Voor bloeiende planten zijn de zeer vroege stadia van seksuele voortplanting misschien wel de belangrijkste. Op het niveau van de pollen-stigma-interactie worden moleculaire beslissingen genomen die de 'compatibiliteit' van de interagerende partners bepalen. Dergelijke beslissingen voorkomen, indien correct genomen, verspilling van middelen die van invloed kunnen zijn op de reproductieve fitheid21. Het toestaan van alleen compatibel stuifmeel om de bevruchting te bewerkstelligen is dus een belangrijk onderdeel van het behoud van goed aangepaste genotypen, en dus het evolutionaire succes van soorten. Onderzoek uitgevoerd met de modelplant A. thaliana is zeer waardevol geweest bij het verdiepen van ons begrip van dit proces. Een aantal studies in de afgelopen decennia hebben de aanwezigheid aangetoond van factoren in de pollenlaag die werken bij het eerste compatibiliteitscontrolepunt, waar het stuifmeel toegang krijgt tot stigmatisch water om pollenhydratatie mogelijk te maken13. Ondanks deze eerste inzichten in de mechanismen die de compatibiliteit tussen pollen en stigma's reguleren, zijn er nog steeds veel hiaten in ons begrip van dit proces. Tot op heden kunnen geen mutanten van door stuifmeel overgedragen liganden of stigmatische receptoren waarvan bekend is dat ze de hydratatie van pollen beïnvloeden, compatibele bestuiving volledig blokkeren, wat de aanwezigheid van andere onontdekte determinanten van pollenhydratatie suggereert. Door het fenotype van interesse gemakkelijk te kunnen observeren, is de hier beschreven pollenhydratatiebioassay een van de meest eenvoudige technieken om potentiële mutanten te bestuderen die de bestuiving reguleren.
Bestaande methoden voor het meten van pollenhydratatie maken vaak gebruik van bulkbestuivingen en rapporteren minder tijdpunten 14,22,23, en kunnen dus belangrijke fenotypen met subtiele hydratatieprofielen missen. Bijvoorbeeld, de studie van Wang et al.13, samen met het werk aan andere pollen coat eiwitmutanten in ons laboratorium (ongepubliceerde observaties), hebben intrigerende verschillen in hydratatieprofielen tussen mutanten onthuld. Dergelijke subtiele verschillen kunnen belangrijke aanwijzingen bevatten voor de regulerende mechanismen die ten grondslag liggen aan compatibele bestuiving.
De hier beschreven methode richt zich op het verkrijgen van relatief kleine aantallen metingen tussen mutant- en WT-plantlijnen, met de nadruk op methodologische precisie om variatie binnen de datasets te verminderen. Hoewel deze methode zeer reproduceerbaar is (zoals weergegeven in figuur 7), ervan uitgaande dat temperatuur en vochtigheid voldoende worden gecontroleerd, is het belangrijk om hydratatiegegevens te verzamelen voor bijna gelijke aantallen WT- en mutant stuifmeel op dezelfde dag om de kans op variatie verder te verminderen. Gegevens kunnen vervolgens indien nodig over verschillende dagen worden samengevoegd. Bovendien is het selecteren van de juiste WT-controle-installaties van vitaal belang voor een juiste interpretatie van de hydratatieresultaten. Voor de stuifmeelontvanger moet dezelfde plantenlijn worden gebruikt voor het ontvangen van zowel WT-controle als gemuteerde stuifmeelkorrels.
We gebruiken bijvoorbeeld de pA9-barnase mannelijke steriele plantenlijn, die ook in het videoprotocol voorkomt, als de stuifmeelontvanger voor zowel WT (controle) als mutant (experimenteel) stuifmeel bij het onderzoeken van T-DNA-stuifmeelmutantlijnen (zoals de 'KD'-mutant beschreven in figuur 8). Het mengen van gegevens van zo'n mannelijke steriele lijn, die niet hoeven te worden uitgemergeld, met die verzameld uit een handmatig uitgemergelde controlelijn moet worden vermeden, omdat deze stigma's zich waarschijnlijk anders zullen gedragen. Evenzo moeten uitgemergelde mutantlijnen waar mogelijk worden gebruikt in combinatie met een uitgemergelde WT (controle) lijn. Dezelfde voorzichtigheid moet ook worden toegepast bij het overwegen van de genetische achtergrond van de onderzochte planten. Terwijl de meest populaire T-DNA-mutantencollecties werden gegenereerd in de Col-0-achtergrond, zijn andere, zoals de FLAG-collectie van het Institut national de la Recherche Agronomique (INRA), beschikbaar in de Wassilewskija (WS) genetische achtergrond24,25. In dergelijke gevallen is het raadzaam om de WT-fabriekslijnen van het betreffende ecotype als controles te gebruiken.
Hoewel we ons hier hebben gericht op pollenhydratatie gedurende de eerste 10 minuten van de pollen-stigma-interactie, kan deze methode ook worden aangepast om hydratatieprofielen te omvatten die een langere periode bestrijken. Een belangrijk kenmerk van het protocol is dat bloemen gehecht blijven aan de oorspronkelijke plant-stroom gepubliceerde protocollen vereisen meestal excisie van de stamper en plaatsing in media om het weefsel te ondersteunen voor de duur van het experiment14,18,26. Hoewel er geen direct bewijs is dat suggereert dat een dergelijke semi-in vivo benadering de hydratatie van stuifmeel beïnvloedt of zelfs de in vivo regulatie van dit proces verandert, is het denkbaar dat excisie van de bloemen van de moederplant de bestuiving kan beïnvloeden. Dit protocol bereikt dus een echte in vivo omgeving voor de studie van de pollen-stigma-interactie, waarbij de structurele integriteit van de plant behouden blijft.
De overdracht van enkele stuifmeelkorrels naar 'maagdelijke' stigmatische papillen is misschien wel een van de meest uitdagende operaties die in dit protocol worden beschreven. Het is niet ongebruikelijk om clusters van stuifmeelkorrels per ongeluk over te brengen. De kans hierop kan echter sterk worden verkleind door ervoor te zorgen dat er slechts een monolaag stuifmeel op de tang aanwezig is (figuur 3A) (of zelfs maar een enkele stuifmeelkorrel; Figuur 5), en/of door gebruik te maken van stuifmeelkorrels die al georiënteerd zijn, zodanig dat ze op de punt van de tang uit anderen 'steken'. We hebben ontdekt dat een ervaren operator met succes de overdracht van een enkel stuifmeel naar een stigmatische papillacel in ongeveer 3 minuten kan voltooien en gegevens kan registreren voor maximaal vijf stuifmeelkorrels gedurende een periode van 1 uur. Zo kunnen over een periode van 2-4 dagen voldoende gegevens worden verzameld voor een zinvolle statistische analyse van de bestudeerde plantenlijnen.
Menselijke fouten zijn potentieel de grootste bron van variatie in de analyse van datasets die zijn afgeleid van studies die dit protocol gebruiken. Zo komt de definitie van de 'pollengrens' tijdens beeldanalyse neer op het oordeel van de individuele onderzoeker. Er is dus het potentieel dat metingen door verschillende onderzoekers, zelfs op dezelfde dataset, variatie kunnen genereren. Waar mogelijk moet één onderzoeker de metingen uitvoeren om bemonsteringsfouten tot een minimum te beperken. Bovendien ontkent het koppelen van de analyse van WT- en mutantdatasets door dezelfde operator de potentieel subjectieve definitie van de 'pollengrens' en interoperatorvariatie.
Kortom, een geavanceerde maar nauwkeurige methode om pollenhydratatieprofielen in het modelorganisme A. thaliana te meten, wordt beschreven. We hebben aangetoond dat, door gebruik te maken van dit protocol, zeer consistente pollenhydratatiegegevens voor A. thaliana gemakkelijk kunnen worden verkregen. Drie onafhankelijke batches van gegevens voor WT-bestuivingen verkregen op verschillende dagen toonden consistente kleine afwijkingen van <3% over alle tijdspunten (figuur 7 en aanvullende tabel S1). Hoewel de hier gepresenteerde bioassay iets complexer is dan de meeste bestaande protocollen, is de resolutie van de gegenereerde gegevens superieur en geschikt voor de identificatie en karakterisering van nieuwe mutanten die van invloed zijn op routes die compatibele bestuiving reguleren.