Optimalisatie van de Single Reporter Serological Assay.
De koppelingsstrategie voor alle SARS-CoV-2-antigenen wordt beschreven in Cameron, et al., 20201 en in stap 2.1 hierboven. De strategie voor koppelingsbevestiging wordt beschreven in stap 2.3 hierboven. Voor een efficiënte koppeling moeten de waarden van de mediane fluorescentie-intensiteit (MFI) aanzienlijk hoger zijn dan de negatieve controlereactie(s) zonder serum/geen antilichaam en moeten ze een dosisrespons van afnemend MFI-signaal aantonen met afnemende hoeveelheden detectiereagens. MFI's van ongeveer 1.000 MFI-eenheden of meer over achtergrond MFI duiden over het algemeen op efficiënte eiwitkoppeling en zijn afhankelijk van de concentratie en specificiteit van het gebruikte detectiereagens. Met behulp van deze methode werd de bevestiging van S-, RBD- en Nc-antigeenkoppeling getest op twee partijen kralen(figuur 2). De MFI-signalen voor alle antigenen waren significant hoger dan de MFI op de achtergrond en vertoonden een dosisrespons met titratie van de detectiereagentia. De gegevens toonden ook een goede reproduceerbaarheid van MFI-niveaus tussen de twee verschillende partijen gekoppelde kralen.
Optimalisatie van de single reporter assay werd gedaan zoals beschreven in Cameron, et al., 20201. Elk antigeen werd getest bij verschillende koppelingsconcentraties met verschillende verdunningen van verschillende serummonsters die hoge, gemiddelde, lage en negatieve monsters vertegenwoordigden. Omdat de test IgG-titers meet, werd bovendien een IgG-gestript serum gebruikt als een extra negatief monster. De resultaten van een representatieve monsterverdunningsreeks met verschillende antigeenkoppelingsniveaus zijn weergegeven in figuur 3. Deze initiële verdunningsreeks werd getest met een vaste concentratie van detectiereagentia om een potentieel bereik van representatieve antigeenspecifieke en achtergrond MFI-niveaus te krijgen. Op basis van deze gegevens werden aanvullende monsterverdunningsbereiken en antigeenkoppelingsniveaus bepaald en verder getest met aanvullende monsters (gegevens niet weergegeven).
Vervolgens werd de concentratie van het detectiereagens geoptimaliseerd voor gebruik met de verschillende serumverdunningen en antigeenkoppelingsniveaus. Representatieve gegevens met 6 positieve en 2 negatieve monsters zijn weergegeven in figuur 4. Na aanvullende tests met enkele honderden negatieve pre-COVID-19 serummonsters werden de uiteindelijke optimale antigeenkoppelingsniveaus en detectieconcentraties geselecteerd voor het definitieve testprotocol, zoals beschreven in rubriek 5.
Conversie naar één neutralisatietest voor verslaggevers
Conversie van de serologische test van de enkele reporter naar een neutralisatietest werd bereikt door een incubatiestap toe te voegen met ACE2 (als een concurrerend reagens) met de kralen voorafgaand aan het toevoegen van het serummonster. Door de toegevoegde hoeveelheid ACE2 te titreren, werd remming van IgG-binding aan de S- en RBD-antigenen waargenomen, zoals weergegeven in figuur 5. Hoewel de sera van 11 patiënten verschillende titers van IgG hadden, vertoonden ze elk een significante afname van het MFI-signaal met een toenemende ACE2-concentratie. Zoals verwacht heeft ACE2 alleen invloed op de MFI-signalen van S en RBD, maar niet op het Nc-antigeen.
Het percentage resterende MFI-signaal ten opzichte van 0 μg/ml ACE2 voor alle monsters is weergegeven in figuur 6. Voor de meeste monsters werd een signaalverlies >30% waargenomen voor S en RBD met toenemende ACE2-concentratie. Zoals verwacht was er geen effect van ACE2 op het Nc-signaal.
Conversie naar een dual reporter IgG en IgM serologische assay
Voor de dual reporter IgG en IgM assay werden de standaard single reporter assay condities gebruikt om verschillende antilichaam- en reportercombinaties voor de twee reporter kanalen te testen. Het RP1-kanaal is vergelijkbaar met eerdere stroomanalyse-instrumenten met detectie van "oranje" fluorescentie voor reporterkleurstoffen zoals PE. Het tweede kanaal, RP2, maakt gebruik van een violette excitatielaser die kan worden gebruikt voor het detecteren van de "blauwe" fluorescentie van kleurstoffen die worden geëxciteerd bij 402 nm met emissiespectrapieken in het bereik van 421-441 nm.
Verschillende anti-humane IgG- en IgM-antilichaamcombinaties werden getest in verschillende concentraties met de standaard 2.000-voudige monsterverdunnings- en incubatieomstandigheden zoals beschreven in sectie 6. Een eerste test van anti-IgM geconjugeerd aan de DyLight 405 reporterkleurstof (DL 405; excitatie bij 400 nm en emissie bij 420 nm) voor het RP2-kanaal werd uitgevoerd met behulp van een set van 11 PCR-positieve monsters met DFSO variërend van 5 tot >60 dagen, en een IgG-gestript serummonster. Dit detectiereagens produceerde geen hoog signaal in het RP2-kanaal zoals weergegeven in figuur 7A, B, C. Voor monsters met de hoge IgM RP2 MFI werden de hoogste signalen gezien voor RBD en Nc(Figuur 7B,C). Hoewel IgM-titers op dit moment in sommige monsters verhoogd moeten zijn, waren de waargenomen MFI-niveaus niet hoger dan 140 MFI-eenheden met het IgM-detectiereagens. Bovendien ontbrak het de controlekraal voor IgM aan een significant dynamisch bereik voor MFI bij gebruik van DL 405 geconjugeerd aan anti-IgM in vergelijking met een PE-gelabelde anti-IgM RP1-reporter die bij dezelfde concentraties werd gebruikt(figuur 7D).
Omdat er geen geschikt detectiereagens met RP2-reporterlabel voor IgM beschikbaar was, werd het oorspronkelijke biotine anti-IgG met SASB getest voor gebruik in het RP2-kanaal. Het signaal voor IgG in het RP2-kanaal met SASB had niet hetzelfde dynamische bereik als met SAPE, maar het had nog steeds een geschikt bereik voor het meten van IgG-titers voor S, RBD en Nc(Figuur 8). Deze gegevens leidden tot het testen van verschillende RP1 IgM- en RP2 IgG-detectiereagenscombinaties, zoals hieronder beschreven.
Conversie naar dual reporter neutralisatie assay
De serologische test met dubbele reporter werd omgezet in een neutralisatietest door een incubatiestap toe te voegen met ACE2 en kralen, voorafgaand aan het toevoegen van het serummonster. Een 2-voudige verdunningsreeks ace2 vanaf 16 μg/ml werd gebruikt en vervolgens getest met sets van 11 monsters en gestripte sera zoals hierboven beschreven. Daarnaast werden 3 verschillende combinaties van RP1 IgM en RP2 IgG detectie antilichaam mixen getest op een set van 11 monsters en gestripte serum controles. De uiteindelijke combinaties en reagensconcentraties die optimaal zijn, zijn vermeld in tabel 1.
Voor IgG-detectie werd de biotine anti-humane IgG / SASB die werd gebruikt in de oorspronkelijke single reporter-test getest samen met een andere anti-IgG geconjugeerd aan de BV reporter-kleurstof. Terwijl de BV-conjugaat hoge RP2 MFI-signalen had, varieerde de MFI-signaalintensiteit voor IgG-titer over de ACE2-titraties(Figuur 9A,C, E). De biotine anti-humaan IgG/SASB-combinatie had een consistentere MFI-signaalafname over de ACE2-titratie in vergelijking met het BV-conjugaat, wat een dosisrespons aantoont, hoewel de MFI-niveaus lager waren. De signaalfluctuatie door de BV-conjugaat over ACE2-concentraties interfereerde ook met het bepalen van de procentuele remming door ACE2 over het bereik van IgG-titers in vergelijking met de biotine anti-humane IgG / SASB-combinatie (Figuur 9B,D, F). Monsters met lage MFI-signalen, zoals het DFSO 3-monster, hebben geen titers die hoog genoeg zijn om de prestaties van deze reagentia te evalueren of de IgG-neutraliserende capaciteit te meten.
Voor het bepalen van IgM-titers in het RP1-kanaal werd een PE-geconjugeerde anti-IgM vergeleken met een anti-humaan IgM geconjugeerd aan de DyLight 549 reporterkleurstof (DL 549; excitatie bij 562 nm en emissie bij 576 nm) bij de concentraties vermeld in tabel 1. Van deze twee reagentia vertoonde de PE anti-IgM hogere MFI's dan die gegenereerd door DL 549 anti-humaan IgM voor de geteste monsters(Figuur 9A,C, E). De IgM-controlekraal die de toevoeging van deze reagentia meet, had verschillende gemiddelde MFI's van ≈ 17.000 voor de PE-anti-IgM en 2.723 voor de DL 549-conjugaat. Zelfs met deze verschillen was de impact van de verschillende ACE2-concentraties op MFI meetbaar met het DL 549-conjugaat. Voor het bepalen van ACE2 procent remming van IgM binding was er een klein maar onbeduidend verschil tussen de twee IgM detectiereagentia(Figuur 9B,D,F).
| Combinatie | Verslaggever | Eindconcentratie in put (μg/ml) |
| RP1 | RP2 |
| 1 | PE anti-IgM | 2 | - |
| Biotine-Ig | - | 0.62 |
| Sasb | - | 4 |
| 2 | DyLight 549 Anti-Human IgM | 1 | - |
| Briljant Violet 421 Anti-Human IgG | - | 1 |
| 3 | DyLight 549 Anti-Human IgM | 1 | - |
| Biotine-Ig | - | 0.62 |
| Sasb | - | 4 |
Tabel 1: Lijst van geteste RP1- en RP2-reporterkleurstofcombinaties. Verschillende RP1- en RP2-reporterkleurstoffen werden geëvalueerd voor het meten van IgG- en IgM-titers. De drie hierboven getoonde combinaties werden getest bij verschillende RP1-detectiemodi en voor optimalisatie van de neutralisatietest. Voor RP2-combinaties met SASB worden concentraties voor het gebiotinyleerde detectieantilichaam en SASB weergegeven. *Eindconcentratie vertegenwoordigt de uiteindelijke concentratie in de reactieput.

Figuur 1: Stroomdiagram met de belangrijkste stappen van het testprotocol. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.

Figuur 2: Bevestiging van de antigeenkoppeling. Antigenen werden gekoppeld aan 100, 10 en 1 pmol/106 kralen. Voor S- en RBD-antigenen werd konijn-anti-S-sera gebruikt en gedetecteerd met PE-anti-konijn IgG. Voor Nc werd een Eiwit G-gezuiverd konijn polyklonaal anti-Nc gebruikt. De titratiecurven voor kralen in combinatie met 10 pmol S (A), 100 pmol RBD (B) en 100 pmol Nc (C) worden weergegeven. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.

Figuur 3: Optimalisatie van serumverdunning met verschillende antigeenkoppelingsniveaus. Serummonsters die hoge, gemiddelde, lage en negatieve monsters vertegenwoordigden, werden getest met de verschillende pmolantigeen/10 6-kraalkoppelingen. Een 4-voudige serumtitratie werd getest met een multiplexmengsel van antigeen-gekoppelde kralen met behulp van het testprotocol beschreven in rubriek 5. De MFI-waarden van de titratiecurven voor S (A), RBD (B) en Nc (C) worden weergegeven. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.

Figuur 4: Bepaling van de optimale serumverdunning en detectie van de reagensconcentratie. Acht serummonsters, waaronder negatieve patiënten (2 monsters) en laag- tot hoog-positief (6 monsters), werden getest op aanvullende serumverdunningen met drie verschillende detectiereagensconcentraties. De MFI-resultaten worden weergegeven voor S (A), RBD (B) en Nc (C). Op basis van deze en andere gegevens (niet getoond) werd een monsterverdunning van 1:2.000 en een biotinedetectieantilichaamconcentratie van 0,62 μg/ml geselecteerd. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.

Figuur 5: Optimalisatie van single reporter neutralization assay. Modificatie van de serologische test van de enkele reporter naar een neutraliserende antilichaamdetectietest werd uitgevoerd door een incubatiestap toe te voegen met ACE2 als concurrent, zoals beschreven in sectie 6. Een set van 11 monsters, variërend van laag- tot hoog-positieve titersera, en een IgG-gestreept serummonster werden getest met een tweevoudige verdunningsreeks ace2 vanaf 4 μg / ml, met behulp van standaard testomstandigheden. Over dit bereik van ACE2-concentraties kan een afname van MFI worden gezien bij verhoogde ACE2 voor S (A) en RBD (B), maar niet voor Nc (C). Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.

Figuur 6: Procentuele remming van het signaal met ACE2. Het percentage restsignalen voor de set van 11 monsters (uit figuur 4)wordt getoond. Voor elk monster, ongeacht de IgG-titer, werd een maximale afname van ≥30% MFI-signaal bereikt voor S (A) en RBD (B) bij de hoogste ACE2-concentratie. Voor het Nc-antigeen (C) was er geen significante remming van het signaal met enige hoeveelheid ACE2 getest. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.

Figuur 7: Test van DyLight 405 anti-IgM als RP2 IgM detectiereagens. Een set van 11 monsters en IgG-gestripte sera werden gebruikt om DL 405-geconjugeerde anti-IgM te testen als een RP2-detectiereagens. De RP2 IgM MFI-signalen voor S(A),RBD(B)en Nc(C)worden weergegeven. Het hoogste MFI-signaal voor elk antigeen met een monster was ongeveer 140 MFI-eenheden voor RBD met monster H (B). Zelfs het signaal op de IgM-controleparelset was minder dan 1.000 MFI in het RP2-kanaal over het hele antilichaamtiterbereik en vertoonde niet het verhoogde dynamische bereik dat werd waargenomen met het PE-anti-IgM-detectieantilichaam in het RP1-kanaal(D). Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.

Figuur 8: Optimalisatie van SASB als RP2 reporter met Biotine anti-IgG. Een set van 11 monsters en IgG-gestripte sera werden gebruikt om een verdunningsreeks SASB te testen met de standaard 0,62 μg / ml biotine anti-IgG. De resulterende IgG MFI's in het RP2-kanaal voor S (A), RBD (B) en Nc (C) worden weergegeven. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.

Figuur 9: Vergelijking van drie verschillende combinaties van RP1 IgM en RP1 IgG detectiemixen. Drie verschillende detectie antilichaammengsels werden getest op 11 monsters en IgG-gestripte sera. De gebruikte combinaties en eindconcentraties zijn beschreven in tabel 1. Alle monsters werden getest met een 2-voudige ACE2-verdunning, beginnend bij 16 μg / ml. Gegevens voor monsters bij DFSO van 3, 12 en 30 dagen worden getoond. De MFI-signalen voor RP1 IgM (oranje) en RP2 IgG (blauw) worden weergegeven in A (DFSO 3), C (DFSO 12) en E (DFSO 30). De resterende ACE2 procent MFI's worden weergegeven in B (DFSO 3), D (DFSO 12) en F (DFSO 30). Signalen die een daling van >30% vertegenwoordigen in vergelijking met geen ACE2-besturingselementen worden lichtgroen gemarkeerd. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.