Alle dier procedures werden uitgevoerd met de goedkeuring van de Universiteit van North Carolina bij Chapel Hill Animal Care and use Committee (IACUC).
1. hersen dissectie en cultuur van primaire muis astrocyten
Opmerking: het volgende protocol is aangepast aan de gepubliceerde methoden, die de oorspronkelijke procedure volgt die is ontwikkeld door McCarthy en devellis13,14,15. Gemengde celculturen van McCarthy/deVellis (MD) astrocyten worden bereid uit postnatale dag 2 − 4 (P2 − P4) muis cortices, behandeld met een anti-mitotische factor, en gezuiverd tot de uiteindelijke verrijkte astrocyten cultuur. Vier cortices van muis pups van beide seks zijn voldoende om één T75 weefselcultuur kolf cultuur te genereren.
- Mantel de bodem van T75 kolven (100% schuine halsopening, 0,22 μm hydrofoob ventilerende filter dop) met poly-D-Lysine (1 mg/mL in 0,1 M Tris-buffer, pH 8,5) en incuberen bij 37 °C gedurende 24 uur vóór aanvang van de dissectie.
- Voor aanvang van de dissectie procedure, warm 30 mL van de astrocyten kweekmedia (Dulbecco's gemodificeerde Eagle's medium [DMEM] hoge glucose, 10% warmtegeïnactiveerd foetaal serum, 1% peniciloot/streptomycine) bij 37 °C en ontdooit een 5 mL aliquot van 2,5% trypsine op ijs. Bereid twee ontsneden gerechten (60 mm diameter) op ijs gevuld met 6 mL van de gebalanceerde zoutoplossing van Hank (HBSS) zonder CA2 + of mg2 +.
- Desinfecteer alle chirurgische hulpmiddelen (fijne punt pincet, ontleed schaar, vannas schaar recht, Graefe pincet met gebogen uiteinden) in 70% ethanol vóór en tussen elke sectie.
- Spuit het hoofd en de nek van de P2 − P4 muis pups met 70% ethanol voordat u ze snel euthanateren door het onthoofding met een chirurgische schaar. Voer een posterieure van anterieure middellijn incisie langs de hoofdhuid om de schedel bloot te leggen. Snijd de schedel voorzichtig van de nek naar de neus.
- Voer twee extra laterale incisies superieur aan de ogen. Gebruik fijne pincet om de schedel kleppen voorzichtig naar de zijkant te draaien. Verwijder de hersenen en plaats deze in de eerste ontleden Dish gevuld met ijskoude HBSS zonder CA2 + of mg2 +. Houd het gerecht op ijs en ga verder met het oogsten van de rest van de hersenen.
Opmerking: Voer de rest van de dissectie procedure uit onder een ontleed bereik.
- Verwijder de olfactorische bollen met Vannas schaar of fijne pincet (Figuur 1AI). Met de gebogen punt Tang op het snijpunt van de dwars-en interhemiferische kloven, plaatst u zachtjes een tweede paar gebogen punt Tang tussen de cortex en diencephalon, waarbij u langzaam de Tang opent om de hersenhelften van de rest van de hersenen (Figuur 1AII, AIII). Verwijder het ongewenste weefsel (Figuur 1AIV).
- Voor elke corticale hemisfeer, verwijder voorzichtig de hersenvliezen met fijne tip pincet. Verwijder desgewenst de hippocampus van de cortices. Breng de ontleed muis cortices over in een tweede gerecht gevuld met ijskoude HBSS zonder CA2 + of mg2 + en houd het op ijs terwijl de overgebleven hersenen worden ontleed.
Opmerking: Voer de volgende stappen onder aseptische omstandigheden uit in een laminaire stroom afzuigkap.
- Snijd de ontsneden cortices in kleine stukjes (ongeveer 2 − 4 mm) met behulp van steriele scherpe chirurgische schaar of een scalpel. Breng het ontleed weefsel over in een conische buis van 50 mL met enzym oplossing (22,5 mL HBSS zonder CA2 + of mg2 +, 2,5 ml 2,5% trypsine). Incuberen bij 37 °C gedurende 30 minuten met zachte inversie elke 10 min.
- Verzamel het verteerde weefsel door centrifugeren bij 300 x g gedurende 5 minuten en verwijder de enzym oplossing door decantatie (gebruik geen vacuüm aspirator). Voeg 10 mL astrocyten kweekmedia toe en dissocieren het weefsel in afzonderlijke cellen door de oplossing 20 − 30x te pipetteren met behulp van een serologische Pipet van 10 mL.
- Filtreer de celsuspensie door een 70 μm celzeef om celklonten en onverteerd weefsel te minimaliseren. Vang het filtraat op in een schone 50 mL conische buis en stel het totale volume in op 20 mL met astrocyten kweekmedia. Evalueer op dit punt de efficiëntie van de corticale dissociatie door 10 μL celsuspensie te mengen met 10 μL trypaan blauw en cellen te tellen met een hemocytometer.
Opmerking: een preparaat van vier P2 − P4 muis cortices levert 10 − 15 x 106 enkelvoudige cellen op.
- Aspireren de poly-D-Lysine coating oplossing uit de T75 cultuur kolven en was tweemaal met steriel water. Plaat de 20 mL celsuspensie en incuberen bij 37 °C en 5% CO2.
2. zuivering en instandhouding van de astrocyten culturen
Opmerking: Voer alle media wijzigingen uit onder aseptische omstandigheden in een laminaire stroom afzuigkap met behulp van steriel gefilterd (0,22 μm filtermembraan) astrociet-media opgewarmd tot 37 °c.
- Vervang de celmedia 48 h na plating (dag in vitro 2, DIV2).
- Op DIV5, vervang de media met verse astrociet cultuur media aangevuld met 10 μM Cytosine uracilarabinoside (araC).
Opmerking: deze stap vergemakkelijkt het verwijderen van verontreiniging cellen, waaronder fibroblasten en andere gliacellen. Het is belangrijk om de culturen met AraC niet langer dan 48 uur te behandelen, omdat een langere incubatietijd de levensvatbaarheid van astrocyten vermindert.
- Op DIV7, verander media naar astrociet cultuur media zonder araC en begin met het controleren van de cultuur confluentie dagelijks. Zodra de cellen 80% samenvloeiing hebben bereikt, worden twee-T75 kolven voor elke niet-gezuiverde astrociet cultuur kolf met poly-D-Lysine en geïninbroed bij 37 °c gedurende ten minste 8 uur tot 's nachts.
- De volgende dag, begin de astrocyten zuivering door het schudden van de kweek kolven bij 180 rpm gedurende 30 min in een 37 °C orbitaal schudden incubator. Verwijder de media en vervang deze door verse astrocyten kweekmedia. Schud cellen bij 240 rpm gedurende 6 uur in een 37 °C orbitale schud incubator. Prewarm 1x fosfaat-gebufferde zoutoplossing (PBS), astrocyten kweekmedia en 0,25% trypsine-EDTA tot 37 °C 20 − 30 min voor het einde van de schud periode.
Opmerking: er is geen co2-incubatie vereist tijdens de schud stappen. Indien gewenst, de media verzameld na de 30-min en 6-h schudden stappen kunnen worden gebruikt voor het kweken van Microglia en oligodendrocyten, respectievelijk. AraC behandeling van de gemengde cultuur zal echter de overvloed van de andere gliacellen verminderen.
- Verwijder de kweek kolven uit de shaker en vervang de media onmiddellijk door 10 mL warme 1x PBS per kolf. Verwijder PBS en voeg 3 mL 0,25% trypsine-EDTA per kolf toe. Inincuberen bij 37 °C en 5% CO2, elke 5 min controleren op loslating.
- Zodra de cellen uit de kolf zijn losgemaakt, moet u trypsinoisatie stoppen door 10 mL astrocyten kweekmedia toe te voegen. Breng losgekoppelde astrocyten over in een conische buis en pellet cellen van 50 mL door centrifugeren bij 300 x g gedurende 5 min. aspirate supernatant en re-Suspendeer de cellen in 40 ml van de astrocyten cultuur media.
- Was de poly-D-Lysine-gecoate T75 kolven tweemaal met steriel water en plaat 20 mL van de gezuiverde astrocyten suspensie. Keer terug naar de incubator 37 °C en 5% CO2 . Verander de Astrocyt cultuur media om de twee dagen voor nog eens 10 dagen totdat astrocyten volwassen zijn.
Opmerking: elke T75 kolf van gezuiverde astrocyten moet voldoende zijn om 2 nieuwe T75 kolven met 3 x 105 cellen bij het beplating te produceren.
- Herhaal stap 2.5 − 2.7 voor latere stadia of voor het plaat astrocyten voor microscopie.
NB: de zuiverheid van de astrocyten culturen na de toevoeging van AraC en na zuivering kan kwalitatief worden beoordeeld door middel van brightfield microscopie, of meer bepaald door het percentage van gliacellen fibrylzuur proteïne (GFAP)-positief te kwantificeren cellen per gezichtsveld in fluorescerende afbeeldingen (Figuur 1B, C).
3. transfectie van fluorescendig gelabelde plasmiden
- De dag voorafgaand aan de transfectie of labeling, zaad astrocyten op gewenste dichtheid voorbeeld vorming 24 − 48 h post-transfectie. Een aanbevolen dichtheid voor 24-Wells platen of 14 mm glazen bodem putjes is 2 x 104 cellen/goed.
Opmerking: dit protocol is geoptimaliseerd voor de transfectie van astrocyten verguld op 12 mm glazen dekstroken op 24-Wells platen of 14 mm glazen bodemputten met behulp van een lipofection-gebaseerde methode. De reagentia moeten worden geschaald afhankelijk van de grootte van de kweek schaal waarin de astrocyten groeien.
- Verdun het lipofection-reagens (tabel met materialen) in gereduceerde serum media (tabel met materialen). Om de verhouding van lipofection reagens tot DNA te optimaliseren, test een aantal adequate verdunningen. Als u bijvoorbeeld het in dit Protocol gebruikte reagens gebruikt (tabel van de materialen), Verdun dan 2, 3, 4 en 5 μL van het lipofection-reagens in 50 μL van de media met verlaagd serum.
- Verdun 5 μg hoog zuiver DNA in 250 μL van de media met verlaagd serum. Voeg 5 μL lipofection Enhancer reagens (tabel van materialen). Combineer de buis met het lipofection-reagens met een gelijk volume van de DNA-lipofection Enhancer mix. Meng door pipetteren en incuberen bij kamertemperatuur (RT) gedurende 15 minuten.
- Verwijder astrocyten kweekmedia en voeg transfectie mix (stap 3,3) toe aan cellen dropwise. Na een incubatie van 6 uur bij 37 °C en 5% CO2, vervangt u het transfectie complex door een geschikte hoeveelheid Astrocyt kweekmedia (2 ml voor glazen bodem gerechten van 14 mm). Incuberen voor een extra 24 − 72 h voordat u doorgaat naar de beeld verwerving. Bewaak nauwgezet de duur van de incubatie stap om de beste balans te bereiken tussen eiwit expressie en levensvatbaarheid van de cellen.
4. etikettering van late endosomes/lysosomes met fluorescentie sondes
Opmerking: sommige cargo's kunnen worden gelabeld met behulp van fluorescerende kleurstoffen met een hoge affiniteit voor Cargo-specifieke eiwitten. In het volgende voorbeeld wordt de etikettering van late endosomes/lysosomes toegestaan met een fluorescerende acidotrope sonde.
- Verdun de lysosomale-etiketterings sonde (tafel van de materialen) in 200 μL van de cultuur van de astrocyten tot een werkconcentratie van 1 μM en breng deze aan op astrocyten uit stap 3,1 met een dichtheid van 2 x 104 cellen/goed. Inincuberen gedurende 30 min bij 37 °C.
- Was de cellen één keer met warme astrocyten cultuur media en vervang deze door Imaging media (tabel met materialen). Ga onmiddellijk naar Live Imaging.
5. Image Acquisition met behulp van een time-lapse Imaging systeem
Opmerking: timelapse-Live beelden moeten worden uitgevoerd met een fluorescentiemicroscoop die is uitgerust met een high-speed camera, duidelijke scherpstelling, incubatie kamer en een 40x-olie doelstelling met een hoog numeriek diafragma (bijv. plan-Apochromat 1.4 NA). Er is een verscheidenheid aan acquisitie software beschikbaar voor time-lapse Imaging. Selectie van het microscopie systeem en acquisitie software moet gebaseerd zijn op hun beschikbaarheid en geschiktheid voor de doelstellingen van de specifieke studie. Hieronder vindt u enkele algemene richtlijnen.
- Plaats de kweekkamer of het gerecht in de juiste adapter op de Microscoop. Selecteer met behulp van epifluorescentie licht de cellen die fluorescerende eiwitten of sonde uitdrukken om op te nemen. Pas de fluorescerende monster verlichting aan om de geselecteerde cellen te visualiseren met behulp van de digitale camera. Vermijd het gebruik van hoge verlichting die fotobleaching en fototoxiciteit kan veroorzaken. Pas scherpstelling en zoomen aan.
- Verkrijg één Z-stack time-lapse serie met een frequentie van 1 frame elke 2 s voor tijdsintervallen variërend tussen 300 s en 500 s met behulp van de zoom en duidelijke focus functies.
Opmerking: de dynamiek van de handel (snelheid, bewegings frequentie, enz.) zal variëren afhankelijk van het eiwit van belang, dus het tijdsverloop van de overname kan aanpassing vereisen. Bijvoorbeeld, mitochondriën zijn minder beweegbaar dan lysosomen en vertonen frequente pauzes. In dit geval is het geschikter om de verwervings parameters aan te passen naar 1 frame elke 5 s voor 800 s.
- Sla timelapse-afbeeldingen op en exporteer ze als AVI-of TIFF-stack bestanden.
6. beeldanalyse
Opmerking: beeldanalyse werd uitgevoerd met behulp van de KymoToolBox plugin voor ImageJ/Fiji16. Gedetailleerde stap-voor-stap schriftelijke instructies zijn online beschikbaar17. De volgende verkorte stappen moeten voldoende zijn om de kymografen te maken en de deeltjes transport parameters te extraheren.
- Open time-lapse-beeld volgorde in ImageJ/Fiji-software. Importeer afbeeldingen uit het menu bestand als AVI-of TIFF-stack bestanden. Converteer de afbeeldingen naar 8-bits of 16-bits door een van deze afbeeldingstypen te selecteren met behulp van het gereedschap tekst in het menu afbeelding . Als u werkt met RGB-bestanden, splitst u kanalen met behulp van de tool splitsen kanaal beschikbaar onder de kleur functie in het menu afbeelding .
- Om een kymograph (representatie in positie en tijd van deeltjes trajecten) te genereren, tekent u elk spoor waarin deeltjes bewegen door een lijn langs de trajecten van de deeltjes te traceren met behulp van het gesegmenteerde lijn gereedschap. Om de directionaliteit van de beweging correct toe te wijzen, tekent u de polylijn met dezelfde gewenste richtings Conventie voor alle films, zodat de polariteit consistent is binnen en tussen alle cellen die worden bestudeerd. Teken bijvoorbeeld de polylijn vanuit het midden van de cel naar de omtrek of omgekeerd. Pas de lijnbreedte aan de dikte van het spoor aan door te dubbelklikken op het gereedschap lijn .
- Voer de macro Draw Kymo van de plug-in KymoToolBox uit met een lijnbreedte van 10. Er verschijnt een vraag om de afbeelding in de tijd te kalibreren (aantal frames, framesnelheid) en spatie (x, y-resolutie). Eenmaal gekalibreerd, worden de kymografen gegenereerd en kunnen ze worden opgeslagen als TIFF-bestanden voor gegevens presentatie of verdere deeltjes analyse.
- Wijs deeltjes trajecten toe door elk deeltje in de kymograph handmatig te volgen met behulp van het gesegmenteerde lijn gereedschap voor de volledige duur van de overname. Noteer elk deeltjestraject als een regio van belang (ROI) met behulp van de ROI Manager -tool in het menu analyse/extra . Sla alle ROIs per timelapse-video op voor verdere analyse.
Opmerking: het is van cruciaal belang om het juiste traject voor afzonderlijke deeltjes op de kymograph toe te wijzen om de meest nauwkeurige berekening van transport parameters te bereiken.
- Voer de macro analyze kymo van de plug-in KymoToolBox uit. Er wordt een venster geopend waarin wordt gevraagd de "uiterlijke" richting van de deeltjes beweging (van links naar rechts of omgekeerd) te definiëren in het vervolgkeuzemenu. Deze selectie is afhankelijk van de positie van de fluorescerende ladingen-afbeelding ten opzichte van de Nucleus of de rand van de cel, zoals vastgesteld in stap 6,2. Als de Nucleus bijvoorbeeld links van de cargo's is geplaatst en de polylijn in stap 6,2 van de Nucleus is verwijderd, definieert u de beweging van de uitwendige deeltjes als "van links naar rechts".
- Definieer de limiet snelheid (minimale snelheid waarmee een lading wordt beschouwd als motiel) in het venster Kymo analyseren . Voor cargo's die bij snelle intracellulaire transport snelheden bewegen, is 0,1 μm/seconde een geschikte keuze. Wijzig deze waarde om de gevoeligheid van de software voor elke lading van belang aan te passen. Pas de lijnbreedte aan de dikte van elk deeltjes traject aan.
- Selecteer in het venster kymo analyseren de optie alle gegevens en de Geëxtregeerde coördinaten van het logboek registreren. Dit berekent verschillende vrachttransport parameters, waaronder gemiddelde snelheid, actieve snelheid, uiterlijke snelheid, cumulatieve afgelegde afstand, afgelegde afstand in hetzij de binnen-of naar buiten richting, het aantal schakelopties voor elk deeltje, het percentage tijd bewegen in elke richting of onderbroken, enz. Gegevens die worden berekend voor afzonderlijke tracks worden vervolgens gegroepeerd per kymograph en opgeslagen in tekstbestanden die specifiek zijn voor elke afbeelding.
Opmerking: de optie gekleurde Kymo tonen van de kymo -macro analyseren genereert een kleurgecodeerde overlay van het pad over de oorspronkelijke kymograph. Deeltjes die naar buiten reizen, zijn groen gekleurd, naar binnen rood en stationaire deeltjes in blauw. De rapport coördinaten op de oorspronkelijke stapel optie van de kymo analyseren macro genereert een kleurgecodeerde overlay van de geëxtrapoleerd object positie op de oorspronkelijke time-lapse video en kymograph.