$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Een voldoende verrijking van een kiem celtype wordt gewoonlijk geacht boven 80%6te liggen. Het MDR-protocol werkt bijzonder goed voor het verrijken van ronde spermatiden. Een groot aantal > 90% zuivere ronde spermatiden kan routinematig worden verkregen met behulp van deze techniek. Optimale fracties van pachytene spermatocyten en rek spermatiden zijn verrijkt tot ~ 75% en ~ 80%, respectievelijk. Het verlengen van spermatiden neiging om op de top van de gradiënt te blijven en worden verzameld met de eerste breuk. In het getoonde voorbeeld bevatte breuk 1 ~ 80% van de rek-spermatiden (Figuur 2B). De meeste rek-spermatiden die met deze techniek zijn verkregen, hebben gecondenseerde kernen, terwijl niet-gecondenseerde vroege rek-spermatiden schaars zijn (Figuur 2A). De volgende fracties bevatten verrijkte ronde spermatiden. In het voorbeeld was de verrijking van ronde spermatiden meer dan 90% in fracties 2, 3 en 4, en werd verrijking boven 80% geheel in zeven fracties (2 − 8) (Figuur 2B) waargenomen. Door hun grote grootte, pachytene spermatocyten sneller sediment en worden de laatste verzameld. In het zuiverings voorbeeld bedroeg de verrijking ongeveer 75% in fracties 14 en 15 (Figuur 2B).
Hoewel nucleaire morfologie, gevisualiseerd door DAPI-kleuring, meestal voldoende is voor de herkenning van de cellen, kan immunofluorescentie analyse worden uitgevoerd om de analyse te ondersteunen. PNA kleurt de ontwikkelende en van ronde en rekbare spermatieën, en het acrosomale uiterlijk kan worden benut om ronde spermatieën verder te categoriseren in stappen 1 − 8 van differentiatie10. Het onderscheiden van PNA-gekleurd rek en ronde spermatiden berust op de verschillen in hun nucleaire vorm (Figuur 2C, linker paneel). Anti-DDX4 antilichaam is een nuttige marker voor de ronde spermatid fracties, omdat het een enkele DDX4-positieve perinucleaire korrel visualiseert, het chromatoïde lichaam (CB), in het cytoplasma van elke ronde spermatid. Deze CB-specifieke kleuring is gemakkelijk te onderscheiden van breder verspreide cytoplasmische kleuring in spermatocyten (Figuur 2C, middelste paneel). Pachytene spermatocyten kan worden herkend door anti-γh2ax antilichaam dat de nucleaire seks lichaam etiquette die specifiek op de pachyteen fase van de eerste Meiotische divisie verschijnt (Figuur 2C, rechter paneel). In deze zuivering onthulde PNA-kleuring dat MDR-verrijkt ronde spermatid-fracties een mengsel van ronde spermatiden bevatte in verschillende stappen van differentiatie, alle met hun kenmerkende structuur, de DDX4-positieve CB (Figuur 2D, RS-Fractie). Anti-γH2AX heeft de verrijking van pachytene spermatocyten in fractie 16 verder gevalideerd (Figuur 2D, pspc-Fractie).
De celtelling toonde aan dat het aantal cellen in de ronde spermatid-en pachytene spermatocyten-fracties voldoende is voor verschillende downstreamanalyses. Ronde spermatid fracties (5 − 8) die elk ongeveer 2,5 x 106 cellen bevatten. Daarom, door het bundelen van deze fracties, is het mogelijk om meer dan 10.000.000 cellen te verkrijgen. Pachytene spermatocyt fracties (14 en 15) bevatten meestal iets minder cellen. In deze isolatie werden ongeveer 1,5 − 2,0 x 106 cellen per breuk geteld. De eerste breuk bevatte 0,75 x 106 verlengende spermatiden.
Zoals weergegeven in Figuur 3A, VARIEERDE het totale RNA-bedrag van de meerderheid van fracties van 0,5 − 2,5 μg, wat voldoende is voor downstream RNA-analyses zoals reverse transcriptie-PCR, RNA-sequencing of het visualiseren van RNA op een gel. De hoeveelheid eiwit verkregen uit elke fractie varieert meestal van 20 − 140 μg (Figuur 3B), wat voldoende is voor verschillende westerse blots. Hele cellijnen werden bereid uit verzamelde fracties en de analyse van Western Blot werd uitgevoerd met behulp van antilichamen die DDX4, PIWIL1 en PIWIL2 werden gedetecteerd, die allemaal sterk zijn uitgedrukt in pachytene spermatocyten en ronde spermatiden, evenals de alomtegenwoordige uitgedrukt Glyceraldehyde 3-fosfaat dehydrogenase (GAPDH).
In dit protocol was 10% van de eiwithoudende lysaten afkomstig van enkelvoudige fracties voldoende om al deze eiwitten duidelijk op te sporen op een standaard Western Blot-instelling (Figuur 3C). De hoeveelheid eiwit in één fractie bleek ook voldoende te zijn voor immunoprecipitatie met een antilichaam tegen PIWIL1, alsook voor de opsporing van co-immunoprecipitated PIWIL2 (Figuur 3D). Bovendien is dit protocol met succes gebruikt voor het verkrijgen van verrijkte fracties van pachytene spermatocyten en ronde spermatiden van controle en genetisch gemodificeerde muizen voor downstreamtoepassingen zoals kwantitatieve reverse transcriptie PCR11 en hoge doorvoer RNA-sequencing12.

Figuur 1: voorbereiding van een discontinu BSA-verloop. A) eenserologische pipetpunt van 5 ml voor de bereiding van het verloop. B) een pipetpunt van 1 ml voor de bereiding van het verloop en de verzameling van de kiemcellen na sedimentatie. C) de uitrusting die nodig is voor de bereiding van de helling. D) zijdelingse weergave van de discontinu-dichtheid van de BSA, van de 5% (onder) tot de 1% (top) BSA-oplossing; de 2% en 4% BSA oplossingen zijn blauw van kleur voor een betere visualisatie. Klik hier om een grotere versie van dit cijfer te bekijken.

Figuur 2: representatieve beelden van de verzamelde celfracties en de verrijkings analyse. (A) DAPI-gekleurd testiculaire cellen. De bovenste rij toont testiculaire cellen in het intacte seminifereuze epitheel van een PFA-vaste, paraffine ingesloten testis-sectie (links) of in suspensie (rechts). De onderste rij bevat fracties van verrijkte rek-spermatiden (ES), ronde spermatiden (RS) of pachyteen spermatocyten (PSpc). Schaal staven = 20 μm voor de bovenste rij en 10 μm voor inzetstukken van de onderste rij. B) de relatieve kwantificering van de verschillende typen kiemcellen in elke fractie. Cellen werden handmatig geteld met behulp van de ImageJ-software en geclassificeerd in RS, ES, PSpc, Sertoli-cellen en andere cellen. De breukgetallen en de respectieve percentages van BSA in het verloop worden aangegeven op de x-as. C) immunofluorescentie analyse van testiculaire cellen. Linker paneel: Rhodamine-gelabeld PNA vlekken de acrosome in zowel ES (gele pijl) en RS (witte pijl). Middelste paneel: DDX4 antilichaam vlekken een enkele perinucleaire korrel in RS, die is gemakkelijk te onderscheiden van de meer diffuse cytoplasmisch signaal in spermatocyten (blauwe pijl). Er wordt geen DDX4-signaal gedetecteerd in ES (oranje pijl). Rechter paneel: γH2AX antilichaam herkent de karakteristieke nucleaire geslachts opbouw die alleen aanwezig is in pachytene spermatocyten (γH2AX-negatieve cellen gemarkeerd met een wit sterretje). Schaal staven = 10 μm.D) MDR verrijkte celfracties werden GEËTIKETTEERD met PNA (RS-Fractie), anti-DDX4 (RS-Fractie) en anti-γH2AX (pspc-Fractie) om de celverrijking in elke fractie verder te valideren. Schaal staven = 10 μm. Klik hier om een grotere versie van dit cijfer te bekijken.

Figuur 3: downstream-analyses na MDR-celverrijking. A) RNA werd uit elke fractie geëxtraheerd na een representatieve MDR-celverrijking en gekwantificeerd. De breukgetallen en de respectieve percentages van BSA in het verloop worden aangegeven op de x-as. B) eiwitten werden uit elke fractie gewonnen door lyseren van de celpellet in een radioimmunoprecipitation assay (Ripa) buffer dan gekwantificeerd. C) de extracten van gehele cellen werden bereid en geanalyseerd met behulp van antilichamen tegen DDX4, PIWIL1, PIWIL2 en gapdh door Western blotting. 10% van het lysaat werd van elke aangegeven breuk geladen. (D) immunoprecipitatie werd uitgevoerd vanuit aangegeven fracties met anti-PIWIL1, gevolgd door westerse blotting met anti-PIWIL1 en anti-PIWIL2 antilichamen. Het ingangs monster bevat een mengsel van eiwithoudende lysaten uit verschillende fracties, en de controle immunoprecipitatie (IP) met behulp van konijnen IgG werd ook uitgevoerd vanuit een gemengd lysaat. Klik hier om een grotere versie van dit cijfer te bekijken.

Figuur 4: schematische weergave van het MDR-protocol en de benodigde tijd voor het voltooien van elke stap. Uitgangsmateriaal bestaat uit twee teelballen van een volwassen muis. Het gemiddelde aantal cellen en de hoeveelheid RNA en eiwitten die uit één fractie zijn verkregen, worden aangegeven. Klik hier om een grotere versie van dit cijfer te bekijken.
| Buffer | Reagentia | Voorbereiding | Opslag |
| Krebs-buffer (10x) | 3,26 g KH2po4
| Breng naar 2 L met H2O, filter 0,22 μm en autoclaaf. | Kan gedurende enkele maanden bij 4 °C worden bewaard |
| 139,5 g NaCl |
| 5,89 g MgSO4 •7h2O |
| 50 g dextrose |
| 3,78 g CACL2•2H2O |
| 7,12 g KCl |
| Krebs-buffer (1x) | 4,24 g NaHCO3
| Los NaHCO3 op 100 ml H2o, voeg 200 ml van 10x Krebs buffer, en breng aan 2 L met H2o. | Om vers te worden bereid |
| 200 mL 10x Krebs buffer |
Tabel 1: voorbereiding van de Krebs-buffer.
| BSA-concentratie (w/v) | 10% BSA oplossing | 1x Krebs-buffer |
| 0,50% | 0,5 mL | 9,5 mL |
| 1 | 1 mL | 9 mL |
| 2 | 2 mL | 8 mL |
| 3 | 3 mL | 7 mL |
| 4 | 4 mL | 6 mL |
| 5 | 5 mL | 5 mL |
Tabel 2: bereiding van BSA-oplossingen.
| Spijsvertering oplossing | Werkconcentratie | Reagentia | Voorbereiding |
| Collagenase | 1 mg/mL | Collagenase IV | Weeg 2 mg Collagenase IV af op een conische buis van 50 mL en voeg 2 mL warme 1x Krebs-buffer vlak voor de spijsvertering toe (stap 2,3). |
| Trypsine | 0,6 mg/mL | Trypsine | Weeg 15 mg trypsine af op een conische buis van 50 mL en voeg 25 mL warme 1x KREBS-buffer en 40 μL DNase I toe vlak voor de spijsvertering (stap 2,6). |
| > 3.2 ku/mL | DNase I |
Tabel 3: bereiding van de spijsverteringsenzymen.