De belangrijkste manier waarop het hier beschreven model verschilt van eerder gepubliceerde vaginale inentingsmodellen is het gebruik van anaëroob gekweekte bacteriën, die speciale overwegingen vereisen voor de bereiding van levensvatbaar entmateriaal en het herstel van bacteriën uit de muizen. Specifieke stappen in het bovenstaande protocol kunnen enigszins variëren, afhankelijk van de gebruikte soort/bacteriestam, zoals voorgesteld in aanvullend dossier 1. Bovendien beschrijft dit manuscript een nieuwe procedurele methode voor het toedienen van bacteriën en vaginale wasbeurten die minder ervaring van de kant van de onderzoeker en minder terughoudendheid voor de muizen vereist. Als de experimentator zich niet op zijn gemak voelt met de vorm van terughoudendheid zoals beschreven in stap 3.2. en stap 3.3., kunnen de muizen in plaats daarvan worden gekrabbeld zoals eerder beschreven34 met of zonder anesthesie volgens het experimentele ontwerp en de institutionele IACUC-richtlijnen.
Een belangrijk voorbehoud bij het gebruik van anaëroob gekweekte bacteriën in muizenmodellen is dat bepaalde stappen (zoals die met levende dieren) buiten de anaerobe kamer moeten worden uitgevoerd. Daarom zijn de meest kritieke stappen in dit protocol die waarin de bacteriën van belang worden blootgesteld aan een aerobe omgeving, zoals tijdens inenting van de muizen. Het gebruik van nieuwe anaërobe in dit model vereist een voorlopig onderzoek naar het vermogen ervan om levensvatbaar te blijven bij blootstelling aan zuurstof (zoals de vergelijking van CFUs vóór en na inenting zoals beschreven in stap 2.5. en stap 3.4. Afhankelijk van de mate van zuurstof en de PBS-gevoeligheid van het organisme, moeten verschillende methoden voor entpreparaat worden overwogen (aanvullend dossier 1, stap 2.4.5.). Voor inentingen met G. vaginalis JCP8151B hebben we ontdekt dat een enkele buis entmateriaal kan worden bereid in PBS en kan worden gebruikt om alle muizen te infecteren. Als een andere anaerobe bacterie wordt gebruikt die gevoeliger is voor zuurstof, kan het entmateriaal in plaats daarvan in afzonderlijke buizen voor elke muis worden bereid, zodat herhaald openen / sluiten van de buis niet nodig is. Evenzo, als de bacteriesoort van belang kieskeuriger / minder in staat is om te overleven in PBS dan G. vaginalis, kan inenting in plaats daarvan worden voorbereid in kweekmedia. Als het gebruikte medium reductiemiddelen bevat, zoals het CDC-anaërobe medium dat wordt gebruikt om Prevotella bivia te kweken (aanvullend bestand 1, stap 2.1. en stap 2.2.), dan zullen de bacteriën ook een verhoogde bescherming hebben tegen blootstelling aan zuurstof.
Alternatieve methoden voor homogenisatie kunnen ook worden overwogen, zoals kraal kloppen22,35, wat wordt gedaan met de buisdop gesloten en daarom minder zuurstof kan introduceren dan de handheld homogenisator. Bovendien kunnen meer zuurstofgevoelige organismen een langere evenwichtstijd voor media nodig hebben. Een zuurstofindicator zoals resazurine kan worden gebruikt om te controleren of anaerobe omstandigheden zijn bereikt (stap 2.1.). Alternatieve methoden zoals anaerobe potten kunnen de resultaten beïnvloeden en moeten vóór gebruik worden doorgelicht op bacteriële levensvatbaarheid.
De zuurstofgevoeligheid en kieskeurigheid van het experimentele organisme kunnen ook een rol spelen bij het succesvol herstel van levensvatbare bacteriën uit de muis tijdens lavages/homogenisatie (aanvullend dossier 1, stap 3.2. en stap 5.1.). Voor hooggevoelige organismen kan de tijd tussen het nemen en vergulden van de lavage leiden tot een verlies van levensvatbaarheid en een kunstmatig lage schatting van bacteriële vaginale kolonisatie veroorzaken. Om dit effect te verzachten, kunnen verzamelde lavages onmiddellijk worden verdund tot verse anaerobe kweekmedia (met reductiemiddel). Evenzo kan orgaanhomogenisatie worden gedaan in verse kweekmedia in plaats van PBS om de bacteriële levensvatbaarheid te vergroten en kan ook worden gedaan in de anaerobe kamer zelf om de blootstelling aan zuurstof te minimaliseren.
Afhankelijk van het doel van een bepaald experiment, moet de experimentator aandacht besteden aan controlegroepen. Om hypothesen te testen, zullen basismetingen van niet-geïnfecteerde controlemuizen die alleen met een voertuig worden behandeld, helpen vaststellen of er inductie van chemokines / cytokines of andere specifieke uitkomsten van infectie is. Het gebruikte controlevoertuig moet hetzelfde zijn als het voertuig dat voor inenting wordt gebruikt, dus als de bacteriën worden ingeënt in kweekmedia, moeten niet-geinoculeerde kweekmedia als controle worden gebruikt (aanvullend dossier 1, stap 2.4.5.).
De methoden die in dit protocol worden beschreven, kunnen ook worden toegepast op facultatieve bacteriën die anaëroob kunnen groeien, maar die traditioneel worden bestudeerd met behulp van aerobe kweekomstandigheden (zoals Escherichia coli of Groep B Streptococcus). Dit kan vooral relevant zijn voor infecties door deze organismen op lichaamslocaties waarvan wordt aangenomen dat ze lage zuurstofniveaus bevatten, zoals de baarmoederhals. Het kan zijn dat een facultatief organisme met meer succes plaatsen infecteert met minder zuurstof wanneer het entmateriaal anaëroob wordt bereid in vergelijking met aëroob. In een dergelijk experiment vereist het herstel van levensvatbare bacteriën voor CFU-inventarisatie mogelijk geen anaerobe omstandigheden.