De depletie-efficiëntie kan cytometrisch worden beoordeeld door de magnetisch niet-gelabelde celfractie voor CD4 en CD8 na immunomagnetische celscheiding (MACS) te labelen en deze te analyseren op een tweedimensionale bivariate dot-plot (figuur 3). Een goede opbrengst van dubbelnegatieve (CD4−, CD8−) cellen is 95% of hoger, zoals weergegeven in figuur 3. Twee van de meest voorkomende oorzaken van een lagere opbrengst zijn de misrekening van de microbeads op basis van het aantal cellen en het aantal gelabelde cellen dat de kolomcapaciteit overschrijdt. Het wordt aanbevolen om het juiste aantal MACS-kolommen te kiezen op basis van het aantal gelabelde cellen. Bij het werken met thymocyten is het aantal gelabelde cellen (DP- en SP-cellen) bijna gelijk aan het aantal totale cellen (meer dan 96%). Celtelling kan worden gedaan in een automatische celteller, een Neubauer-kamer of met een alternatieve methode. Als gevolg hiervan moeten de volumes die zijn toegewezen voor het tellen van cellen mogelijk worden aangepast, afhankelijk van de specifieke machine en de gekozen telmethode.
Het is belangrijk om het aantal cellen te bepalen dat aanwezig is voor en na uitputting. Deze celtellingen zijn nodig om het aantal benodigde LD-depletiekolommen te berekenen en om de DN-thymocyten gelijkmatig te verdelen over het juiste aantal OP9-DL4-kolven. De controles voor flowcytometrie (niet-gelabelde cellen, cellen gelabeld voor CD4 en cellen gelabeld voor CD8) kunnen worden uitgevoerd met het gereserveerde pre-depletiemonster, omdat dit meer cellen bevat. Omdat echter wordt verwacht dat de meeste cellen in de kolom worden bewaard, heeft het te labelen monster na depletie een hoger volume nodig. Daarom kan het nodig zijn om aanpassingen aan te brengen volgens het gekozen etiketteringsprotocol.
Bij gebruik van vectoren die screenbare markers tot expressie brengen, zoals een fluorescentiegen, kunnen de transfectie en transductie ruw en empirisch worden beoordeeld door fluorescentiemicroscopie (figuur 2). De transductie-efficiëntie kan worden geanalyseerd door de thymocyt uit de OP9-DL4-monolaag te oogsten, zoals beschreven in stap 8.3, en te kijken naar de expressie van een fluorescentiegen door flowcytometrie. De efficiëntie van transductie met behulp van een lege retrovirale vector met GFP als reportergen was 84,2% (figuur 4).
T-celdifferentiatie op OP9-DL4-cellen kan 4 dagen na transductie worden waargenomen. Flowcytometrie wordt meestal uitgevoerd om de celdifferentiatie geïnduceerd door de co-cultuur op OP9-DL4-cellen en / of de transgenexpressie te beoordelen, zoals weergegeven in figuur 5, waar de cellen werden gelabeld voor CD4, CD8, CD44 en CD25. Er zijn verschillende mogelijke combinaties van celoppervlakmolecuullabeling waarvan is aangetoond dat ze nuttig zijn voor het onderzoeken van de moleculaire en cellulaire mechanismen van T-celontwikkeling bij muizen24,25,26,27. Daarom kunnen de panelen van fluorescerende antilichamen variëren afhankelijk van de vraag van belang die wordt behandeld. De transductie van DN-thymocyten met de lege retrovirale vector pMIG, weergegeven in paneel B, vertoonde ongeveer dezelfde verhoudingen van enkele positieven (CD4+ of CD8+), dubbele positieven (CD4+/CD8+), dubbele negatieven (CD4−/CD8−), en de substadia dubbel-negatief 1-4 (DN1-DN4) als de niet-getransduceerde thymocyten, weergegeven in paneel A, wat aangeeft dat de ontwikkeling van T-cellen niet werd beïnvloed door het transductieproces.

Figuur 1: Diagram van de stappen van thymocytenisolatie, transductie en co-cultuur. Afkorting: DN = dubbel-negatief. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.

Figuur 2: Co-cultuur fluorescentiemicroscopie van GFP-getransduceerde thymocyten of niet-getransduceerde thymocyten en OP9-DL4-cellen. (A) Niet-getransduceerde thymocyten en (B) stabiele GFP-tot expressie brengende muizenthymocyten op OP9-DL4 op dag 3 na de tweede transductie. Er werd gebruik gemaakt van een Olympus-IX71 fluorescentiemicroscoop met een 40x lens en een 480/30 filter geschikt voor GFP detectie. Schaalbalk = 40 μm. Afkortingen: GFP = groen fluorescerend eiwit; DN = dubbel-negatief. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.

Figuur 3: Flowcytometrie van thymocytendepletie. Representatieve flowcytometrieplots analyseren de expressie van CD4 en CD8 op thymocyten verkregen uit 7-8 weken oude C57BL / 6J vrouwelijke muizen (A) pre-depletie en (B) post-depletie van CD4 + en CD8 + met behulp van microbeads en LD-kolommen volgens de instructies van de fabrikant. De stippenplots aan de linkerkant tonen poorten op basis van de grootte en complexiteit van het evenement (respectievelijk FCS-A en SSC-A). Het middelste paneel toont FSC-H versus FSC-A om enkele cellen te gaten en doubletten uit te sluiten. In de plots aan de rechterkant werden cellen gedefinieerd als CD4 en CD8 van de eencellige poort. Afkortingen: FSC-A = forward scatter-peak area; SSC-A = zijwaarts verstrooid-piekgebied; FSC-H = voorwaartse verstrooiing-piekhoogte; FITC = fluoresceïne-isothiocyanaat; PE = fycoerythrin. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.

Figuur 4: Flowcytometrie van de retrovirale transductie-efficiëntie van thymocyten. (A) niet-getransduceerde thymocyten die samen op OP9-DL4 zijn gekweekt; (B) retroviraal getransduceerde thymocyten op OP9-DL4 op dag 3 na transductie. Afkortingen: FSC-A = forward scatter-peak area; SSC-A = zijwaarts verstrooid-piekgebied; FSC-H = voorwaartse verstrooiing-piekhoogte; FITC = fluoresceïne-isothiocyanaat; PE = fycoerythrin; DN = dubbel-negatief. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.

Figuur 5: Flowcytometrie van getransduceerde thymocyten na 4 dagen OP9-DL4 co-cultuur. (A) Niet-getransduceerd en (B) getransduceerd met pMIG retrovirus. De cellen werden eerst gated op levende cellen en vervolgens gated op basis van grootte en complexiteit (respectievelijk FCS-A en SSC-A), gevolgd door het plotten van FSC-H versus FSC-A om op afzonderlijke cellen te gaan en doubletten uit te sluiten. Voor niet-getransduceerde cellen gebruikten we de volgende poortstrategie. Vanuit de eencellige poort werden de cellen gedefinieerd als enkele positieven (CD4+ of CD8+), dubbele positieven (CD4+/CD8+) en dubbele negatieven (CD4−/CD8−). Vervolgens werden de cellen vanaf de dubbele negatieven (CD4−/CD8−) gate gedefinieerd als CD44+, CD25+, CD44+/CD25+ en CD44−/CD25−, zoals weergegeven in paneel A. Voor de pMIG-getransduceerde cellen, weergegeven in paneel B, werden de cellen van de eencellige poort eerst gedefinieerd als GFP + / GFP−, en vervolgens van GFP + -cellen, werd de celpopulatieverdeling in de belangrijkste T-celontwikkelingsstadia, zoals gedefinieerd door CD4, CD8, CD44 en CD25-expressie, bepaald met behulp van dezelfde poortstrategie als voor de niet-getraduceerde cellen. Afkortingen: FSC-A = forward scatter-peak area; SSC-A = zijwaarts verstrooid-piekgebied; FSC-H = voorwaartse verstrooiing-piekhoogte; FITC = fluoresceïne-isothiocyanaat; GFP = groen fluorescerend eiwit. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.