in de volgende vergelijking.
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
243. CRonald sfg polarisatie combinatie
4. monstervoorbereiding
25
staat voor de intensiteit van de QTH vibratie mode
, vertegenwoordigt de resonante frequentie
, geeft de halve breedte op halve maximum (hwhm)
en vertegenwoordigt de scanfrequentie van de incident IR Beam.Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.
In de Fresnel coëfficiënt deel van protocol sectie, we hebben aangetoond dat, theoretisch, het haalbaar is om selectief te detecteren slechts één enkele interface in één keer. Hier, experimenteel, hebben we bevestigd dat deze methodologie in principe correct is, zoals weergegeven in Figuur 5 en Figuur 6.
Figuur 5 toont de begraven INTERFACIALE phema structuur na water inbraak met een ~ 150 Nm phema hydrog...
Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.
Om de structurele informatie op moleculair niveau te onderzoeken, heeft sfg zijn inherente voordelen (d.w.z. monolaag-of submonolayer-gevoeligheid en Interfaciale selectiviteit), die kunnen worden toegepast om verschillende interfaces te bestuderen, zoals de vaste/vaste, vaste/ vloeistof, vaste/gas, vloeistof/gas, vloeistof/vloeibare interfaces. Hoewel het onderhoud van de apparatuur en de optische uitlijning nog steeds tijdrovend zijn, is de uitbetaling belangrijk omdat de gedetailleerde moleculaire informatie op de opp...
Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.
We hebben niets te onthullen.
Deze studie werd gesteund door het State Key Development Program voor fundamenteel onderzoek van China (2017YFA0700500) en de National Natural Science Foundation of China (21574020). De fundamentele onderzoeksfondsen voor de centrale universiteiten, een project gefinancierd door de prioritaire academische programma ontwikkeling van de Jiangsu hogeronderwijsinstellingen (PAPD) en het National demonstratie Center for experimental Biomedical Engineering Onderwijs (Zuidoost-Universiteit) werden ook zeer gewaardeerd.
Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.
| Naam | Bedrijf | Catalogusnummer | Opmerkingen |
|---|---|---|---|
| 1,2-dipalmitoyl-sn-glycero-3-fosfocholine (DPPC) | Avanti Polar Lipids, Inc. | 850355P-1g | |
| Watervrij ethanol | Sinopharm Chemical Reagent Co., Ltd | 100092680 | ≥99.7% |
| CaF2 prisma | Chengdu YaSi Optoelectronics Co., Ltd. | ||
| Calciumchloride watervrij | Sinopharm Chemical Reagent Co., Ltd | 10005817 | ≥96.0% |
| Gedeutereerd DPPC (d-DPPC) | Avanti Polar Lipids, Inc. | 860345P-100mg | |
| Elektromagnetische oven | Zhejiang Supor Co., Ltd | C21-SDHCB37 | |
| Langmuir-Blodgett (LB) trog | KSV NIMA Co., Ltd. | KN 2003 | |
| Watervrij lithiumbromide | Sinopharm Chemical Reagent Co., Ltd | 20056926 | |
| Milli-Q-synthesesysteem | Millipore | Ultrapuur water | |
| Plasma-reiniger | Chengdu Mingheng Science&Technology Co., Ltd | PDC-MG | Zuurstofplasma-reiniging |
| Poly(2-hydroxyethylmethacrylaat) (PHEMA) | Sigma-Aldrich Co., LLC. | 192066 MSDS | Mw = 300 000 |
| Polystyreen | Sigma-Aldrich Co., LLC. | 330345 MSDS | Mw = 48 kDa en Mn = 47 kDa |
| Zijderupscocons | Van Bombyx mori | ||
| Enkel complementair streepje oligonucleotide | Nanjing Genscript Biotechnology Co., Ltd. | H03596 | 5'-CGAAGGCTTCCAGCT-3' |
| Enkelstrengs oligonucleotide | Nanjing Genscript Biotechnology Co., Ltd. | H04936 | 3¢-eind gemodificeerd met cholesterol-triethyleenglycol(Chol-TEG) (5¢-GCTTCCGAAGGTCGA-3¢) |
| Watervrij natriumcarbonaat | Sinopharm Chemical Reagent Co., Ltd | 10019260 | ≥99.8% |
| Spin-coater | Institute of Microelectronics of the Chinese Academy of Sciences | KW-4A | Voor de voorbereiding van polymeerfilms |
| Step-profiler | Veeco | DEKTAK 150 | Voor de meting van de dikte van films |
| Sum frequency generation (SFG) vibratiespectroscopiesysteem | EKSPLA | Een commercieel picoseconde SFG-systeem |
Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.
Toestemming aanvragen om de tekst of afbeeldingen van dit JoVE-artikel te hergebruiken
Toestemming aanvragen