Een abonnement op JoVE is vereist om deze inhoud te bekijken. Log in of start vandaag met uw gratis proefperiode.

Methodenartikel

Een eenvoudige techniek om locomotorische activiteit in Drosophila te testen

5.1K weergaven

DOI:

10.3791/65092

24 februari 2023

In dit artikel

Samenvatting

Het huidige protocol beoordeelt de locomotorische activiteit van Drosophila door de beweging van vliegen in een handgemaakte arena te volgen en te analyseren met behulp van open-source software Fiji, compatibel met plug-ins om pixels van elk frame te segmenteren op basis van high-definition video-opname om parameters van snelheid, afstand, enz. Te berekenen.

Samenvatting

Drosophila melanogaster is een ideaal modelorganisme voor het bestuderen van verschillende ziekten vanwege de overvloed aan geavanceerde genetische manipulatietechnieken en diverse gedragskenmerken. Het identificeren van gedragsdeficiëntie in diermodellen is een cruciale maat voor de ernst van de ziekte, bijvoorbeeld bij neurodegeneratieve ziekten waarbij patiënten vaak stoornissen in de motorische functie ervaren. Met de beschikbaarheid van verschillende systemen om motorische tekorten in vliegmodellen te volgen en te beoordelen, zoals met geneesmiddelen behandelde of transgene personen, ontbreekt het echter nog steeds aan een economisch en gebruiksvriendelijk systeem voor nauwkeurige evaluatie vanuit meerdere hoeken. Een methode op basis van de AnimalTracker application programming interface (API) is hier ontwikkeld, die compatibel is met het Fiji-beeldverwerkingsprogramma, om systematisch de bewegingsactiviteiten van zowel volwassen als larvale individuen van opgenomen video te evalueren, waardoor de analyse van hun trackinggedrag mogelijk is. Deze methode vereist alleen een high-definition camera en een computerrandapparatuurintegratie om gedrag vast te leggen en te analyseren, waardoor het een betaalbare en effectieve aanpak is voor het screenen van vliegmodellen met transgene of omgevingsgedragsgebreken. Voorbeelden van gedragstests met farmacologisch behandelde vliegen worden gegeven om te laten zien hoe de technieken gedragsveranderingen bij zowel volwassen vliegen als larven op een zeer herhaalbare manier kunnen detecteren.

Inleiding

Drosophila melanogaster biedt een uitstekend modelorganisme voor het onderzoeken van cellulaire en moleculaire functies in neuronale ziektemodellen gemaakt door genmodificatie1, medicamenteuze behandeling2 en senescentie3. Het hoge behoud van biologische routes, fysieke eigenschappen en ziekte-geassocieerde homologe genen tussen mensen en Drosophila maakt de fruitvlieg een ideale nabootsing van het moleculaire naar het gedragsniveau4. In veel ziektemodellen is gedragsdeficiëntie een belangrijke index, die een nuttig model biedt voor verschillende menselijke neuropathieën 5,6. Drosophila wordt nu gebruikt om meerdere menselijke ziekten, neurologische ontwikkeling en neurodegeneratieve ziekten zoals de ziekte van Parkinson en amyotrofische laterale sclerose te bestuderen 7,8. Het detecteren van het motorisch vermogen van de ziektemodellen is cruciaal voor het begrijpen van de pathogene vooruitgang en kan een fenotypische correlatie bieden met de moleculaire mechanismen die ten grondslag liggen aan het ziekteproces.

Onlangs zijn commercieel beschikbare softwaretools en kosteneffectieve programma's ontwikkeld voor Drosophila locomotorische detectiestrategieën, zoals high-throughput testen in gegroepeerde vliegen 9,10 en het meten van voortbeweging in real-time11,12. Een dergelijke conventionele benadering is snelle interactieve negatieve geotaxis (RING), ook wel de klimtest genoemd, die meerdere kanalen omvat waarmee een grote vliegenpopulatie met hetzelfde geslacht en dezelfde leeftijd kan worden ingeperkt, waardoor variatie wordt verminderd terwijl gegevens 9,13 worden verzameld. Een andere pre-testmethode voor het analyseren van locomotorisch gedrag is TriKinetics Drosophila activity monitor (DAM), een apparaat dat meerdere bundels gebruikt om vliegactiviteitsbewegingen in een dunne glazen buiste detecteren 14. Het apparaat registreert continu de positie, wat de geautomatiseerde voortbeweging vertegenwoordigt door de balkkruisingen te berekenen om de activiteit en het circadiane ritme van vliegen over een langere periode te bestuderen15. Hoewel deze methoden op grote schaal zijn gebruikt bij het analyseren van gedragsdefecten bij fruitvliegen om veranderingen in gedragsvoortbeweging te bepalen, vereisen ze altijd speciale testapparatuur of complexe analyseprocessen en beperken ze hun toepassing in sommige modellen met een beperkt, eenvoudig apparaat. Diertraceringsgroepgebaseerde strategieën voor het testen van de volwassen Drosophila, zoals FlyGrAM11 en de Drosophila-eilandtest 10, implementeren sociale rekrutering en individuele tracking in een vooraf gedefinieerd gebied. Niettemin kan sociale individuele beperking in getrotseerde gebieden een negatief effect hebben op identificaties in de beelden, veroorzaakt door de botsing of overlapping van vliegen. Hoewel sommige op open-source materialen gebaseerde methoden, zoals TRex16, MARGO 12 en FlyPi17, een noodgeval hebben, kunnen ze de vliegen snel traceren met flexibel gebruik in gedragstests. Deze testbenaderingen worden geassocieerd met uitgebreide experimentele apparaatinstallaties, speciale softwarevereisten of professionele computertalen. Voor larven zijn het meten van de totale afgelegde afstand over het aantal rastergrenslijnen per tijdseenheid18, of het ruw tellen van de lichaamswandcontracties voor individuen handmatig19, de belangrijkste methoden om hun motorische vermogen te beoordelen. Vanwege het gebrek aan precisie in apparatuur of apparaten en analysemethoden, kan enige gedragsbeweging van larven aan detectie ontsnappen, waardoor het moeilijk wordt om gedragsbewegingen nauwkeurig te beoordelen, vooral fijne beweging15.

De huidige ontwikkelde methode maakt gebruik van de AnimalTracker application programming interface (API), compatibel met het Fiji (ImageJ) beeldverwerkingsprogramma, om systematisch de locomotorische activiteit van zowel volwassen als larvale vliegen te evalueren door hun trackinggedrag van high-definition (HD) video's te analyseren. Fiji is een open-source software ImageJ-distributie die robuuste softwarebibliotheken kan combineren met tal van scripttalen, wat resulteert in snelle prototyping van beeldverwerkingsalgoritmen, waardoor het populair is bij biologen vanwege de beeldanalysemogelijkheden20. In de huidige aanpak wordt de integratie van Fiji in de AnimalTracker API gebruikt om een unieke Drosophila-gedragstest te ontwikkelen met gepersonaliseerde algoritme-invoeging, en biedt een nuttige stap voor gedetailleerde documentatie en tutorials ter ondersteuning van robuuste analytische mogelijkheden van locomotorisch gedrag (figuur 1). Om de complicatie van objectieve identificaties in de beelden veroorzaakt door de botsing of overlapping van vliegen te omzeilen, is elke arena beperkt tot het hosten van slechts één vlieg. Na het beoordelen van de trackingprecisie van de aanpak, werd het geïmplementeerd om de locomotorische bewegingen van Drosophila te traceren en te kwantificeren die werden toegediend met het toxische medicijn rotenon, dat over het algemeen wordt gebruikt voor diermodellen van de ziekte van Parkinson, en uiteindelijk locomotiestoornissen ontdekte in de medicamenteuze behandeling21. Deze methodologie, die open-source en vrije software gebruikt, vereist geen dure instrumentatie en kan de gedragsbeweging van Drosophila nauwkeurig en reproduceerbaar analyseren.

Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.

Protocol

W1118 volwassen vliegen en derde instar larven werden gebruikt voor de huidige studie.

1. Experimentele voorbereiding

OPMERKING: Een open-veld arena voor Drosophila locomotion tracking is gemaakt metacolorless en geurloze silicagel.

  1. Meng reagens A en reagens B in een verhouding van 1:10, volgens de instructies van de fabrikant voor de silicakit (zie materiaaltabel). Zorg ervoor dat natriumbicarbonaat aan het mengsel wordt toegevoegd door te roeren totdat de kleur wit wordt. Breng het mengsel over in een schone petrischaal en plaats het in een oven op 40 °C om gedurende 48 uur te drogen.
  2. Plaats de HD-camera (zie Materiaaltabel) op een statief en stel deze zo in dat de cameralens loodrecht op het oppervlak van de silica-arena staat. Door de brandpuntsafstand en de diafragma's van de camera aan te passen, moet u ervoor zorgen dat de camera op het oppervlak van het silica is gericht en dat het display voldoende wordt verlicht. De experimentele opzet wordt geïllustreerd in figuur 1.
  3. Breng een vlieg over in de open arena om een continue video van ten minste 61 s op te nemen.
    OPMERKING: Gezien de trage aard van larven, wordt een video-opnametijd van meer dan 10 minuten aanbevolen.
    1. Open de video met Fiji, sleep de voortgangsbalk naar het beginframe en keur stilzwijgend goed. Kies het hele lichaam van de vlieg met behulp van het gereedschap "selectie uit de vrije hand" (figuur 2B, C).
    2. Klik op de afbeelding > pas > helderheid en contrast aan om de witbalans aan te passen totdat de grijswaarde van het geselecteerde gebied de brede achtergrond nadert (figuur 2D-F).
      OPMERKING: Achtergrondhomogenisatie van het eerste frame stelt de software in staat om de achtergrond zonder objecten te onderscheiden en een contrast te creëren wanneer een vlieg aanwezig is, waardoor de software deze kan volgen.
  4. Voer het hele experiment uit in een testomgeving die is ingesteld op 25 °C en 60% relatieve vochtigheid, in een ruimte die stil is en verstoken van blootstelling aan fel licht.

2. Video-opname en voorbewerking

  1. Na een korte periode van anesthesie met behulp van95% koolstofdioxide (CO2), breng je een vlieg over naar de open arena en druk je op de opnameknop op de cameratoepassing om de video-opname te starten.
    OPMERKING: Om het effect van de verdoving op de voortbeweging te minimaliseren, laat u de vliegen 10 minuten herstellen voordat u de video-opname start. Koel-verdoving door koelen wordt ook aanbevolen.
    1. Zodra de vliegen herstellen van de anesthesie, plaatst u de arenaschotel met de vlieg onder de camera en schudt u de plaat snel van links naar rechts om ervoor te zorgen dat de vlieg in beweging is wanneer de opname begint.
  2. Druk na voltooiing van de opname op de stopknop om de video-opname te beëindigen.
    OPMERKING: Zorg ervoor dat de video-opnametijd de tijd voor het volgen van de bestemming met een kleine marge iets overschrijdt. Om de experimentele efficiëntie te verbeteren, is het bovendien mogelijk om meerdere vliegen spontaan te volgen. Dit is afhankelijk van de resolutie van de camera om een video-uitsnede van hoge kwaliteit mogelijk te maken.
  3. Converteer de opgenomen video's naar AVI-formaat met MJPEG-codering, zodat ze kunnen worden geopend en geanalyseerd met Fiji. Stel ondertussen de frames per seconde (fps) snelheid van de video in op 15 fps voor volwassen vliegen en 12 fps voor larven.

3. Video-analyse

  1. Open de video die is getransformeerd met "gebruik virtuele stapel" en "converteren naar grijswaarden", twee opties in het pop-upvenster bij het openen van de video met Fiji (figuur 2A).
  2. Maak een leeg eerste frame, zoals hierboven vermeld.
  3. Verkrijg een verwerkingsvenster met behulp van de tool "actieve afbeelding instellen" van de AnimalTracker-plug-in en maak een trackinggebied dat de arena in het oorspronkelijke videovenster omcirkelt met behulp van het gereedschap "ovaal" (figuur 3A).
  4. Stel de filters (Figuur 3A,3) en de parameters van de twee filters (Figuur 4A-G) in voor het eerste lege frame in het verwerkingsvenster. Selecteer vervolgens het volgende frame in het originele videovenster en kies het gefilterde oppervlak van het verwerkingsvenster (figuur 5A-C).
    OPMERKING: De filterstap dient om beeldruis te verminderen en/of de achtergrond te verwijderen, waardoor het eenvoudiger wordt om de voorgrond van de achtergrond te scheiden in de binarisatie van de frames.
  5. Zodra een gefilterd verwerkingsvenster is geselecteerd, draait u de gevolgde vlieg met een rood profiel bedekt in het verwerkingsvenster met behulp van het gereedschap "drempel instellen" (figuur 3A,4, figuur 5D-E en figuur 6A).
  6. Gebruik de "set blob-detector" om de computer de vlieg te laten herkennen met een rood profiel bedekt in het verwerkingsvenster (figuur 3A,5 en figuur 6B).
  7. Stel frame 901 in als het laatste frame voor de volwassen vlieg, berekend op basis van de opnameduur en fps van de video (figuur 3A,6, figuur 6C).
    OPMERKING: Het volgende experiment met larven is gedurende 10 minuten gevolgd, dus frame 7200 is ingesteld als het laatste frame.
  8. Gebruik het gereedschap "blobs weergeven" om een trackingrechthoek in het oorspronkelijke videovenster weer te geven (figuur 3A,7 en figuur 6D,E). Start vervolgens de tracking en exporteer het trackingbestand nadat de monitoring is voltooid (figuur 3A,8,9 en figuur 7A,B).

4. Bestandsanalyse bijhouden

  1. Laad de track- en zonebestanden met de plug-in Animal tracker > Tracking analyzer (Figuur 8A).
  2. Selecteer de gewenste index met behulp van zone-instellingen en wijzig de parameterinstellingen (Afbeelding 8). Bereken de tijd van het frame-interval met behulp van de framesnelheid.
    OPMERKING: In deze situatie is de framesnelheid 15 fps en is het frame-interval ongeveer 0,067 s, wat de standaardinstelling is (Figuur 8D).
  3. Produceer de kwantitatieve analysegrafieken met behulp van de spreadsheetsoftware en GraphPad Prism na analyse in tracking analyzer (figuur 9).

5. Analyse per frame

  1. Voer snelheidsanalyses uit per frame-interval. Analyseer het trackbestand zonder Fiji als er meer gedetailleerd onderzoek nodig is.
    1. Open het trackbestand, kopieer alle coördinaten naar Microsoft Office Excel en splits de cellen met de spatietoets.
      OPMERKING: Zodra het bestand bijvoorbeeld is verdeeld in de kolommen "C" en "D", wordt de snelheid van Drosophila per frame-interval berekend met de formule SQRT((C5-C4)^ 2+(D5-D4)^2), die wordt weergegeven in de kolom "E" (Figuur 10A). De gegevens in kolom "E" geven het aantal pixels aan dat de vlieg tussen twee frames heeft verplaatst, waarbij het eerste frame niet in aanmerking wordt genomen. Selecteer alle berekende resultaten en voeg een lijndiagram in om een intuïtieve vliegbewegingssnelheid per frame-interval weer te geven, met een piek in het lijndiagram (figuur 10B).
  2. Bereken de immobiliteitstijd per frame-interval. Nadat het bestand is gesplitst in de kolommen "C" en "D", berekent u de immobiliteitsstatus van Drosophila per frame-interval met behulp van de formule ALS(SQRT((C6-C5)^2+(D6-D5)^2) <20, 0, 1), die wordt weergegeven in de kolom "E". (Figuur 10C).
    OPMERKING: In tegenstelling tot snelheidsanalyse werden de resultaten van het eerste frame gedefinieerd. Vliegen die minder dan 20 pixels bewogen, werden als onbeweeglijk beschouwd en geregistreerd als "0" in kolom "E".
    1. Selecteer alle berekende resultaten en voeg een kolomdiagram in om de immobiliteitstijd visueel weer te geven met de marge van het hele kolomdiagram (figuur 10D).
  3. Zorg ervoor dat de hoek van richting verandert.
    OPMERKING: De analyse van de hoek van de richtingsverandering vertegenwoordigt de richtingskeuze van de vliegen. Zodra het bestand is gesplitst in de kolommen "C" en "D", wordt de hoek van richtingsverandering berekend met de formule ACOS(((SQRT((C7-C6)^2+(D7-D6)^2))^2+(SQRT((C6-C5)^2+(D6-D5)^2))^2-(SQRT((C7-C5)^2+(D7-D5)^2))^2)/(2*SQRT((C6-C5)^2+(D6-D5)^2))*(SQRT((C7-C6)^ 2+(D7-D6)^2)))*180/PI(), die wordt weergegeven in de kolom "E" (Figuur 10E). De berekende resultaten geven de hoek tussen drie coördinaten aan.
    1. Selecteer alle berekende resultaten en voeg een spreidingsdiagram in om de richtingshoek van de beweging van de vliegen te illustreren (figuur 10F).

Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.

Resultaten

In deze studie werden locomotorische tekorten bij volwassen vliegen en derde instarlarven behandeld met rotenon onderzocht en vergeleken in hun motorische activiteit met die van een controlevlieg gevoed met het geneesmiddel oplosmiddel dimethylsulfoxide (DMSO). Van behandeling met rotenon in Drosophila is aangetoond dat het dopaminerge neuronverlies in de hersenenveroorzaakt 22 en leidt tot significante locomotorische tekorten23. Zoals te zien is in figuur

Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.

Discussie

We hebben een methode ontworpen, gebaseerd op het open-source materiaal AnimalTracker API compatibel met het Fiji-beeldverwerkingsprogramma, waarmee onderzoekers systematisch locomotorische activiteit kunnen evalueren door zowel volwassen als individuele larvale vliegen te volgen. AnimalTracke is een tool geschreven in Java die eenvoudig kan worden geïntegreerd in bestaande databases of andere tools om de analyse van door de toepassing ontworpen gedrag van het volgen van dieren te vergemakkelijken

Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.

Openbaarmakingen

De auteurs verklaren dat zij geen concurrerende financiële belangen hebben.

Dankbetuigingen

Dit werk werd ondersteund door een speciaal lanceringsfonds van Soochow University en de National Science Foundation of China (NSFC) (82171414). We bedanken prof. Chunfeng Liu's lableden voor hun discussie en commentaar.

Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.

Materialen

Lijst van materialen gebruikt in dit artikel
NaamBedrijfCatalogusnummerOpmerkingen
Animal trackerHongaars hersenonderzoeksprogrammaversie: 1.7officiële website: http://animaltracker.elte.hu/main/downloads
Camera softwareMicrosoftversie: 2021.105.10.0ingebouwd windows 10 systeem
ComputerDELLVostro-14-5480een computer met win 10 systeem is beschikbaar
Drosophila kooldioxide anesthesie werkstationWu han Yihong technologie#YHDFPCO2-018officiële website: http://www.yhkjwh.com/
Fiji softwareFiji teamversie: 1.53vofficiële website: https://fiji.sc/
Format factory softwarePcfreetimeversie: X64 5.4.5officiële website: http://www.pcfreetime.com/formatfactory/CN/index.html
Graph pad prismGraphPad Softwareversie: 8.0.2officiële website: https://www.graphpad-prism.cn
Hight definition cameraTTQJingwang2 (HD1080P F1.6 6-60mm)officiële website: http://www.ttq100.com/product_show.php?id=35
Office softwareMicrosoftversie: office 2019officiële website: https://www.microsoftstore.com.cn/software/office
PetrischaalBkman110301003maat: 60 mm
Silica gelDOWSYLGARD 184 Silicone Elastomer KitGoed mengen volgens de instructies
NatriumbicarbonaatMacklin#144-55-8Goed mengen met silica gel

Referenties

  1. Ham, S. J., et al. Loss of UCHL1 rescues the defects related to Parkinson's disease by suppressing glycolysis. Science Advances. 7 (28), (2021).
  2. Algarve, T. D., Assmann, C. E., Aigaki, T., da Cruz, I. B. M. Parental and preimaginal exposure to methylmercury disrupts locomotor activity and circadian rhythm of adult Drosophila melanogaster. Drug and Chemical Toxicology. 43 (3), 255-265 (2020).
  3. Jones, M. A., Grotewiel, M. Drosophila as a model for age-related impairment in locomotor and other behaviors. Experimental Gerontology. 46 (5), 320-325 (2011).
  4. Yamaguchi, M., Yoshida, H. Drosophila as a model organism. Advances in Experimental Medicine and Biology. 1076, 1-10 (2018).
  5. Rothenfluh, A., Heberlein, U. Drugs, files, and videotape: the effects of ethanol and cocaine on Drosophila locomotion. Current Opinion in Neurobiology. 12 (6), 639-645 (2002).
  6. Tsuda, L., Lim, Y. M. Alzheimer's disease model system using Drosophila. Advances in Experimental Medicine and Biology. 1076, 25-40 (2018).
  7. Dung, V. M., Thao, D. T. P. Parkinson's disease model. Advances in Experimental Medicine and Biology. 1076, 41-61 (2018).
  8. Liguori, F., Amadio, S., Volonte, C. Fly for ALS: Drosophila modeling on the route to amyotrophic lateral sclerosis modifiers. Cellular and Molecular Life Sciences. 78 (17-18), 6143-6160 (2021).
  9. Cao, W., et al. An automated rapid iterative negative geotaxis assay for analyzing adult climbing behavior in a Drosophila model of neurodegeneration. Journal of Visualized Experiments. (127), 56507(2017).
  10. Eidhof, I., et al. High-throughput analysis of locomotor behavior in the Drosophila island assay. Journal of Visualized Experiments. (129), 55892(2017).
  11. Scaplen, K. M., et al. Automated real-time quantification of group locomotor activity in Drosophila melanogaster. Scientific Reports. 9 (1), 4427(2019).
  12. Werkhoven, Z., Rohrsen, C., Qin, C., Brembs, B., de Bivort, B. MARGO (Massively Automated Real-time GUI for Object-tracking), a platform for high-throughput ethology. PLoS One. 14 (11), e0224243(2019).
  13. Gargano, J. W., Martin, I., Bhandari, P., Grotewiel, M. S. Rapid iterative negative geotaxis (RING): a new method for assessing age-related locomotor decline in Drosophila. Experimental Gerontology. 40 (5), 386-395 (2005).
  14. Cichewicz, K., Hirsh, J. ShinyR-DAM: a program analyzing Drosophila activity, sleep and circadian rhythms. Communications Biology. 1, 25(2018).
  15. McParland, A. L., Follansbee, T. L., Ganter, G. K. Measurement of larval activity in the Drosophila activity monitor. Journal of Visualized Experiments. 98, e52684(2015).
  16. Walter, T., Couzin, I. D. TRex, a fast multi-animal tracking system with markerless identification, and 2D estimation of posture and visual fields. eLife. 10, (2021).
  17. Maia Chagas, A., Prieto-Godino, L. L., Arrenberg, A. B., Baden, T. The €100 lab: A 3D-printable open-source platform for fluorescence microscopy, optogenetics, and accurate temperature control during behaviour of zebrafish, Drosophila, and Caenorhabditis elegans. PLoS Biology. 15 (7), e2002702(2017).
  18. Nichols, C. D., Becnel, J., Pandey, U. B. Methods to assay Drosophila behavior. Journal of Visualized Experiments. (61), (2012).
  19. Xiao, G. Methods to assay the behavior of Drosophila melanogaster for toxicity study. Methods in Molecular Biology. 2326, 47-54 (2021).
  20. Schindelin, J., et al. Fiji: an open-source platform for biological-image analysis. Nature Methods. 9 (7), 676-682 (2012).
  21. Johnson, M. E., Bobrovskaya, L. An update on the rotenone models of Parkinson's disease: their ability to reproduce the features of clinical disease and model gene-environment interactions. Neurotoxicology. 46, 101-116 (2015).
  22. Coulom, H., Birman, S. Chronic exposure to rotenone models sporadic Parkinson's disease in Drosophila melanogaster. The Journal of Neuroscience. 24 (48), 10993-10998 (2004).
  23. Kumar, P. P., Bawani, S. S., Anandhi, D. U., Prashanth, K. V. H. Rotenone mediated developmental toxicity in Drosophila melanogaster. Environmental Toxicology and Pharmacology. 93, 103892(2022).
  24. Gulyas, M., Bencsik, N., Pusztai, S., Liliom, H., Schlett, K. AnimalTracker: an ImageJ-based tracking API to create a customized behaviour analyser program. Neuroinformatics. 14 (4), 479-481 (2016).
  25. Qu, S. EasyFlyTracker: a simple video tracking Python package for analyzing adult Drosophila locomotor and sleep activity to facilitate revealing the effect of psychiatric drugs. Frontiers in Behavioral Neuroscience. 15, 809665(2022).
  26. Yarwais, Z. H., Najmalddin, H. O., Omar, Z. J., Mohammed, S. A. Automated data collection of Drosophila movement behaviour assays using computer vision in Python. International Journal of Innovative Approaches in Science Research. 4 (1), 15-22 (2020).

Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.

Herprints en machtigingen

Tags

Locomotieve activiteit van DrosophilagedragsassaydierentrackerFiji-softwarelocomotie-trackingopen veld-arenavideoanalyserotenonbehandelingmotorisch defectkwantitatieve gedragsanalyse