Andere methoden die de generatie van gnotobiotische kakkerlakken beschrijven , beschreven ofwel de verzameling van oothecae niet of gebruikten benchmarks die specifiek waren voor andere kakkerlaksoorten om aan te geven wanneer de oothecae bij moeder23,25,26kon worden verwijderd . Oorspronkelijk werden oothecae verzameld uit het houtsnipperbedden in de voorraadtanks, wat resulteerde in zeer lage broedsnelheden (~ 10%) vergeleken met niet-gesteriliseerde oothecae (47%)29. Dit is waarschijnlijk te wijten aan het feit dat onbeschadigde oothecae zich in de loop van de tijd ophopen in de voorraadkooi en er geen manier is om de leeftijd of levensvatbaarheid van ootheca te verifiëren. De toepassing van de "kraamafdeling"-aanpak maakt het mogelijk om vers gedeponeerde oothecae van bekende leeftijd te verzamelen. Dit vergemakkelijkt verder experimentele planning, omdat de onderzoeker kan anticiperen op waarschijnlijke broedtijden voor individuele oothecae. Een andere wijziging ten opzichte van de oorspronkelijke en gepubliceerde protocollen omvat de incubatie van oothecae en nimfen in half verzegelde kamers die ook een oververzadigde natriumchlorideoplossing bevatten. De aanwezigheid van de oplossing handhaaft een relatieve vochtigheid van ongeveer 75%30. Oothecae worden routinematig geïncubeerd bij 30 °C, waarvan is aangetoond dat het het aantal dagen dat nodig is voor incubatie minimaliseert en tegelijkertijd de levensvatbaarheid van de embryo's en het aantal nimfen dat per oothecawordt geproduceerd,maximaliseert. Na het uitkomen worden gnotobiotische nimfen routinematig gekweekt op de tafeltop bij laboratoriumkamertemperatuur en omgevingsomstandigheden, hoewel vochtigheidsgestuurde kamers opnieuw worden gebruikt voor kritische experimenten. Na het vaststellen van deze veranderingen in ootheca-verzameling en incubatie stegen de broedsnelheden tot ongeveer 41% (n = 51), exclusief oothecae verwijderd als gevolg van verontreiniging. Een mogelijke route naar verdere optimalisatie van de broedsnelheden kan het verlengen van de tijd tussen ootheca-verzameling en sterilisatie omvatten. De cuticula van de eicel mag bij de eerste afgifte niet volledig gelooid zijn32, en kan daarom binnen 24 uur na het vallen van de sterilisatie doorlatend zijn voor oplossingen die tijdens sterilisatie worden gebruikt.
Het sterilisatieprotocol met 0,1% perazijnzuur werd aangepast van Doll et al.25. Andere studies hebben alternatieve technieken voor het steriliseren van oothecae23,26 gedocumenteerd. Besmettingspercentages zijn gebaseerd op de niet-destructieve methode om de oothecae op een BHI-helling te incuberen. Deze aanpak is zeer voordelig omdat het een snelle identificatie en verwijdering van verontreinigd oothecae mogelijk maakt. De meeste eerdere protocollen testen op cultureerbare organismen door uitwerpselen of nimfhomogenaat op bacteriologische media te plateren en te controleren op groei22,23,25,27,28,33. In ten minste één geval werd de methode voor het testen van de gnotobiotische status niet volledig beschreven26. Behalve Clayton die een kleine plaat van steriliteit testend medium toevoegde aan het fokken van flessen24, vorige methoden22,23 huisvestte gnotobiotische insecten op bacteriologische media slechts voor korte perioden om het sterilisatieprotocol in eerste instantie te evalueren.
Voortzetting van de huisvesting van de resulterende nimfen op BHI-medium als een ingebouwde kwaliteitscontrolemaatregel maakt het mogelijk hun gnotobiotische status in semi-real-time te controleren - een techniek die in de meeste eerdere methoden niet werd gezien22,23. Dit is vooral handig voor langetermijnexperimenten waarvoor gnotobiotische nimfen moeten worden geopend. Als de BHI-vloer onder nimfen besmet lijkt met bacteriële of schimmelgroei, moet de kolf worden weggegooid. Dit type besmetting treedt meestal op bij het blootleggen van de kolven aan waternimfen, maar het kan ook ontstaan uit de uitwerpselen in het geval van onvoldoende gesteriliseerde oothecae of voedsel. Het gebruik van een laminaire stromingskap bij het water geven verbetert de verontreinigingssnelheid die wordt veroorzaakt door het blootleggen van kolven.
Aangezien niet alle besmetteorganismen aeroob kunnen groeien op BHI-medium, is een extra kweekonafhankelijke methode voor steriliteitstests vereist. Een mogelijke aanpak is microscopie27,maar deze aanpak kan arbeidsintensief zijn. Andere protocollen maken gebruik van op sequenties gebaseerde technieken om organismen te detecteren die aan kweek14,23,27,28kunnen ontsnappen . Dergelijke benaderingen zijn echter vaak duur en moeilijk te interpreteren, omdat de resultaten van sequencingbenaderingen met hoge doorvoer gemakkelijk kunnen worden beïnvloed door verontreiniging op laag niveau van reagentia34 en barcodehoppen35. In plaats daarvan is een nieuwe aanpak ontwikkeld die pcr-versterking van het 16S rRNA-gen gebruikt in combinatie met restrictiefragmentlengtepolymorfisme om zowel het endosymbiont als eventuele vervuilende darmsymbioten te visualiseren. Deze techniek omvat een interne PCR-controle, aangezien het 16S-gen van Blattabacteriumis gesequenced en het banderolleerpatroon aanwezig moet zijn bij zowel gnotobiotische als niet-sterile insecten. Aangezien het restrictiepatroon van de endosymbiont kan worden voorspeld aan de den36van het genoom, is het niet nodig om de amplicons of de beperkingsfragmenten te sequencen, tenzij identificatie van een verontreiniging gewenst is. De huidige versie van dit protocol vraagt om een nimf op te offeren voor PCR/RFLP, maar deze techniek kan ook op uitwerpselen worden gebruikt als een niet-destructieve maatregel. Het zal echter geen ingebouwde controle bevatten, omdat de uitwerpselen niet veel Blattabacteriummogen bevatten .
Een extra gemakkelijk te wijzigen maar kritische component van het fokken van gnotobiotische dieren is dieet. Hoewel BHI-agar kan dienen als een tijdelijke voedselbron voor de insecten, is gebleken dat het resulteert in aanzienlijke groeitekorten bij nimfen wanneer het voor langere tijd als enige voedselbron wordt gebruikt. Hoewel verschillende diëten zijn geprobeerd, wordt autoclaveerbare rattenvoer aanbevolen als een routinedieet voor het onderhoud van gnotobiotische insecten. Diëten die niet specifiek waren geformuleerd voor sterilisatie waren vaak moeilijk volledig steriel te maken, en veel steriele of autoclaveerbare proefdierdiëten bleken een snelle schimmelgroei te vertonen onder niet-steriele omstandigheden. Deze neiging om af te nemen onder niet-steriele omstandigheden maakte ze ongeschikt voor gebruik in experimenten die gnotobiotische en niet-gnotobiotische insecten direct vergeleken. Het aanbevolen dieet maakt het gebruik van een consistent dieet tussen gnotobiotische en standaardnimfen mogelijk, waardoor de vergelijking van kenmerken - zoals groeisnelheden - tussen de twee groepen wordt vergemakkelijkt.
Zoals anderen27hebben waargenomen, groeien de gnotobiotische nimfen langzamer dan hun niet-steriele tegenhangers. Een vergelijking tussen lichaamslengtes van gnotobiotische (n = 105) en niet-steriele nimfen (n = 50) gevoed hetzelfde, autoclaaf knaagdierdieet en bij kamertemperatuur gehouden, toont aan dat niet-steriele nimfen gemiddeld 0,059 mm/dag groeien, terwijl gnotobiotische nimfen 0,028 mm/dag groeien (p < 0,0001) (figuur 5). De aanwezigheid van darmmicrobiota in P. americana is aangetoond dat het de stofwisseling van de insectenverandert 37, en darmgemeenschappen in het algemeen worden verondersteld de opname van voedingsstoffen te beïnvloeden38,39. Deze redenen ondersteunen de waargenomen verschillen in groeisnelheid van gnotobiotische en niet-sterile nimfen.
Een mogelijke beperking van deze techniek is dat gnotobiotische nimfen mogelijk geen geslachtsrijpheid bereiken, omdat de oudste steriele cohorten meer dan 10 maanden oud zijn en alleen de zevende instar (van de 10; 11 volwassenheid) hebben bereikt, zoals benaderd door lichaamslengte40. Deze oudste cohorten volgen niet het autoclaafrattendieet, maar eten in plaats daarvan bestraalde rattenvoer, een dieet dat te veel vocht bevat om te voeden met niet-steriele cohorten zonder overmatige schimmelgroei. Niet-steriele nimfen op een niet-gesteriliseerd hondenvoerdieet bleken na 9−10 maanden volwassen te worden onder laboratoriumomstandigheden (kamertemperatuur en vochtigheid). Cohorten van gnotobiotische en niet-steriele nimfen op de gedeelde, autoclaved rat chow zijn momenteel minder dan 7 maanden oud, niet-steriele insecten worden geschat op zevende instar (gemiddeld: 16,7 mm) terwijl steriele insecten worden geschat op vijfde instar (gemiddelde: 11,2 mm). Als gevolg hiervan kunnen we tot nu toe niet controleren of onze gnotobiotische kakkerlakken zich met succes kunnen voortplanten. Gezien het gemak waarmee nieuwe gnotobiotische cohorten met behulp van deze aanpak kunnen worden vastgesteld, toont deze methode echter grote belofte, zelfs bij afwezigheid van bewezen reproductie van gnotobiotische insecten.
Concluderend, dit protocol biedt een veelzijdig hulpmiddel waarmee microbioom onderzoekers hun eigen, goedkope gnotobiotische "faciliteit" kunnen bedienen met behulp van gemeenschappelijke laboratoriummaterialen. Deze aanpak kan worden gebruikt om gnotobiotische kakkerlakken te genereren voor experimenten die de rol van de microbiota onderzoeken bij het vormgeven van gastheergedrag, immuniteit, ontwikkeling en stressreacties21,26,27. Deze gnotobiotische insecten kunnen ook worden ingeënt met synthetische of xenobiotische gemeenschappen en vervolgens worden gebruikt als proefpersonen voor darmmicrobioomstudies23,28. Verder zijn elementen van deze aanpak, waaronder het gebruik van met bacteriologische media omzoomde incubatiekamers als ingebouwde steriliteitscontrole, generaliseerbaar voor andere modelsystemen en kunnen routinematig onderhoud van gnotobiotische dieren in kleinere faciliteiten vergemakkelijken.