Thermische tolerantie is de sleutel tot de overleving en functie van organismen 1,2. Naarmate de planeet blijft opwarmen als gevolg van antropogene koolstofemissies, wordt er steeds meer aandacht besteed aan het bepalen en toepassen van thermische limieten3. Verschillende eindpunten, zoals mortaliteit, niet-ontwikkeling en verlies van mobiliteit, zijn gebruikt om zowel de bovenste als de onderste thermische limieten te bepalen4. Deze thermische limieten worden vaak beschouwd als een proxy voor de thermische niche van een organisme. Deze informatie wordt op zijn beurt gebruikt om soorten te identificeren die kwetsbaarder zijn voor het broeikaseffect, en om toekomstige soortendistributie en de resulterende soortinteracties te voorspellen 3,5,6,7. Het bepalen van thermische limieten, vooral voor kleine planktonorganismen, kan echter een uitdaging zijn.
Voor planktonorganismen, met name de larvale stadia van ongewervelde zeedieren, kan de thermische limiet worden bepaald door chronische blootstelling. Chronische blootstelling wordt bereikt door larven op verschillende temperaturen gedurende dagen tot weken op te voeden en de temperatuur te bepalen waarbij de overlevings- en/of ontwikkelingssnelheid van larven 8,9,10 vermindert. Deze aanpak is echter nogal tijdrovend en vereist grote incubators en ervaring in de veehouderij van larven (zie referentie11 voor een goede inleiding tot het kweken van mariene ongewervelde larven).
Als alternatief kan acute blootstelling aan thermische stress worden gebruikt om thermische limieten te bepalen. Vaak omvat deze bepalingsbenadering het plaatsen van kleine injectieflacons met larven in temperatuurgecontroleerde droge baden 12,13,14, het gebruik van thermische gradiëntfuncties in PCR thermische cyclers15,16, of het plaatsen van glazen injectieflacons / microcentrifugebuizen langs een thermische gradiënt die wordt gegenereerd door toegepaste verwarming en koeling aan de uiteinden van grote aluminium blokken met gaten waarin de injectieflacons knuspassen 17, 18,19. Typische droge baden genereren een enkele temperatuur; daarom moeten meerdere eenheden tegelijkertijd worden gebruikt om de prestaties over een temperatuurbereik te beoordelen. Thermische cyclers genereren een gradiënt, maar bieden slechts plaats aan een klein monstervolume (120 μL) en vereisen zorgvuldige manipulaties. Net als thermische cyclers creëren grote aluminium blokken lineaire en stabiele temperatuurgradiënten. Beide benaderingen kunnen worden gekoppeld aan logistische of probit-regressie om de dodelijke temperatuur voor 50% procent van de bevolking te berekenen (LT50) 12,20,21. De gebruikte aluminium blokken waren echter ~ 100 cm lang; deze grootte vereist een grote laboratoriumruimte en toegang tot gespecialiseerde computer numerieke besturingsmachines om de gaten te boren. Samen met het gebruik van twee waterbaden van onderzoekskwaliteit om de doeltemperatuur te handhaven, zijn de financiële kosten van het monteren van de opstelling hoog.
Daarom is dit werk gericht op het ontwikkelen van een alternatief middel om een stabiele, lineaire temperatuurgradiënt te genereren met in de handel verkrijgbare onderdelen. Een dergelijk product moet een kleine voetafdruk hebben en moet gemakkelijk kunnen worden gebruikt voor experimenten met acute thermische stressblootstelling voor planktonische organismen. Dit protocol is ontwikkeld met zoöplankton dat <1 mm groot is als doelorganismen, en dus is het geoptimaliseerd voor het gebruik van een microcentrifugebuis van 1,5 of 2 ml. Grotere onderzoeksorganismen vereisen containers die groter zijn dan de gebruikte 1,5 ml microcentrifugebuizen en vergrote gaten in de aluminiumblokken.
Naast het toegankelijker maken van het experimentele apparaat, heeft dit werk tot doel de pijplijn voor gegevensverwerking te vereenvoudigen. Hoewel commerciële statistische software routines biedt om LT50 te berekenen met behulp van logistische of probit-regressie, zijn de licentiekosten niet triviaal. Daarom zou een eenvoudig te gebruiken script dat afhankelijk is van het open-source statistische programma R22 data-analyse toegankelijker maken.
Dit protocol laat zien hoe een compact warmteblok kan worden vervaardigd met in de handel verkrijgbare onderdelen en kan worden toegepast op het blootstellen van zoöplankton (larven van de zanddollar Dendraster excentricus) aan acute hittestress om hun bovenste thermische limiet te bepalen.