De hier beschreven methoden hebben betrekking op stoffen die operationeel worden gedefinieerd als mariene lipiden. Deze definitie is gebaseerd op hun vatbaarheid voor vloeistof-vloeistofextractie in niet-polaire organische oplosmiddelen en biedt een handige methode voor hun scheiding van andere stoffen in een aquatische matrix. Hun hydrofobe aard vergemakkelijkt hun isolatie van zeewater of biologische exemplaren, evenals hun verrijking en de verwijdering van zouten en eiwitten.
Het meten van het lipidengehalte en de samenstelling ervan in mariene organismen is al tientallen jaren van groot belang in voedselwebecologie, aquacultuurvoeding en voedingswetenschap. Lipiden zijn universele componenten in levende organismen, die fungeren als essentiële moleculen in celmembranen, als belangrijke bronnen van biologisch beschikbare energie, thermische isolatie en drijfvermogen bieden en dienen als signaalmoleculen. Hoewel procedures voor lipidenbepaling op andere gebieden goed zijn beschreven, vereist het gebruik ervan met mariene monsters gewoonlijk modificatie om zich aan te passen aan veldomstandigheden en om type1te bemonsteren.
Voor zeewatermonsters vereist de eerste stap meestal scheiding in de operationeel gedefinieerde 'opgeloste' en 'deeltjes' fracties, normaal gesproken door filtratie (protocolstap 1). De deeltjesfractie is wat wordt vastgehouden door het filter en de grootte van de poriën is belangrijk bij het definiëren van de afsnijding2. Vaak willen we bij het bemonsteren van fijnstof lipideconcentraties relateren aan totale massaconcentraties, in welk geval hiervoor een apart, kleiner monster (bijv. 10 ml) moet worden genomen (protocolstap 1, opmerking). Om een nauwkeurige massabepaling te krijgen, is het belangrijk om ammoniumformium (35 g / L) toe te voegen aan het einde van de filtratie.
Het zeewaterfiltraat uit het grotere monster moet tussen 250 ml en 1 l bedragen, afhankelijk van het type monster en wordt onderworpen aan vloeistof-vloeistofextractie in een separatortrechter (protocolstap 2). De hydrofobe aard van lipiden betekent dat ze kunnen worden gescheiden van andere verbindingen door extractie in een niet-polair oplosmiddel zoals chloroform. Er wordt een tweelaags systeem gecreëerd waarbij lipiden zich opdelen in de organische laag terwijl wateroplosbare componenten in de waterige laag blijven.
Deeltjesmonsters op een filter, of biologische monsters worden geëxtraheerd met een gemodificeerde Folch et al. extractie3, ook met chloroform (Protocol stap 3). Nogmaals, een organisch / waterig systeem wordt gecreëerd waarin lipiden zich verdelen in de organische fase, terwijl in water oplosbare moleculen in de waterige fase blijven en eiwitten worden neergeslagen. In feite gebruiken de meeste laboratoria voor vaste stoffen een variatie op de Folch et al. extractie3-procedure met chloroform en methanol. Voor filters is de eerste stap om te homogeniseren in 2 ml chloroform en 1 ml methanol.
Tijdens de extractie moet ervoor worden gezorgd dat lipiden worden beschermd tegen chemische of enzymatische modificatie, door monsters en oplosmiddelen op ijs te houden om esterbindingshydrolyse of koolstof-koolstof dubbele bindingsoxidatie te verminderen. Weefsels en cellipiden worden vrij goed beschermd door natuurlijke antioxidanten en door compartimentering4; na de homogenisatie van monsters wordt de celinhoud echter gecombineerd, waardoor lipiden meer vatbaar zijn voor verandering, chemisch of enzymatisch. Sommige lipiden, zoals de meeste sterolen, zijn zeer stabiel, terwijl andere, zoals die met meervoudig onverzadigde vetzuren, gevoeliger zijn voor chemische oxidatie. Anderen, zoals sterolen met geconjugeerde dubbele bindingen, zijn gevoelig voor oxidatie gekatalyseerd door licht5. Na extracties zijn lipiden veel gevoeliger voor chemische oxidatie en moeten monsters worden opgeslagen onder een inert gas zoals stikstof. Een zachte stroom stikstof zou ook worden gebruikt om extracten te concentreren.
Na concentratie zouden lipiden dan normaal gesproken in bulk worden gekwantificeerd, omdat ze een belangrijk onderdeel zijn van mariene ecosystemen die een hoge concentratie energie leveren, meer dan twee keer de kJ / g koolhydraten en eiwitten. Steevast zouden ze vervolgens worden gekwantificeerd als afzonderlijke componenten: de uitgebreide analyse van lipiden omvat over het algemeen scheiding in eenvoudigere categorieën, afhankelijk van hun chemische aard. Een volledige analyse omvat dus het meten van totale lipiden, lipidenklassen en individuele verbindingen.
Het totale lipide kan worden bepaald door de som te nemen van individueel gemeten lipideklassen gescheiden door chromatografie6. Een marien lipidenextract kan meer dan een dozijn klassen bevatten uit biogene en antropogene bronnen. De grote verscheidenheid aan lipidestructuren betekent dat veel informatie kan worden verkregen door individuele groepen van structuren te bepalen. Lipideklassen afzonderlijk, of in bepaalde groepen, zijn gebruikt om de aanwezigheid van bepaalde soorten organismen aan te geven, evenals hun fysiologische status en activiteit2. Ze zijn ook gebruikt als een indicator van de oorsprong van organisch materiaal, waaronder opgelost organisch materiaal (DOM) en hydrofobe verontreinigingen.
Triacylglycerolen, fosfolipiden en sterolen behoren tot de belangrijkere biogene lipidenklassen. De eerste twee zijn biochemisch verwant omdat ze een glycerol-ruggengraat bezitten waaraan twee of drie vetzuren zijn veresterd(figuur 1). Triacylglycerolen zijn samen met wasesters zeer belangrijke opslagstoffen, terwijl andere vetzuurbevattende lipideklassen zoals diacylglycerolen, vrije vetzuren en monoacylglycerolen over het algemeen minder belangrijke bestanddelen zijn. Vrije vetzuren zijn in lagere concentraties aanwezig in levende organismen, omdat de onverzadigde vetzuren giftig kunnen zijn7. Sterolen (zowel in hun vrije als veresterde vormen) en vetalcoholen behoren ook tot de minder polaire lipiden, terwijl glycolipiden en fosfolipiden polaire lipiden zijn. Polaire lipiden hebben een hydrofiele groep, die de vorming van lipide bilayers in celmembranen mogelijk maakt. Vrije sterolen zijn ook structurele componenten van het membraan en wanneer ze in verhouding tot triacylglycerolen worden ingenomen, bieden ze een conditie of voedingsindex (TAG: ST) die op grote schaal is gebruikt8. Wanneer ze in verhouding tot fosfolipiden (ST: PL) worden ingenomen, kunnen ze worden gebruikt om de gevoeligheid van de plant voor zout aan te geven: hogere waarden behouden de structurele integriteit en verminderen de membraandoorlaatbaarheid9. De inverse van deze verhouding (PL: ST) is bestudeerd in tweekleppige weefsels tijdens temperatuuraanpassing10.
Mariene lipideklassen kunnen worden gescheiden door dunnelaagchromatografie (TLC) op silicagel gecoate staven (Protocol stap 4) en vervolgens worden gedetecteerd en gekwantificeerd door vlamionisatiedetectie (FID) in een automatische FID-scanner. TLC / FID is routinematig gebruikt voor mariene monsters omdat het snel synoptische lipideklassegegevens van kleine monsters levert, en door de som van alle klassen te nemen, een waarde voor totale lipiden. TLC/FID is onderworpen aan een kwaliteitsborgingsbeoordeling (QA) en bleek te voldoen aan de normen die vereist zijn voor consistente externe kalibratie, lage blanco's en nauwkeurige replicatieanalyse11. Variatiecoëfficiënten (CV) of relatieve standaardafwijkingen liggen rond de 10%, en de totale lipidengegevens van de FID-scanner zijn normaal gesproken ongeveer 90% van die verkregen door gravimetrische en andere methoden2. Gravimetrie geeft een hoger totaal aan lipiden waarschijnlijk omdat de FID-scanner alleen niet-vluchtige stoffen meet, en ook als gevolg van mogelijke opname van niet-lipide materiaal in gravimetrische metingen.
De informatie die wordt verstrekt door lipidenklasseanalyse is vooral nuttig in combinatie met bepalingen van vetzuren als individuen, of sterolen, of de twee in combinatie. De eerste stap naar deze analyses omvat de afgifte van alle samenstellende vetzuren samen met sterolen in de lipide-extracten (Protocol stap 5). De grote verscheidenheid aan lipidestructuren en -functies betekent dat ze op grote schaal zijn gebruikt in ecologische en biogeochemische studies die de gezondheid van ecosystemen beoordelen en de mate waarin ze zijn beïnvloed door antropogene en terrestrische inputs. Ze zijn gebruikt om de biosynthese van stoffen met een voedingswaarde voor de mariene fauna te meten en om de kwaliteit van watermonsters aan te geven. Het meten van lipiden in sedimentkernmonsters helpt de gevoeligheid van sedimenten voor veranderingen in menselijk landgebruik in de buurt van de land-zeerand aan te tonen.
Het belangrijkste hulpmiddel voor het identificeren en kwantificeren van individuele lipideverbindingen is van oudsher gaschromatografie (GC) met FID. Vóór de analyse worden deze verbindingen echter vluchtiger gemaakt door derivatisatie. Vetzuren komen vrij in aanwezigheid van een zure katalysator (H2SO4) uit acyllipideklassen (Figuur 1). In de organische chemie is de acylgroep (R-C=O) meestal afgeleid van een carbonzuur (R-COOH). Ze worden vervolgens opnieuw veresterd tot vetzuurmethylesters (FAME), wat betere scheidingen op GC-kolommen geeft (protocolstap 5).