Een abonnement op JoVE is vereist om deze inhoud te bekijken. Log in of start vandaag met uw gratis proefperiode.

Methodenartikel

Mycobacterium tuberculose Extracellulaire vesikelverrijking door grootte-uitsluitingschromatografie

2.3K weergaven

DOI:

10.3791/63895

19 mei 2022

In dit artikel

Samenvatting

Dit protocol beschrijft grootte-uitsluitingschromatografie, een gemakkelijke en reproduceerbare techniek voor het verrijken van Mycobacterium tuberculosis extracellulaire blaasjes uit kweeksupernatanten.

Samenvatting

De rol van extracellulaire blaasjes (EV's) in de context van bacteriële infectie is naar voren gekomen als een nieuwe weg voor het begrijpen van microbiële fysiologie. Specifiek spelen Mycobacterium tuberculosis (Mtb) EV's een rol in de gastheer-pathogeen interactie en reactie op omgevingsstress. Mtb EV's zijn ook zeer antigeen en hebben potentieel als vaccincomponenten. De meest gebruikelijke methode voor het zuiveren van Mtb EV's is ultracentrifugatie van de dichtheidsgradiënt. Dit proces heeft verschillende beperkingen, waaronder een lage doorvoer, lage opbrengst, afhankelijkheid van dure apparatuur, technische uitdagingen en het kan een negatieve invloed hebben op de resulterende voorbereiding. Size exclusion chromatography (SEC) is een zachtere alternatieve methode die veel van de beperkingen van ultracentrifugatie bestrijdt. Dit protocol toont aan dat SEC effectief is voor Mtb EV-verrijking en produceert hoogwaardige Mtb EV-preparaten met een verhoogde opbrengst op een snelle en schaalbare manier. Bovendien toont een vergelijking met ultracentrifugatie van dichtheidsgradiënt door kwantificerings- en kwalificatieprocedures de voordelen van SEC aan. Terwijl de evaluatie van ev-kwantiteit (nanodeeltjestrackinganalyse), fenotype (transmissie-elektronenmicroscopie) en inhoud (Western blotting) is afgestemd op Mtb EV's, kan de geleverde workflow worden toegepast op andere mycobacteriën.

Inleiding

Extracellulaire vesicle (EV) afgifte door pathogenen kan de sleutel zijn tot het ontsluiten van nieuwe technologieën om infectieziekten te beheersen1. Mycobacterium tuberculosis (Mtb) is een ziekteverwekker van hoge betekenis, infecteert ongeveer een derde van de wereldbevolking en eist elk jaar het leven van miljoenen mensen2. Ev-productie door Mtb is goed gedocumenteerd maar ongrijpbaar in de biogenese en gevarieerde rollen (d.w.z. immunostimulerend, immunosuppressief, ijzer- en nutriëntenacquisitie) van deze EV's in de context van infectie 3,4,5. Inspanningen om de samenstelling van Mtb EV's te begrijpen onthulden 50-150 nm lipidemembraan-ingesloten bollen afgeleid van het plasmamembraan met lipiden en eiwitten van immunologische betekenis 3,6. Onderzoek naar de rol van MTB EV's in de bacteriële fysiologie heeft het belang van bacteriële EV-modulatie als reactie op omgevingsstress voor overleving aan het lichtgebracht 5. Gastheer-pathogeen interactiestudies zijn ingewikkelder om te interpreteren, maar er zijn aanwijzingen dat Mtb EV's de immuunrespons van de gastheer kunnen beïnvloeden en mogelijk kunnen dienen als een effectieve vaccinatiecomponent 3,4,7.

De meeste studies van Mtb EV's tot nu toe hebben vertrouwd op dichtheidsgradiënt ultracentrifugatie voor blaasjesverrijking8. Dit is effectief geweest voor kleinschalige studies; deze techniek heeft echter verschillende technische en logistieke uitdagingen. Alternatieve workflows koppelen meerstaps centrifugatie, voor het verwijderen van hele cellen en groot puin, met een laatste ultracentrifugatiestap naar pellet-EV's. Deze methodologie kan variëren in efficiëntie en resulteert vaak in een lage opbrengst en co-zuivering van oplosbare niet-blaasjes geassocieerde biomoleculen, terwijl het ook de integriteit van blaasjes beïnvloedt9. Bovendien is dit proces tijdrovend, handmatig intensief en zeer beperkt in doorvoer vanwege apparatuurbeperkingen.

Het huidige protocol beschrijft een alternatieve techniek voor ultracentrifugatie van dichtheidsgradiënt: grootte-exclusiechromatografie (SEC). Deze methode is gedemonstreerd voor omgevingsmycobacteriën en in het huidige werk is het geëxtrapoleerd naar Mtb10. Een in de handel verkrijgbare kolom en automatische fractiecollector kunnen de consistentie in de vesische bereiding verbeteren en de noodzaak voor specifieke, dure apparatuur verminderen. Het is ook mogelijk om dit protocol in een fractie van de tijd te voltooien in vergelijking met ultracentrifugatie van de dichtheidsgradiënt, waardoor de doorvoer toeneemt. Deze techniek is technisch minder uitdagend, waardoor het gemakkelijker te beheersen is en kan de reproduceerbaarheid tussen / intra-laboratoria vergroten. Ten slotte heeft SEC een hoge scheidingsefficiëntie en is zachtaardig, waardoor de integriteit van de blaasjes behouden blijft.

Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.

Protocol

Het Colorado State University Institutional Biosafety Committee keurde de huidige studie goed (19-046B). De teelt van Mycobacterium tuberculosis en het oogsten van EV-rijke kweeksupernatanten werden uitgevoerd door getraind personeel in een laboratorium met hoge containment. De materialen werden uit het gebied met hoge insluiting verplaatst nadat een geldige inactiveringsmethode was uitgevoerd, bevestigd en goedgekeurd door het institutionele bioveiligheidsbeleid. Hoewel het repliceren van het protocol, als gevalideerde inactivatie of steriele filtratiemethode niet haalbaar is, moeten de volgende procedures worden uitgevoerd in een laboratorium met een hoge containment.

1. Bereiding van ruw MTB EV-concentraat

OPMERKING: Voor gedetailleerde procedures voor de teelt van Mtb en de bereiding van kweekfiltraateiwit (CFP), zie referenties11,12. Het wordt aanbevolen dat bacteriële kweekmedia vrij zijn van groeisupplementen met EV-bevattende of eiwithoudende componenten, zoals Oleic Albumin Dextrose Catalase (OADC) en detergentia zoals Tween. Het wordt ook aanbevolen om de kwaliteit van de bacteriecultuur en het geoogste GVB te screenen om een beperkte celdood en lysis13,14 te garanderen.

  1. Bereid een 100 kDa moleculair gewichtsafsnijding (MWCO) centrifugaalfilter (zie Materiaaltabel) door de volledige volumecapaciteit van fosfaat-gebufferde zoutoplossing (1x PBS) toe te voegen. Centrifugeer gedurende 5 minuten bij 2.800 x g bij 4 °C.
    OPMERKING: Als u een filter zonder dead stop volume gebruikt, moet ervoor worden gezorgd dat het monstervolume niet onder het filterniveau daalt, wat resulteert in volledige filterdroging tijdens centrifugatie.
  2. Gooi de doorstroom en eventuele resterende PBS weg voordat u de monsterkamer met Mtb CFP tot de maximale capaciteit vult. Centrifugeer bij 2.800 x g bij 4 °C totdat het volume is teruggebracht tot het minimumvolume van het ultrafiltratieapparaat. Herhaal indien nodig en voeg meer GVB toe aan de eenheid totdat het volledige monster voldoende is verkleind.
    OPMERKING: Bewaar indien gewenst een deel van het 100 kDa doorstroommateriaal (100F) voor downstream kwalificatie. Bewaren bij 4 °C.
  3. Voeg 1x PBS toe aan de filtereenheid met het concentraat tot de totale apparaatcapaciteit. Verlaag het volume zoals beschreven in 1.2. Herhaal deze stap vijf keer om te zorgen voor volledig wassen en bufferuitwisseling.
  4. Herstel het 100 kDa geconcentreerde CFP-retentaat (100R) volgens de specificaties van het ultrafiltratieapparaat (zie Materiaaltabel). Zodra de 100R is hersteld, wast u het filter minstens drie keer met een minimaal volume van 1x PBS en poolt u de was met de 100R om het herstel te maximaliseren.
  5. Kwantificeer het 100R-materiaal met een bicinchoninische assay (BCA) volgens de instructies van de fabrikant (zie materiaaltabel). Gebruik voor het uitvoeren van de test verschillende verdunningen van monsters 1:2, 1:5 en 1:10 in PBS. Test het monster in drievoud.
    OPMERKING: Bewaar indien gewenst een deel van het 100R-materiaal voor downstream-kwalificatie. Bewaren bij 4 °C.

2. Grootte-uitsluitingschromatografie voor de verrijking van MTB EV's van CFP

OPMERKING: De volgende procedure is specifiek voor het gebruik van 3 mg 100R Mtb CFP met SEC-kolom en automatische fractiecollector (AFC, zie Materiaaltabel). Het kan worden aangepast voor andere startconcentraties en kolomtypen door de specificaties van de fabrikant te volgen. Bovendien wordt de gebruikers aangeraden om de gebruikershandleiding van de automatische breukverzamelaar te lezen en te begrijpen.

  1. Laat de SEC-kolom in evenwicht brengen tot kamertemperatuur.
  2. Schakel de AFC in met behulp van de aan/uit-schakelaar aan de achterkant van de toreneenheid en pas de instellingen voor de loadcel aan, indien nodig, door op SETUP te drukken op het touchscreen van het hoofdmenu. De loadcel mag alleen worden gekalibreerd bij het eerste gebruik, na elke software-update en als inconsistentie in de volumes van de fractieverzameling wordt opgemerkt.
  3. Lijn in het scherm SETUP de carrousel uit door CARROUSEL > KALIBREREN te selecteren. Plaats de carrousel met de 13 kleine gaatjes naar boven in de AFC-toren en stel de carrousel zo in dat het vloeistofmondstuk zich direct boven de spoelpositie bevindt door op de knoppen - en / of + te drukken.
  4. Verwijder de doppen uit de gebalanceerde SEC-kolom. Schuif de SEC-kolom in de juiste kolombevestiging en installeer deze zorgvuldig op de AFC-toren. Zorg ervoor dat de RFID-tag (Radio Frequency Identification) op de kolom naar de AFC is gericht en controleer of de verbinding tussen de kolom en de klep veilig is. Plaats de afvaluitlaatbuis in een opvangbak.
  5. Selecteer in het scherm SETUP de optie Collectieschema en stel het aantal in op 13 en de grootte op 0,5 ml door op de knoppen - en/of + te drukken. Laat de instelling "Buffervolume" als de standaardinstelling van 2,7 ml en sluit vervolgens het venster "Collectieschema" door op X te drukken.
  6. Selecteer COLLECTIE STARTEN in het startscherm en bevestig de collectieparameters door JA te selecteren. Laad 13 gelabelde microcentrifugebuizen van 1,7 ml met de deksels open en gericht op het carrouselcentrum.
  7. Ga verder met de AFC door OK te selecteren, monteer vervolgens het kolomreservoir en ga opnieuw verder door op OK te drukken. Selecteer de optie om de kolom leeg te maken door op JA te drukken en voeg één kolomvolume van 0,2 μm gefilterd PBS toe om eventuele opslagbuffers te verwijderen. Zodra de spoeling is voltooid, gaat u verder met de AFC door op OK te drukken.
  8. Plaats het carrouseldeksel over de AFC en druk op OK. Bereid één kolomvolume van 0,2 μm gefilterd PBS voor. Gebruik een pipet om overtollige buffer uit de kolom te verwijderen.
  9. Breng 3 mg 100R monster zoals gekwantificeerd in stap 1,5 tot 500 μL met 1x PBS. Voeg het monster van 3 mg toe aan de bovenkant van de kolom. Zet de AFC vooruit en laat het monster in de friet lopen. Zodra het monster volledig in de kolom is gekomen, voegt u het in stap 2.6 voorbereide PBS toe aan het reservoir.
  10. Controleer de uitvoering van de AFC terwijl deze eerst het leegtevolume en vervolgens de opgegeven fracties verzamelt. Nadat de run is voltooid en de carrousel terugkeert naar de afvalpositie, verwijdert u de afdekking en verwijdert u de fractiebuizen uit de carrousel. Bewaar de fracties bij 4 °C voorafgaand aan de kwantificering (stap 3) en kwalificatie (stap 4).
  11. Als de kolom opnieuw moet worden gebruikt, selecteert u de optie om de kolom schoon te maken door op JA te drukken; druk anders op NEE. Volg de instructies op de AFC.
    OPMERKING: Zodra de kolom is gewassen en de opslagbuffer is doorgelopen, kan deze worden verwijderd, afgedekt en bewaard bij 4 °C.

3. Kwantificering van de MTB EV's

  1. Meet de eiwitconcentratie voor elke fractie met behulp van BCA en micro BCA12.
    1. Gebruik voor 0,5 ml fracties verzameld uit 3 mg 100R Mtb CFP de micro BCA met een 1:3 verdunning voor fracties genummerd 1-7 van elk monster in drievoud.
    2. Gebruik voor 0,5 ml fracties genummerd 5-13 de BCA zonder verdunning voor elk monster in drievoud.
      OPMERKING: Het overlappen van de assays voor breuken 5-7 helpt ervoor te zorgen dat alle fracties een leesbare output hebben.
  2. Kwantificeer de deeltjesconcentratie voor elke fractie met behulp van nanodeeltjes tracking analyse (NTA).
    1. Verdun de monsters in 1 ml 1x PBS met behulp van de volgende voorgestelde startverhoudingen; gebruik voor fracties 1-3 1:100 en gebruik vervolgens voor de resterende fracties een verdunning van 1:10.
    2. Vortex de verdunde oplossingen en trek het monster vervolgens in een wegwerpspuit van 1 ml. Plaats de spuit in een automatische spuitpomp indien beschikbaar.
    3. Stel de spuitpomp in op 30 μL/min en gebruik de video-opname-instellingen met een schermversterking van 10-12 en een cameraniveau van 10-12. Pas de focus voor elk monster aan.
    4. Verzamel minimaal drie video's op 30 s elk met behulp van een constante stroom.
    5. Voer de analyse uit met de softwaredetectiedrempel ingesteld op vijf.
      OPMERKING: Het is mogelijk dat het niet mogelijk is om NTA-gegevens voor de meest recente fracties (>7) te verkrijgen zonder een aanzienlijk monstervolume op te offeren.

4. Kwalificatie van MTB EV's

  1. Visualiseer het algemene eiwitprofiel van elke fractie met behulp van een zilvergekleurde eiwitgel.
    OPMERKING: Gedetailleerde procedures voor SDS-PAGE en zilvervlek zijn te vinden in Referentie15.
    1. Voeg sds-monsterbuffer toe aan 10 μl van elke fractie en 5 μg CFP, 100R en 100F. Kook gedurende 5 minuten bij 100 °C en laad vervolgens op een 4% -12% Bis-Tris Gel met een moleculaire gewichtsladder voor polyacrylamidegelelektroforese (PAGE) (zie Materiaaltabel).
    2. Laat de gel draaien met behulp van 1x 2-[N-morpholino]ethaansulfonzuur (MES) lopende buffer (zie Tabel van materialen) en een 200 V stroom gedurende 35 min.
    3. Verwijder de gel van de cassette en ga verder met zilverkleuring15.
  2. Evalueer de aan- of afwezigheid van EV-markers in elke fractie door Western blot.
    OPMERKING: Gedetailleerde procedures voor Western blotting zijn te vinden in Referentie15.
    1. Voer een SDS-PAGE-gel uit zoals beschreven in stap 4.1.1-4.1.2.
    2. Verwijder de gel van de cassette en breng de opgeloste eiwitten over naar een nitrocellulosemembraan van 0,2 μm (zie materiaaltabel) door minimaal 1 uur een stroom van 50 V toe te passen.
    3. Voer Western blot-analyse uit om interessante eiwitten te evalueren. Primaire antilichamen tegen LpqH, lipoarabinomannan (LAM) en GroES (zie Materiaaltabel) worden aanbevolen.
    4. Poolfracties op basis van de aan- of afwezigheid van markers zoals van toepassing voor de downstreamtoepassing.
  3. Bevestig de aanwezigheid van intacte blaasjes door transmissie-elektronenmicroscopie (TEM).
    1. Fixeer 15 μL van het blaasjesmonster door 15 μL 4% EM-klasse paraformaldehyde toe te voegen en bewaar het bij 4 °C 's nachts.
    2. Bereid een 200 mesh formvar-carbon gecoat koper TEM-rooster voor door het oppervlak te reinigen en een hydrofiel substraat te maken.
      OPMERKING: Plasmareiniging met 95% argon, 5% zuurstof en 30% plasmavermogen gedurende 1 minuut wordt aanbevolen.
    3. Laat 10 μL van het vaste monster op het rooster vallen en laat het monster gedurende 10 minuten hechten en veeg vervolgens de overtollige vloeistof weg met filterpapier.
    4. Drijf het rooster op een druppel ultrapuur water gedurende 30 s en veeg vervolgens overtollige vloeistof weg.
    5. Laat het rooster gedurende 2 minuten op een d% EM-kwaliteit uranylacetaatdruppel drijven en de overtollige vloeistof vervolgens wegvegen.
    6. Laat het rooster volledig aan de lucht drogen.
    7. Afbeelding met een TEM (zie Materiaaltabel) bij 100 kV of iets dergelijks.
      OPMERKING: Andere EV-kwantificerings- en karakteriseringsmethoden moeten worden gebruikt op basis van downstreamtoepassingen. De minimale informatie voor studies van extracellulaire blaasjes18 moet worden geraadpleegd voor richtlijnen om de striktheid en reproduceerbaarheid van alle EV-onderzoeken te waarborgen.

Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.

Resultaten

Kweekfiltraateiwit (CFP) van Mycobacterium tuberculosis (Mtb) werd geconcentreerd, gekwantificeerd en vervolgens werd 3 mg materiaal aangebracht op een sec-kolom (size exclusion chromatography). De eiwit- en deeltjesconcentraties werden opgesomd door respectievelijk BCA en NTA. De verwachte marges voor eiwit- en deeltjesterugwinning plus de exacte waarden die voor deze resultaten zijn verkregen, worden weergegeven in tabel 1. Waarden die veel hoger zijn dan deze bereiken kunnen wijzen op verontr...

Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.

Discussie

Mycobacterium tuberculosis extracellulaire blaasjes zijn zeer antigene reservoirs, die ze presenteren als een aantrekkelijke manier voor het ontwikkelen van diagnostische hulpmiddelen en toekomstige vaccins 4,19,20. Historisch gezien is ultracentrifugatie van de dichtheidsgradiënt gebruikt om Mtb EV's te scheiden van ander oplosbaar, uitgescheiden materiaal8. Hoewel dit proces effectief is, is he...

Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.

Openbaarmakingen

De auteurs hebben niets te onthullen.

Dankbetuigingen

We willen graag de steun erkennen van het College of Veterinary Medicine and Biomedical Sciences Experiential Award en College Research Council Shared Research Program aan NKG en financiering door ATCC (award # 2016-0550-0002) aan KMD. We willen ook Anne Simpson bedanken voor technische ondersteuning en BEI Resources, NIAID, NIH voor de volgende reagentia: Monoklonale Anti-Mycobacterium tuberculosis LpqH (Gene Rv3763), IT-54 (geproduceerd in vitro), NR-13792, Monoklonale Anti-Mycobacterium tuberculosis GroES (Gen Rv3418c), Clone IT-3 (SA-12) (geproduceerd in vitro), NR-49223, en Monoclonal Anti-Mycobacterium tuberculosis LAM, Clone CS-35 (geproduceerd in vitro), NR-13811.

Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.

Materialen

Lijst van materialen gebruikt in dit artikel
NaamBedrijfCatalogusnummerOpmerkingen
20x MES SDS Running BufferThermoFisher ScientificNP0002
96 well plateCorning15705-066
Automatic Fraction CollectorIZON ScienceAFC-V1-USD
BenchMark Pre-stained Protein LadderInvitrogen10748010
Benchtop centrifugeBeckman CoulterAllegra 6R
Centricon Plus - 70 Centrifugal filter, 100 kDa cutoffMillipore SigmaUFC710008Ultrafiltratie apparaat gebruikt in stap 1.1
Electroblotting SystemThermoFisher Scientific09-528-135
EM Grade ParaformaldehydeElectron Microscopy Sciences15714-S
Formvar/Carbon 200 mesh Cu GridsElectron Microscopy SciencesFCF200H-Cu-TA
Goat Anti-Mouse IgG H&L (Alkaline Phosphatase), whole molecule, 1 mLAbCamab6790Secundaire antilichaam
JEM-1400 Transmission Electron MicroscopeJOEL
Micro BCA Protein Assay KitThermoFisher Scientific23235
Microplate readerBIOTEKEpoch
Monoclonal Anti-Mycobacterium tuberculosis GroES (Gene Rv3814c)BEI ResourcesNR-49223Primair antilichaam
Monoclonal Anti-Mycobacterium tuberculosis LpqH (Gene Rv3763)BEI ResourcesNR-13792Primair antilichaam
Monocolonal Anti-Mycobacterium tuberculosis LAM, Clone CS-35BEI ResourcesNR-13811Primair antilichaam
NanoClean 1070Fischione InstrumentsVoor plasma schoonmaak van de TEM grid
Nanosight uitgerust met spuitpomp en computer met NanoSight NTA softwareMalvern PanalyticalNS300
Nitrocellulose membrane, Roll, 0.2 μmBioRad1620112
NuPAGE 4-12% Bis-Tris Protein GelsThermoFisher ScientificNP0323BOX
Phosphate-buffered Saline, 1X without calcium and magnesiumCorning21-040-CV
Pierce BCA Protein Assay KitThermoFisher Scientific23225
PowerPac Basic Power SupplyBioRad1645050
qEV Original 35 nm 5/pkIZON ScienceSP5-USDSEC kolom
SDS sample bufferBosterAR1112In-house recept gebruikt in deze procedure, echter is dit product equivalent
SDS-PAGE gel chamberThermoFisher ScientificEI0001
Sigmafast BCIP/NBTMillipore SigmaB5655
Silver Stain Plus KitBioRad1610449In-house protocol gebruikt in deze procedure, echter is deze kit equivalent
Uranyl AcetateElectron Microscopy Sciences22400

Referenties

  1. Gill, S., Catchpole, R., Forterre, P. Extracellular membrane vesicles in the three domains of life and beyond. FEMS Microbiology Reviews. 43 (3), 273-303 (2019).
  2. World Health Organization. GLOBAL TUBERCULOSIS REPORT 2021. World Health Organization. , (2021).
  3. Prados-Rosales, R., et al. Mycobacteria release active membrane vesicles that modulate immune responses in a TLR2-dependent manner in mice. Journal of Clinical Investigation. 121 (4), 1471-1483 (2011).
  4. Prados-Rosales, R., et al. Mycobacterial membrane vesicles administered systemically in mice induce a protective immune response to surface compartments of mycobacterium tuberculosis. mBio. 5 (5), 01921(2014).
  5. Prados-Rosales, R., et al. Role for mycobacterium tuberculosis membrane vesicles in iron acquisition. Journal of Bacteriology. 196 (6), 1250-1256 (2014).
  6. Lee, J., et al. Proteomic analysis of extracellular vesicles derived from Mycobacterium tuberculosis. Proteomics. 15 (19), 3331-3337 (2015).
  7. Athman, J. J., et al. Mycobacterium tuberculosis Membrane Vesicles Inhibit T Cell Activation. The Journal of Immunology. 198 (5), 2028-2037 (2017).
  8. Prados-Rosales, R., Brown, L., Casadevall, A., Montalvo-Quirós, S., Luque-Garcia, J. L. Isolation and identification of membrane vesicle-associated proteins in Gram-positive bacteria and mycobacteria. MethodsX. 1, 124-129 (2014).
  9. Cvjetkovic, A., Lötvall, J., Lässer, C. The influence of rotor type and centrifugation time on the yield and purity of extracellular vesicles. Journal of Extracellular Vesicles. 3 (1), 23111(2014).
  10. Dauros Singorenko, P., et al. Isolation of membrane vesicles from prokaryotes: a technical and biological comparison reveals heterogeneity. Journal of Extracellular Vesicles. 6 (1), 1324731(2017).
  11. Wallace, E., et al. Culturing mycobacteria. Methods in Molecular Biology. 2314, 1-58 (2021).
  12. Lucas, M., et al. Extraction and separation of mycobacterial proteins. Methods in Molecular Biology. 2314, 77-107 (2021).
  13. Walker, S. A., Kennedy, M. T., Zasadzinski, J. A. Encapsulation of bilayer vesicles by self-assembly. Nature. 387 (6628), 61-64 (1997).
  14. Edwards, D. A., et al. Spontaneous vesicle formation at lipid bilayer membranes. Biophysical Journal. 71 (3), 1208(1996).
  15. Dobos, K. Production Manuals & SOPs. SP007: Running of polyacrylamide gels, SP011: Western blot, and SP0012: Silver staining protocols. , Available from: https://labs.vetmebiosci.colostate.edu/dobos/bei-resources/ (2022).
  16. Engers, H. D., et al. Results of a World Health Organization-sponsored workshop to characterize antigens recognized by mycobacterium-specific monoclonal antibodies. Infection and Immunity. 51 (2), 718-720 (1986).
  17. Chatterjee, D., Lowell, K., Rivoire, B., McNeil, M. R., Brennan, P. J. Lipoarabinomannan of Mycobacterium tuberculosis. Capping with mannosyl residues in some strains. Journal of Biological Chemistry. 267 (9), 6234-6239 (1992).
  18. Théry, C., et al. Minimal information for studies of extracellular vesicles 2018 (MISEV2018): a position statement of the International Society for Extracellular Vesicles and update of the MISEV2014 guidelines. Journal of Extracellular Vesicles. 7 (1), 1535750(2018).
  19. Palacios, A., et al. Mycobacterium tuberculosis extracellular vesicle-associated lipoprotein LpqH as a potential biomarker to distinguish paratuberculosis infection or vaccination from tuberculosis infection. BMC Veterinary Research. 15 (1), 1-9 (2019).
  20. Ziegenbalg, A., et al. Immunogenicity of mycobacterial vesicles in humans: Identification of a new tuberculosis antibody biomarker. Tuberculosis. 93 (4), 448-455 (2013).
  21. Chiplunkar, S. S., Silva, C. A., Bermudez, L. E., Danelishvili, L. Characterization of membrane vesicles released by Mycobacterium avium in response to environment mimicking the macrophage phagosome. Future Microbiology. 14 (4), 293-313 (2019).

Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.

Herprints en machtigingen

Trefwoorden

Mycobacterium tuberculosis EV sextracellulaire blaasjesdichtheidsgradi nt ultracentrifugatienanoparticle tracking analysetransmissie elektronenmicroscopieWestern bloteiwitkwantificeringSDS PAGEgastheer pathogeeninteractie