$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
APTrack is een software plugin voor gebruik met het Open Ephys platform. We hebben voor dit platform gekozen omdat het open-source, flexibel en goedkoop te implementeren is. Exclusief de kosten van de constante stroomstimulator, kan alle apparatuur die nodig is om de plug-in te gaan gebruiken op het moment van schrijven worden gekocht voor ongeveer $ 5.000 USD. We hopen dat dit onderzoekers in staat zal stellen om APTrack gemakkelijker te implementeren in hun perifere zenuwelektrofysiologische studies. Bovendien kunnen onderzoekers de software vrijelijk aanpassen aan hun experimentele behoeften. Belangrijk is dat deze tool voor het eerst de elektrische drempeltracking van enkele C-vezelnociceptoren bij mensen mogelijk heeft gemaakt.
Hoe hoger de signaal-ruisverhouding, hoe beter de algoritmes actiepotentialen kunnen identificeren. De signaal-ruisverhouding tijdens microneurografie was voldoende in de meeste van onze opnames, maar gebruikers moeten alert zijn op het risico van signaaldegradatie in de loop van de tijd. Dit is vooral belangrijk voor langere experimentele protocollen, omdat als de amplitude van de gevolgde actiepotentiaal onder de detectiedrempel daalt, de stimulatieamplitude ten onrechte wordt verhoogd; Dit kan worden verzacht door experimentatoren die de plug-in controleren en vervolgens de instellingen indien nodig aanpassen. De signaal-ruisverhouding is verbeterd met bandpass-filtering, maar grotere transiënten kunnen nog steeds verkeerd worden geïdentificeerd als actiepotentialen als ze aankomen tijdens het tijdvenster van het zoekvak. Het risico van het verkeerd identificeren van voorbijgaande ruis als actiepotentiaal kan worden verminderd door het tijdsvenster waarin de plug-in naar actiepotentialen zoekt te verkleinen en door de drempelinstellingen te optimaliseren. Er zijn echter nog steeds situaties die men kan tegenkomen die de prestaties van de plug-in belemmeren. Spontane activiteit kan problemen veroorzaken als actiepotentialen met een grotere amplitude binnen het zoekvakvenster van het algoritme vallen, omdat ze verkeerd worden geïdentificeerd als het doelactiepotentiaal. Bovendien kan spontane activiteit in het neuron van belang betekenen dat de elektrische stimulatie daalt tijdens de refractaire periode, waardoor het niet lukt om een actiepotentiaal te genereren. Problemen met het gebruik van de software kunnen ook optreden wanneer primaire afferente neuronen flip-flop vertonen, waarbij alternatieve terminale takken van een enkel neuron worden gestimuleerd, waardoor het opgeroepen actiepotentiaal twee (of meer) basislijnlatenties heeft die elkaar uitsluiten20. Tijdens opnames van neuronen die flip-flop vertoonden met hoge signaal-ruisverhoudingen, hebben we met succes latentie- en elektrische drempeltracking uitgevoerd door de breedte van het zoekvak te vergroten om alle potentiële geleidingssnelheden in te kapselen die het neuron vertoonde. De elektrische drempel kan echter variëren afhankelijk van de terminale tak van het neuron dat wordt geëxciteerd, wat waarschijnlijk gedeeltelijk te wijten is aan verschillen in de afstand van de plaats van de elektrische stimulatie tot de alternatieve nociceptorterminals. Extra werk aan het actiepotentiaalidentificatieproces om bijvoorbeeld sjabloonmatching op te nemen, is haalbaar en kan in deze software worden geïntegreerd. De GUI-plug-ins voor band-stop of adaptieve ruisfiltratie kunnen ook vóór APTrack in de signaalketen worden gebruikt als ze worden ontwikkeld.
We beschouwen de elektrische drempel bepaald als de stroom die nodig is om 50% van de tijd een actiepotentiaal uit te lokken, over een door de gebruiker gedefinieerd aantal elektrische stimuli, meestal 2-10. De morfologie van elektrische stimulatie is 0,5 ms en positieve, blokgolfpulsen. Dit is niet hetzelfde als het bepalen van de rheobase, een veelgebruikte maat voor neuronale prikkelbaarheid. De plug-in kan worden aangepast om de rheobase te bepalen. We streefden echter naar een eenvoudigere maat, omdat dynamische veranderingen in prikkelbaarheid, zoals die verondersteld worden op te treden tijdens verwarming, moeilijker te kwantificeren zouden zijn geweest met rheobase-veranderingen dan onze elektrische drempelschatting.
Deze software kan worden gebruikt in zowel menselijke als knaagdierexperimenten. Dit wordt mogelijk gemaakt door flexibele ondersteuning van de elektrische stimulatiesystemen. De software werkt met elke stimulator die een analoge opdrachtspanning accepteert of handmatig kan worden gekoppeld aan een stappenmotor. Voor microneurografie gebruikten we het met een CE-gemarkeerde constante stroomstimulator die was ontworpen voor gebruik in menselijk onderzoek en waarvan de stimulatie werd geregeld door een wijzerplaat. Stimulatoren die analoge spanningscommando's accepteren, kunnen luidruchtig zijn omdat ze het circuit tussen stimuli niet loskoppelen, wat betekent dat elke 50/60 Hz-brom of ruis op de analoge ingang naar de opname wordt verzonden. Een stimulator die een extra TLL-triggersignaal nodig heeft om het circuit aan te sluiten, waardoor een stimulus kan worden gegenereerd bij een stroom analoog aan de analoge spanningsingang, is ideaal voor gebruik met de plug-in. Dit voorkomt dat de ruis tussen de prikkels door wordt doorgegeven aan de opname.
De software maakt gebruik van een eenvoudige up-down methode om de elektrische drempel te schatten. Dit wordt al vele decennia gebruikt in psychofysische tests25. In lijn met de up-down-methode houdt het algoritme voor het volgen van elektrische drempels voor het moduleren van de stimulatieamplitude alleen rekening met de amplitude en respons van de vorige stimulatie bij het berekenen van de amplitude van de volgende stimulatie. Dit betekent dat de stimulatieamplitude rond de werkelijke elektrische drempel zal oscilleren, waardoor een ontstekingssnelheid van 50% wordt geproduceerd, ervan uitgaande dat de drempel stabiel is. De minimale grootte van een toename of afname is 0,01 V; dit komt overeen met 0,01 mA, ervan uitgaande dat de stimulator een input-to-output-verhouding van 1 V: 1 mA heeft en voldoende resolutie om stapveranderingen zo klein te bereiken. De plug-in zal de live schatting van de elektrische drempel van het doelactiepotentieel bijwerken telkens wanneer deze een vuursnelheid van 50% bereikt ten opzichte van een door de gebruiker gedefinieerd aantal eerdere stimuli (2-10). Post hoc raden we aan om een voortschrijdend gemiddelde van de stimulatieamplitude over de laatste 2-10 stimuli te gebruiken om de elektrische drempel te schatten, en opgemerkt moet worden dat deze schatting alleen nauwkeurig zal zijn wanneer de vuursnelheid relatief stabiel is op 50%. In zowel de live als post hoc schattingen van de elektrische drempel, is er een balans tussen resolutie, betrouwbaarheid en tijd om te overwegen. Het gebruik van kleinere stap- en afnamestappen zal de nauwkeurigheid van de schatting van de elektrische drempel verhogen, maar zal de tijd die nodig is om de nieuwe elektrische drempel in eerste instantie en na verstoring te vinden, verlengen. Het berekenen van de elektrische drempel over een groter aantal eerdere stimuli zal een betere betrouwbaarheid bieden, maar zal de tijd die nodig is om tot een nauwkeurige schatting te komen, verlengen.
APTrack is ontworpen voor gebruik in perifere zenuwopnamen, specifiek om de elektrische drempels van C-vezels te volgen tijdens experimentele en pathologische verstoringen gedurende perioden waarin de actiepotentiaallatentie kan variëren afhankelijk van de onderliggende neuronale activiteit. Deze methode maakt het mogelijk om niet alleen axonale prikkelbaarheid, maar ook van nociceptorgeneratorpotentialen bij gezonde vrijwilligers en patiënten te onderzoeken. We verwachten dat andere gebieden van de elektrofysiologie deze tool kunnen overnemen en aanpassen voor gebruik in elk experiment dat de elektrische drempeltracking van een stimulus-vergrendelde activiteit vereist. Dit kan bijvoorbeeld net zo goed worden aangepast voor optogenetische stimulatie met lichtpulsen aangedreven door APTrack. De plug-in is open-source en beschikbaar voor onderzoekers onder een GPLv3-licentie. Het is gebouwd op het Open Ephys-platform, een aanpasbaar, goedkoop, open-source data-acquisitiesysteem. De plug-in biedt extra haken voor downstream-plug-ins om de actiepotentiaalinformatie te extraheren en extra gebruikersinterfaces of adaptieve paradigma's te bieden. De plug-in biedt een eenvoudige gebruikersinterface voor de visualisatie en latentietracking van actiepotentialen in realtime. Het kan ook eerdere gegevens afspelen en visualiseren met behulp van de tijdelijke rasterplot. Bovendien kan het ook latentietracking uitvoeren tijdens het afspelen van eerdere gegevens. Hoewel er andere softwarepakketten beschikbaar zijn voor real-time latentietracking, zijn ze niet open-source en kunnen ze geen elektrische drempeltrackinguitvoeren 26,27. APTrack heeft een voordeel ten opzichte van traditionele methoden voor het identificeren van actiepotentialen met constante latentie uit spanningssporen, omdat het een tijdelijke rasterplot gebruikt voor de gegevensvisualisatie. Bovendien hebben onze ervaringen met het gebruik ervan in experimenten met lage signaal-ruisverhoudingen aangetoond dat de visualisatiemethode voor temporele rasterplots de identificatie mogelijk maakt van actiepotentialen met constante latentie die anders misschien waren gemist.
Het volgen van de hele zenuwdrempel is een veelgebruikte methode voor het beoordelen van axonale prikkelbaarheid13. Single-neuron elektrische drempel tracking in knaagdier C-vezels is eerder gebruikt om nociceptor excitability14 te kwantificeren, en het nut ervan bij mensen wordt erkend10,11; Tot nu toe was dit echter niet mogelijk. We bieden een nieuwe, open-source tool om de prikkelbaarheid van enkele nociceptor direct te meten in elektrofysiologische studies van zowel knaagdieren als menselijke perifere zenuwen. APTrack maakt voor het eerst de real-time, open-source, elektrische drempeltracking van actiepotentialen met één neuron bij mensen mogelijk. We verwachten dat het translationele studies van nociceptoren tussen knaagdieren en mensen zal vergemakkelijken.