Het protocol voor het verzamelen en hanteren van huidmonsters en isolatie van menselijke keratinocyten is herzien door de IRB van de Universiteit van South Carolina (UofSC) en geclassificeerd als "onderzoek waarbij geen menselijke proefpersonen betrokken waren", omdat de voorhuidmonsters chirurgische teruggooi waren die werden geproduceerd tijdens routinechirurgische procedures (besnijdenis van pasgeboren jongens) en volledig verstoken waren van identificerende informatie. Het protocol werd ook regelmatig herzien en goedgekeurd door het UofSC Biosafety Committee en al het laboratoriumpersoneel onderging een opleiding in laboratoriumbioveiligheid. Alle procedures werden uitgevoerd in overeenstemming met de veiligheids- en ethische normen van UofSC.
1. Isolatie en kweek van menselijke keratinocyten uit neonatale voorhuidweefsel
- Bereid het wasmedium voor door 0,1 M HEPES-buffer toe te voegen aan 500 ml KSFM-medium en stel het in op een pH van 7,2. Steriliseer medium in een vacuümfilter van 500 ml (poriegrootte van 0,22 μm). MCDB 153-LB basaal medium kan ook worden gebruikt als alternatieve wasoplossing in plaats van KSFM.
- Was in een laminaire stromingskap neonatale voorhuid met 5 ml wasmedia in een conische buis van 50 ml. Herhaal dit twee keer.
- Breng gewassen voorhuid over op een steriele petrischaal. Schraap met behulp van een scalpel en tang vet en losse bindweefsels van de huidlaag af. Spoel de voorhuid opnieuw met 5 ml wasmedia in een conische buis van 50 ml.
- Plaats de voorhuid epidermis naar boven in een 6-put plaat met 2 ml dispase enzym verdund in wasmedia (50 U/ml).
- Breng de plaat gedurende 4 uur over in een incubator (37 °C, 5% CO2,95% vochtigheid).
- Verwijder de voorhuid uit de incubator en breng deze onder steriele omstandigheden over in een petrischaal. Scheid met behulp van een fijnpuntige tang de opperhuid van de dermislaag.
- Plaats epidermis in een conische buis van 15 ml met 2 ml 0,25% Trypsine-EDTA. Verpletter met behulp van een serologische pipet van 5 ml de drijvende epidermis mechanisch. Incubeer gedurende 15 min bij 37 °C met periodieke vortexing gedurende 5 s om de 5 min.
- Voeg na incubatie 2 ml soja trypsineremmer toe en meng door pipetten om de trypsine te neutraliseren.
- Centrifugeer celsuspensie gedurende 2 min bij 450 x gen vervolgens gedurende 8 min bij 250 x g.
- Verwijder drijvend vuil met een tang en zorg ervoor dat u de celkorrel niet loslaat. Aspireer voorzichtig supernatant uit de celkorrel.
- Resuspend pellet in 12 ml compleet KSFM-scm medium en plaat in een schaal van 10 cm. Incubeer de schotel 's nachts (37 °C, 5% CO2,95% vochtigheid).
- Verwijder het medium de volgende dag met een aspirerende pipet en vervang het door 12 ml complete KSFM-scm. Herhaal dit op dag 4 en 7.
- Om een optimale groei van normale menselijke keratinocyt (NHKc) culturen te behouden, passage cellen 1:5 op dag 10 om te voorkomen dat cellen bereiken meer dan 80% confluency.
2. Het genereren van huid epidermosfeer culturen in vitro
- Bereid een 5% agarosemengsel door 2,5 g agarose toe te voegen aan 50 ml 1x fosfaatgebufferde zoutoplossing (PBS), in een glazen fles van 50 ml. Autoclaaffles onder vloeibare cyclus. Laat afkoelen tot kamertemperatuur.
- Om borden te bereiden, plaatst u de gekoelde glazen fles met agarose-oplossing in een plastic bekerglas van 1 L gevuld met 200 ml gedeïoniseerd water (dH2O). Smelt het agarosemengsel gedurende maximaal 2 minuten in een magnetron van onderzoekskwaliteit en meng de agar om de 60 s door de fles voorzichtig van links naar rechts te kantelen.
LET OP: Het smelten van agar in de magnetron zorgt ervoor dat de kolfcontainer extreem heet wordt, wat resulteert in drukopbouw. Laat drukopbouw om de 30 s los. Draag geschikte beschermingsmiddelen om letsel te voorkomen.
- Voeg 3 ml gesmolten 5% agarose toe aan 12 ml KSFM-scm voorverwarmd tot 42 °C voor een eindconcentratie van 1% agarose (wt/vol).
Optioneel: verwarm de serologische pipetten en pipettips voor om voortijdige polymerisatie van de zachte agar te voorkomen.
- Pipetteer snel 200 μL van de 1% agarmix in individuele putten van een 96-put ronde bodemplaat met behulp van een meerkanaals pipettor (figuur 1A). Laat de plaat 4 uur in een steriele omgeving bij 25 °C staan om agarose volledig te laten polymeriseren.
OPMERKING: Het experimenteren kan hier worden gestopt en de volgende dag worden voortgezet. Gepolymeriseerde agaroseplaten kunnen tot 24 uur op 37 °C of tot 4 °C worden gehouden wanneer ze worden afgedicht met parafilmfolie. Warme plaat tot 37 °C in een bevochtigde incubator gedurende ten minste 1 uur voor gebruik.
- Passage sferoïdevormende NHKc door aspirerende media en wascellen in 2 ml PBS. Aspireer PBS en voeg 2 ml 0,25% Trypsine-EDTA toe aan gewassen cellen. Incubeer gedurende 5 minuten bij 37 °C of totdat alle cellen volledig loskomen. Voeg 2 ml soja trypsine remmer toe aan de plaat en spoel cellen van de plaat af in een buis van 15 ml. Centrifugeer op 250 x g gedurende 5 min.
- Resuspend pellet in 1 mL of PBS. Kwantificeer de levensvatbaarheid van cellen met behulp van trypan blauwe kleuring en een hemocytometer of een geautomatiseerde celteller.
- Aliquot 2 x 104 NHKc in 100 μL KSFM-scm en zaad in individuele putten van eerder bereide 96-wells ronde bodemplaat. Incubeer plaat 's nachts (37 °C, 5% CO2,95% vochtigheid).
- Met behulp van een omgekeerde fasecontrastmicroscoop, analyseert u goed gezaaid voor epidermosfeervorming.
OPMERKING: Menselijke epidermosfeeren van normale menselijke keratinocyten kunnen in 3D-suspensiecultuur tot 96 uur levensvatbaar blijven, zij het met een aanzienlijke afname van de levensvatbaarheid van cellen (figuur 2).
3. Epidermale sferoïde re-plating assay
- 24-48 uur na 3D epidermosfeervorming, voeg 4 ml voorverwarmde KSFM-scm toe aan een schaal van 6 cm. Gebruik een brede boor van 1 ml pipetpunt om een enkele sferoïde op de plaat over te brengen, zodat deze niet uit elkaar valt. U kunt ook een pipetpunt van 1 ml verbreden met een steriel scheermesje om de punt te snijden.
- Incubeer de plaat 's nachts (37 °C, 5% CO2,95% vochtigheid).
- Analyseer gezaaide sferoïde voor bevestiging aan de bodem van de plaat en observeer voor het vermeerderen van cellen met behulp van een omgekeerde fasecontrastmicroscoop (figuur 3). Voer cellen om de 96 uur door voorzichtig 2 ml van de media in de plaat te verwijderen en langzaam 2 ml verse KSFM-scm media aan de plaat toe te voegen.
- Passage spheroid-afgeleide (SD) NHKc zodra ze 70-80% samenvloeiing bereiken en doorgaan met het maken van een keuzetest. Monitor SD-NHKc regelmatig om te voorkomen dat cellen volledige samenvloeiing in cultuur bereiken, omdat dit resulteert in voortijdige differentiatie en celgroeistilstand (Figuur 3E-F).
- De epidermale sferoïde replating assay modellen keratinocyt-gemedieerde wondherstel door het vastleggen van elk van de belangrijkste opeenvolgende fasen van epidermale regeneratieve plasticiteit: a) homeostatisch onderhoud, b) differentiatie halt /omkering c) stress lineage mobiliteit, en d) weefselherstel (Figuur 1B; Tabel 2). Deze test kan ook worden gebruikt om celpopulaties voor organotypische vlotculturen te produceren of om HPV-gemedieerde neoplasie te modelleren, zoals aangetoond in ons vorige werk 11,12.
4.3D fluorescentiecel het volgen
- In een schaal van 6 cm, transfect sferoïde-vormende 2D monolayer NHKc culturen met 1 μg pMSCV-IRES-EGFP plasmide vector met het verbeterde groene fluorescerende eiwit (eGFP) gen. Incubeer plaat 's nachts (37 °C, 5% CO2,95% vochtigheid) microscoop(figuur 4A).
OPMERKING: Het is belangrijk dat transfectie wordt voltooid in serumvrije antibioticavrije omstandigheden.
- Zonder transfectiemix te verwijderen, voegt u 2 ml voorverwarmde KSFM-scm toe aan cellen. Incubeer plaat 's nachts (37 °C, 5% CO2,95% vochtigheid).
- Aspireer alle transfectiemedia uit plaat- en voedingscellen met 3 ml voorverwarmde KSFM-scm. Beoordeel op aanwezigheid van EGFP-uitdrukkende cellen onder het FITC-kanaal van een fluorescerende microscoop.
- Passage en zaad 2 x 104 EGFP-getransfecteerde cellen in individuele putten van een eerder bereide 96-put ronde bodemplaat. Incubeer plaat 's nachts (37 °C, 5% CO2,95% vochtigheid). Visualiseer en bewaak egfppos spheroid celbeweging onder het FITC-kanaal van een fluorescentiemicroscoop (figuur 4B-C).
- Voeg 24 uur na het plateren 3 ml voorverwarmde KSFM-scm toe aan een schaal van 6 cm. Gebruik een brede boor van 1 ml pipetpunt om een enkele sferoïde op de plaat over te brengen, zodat deze niet uit elkaar valt. Incubeer plaat 's nachts (37 °C, 5% CO2,95% vochtigheid).
- Observeer en analyseer de voortplanting van SD-NHKcEGFP met behulp van een fluorescentiemicroscoop. Voer cellen om de 96 uur door voorzichtig 2 ml de media in de plaat te verwijderen en langzaam 2 ml verse KSFM-scm media aan de plaat toe te voegen.
- Oogst SD-NHKCEGFP voor FACS-isolatie of keuzetesten.
5. Karakterisering van sferoïde-afgeleide (SD) subpopulaties door FACS
- Passage SD-NHKc en bijbehorende autologe 2D monolayer culturen door het aanzuigen van oude media en wascellen in 2 ml PBS. Verwijder PBS en voeg 2 ml 0,25% Trypsine-EDTA toe aan gewassen cellen. Incubeer bij 37 °C gedurende 5 minuten of totdat alle cellen volledig loskomen.
- Voeg 2 ml soja trypsine remmer toe aan de plaat en breng cellen over in een buis van 15 ml. Centrifugeer op 250 x g gedurende 5 min.
- Resuspend pellets in 1 mL of PBS. Kwantificeer de levensvatbaarheid van cellen met trypanblauw en een geautomatiseerde celteller van hemocytometer.
- Aliquot 100 μL met 0,1-4 x 106 NHKc-cellen tot 1,5 ml microcentrifugebuizen. Plaats de buis op ijs in een donkere omgeving, gecreëerd door felle lichten in de laminaire kap uit te schakelen.
- Voeg 2 μL FITC-geconjugeerde anti-integrinα6 en 2 μL PE-geconjugeerde anti-EGFR toe aan buizen om een verdunning van 1:50 te bereiken. Bereid een buis voor zonder toegevoegde antilichamen om te dienen als de niet-aangetaste controle. Incubeer buizen op ijs in het donker of bij 4 °C gedurende 30 minuten. Het gebruik van kralen of een huid SCC lijn kan dienen als positieve controle, als huid SCC cellen uitdrukken verhoogde niveaus van integrinα6 en EGFR.
- Voer flowcytometrieanalyse uit met behulp van flowcytometer naar keuze met geschikte lasers.
- Gebruik de negatieve en positieve bedieningselementen om poorten te maken. Sorteer de subpopulatie van integrinα6hi/EGFRlo cellen; dit is de epidermale stamcelfractie. Integrinα6hi/EGFRhi cellen zijn de proliferatieve voorloper celfractie. De integrinα6lo/EGFRhi cellen zijn de geëngageerde voorlopercelfractie (Figuur 4D). Sorteerbuis(en) moet(en) ten minste 1 ml ijskoude KSFM-scm bevatten.
- Test op proliferatieve capaciteit van gesorteerde celsubpopulaties door de inhoud van elke respectieve sorteerbuis over te brengen in een conische buis van 15 ml die 10x het volume gesorteerde cellen in PBS bevat. OPMERKING: Het is belangrijk om alle cellen die aan de rand zijn bevestigd te verwijderen door de wand van de sorteerbuis(en) meerdere keren te pipetten, omdat keratinocyten zich daar vaak kunnen hechten.
- Centrifugeer 15 ml buizen op 250 x g gedurende 5 min. Verwijder supernatant en resuspend pellet in 12 ml KSFM-scm. Breng de geresuspendeerde cellen over in een plaat van 6 cm en incubeer 's nachts (37 °C, 5% CO2, 95% vochtigheid).
- Verwijder de volgende dag media in platen en voeg 8 ml voorverwarmde KSFM-scm toe. Incubeer bij 37 °C, 5% CO2,95% vochtigheid. Voer cellen met een medium van 12 ml om de 3 dagen opnieuw tot 70-80% samenvloeiing (figuur 4E).
6. Immunofluorescentie en kleuring van epidermosfeer voor basale stamcelmarkers
- Breng epidermosfeer over op coverslips bedekt met polylysine. Laat SD-NHKc zich voortplanten tot 75% samenvloeiing.
- Was de cellen tweemaal in PBS (4 °C) gedurende elk 5 minuten.
- Fix cellen met 4% paraformaldehyde (PFA) gedurende 20 min bij kamertemperatuur.
- Permeabiliseer cellen met 0,5% Triton X-100 in 1% glycine. Blokkeer met 0,5% BSA en 5% geitenserum gedurende 30 minuten bij kamertemperatuur.
- Incubeer monsters met antilichamen tegen P63 (1:200) en cytokeratine 14 (1:200) in blokkeeroplossing 's nachts bij 4 °C.
- Was driemaal met PBS (4 °C) met Tween 20 (PBST), gevolgd door incubatie met FITC-en Alexa 568-geconjugeerde secundaire antilichamen (1:1000 verdunning).
- Vlekkernen met 4', 6-diamidino-2-fenylindole (DAPI) (1:5000 verdunning) vóór montage van cellen.
- Observeer cellen met behulp van een fluorescentie-compatibele microscoop met FITC- en PE-laserlijnen (figuur 4F).
7. Transcriptieanalyse van epidermosfeerculturen
- Het instellen van drievoudsplaten van NHKc-culturen met een lage passage om RNA te isoleren, kan afkomstig zijn van monolaag-, sferoïde- en sferoïde-afgeleide culturen uit dezelfde autologe cellijn.
- Pool 3-5 overeenkomstige epidermospheres in een 1,5 ml microcentrifugebuis. Oogst afzonderlijk autologe SD-NHKc- en 2D-monolaagculturen.
- Isoleer het totale RNA van alle drie de groepen.
- Voer omgekeerde transcriptie uit met 1 μg totaal RNA.
- Voer met behulp van cDNA real-time PCR uit, met GAPDH als interne controle (Tabel 1).
- Valideer de productgrootte van amplicon door agarosegelelektroforese (2% v/v).
OPMERKING: Voor transcriptomische profilering van epidermosfeerculturen met behulp van microarrayanalyse van het hele genoom, isoleert u het totale RNA van massaculturen van één NHKc-donor en overeenkomstige SD-NHKc van dezelfde donor, in zes replica's elk.
- Beoordeel de RNA-kwaliteit met behulp van een bioanalyzer om RNA Integrity Numbers (RIN) te bereiken, variërend van ten minste 9,0 tot 9,1.
- Voer microarray-experimenten uit door het totale RNA-monster te versterken en te biotinyleren.
- Transcriber 100 ng totaal RNA per monster in ds-cDNA met behulp van NNN random primers die een T7 RNA polymerase promotorsequentie bevatten.
- Voeg T7 RNA-polymerase toe aan cDNA-monsters om RNA te versterken en kopieer RNA naar ss-cDNA. Degradatie overtollige RNA met behulp van RNase H.
- Fragment sscDNA moleculen en label met biotine.
- Bemonstering van etiketten gedurende 16 uur bij 45 °C versterken.
- Hybridiseer monsters met behulp van een hybridisatieoven en een was- en vlekkenset.
- Was en bevlek gehybridiseerde arrays.
- Arrays scannen met behulp van een systeem- en computerwerkstation.
- Na voltooiing van arrayscans importeert u CEL-bestanden (Probe Cell Intensity) in expressieconsolesoftware en verwerkt u op genniveau met behulp van een bibliotheekbestand en het Robust Multichip Analysis (RMA)-algoritme om WKK-bestanden te genereren.
- Nadat u de gegevenskwaliteit in Expression Console hebt bevestigd, importeert u WKK-bestanden met log2-expressiesignalen voor elke sonde in een transcriptoomanalysesoftware om celtypespecifieke transcriptiereacties te analyseren met behulp van eenrichtingsanalyse tussen onderwerpen van variantie.
8. Beoordelen van SD-NHKc kolonievormende efficiëntie
- Aspireer media uit platen wanneer cellen 70-80% samenvloeiing bereiken. Was de cellen driemaal in PBS (4 °C) gedurende elk 5 minuten.
- Fix cellen met 3 ml 100% methanol (4 °C) gedurende 15 min. Was drie keer in PBS gedurende elk 5 minuten.
- Vlekcellen in 3 ml 10% Giemsa gedurende 30 min. Was drie keer in PBS gedurende elk 5 minuten. Laat cellen 's nachts aan de lucht drogen.
- Analyseer de kolonievorming de volgende dag en kwantificeer het aantal verkregen kolonies
9. Bepaal SD-NHKc populatie verdubbeling
- Passage SD-NHKc en bijbehorende autologe 2D monolayer culturen door het aanzuigen van oude media en wascellen in 2mL PBS. Verwijder PBS en voeg 2 ml 0,25% Trypsine-EDTA toe aan gewassen cellen. Incubeer gedurende 5 minuten of totdat alle cellen volledig loskomen (37 °C, 5% CO2,95% vochtigheid).
- Voeg 2 ml soja trypsine remmer toe aan de plaat en breng cellen over in een buis van 15 ml.
- Centrifugeer op 250 x g gedurende 5 min.
- Verwijder het supernatant en de resuspend pellet in 12 ml KSFM-scm.
- Zaadcellen met een lage dichtheid 1-2 x 104 NHKc in individuele gerechten van 10 cm en incuberen 's nachts (37 °C, 5% CO2,95% vochtigheid).
- Voerplaten met 8 ml KSMF-scm de volgende dag. Voer om de 4 dagen tot ten minste 25% samenvloeit en voer vervolgens om de 2 dagen.
- Serieel passage cellen 1:5 in 60 cm gerechten totdat celproliferatie capaciteit is uitgeput. Kwantificeer de levensvatbaarheid van cellen door blauwe kleuring te proberen. Bepaal de populatieverdubbeling bij elke passage met behulp van de formule: log(N/N0) / log2, waarbij N het totale celnummer vertegenwoordigt dat bij elke passage is verkregen en N0 het aantal cellen vertegenwoordigt dat aan het begin van het experiment is geplateerd.