Technieken voor het genereren van een bibliotheek van korte peptiden die mestcellen kunnen activeren via de MRGPRX2-receptor worden beschreven. Bijbehorende technieken zijn eenvoudig, goedkoop en kunnen worden uitgebreid naar andere celreceptoren.
Een abonnement op JoVE is vereist om deze inhoud te bekijken. Log in of start vandaag met uw gratis proefperiode.
Methodenartikel
Technieken voor het genereren van een bibliotheek van korte peptiden die mestcellen kunnen activeren via de MRGPRX2-receptor worden beschreven. Bijbehorende technieken zijn eenvoudig, goedkoop en kunnen worden uitgebreid naar andere celreceptoren.
Het identificeren van liganden die specifiek zijn voor therapeutisch significante celreceptoren is cruciaal voor veel toepassingen, waaronder het ontwerp en de ontwikkeling van nieuwe therapieën. Mas-gerelateerde G-eiwitreceptor-X2 (MRGPRX2) is een belangrijke receptor die mestcelactivatie reguleert en dus de algemene immuunrespons stuurt. Talrijke liganden voor MRGPRX2 zijn geïdentificeerd en omvatten endogene peptiden zoals PAMPs, defensinen, LL-37 en andere eiwitfragmenten (d.w.z. afgebroken albumine). Verdere identificatie van MRGPRX2-specifieke liganden vereist de screening van een groot aantal peptiden (d.w.z. peptidebibliotheek); mestcellen zijn echter moeilijk en duur om in vitro te onderhouden en daarom niet economisch in gebruik voor het screenen van grote aantallen moleculen. Het huidige artikel demonstreert een methode om een bibliotheek van kleine peptidemoleculen te ontwerpen, ontwikkelen en screenen met behulp van MRGPRX2 die HEK-cellen tot expressie brengen. Deze cellijn is relatief eenvoudig en goedkoop te onderhouden en kan worden gebruikt voor in vitro high-throughput analyse. Een calciumgevoelige Fura-2 fluorescerende kleurstof om intracellulaire calciumflux bij activering te markeren, werd gebruikt om de activering te controleren. De verhouding van fluorescentie-intensiteit van Fura-2 bij 510 nm tegen excitatiegolflengten van 340 en 380 nm werd gebruikt om de calciumconcentratie te berekenen. De peptidebibliotheek die werd gebruikt om dit systeem te verifiëren, was gebaseerd op de endogene proadrenomedulline N-terminal 12 (PAMP-12) secretagoge, waarvan bekend is dat het MRGPRX2 bindt met hoge specificiteit en affiniteit. Latere peptiden werden gegenereerd door aminozuur-truncation en alanine scanning technieken toegepast op PAMP-12. De hier beschreven methode is eenvoudig en goedkoop maar robuust voor het screenen van een grote bibliotheek van verbindingen om bindingsdomeinen en andere belangrijke parameters te identificeren die een belangrijke rol spelen bij receptoractivering.
Mestcellen zijn een integraal onderdeel van het immuunsysteem en spelen een cruciale rol in zowel aangeboren als adaptieve immuunresponsen. Mestcellen worden voornamelijk geactiveerd door de binding van een antigeen aan het immunoglobuline E (IgE) - FcεRI-receptorcomplex, of door het onlangs ontdekte mas-gerelateerde G-eiwitreceptor-X2 (MRGPRX2)1. MRGPRX2-activering is in verband gebracht met verschillende immuun- en ontstekingsziekten en daarom is het belangrijk om het bindingsmechanisme van de receptor aan zijn liganden te begrijpen2. Om dit te doen, werd een bibliotheek van kleine peptidemoleculen ontwikkeld en gescre....
Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.
1. Ontwerp en ontwikkeling van peptidebibliotheek
Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.
Tabel 1 bevat de peptidesequenties die worden gegenereerd door terminale aminozuur-truncation en alanine scanning. Zoals weergegeven in tabel 1,mist peptidesequentie RKKWNKWALSR N-terminale fenylalanine (F) ten opzichte van zijn moeder PAMP-12 en is daarom een representatief peptide in de N-afgekapte bibliotheek. Evenzo is in FRKKWNKWALS PAMP-12 C-terminal serine verwijderd, wat een C-afgekapte peptidebibliotheek vertegenwoordigt die is afgeleid van PAMP-12. In de N+C-afgeknotte peptideb.......
Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.
Calciumsignalering staat centraal bij mestceldegranulatie en is veel gebruikt in de studie van receptor-ligandinteracties, ligandidentificatie en medicijnontdekking14. MRGPRX2 is een recent ontdekte mestcelreceptor waarvan is gebleken dat deze een sleutelrol speelt bij veel ontstekingsziekten zoals jeuk, astma en atopische dermatitis, onder andere2. Bovendien is aangetoond dat verschillende goedgekeurde geneesmiddelen een ontstekingsreactie opwekken via de MRGPRX2-receptor<.......
Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.
Auteurs verklaren geen tegenstrijdige belangen te hebben.
SR en LDU willen alberta innovates strategic research project, NRC en NSERC-Discovery subsidie voor dit project bedanken.
....Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.
| Naam | Bedrijf | Catalogusnummer | Opmerkingen |
|---|---|---|---|
| Bovine Serum Albumin | Sigma Aldrich | 5470 | |
| Calcium Chloride | Sigma Aldrich | 793939 | |
| Corning 96 Well | Sigma Aldrich | CLS3603 | |
| Black Polystyrene Microplate | Sigma Aldrich | CLS3603 | |
| DMEM | Thermo Fischer | 11995065 | Hoge glucose |
| DMSO | Thermo Fischer | D12345 | Steriele, biologische kwaliteit |
| EGTA | Sigma Aldrich | E3889 | |
| Fetal Bovine Serum | Thermo Fischer | 12483-020 | |
| Flexstation 3 | Molecular devices | FV06060 | |
| Fura-2 AM | Thermo Fischer | F1221 | |
| Glucose | Sigma Aldrich | D8270 | |
| HEPES buffer | Thermo Fischer | 15630-080 | |
| Ionomycin | Sigma Aldrich | I9657 | |
| L Glutamine | Thermo Fischer | 25030-081 | |
| Pen Strep | Thermo Fischer | 15140122 | |
| Peptides | RS Syntehsis | Aangepast | ≥95% puur; N terminaal - acetylgroep C terminaal - amidegroep |
| Potassium Chloride | Sigma Aldrich | 12636 | |
| Sodium Chloride | Sigma Aldrich | S9888 | |
| TritonX-100 | DOW Chemical | 166704 |
Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.