$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Hier worden twee verschillende methoden vergeleken om het 6E10-positieve gebied in de hippocampus en de cortex van hersenweefsels van muizen te kwantificeren. De twee methoden zijn de analyses van de volledige regio en subregio van belang (figuur 1). De volledige interessegebiedanalyse omvat, zoals de naam al doet vermoeden, het schetsen van het hele interessegebied (in dit geval de iso-cortex of de hippocampus) om het 6E10-positieve gebied te bepalen (figuur 1A, B). De subregio van interesseanalyse omvat het selecteren van een vooraf gedefinieerde regio binnen de interesseregio om het 6E10-positieve gebied te bepalen (figuur 1C, D). Het stapsgewijze ImageJ-protocol voor de twee methoden wordt weergegeven in figuur 2, figuur 3 en figuur 4.
Deze studie gebruikte drie lezers; twee onafhankelijke lezers voerden de subregio van interesseanalyse uit en de derde lezer voerde de volledige interessegebiedanalyse uit. Zoals te zien is in figuur 5A, B, was er een sterke significante positieve correlatie (p < 0,0001) tussen het 6E10-positieve gebied gerapporteerd door de twee lezers die de subregio van interesseanalyse uitvoerden (Pearson-correlatiecoëfficiënt r = 0,97 voor de cortex en r = 0,96 voor de hippocampus). De 6E10-positieve gebieden gerapporteerd door de twee lezers voor de subregio van interesseanalyse werden gemiddeld, en de gemiddelde subregio van belang 6E10-positief gebied deelde een sterke significante positieve correlatie (p < 0,0001) met het 6E10-positieve gebied verkregen met behulp van de volledige regio van interesseanalyse voor zowel de cortex (Pearson-correlatiecoëfficiënt r = 0,96; Figuur 5C) en de hippocampus (Pearson correlatiecoëfficiënt r = 0,95; Figuur 5D). Het gemiddelde corticale- en hippocampus-6E10-positieve gebied verkregen door de volledige regio- en subregio van belanganalyses was vergelijkbaar zonder significant verschil, wat de overeenkomst tussen de twee methoden bevestigt (figuur 5E). Verder werd de onoplosbare Aβ1-42 gemeten in homogenen van de hele hersenen in een subset van muizen en het corticale (figuur 5F) en hippocampus (figuur 5G) 6E10-positieve gebied bepaald door de analyse van het volledige interessegebied was significant (p < 0,01) gecorreleerd met onoplosbare Aβ1-42-belasting met behulp van ELISA (zie Tabel van materialen).

Figuur 1: Volledige versus subregio's van belangselectie. Representatieve beelden van de volledige iso-cortex (cortex) en hippocampus geschetst voor de volledige regio van belang analyse in respectievelijk (A) en (B). Representatieve beelden tonen de selectie van subregio('s) van de cortex en hippocampus voor de subregio van belanganalyse in respectievelijk (C) en (D). Schaalbalk = 200 μm. Klik hier om een grotere versie van dit cijfer te bekijken.

Figuur 2: Protocol voor de volledige interesseregio 6E10-positieve gebiedskwantificering. Stappen voor beeldanalyse met de oorspronkelijke afbeelding (A), de afbeelding na aanpassing van de helderheid/het contrast (B), selectie van het interessegebied (C), clearing (D), drempelaanpassing (E) en de uiteindelijke afbeelding die klaar is voor analyse (F). De nummers in de afbeelding geven de stapnummers in het protocol aan. Schaalbalk = 200 μm. Klik hier om een grotere versie van dit cijfer te bekijken.

Figuur 3: Protocol voor de subregio van belang 6E10-positieve gebiedskwantificering. Stappen voor beeldanalyse met de oorspronkelijke afbeelding (A), de afbeelding na aanpassing van de helderheid/het contrast (B), selectie van het interessegebied (C), duplicatie van de afbeelding van het interessegebied (D), het wijzigen van de afbeelding in 8-bits en het omkeren van de afbeelding (E), drempelaanpassing (F) en de uiteindelijke afbeelding die klaar is voor analyse (G). De nummers in de afbeelding geven de stapnummers in het protocol aan. Schaalbalk = 200 μm. Klik hier om een grotere versie van dit cijfer te bekijken.

Figuur 4: Protocol voor de regio van belangrotatie. Beeldanalysestappen die de selectie van het interessegebied en de rotatie van het selectievak weergeven om te passen bij de weefselkromming (A), de afbeelding van het interessegebied na duplicatie (B) en de afbeelding na het wissen van het buitengebied (niet-interessegebied) (C). De getallen in de figuur geven het stapnummer in het protocol aan. Schaalbalk = 200 μm. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.

Figuur 5: Correlatie tussen de volledige en subregio's van belang analyses. Scatterplots tonen de correlatie tussen het 6E10-positieve gebied door de twee onafhankelijke lezers die de subregio van belanganalyse voor de cortex (A) en de hippocampus (B) uitvoeren. Er wordt een sterke positieve correlatie waargenomen tussen het 6E10-positieve gebied dat het resultaat is van de subregio van interesseanalyse en de volledige interessegebiedanalyse voor zowel de cortex (C) als de hippocampus (D). Er is geen statistisch significant verschil in het gemiddelde 6E10-positieve gebied door de volledige interesseregio en de subregio van interesseanalyses in de cortex en de hippocampus (E). Er wordt een significante correlatie waargenomen tussen homogene onoplosbare Aβ1-42-metingen van de hele hersenen met behulp van ELISA en de analyse van het volledige interessegebied voor zowel de cortex (F) als de hippocampus (G). Gegevens werden geanalyseerd met behulp van de Pearson-correlatiecoëfficiënt, r, in (A-D) en (F-G), en met behulp van tweeweg herhaalde metingen ANOVA in (E) met behulp van een grafiek- en statistieksoftware. De gegevens worden gepresenteerd als gemiddelde ± standaardfout van het gemiddelde (SEM) van n = 35 muizen in (E), en een tweezijdige p < 0,05 werd als statistisch significant beschouwd. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.