$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Extracellulaire blaasjes (EV's) zijn nanogrote, lipidemembraangebonden deeltjes die zijn gecategoriseerd op basis van hun grootte: ectosomen (100-500 nm) en exosomen (50-150 nm)1. EV's bevatten verschillende biomoleculen, zoals eiwitten, nucleïnezuren en lipiden. Deze biomoleculen zijn afkomstig uit de cellen voordat ze als lading worden ingekapseld en via EV's in de extracellulaire ruimte worden vrijgegeven1,2,3.
Vanwege de verscheidenheid van hun lading, worden EV's verondersteld een actieve rol te spelen in intercellulaire communicatie. De afgifte en opname van EV's door cellen maakt de overdracht van biomoleculen tussen de cellen mogelijk4,5. De introductie van EV-lading in een cel kan de functies en homeostatische toestand van de ontvangende cel veranderen4,5,6. EV's worden geïnternaliseerd via meerdere paden; de exacte mechanismen zijn echter niet nauwkeurig aangetoond.
De meerderheid van de EV-opnametests, zoals genetische tagging, labelt fluorescerend individuele EV's7. Het resulterende signaal kan worden gemeten met een microplaatfotometer, flowcytometrie of microscopie, waarbij elke technologie aanzienlijke beperkingen heeft. Microplaatfotometers, flowcytometrie of standaard tweedimensionale (2D) microscopie kunnen geen onderscheid maken tussen geïnternaliseerde en oppervlakkig bevestigde EV's8,9. Bovendien kan de noodzakelijke monstervoorbereiding voor elk van deze technieken extra problemen met zich meebrengen voor de evaluatie van de ev-opname. Het opheffen van aangehechte cellen met trypsine vóór ev-opnameanalyse kan bijvoorbeeld enkele oppervlakkig gehechte EV's op het oppervlak van de cel splijten10,11. Trypsine kan ook interageren met het celoppervlak, waardoor het cel- en EV-fenotype wordt beïnvloed. Bovendien kan trypsine oppervlakkige EV's niet volledig losmaken, waardoor geïsoleerde populaties scheeftrekken.
Om EV's nauwkeurig te labelen met fluorescerende kleurstoffen, zijn extra wasstappen nodig om de resterende kleurstof7 te verwijderen. Geaccepteerde isolatietechnieken kunnen ook bijdragen aan vals-positieve signalen als gevolg van stolling die optreedt tijdens EV-isolatie. Seriële ultracentrifugatie (UC) wordt bijvoorbeeld veel gebruikt om EV's te isoleren en de geïmmobiliseerde kleurstof te verwijderen. UC kan echter ev's co-neerslaan en de resterende kleurstof kan leiden tot een vals-positief signaal12,13. Andere nanofiltratiemethoden, zoals kolomgebaseerde filtratie, worden ook veel gebruikt voor niet-geïmmobiliseerde kleurstofverwijdering. De complexe aard van EV's en kleurstof die binnen de kolommatrix interageren, kan leiden tot onvolledige verwijdering van resterende kleurstof als gevolg van de moleculaire afsnijding van de kolom die wordt gewijzigd door de complexe input14,15,16.
Het huidige protocol stelt een op nanofiltratie gebaseerd microfluïdisch apparaat voor om fluorescerend gelabelde geïsoleerde EV's te isoleren en te wassen. Het op nanofiltratie gebaseerde microfluïdische apparaat kan efficiënte filtratie bieden via vloeistofondersteunde scheidingstechnologie (FAST)17,18. FAST vermindert de drukval over het filter, waardoor de potentiële aggregatie tussen EV's en kleurstoffen wordt verminderd. Door restkleurstof efficiënt te verwijderen, is het mogelijk om de kwaliteit van fluorescerend gelabelde EV's en de specificiteit van de test te verbeteren.
Confocale microscopie kan onderscheid maken tussen geïnternaliseerde en oppervlakkig gehechte EV's op het celoppervlak en de cellulaire mechanismen van EV-opname uitgebreid onderzoeken in een spatiotemporale resolutie19,20,21,22,23,24,25. Sung et al. beschreven bijvoorbeeld de visualisatie van de exosoomlevenscyclus met behulp van hun ontwikkelde live-cell reporter. De locatie van de geïnternaliseerde EV's werd gedetecteerd en geanalyseerd met behulp van een confocale microscoop in driedimensionale (3D) en post-beeldverwerkingstools20. Hoewel de grootte van kleine EV's (40-200 nm) onder de resolutiegrens van de optische microscoop ligt, kunnen de fluorescerend gelabelde EV's worden gedetecteerd door confocale microscopie, omdat de fotodetector de verhoogde fluorescentie-emissie kan detecteren. Daarom kan de subcellulaire lokalisatie van de fluorescerend gelabelde EV's in een cel nauwkeurig worden bepaald door meerdere z-gestapelde beelden van de EV's en de omliggende cellulaire organellen te verkrijgen.
Daarnaast kunnen 3D-reconstructie en post-dataverwerking meer inzicht geven in de positionering van de geïnternaliseerde, oppervlakkige en vrij zwevende EV's. Door deze processen te gebruiken in combinatie met de time-lapse live-cell imaging die wordt aangeboden door confocale microscopie, kan het niveau van EV-opname nauwkeurig worden geëvalueerd en is het real-time volgen van EV-opname ook mogelijk. Verder kan ev-trafficking-analyse worden uitgevoerd met behulp van confocale microscopie door de co-lokalisatie van EV's met organellen te beoordelen, een eerste stap om te bepalen hoe geïnternaliseerde EV's betrokken zijn bij de intracellulaire functie. Dit protocol beschrijft de methodologie voor het uitvoeren van een EV-opnametest met behulp van het op nanofiltratie gebaseerde microfluïdische apparaat17,26, confocale microscopie en post-image analyse.