Senescente cellen hopen zich normaal gesproken op in organismen gedurende de jaren tijdens normale biologische veroudering, maar kunnen zich ook snel ontwikkelen in tumorcellen als reactie op schade veroorzaakt door verschillende kankerbehandelingen, waaronder bestraling en chemotherapie. Hoewel ze niet langer prolifereren, kunnen door therapie geïnduceerde senescente (TIS) tumorcellen bijdragen aan de behandelingsresistentie en recidief veroorzaken 1,2,3. Factoren die door TIS-cellen worden uitgescheiden, kunnen de tumormaligniteit verergeren door immuunontwijking of metastasete bevorderen 4,5. TIS-cellen ontwikkelen complexe, contextspecifieke fenotypen, veranderde metabole profielen en unieke immuunresponsen 6,7,8. Daarom is de identificatie en karakterisering van TIS-tumorcellen geïnduceerd door verschillende kankerbehandelingsbenaderingen een onderwerp van voortdurende interesse voor de kankeronderzoeksgemeenschap.
Om TIS-tumorcellen te detecteren, worden conventionele senescentietests op grote schaal gebruikt, voornamelijk gebaseerd op het detecteren van verhoogde activiteit van het senescentiemarkerenzym, het lysosomale bèta-galactosidase GLB19. Detectie bij een bijna neutrale (in plaats van zure) lysosomale pH maakt specifieke detectie van senescentie-geassocieerde bèta-galactosidase (SA-β-Gal)10 mogelijk. Een standaard SA-β-Gal-test die al tientallen jaren wordt gebruikt, gebruikt X-Gal (5-broom-4-chloor-3-indolyl-β-D-galactopyranoside), een blauw chromogeen bèta-galactosidase-substraat, om SA-β-Gal in vaste cellen te detecteren door lichtmicroscopie11. De X-Gal-test maakt de kwalitatieve visuele bevestiging van TIS mogelijk met behulp van algemeen beschikbare reagentia en laboratoriumapparatuur. Een basistransmissielichtmicroscoop is de enige instrumentatie die nodig is om de aanwezigheid van het blauwe chromogeen te evalueren. De X-Gal-kleuringsprocedure kan echter niet gevoelig zijn en soms meer dan 24 uur nodig hebben om de kleur te ontwikkelen. Kleuring wordt gevolgd door een subjectieve score met lage doorvoer van individuele senescente cellen op basis van het tellen van de cellen die een bepaald intensiteitsniveau van het blauwe chromogeen vertonen onder een lichtmicroscoop. Omdat X-Gal celdoordringbaar is, vereist deze test oplosmiddelvaste cellen, die niet kunnen worden teruggewonnen voor downstream-analyse. Bij het werken met beperkte monsters van dieren of patiënten kan dit een groot nadeel zijn.
Verbeterde SA-β-Gal-assays met behulp van celpermeant, fluorescerend enzymsubstraten, waaronder C12-FDG (5-dodecanoylaminofluoresceïne Di-β-D-Galactopyranoside, groen) en DDAOG (9H-(1,3-dichloor-9,9-dimethylacridin-2-one-7-yl) β-D-Galactopyranoside, verrood) zijn eerder in de literatuur verschenen 12,13,14,15. De chemische sondestructuur en optische eigenschappen van DDAOG zijn weergegeven in aanvullende figuur S1. Deze celpermeant sondes maken de analyse van levende (in plaats van vaste) cellen mogelijk, en fluorescerende in plaats van chromogene sondes vergemakkelijken het gebruik van snelle fluorescentieanalyseplatforms met hoge doorvoer, waaronder screeningsinstrumenten met hoge inhoud en flowcytometers. Sorteerstroomcytometers maken het herstel mogelijk van verrijkte populaties van levende senescente cellen uit celculturen of tumoren voor downstream-analyse (bijv. Western blotting, ELISA of 'omics'). Fluorescentieanalyse biedt ook een kwantitatief signaal, waardoor het percentage senescente cellen in een bepaald monster nauwkeuriger kan worden bepaald. Extra fluorescerende sondes, waaronder levensvatbaarheidsondes en fluorofoor-gelabelde antilichamen, kunnen gemakkelijk worden toegevoegd voor multiplexanalyse van doelen buiten SA-β-Gal.
Net als DDAOG is C12-FDG een fluorescerende sonde voor SA-β-Gal, maar de groene fluorescerende emissie overlapt met intrinsieke cellulaire AF, die ontstaat tijdens senescentie als gevolg van de accumulatie van lipofuscine-aggregaten in cellen16. Door gebruik te maken van de verrode DDAOG-sonde kan groene cellulaire AF worden gebruikt als secundaire parameter om senescentie te bevestigen17. Dit verbetert de betrouwbaarheid van de test door een tweede marker te gebruiken naast SA-β-Gal, die vaak onbetrouwbaar kan zijn als een enkele marker voor senescentie18. Omdat de detectie van endogene AF in senescente cellen een labelvrije benadering is, is het een snelle en eenvoudige manier om de specificiteit van onze op DDAOG gebaseerde test uit te breiden.
In dit protocol demonstreren we het gebruik van DDAOG en AF als een snelle, dual-parameter flowcytometrietest voor de identificatie van levensvatbare TIS-tumorcellen uit in vitro culturen of geïsoleerd uit met geneesmiddelen behandelde tumoren die bij muizen zijn vastgesteld (figuur 1). Het protocol maakt gebruik van fluoroforen die compatibel zijn met een breed scala aan standaard commerciële flowcytometrie-analysers en sorteerders (tabel 1). Kwantificering van het percentage levensvatbare senescente cellen met behulp van standaard flowcytometrieanalyse is mogelijk. Indien gewenst kan een optionele immunolabelingstap worden uitgevoerd om antigenen van het celoppervlak gelijktijdig met senescentie te evalueren. Geïdentificeerde senescente cellen kunnen ook worden verrijkt met behulp van de standaard fluorescentie-geactiveerde celsortering (FACS) methodologie.

Figuur 1: Experimentele workflow. Een schematische samenvatting van de belangrijkste punten van de DDAOG-test. (A) Een TIS-inducerend geneesmiddel wordt toegevoegd aan gekweekte cellen van zoogdieren of toegediend aan tumordragende muizen. Er wordt dan tijd toegestaan voor het begin van TIS: voor cellen, 4 dagen na de behandeling; voor muizen, 22 dagen in totaal, met drie behandelingen om de 5 dagen plus 7 dagen herstel. Cellen worden geoogst of tumoren worden gedissocieerd in suspensie. (B) Monsters worden behandeld met Baf om de lysosomale pH aan te passen voor detectie van SA-β-Gal gedurende 30 minuten; vervolgens wordt de DDAOG-sonde gedurende 60 minuten toegevoegd om SA-β-Gal te detecteren. Monsters worden 2x gewassen in PBS en een levensvatbaarheidsvlek wordt kort toegevoegd (15 min). Optioneel kunnen monsters worden gekleurd met fluorescerende antilichamen in open fluorescentiekanalen en / of worden gefixeerd voor latere analyse. (C) Monsters worden geanalyseerd met behulp van een standaard flowcytometer. Levensvatbare cellen worden gevisualiseerd in dot plots met rode DDAOG (wat wijst op SA-β-Gal) versus groene autofluorescentie (lipofuscine). Een poort om het percentage TIS-cellen te bepalen wordt vastgesteld op basis van onbehandelde controlemonsters (niet weergegeven). Als een sorteercytometer (FACS) wordt gebruikt, kunnen TIS-cellen worden verzameld en teruggeplaatst in cultuur voor verdere in vitro assays of worden gelyseerd en verwerkt voor moleculaire biologie-assays. Afkortingen: DDAO = 9H-(1,3-dichloro-9,9-dimethylacridin-2-one); DDAOG = DDAO-Galactoside; TIS = therapie-geïnduceerde senescentie; FL-Ab = fluorofoor-geconjugeerd antilichaam; Baf = Bafilomycine A1; SA-β-Gal = senescentie-geassocieerde bèta-galactosidase; PBS = fosfaatgebufferde zoutoplossing; FACS = fluorescentie-geactiveerde celsortering. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.
| Fluorofoor | Detecteert | Ex /Em (nm) | Cytometerlaser (nm) | Cytometer detector / bandpass filter (nm) |
| DDAOG | SA-β-Gal | 645/6601 | 640 | 670 / 30 |
| Af | Lipofuscine | < 600 | 488 | 525 / 50 |
| Cv450 | Levensvatbaarheid | 408/450 | 405 | 450 / 50 |
| PE | Antilichaam/oppervlaktemarker | 565/578 | 561 | 582 / 15 |
Tabel 1: Fluoroforen en cytometer optische specificaties. Cytometerspecificaties die in dit protocol worden gebruikt, worden vermeld voor een instrument met in totaal 4 lasers en 15 emissiedetectoren. DDAOG gedetecteerd bij 645/660 nm is de vorm van de sonde gesplitst door SA-β-Gal1. Uncleaved DDAOG kan een lage fluorescentie vertonen bij 460/610 nm, maar wordt verwijderd door wasstappen in het protocol. Afkortingen: DDAO = 9H-(1,3-dichloro-9,9-dimethylacridin-2-one); DDAOG = DDAO-Galactoside; AF = autofluorescentie; PE = phycoerythrin; SA-β-Gal = senescentie-geassocieerde bèta-galactosidase.