Hier wordt een effectief protocol voor snelle bloedperfusie gepresenteerd om weefselmonsters van Afrikaanse klauwkikkers voor te bereiden voor transcriptomics- en proteomics-studies.
Een abonnement op JoVE is vereist om deze inhoud te bekijken. Log in of start vandaag met uw gratis proefperiode.
Methodenartikel
Hier wordt een effectief protocol voor snelle bloedperfusie gepresenteerd om weefselmonsters van Afrikaanse klauwkikkers voor te bereiden voor transcriptomics- en proteomics-studies.
Xenopus zijn al meer dan 100 jaar krachtige modelorganismen voor het begrijpen van de ontwikkeling en ziekte van gewervelde dieren. Hier wordt een snel bloedperfusieprotocol bij Xenopus gedefinieerd, gericht op een consistente en drastische vermindering van bloed in alle weefsels. Perfusie wordt uitgevoerd door een naald rechtstreeks in de ventrikel van het hart in te brengen en gehepariniseerde fosfaat-gebufferde zoutoplossing (PBS) door het vasculaire systeem te pompen. De procedure kan in ongeveer 10 minuten per dier worden voltooid. Het bloed wordt gedomineerd door een paar zeer overvloedige eiwitten en celtypen, waardoor tal van problemen ontstaan omdat deze eiwitten de meeste andere moleculen en celtypen van belang maskeren. De reproduceerbare karakterisering van volwassen Xenopusweefsels met kwantitatieve proteomica en eencellige transcriptomica zal baat hebben bij de toepassing van dit protocol voorafgaand aan orgaanbemonstering. De protocollen voor weefselbemonstering zijn vastgelegd in begeleidende documenten. Deze procedures zijn gericht op de standaardisatie van praktijken in Xenopus van verschillende geslacht, leeftijd en gezondheidsstatus, met name X. laevis en X. tropicalis.
De hele lichaamsperfusie van amfibieën wordt routinematig voltooid met het oog op behoud en fixatie 1,2,3,4,5,6. Deze procedures vinden echter plaats met een snelheid die het aantal verse monsters dat per dier kan worden genomen, beperkt. Het doel van dit werk is om een effectief bloedperfusieprotocol in Xenopus te ontwikkelen, waarbij prioriteit wordt gegeven aan de snelheid van de techniek. Het protocol duurt minder dan 10 min per dier voor X. tropicalis en minder dan 15 min per X. laevis dier. De secundaire prioriteiten zijn het gemak van replicatie en het gebruik van gemakkelijk te verkrijgen apparatuur, zodat hoogwaardige monsters op grote schaal kunnen worden gedeeld tussen Xenopus-laboratoria.
Xenopuskikkers worden veel gebruikt in biomedisch onderzoek om fundamentele biologische en pathologische processen te bestuderen die bewaard zijn gebleven bij verschillende soorten. Deze tetrapode heeft een nauwere evolutionaire relatie met zoogdieren dan andere aquatische modellen, met longen, een hart met drie kamers en ledematen met cijfers. De internationale gemeenschap gebruikt Xenopus effectief om een dieper inzicht te krijgen in menselijke ziekten door middel van diepgaande ziektemodellering en moleculaire analyse van ziektegerelateerde genfunctie. De talrijke voordelen van Xenopus als diermodel maken ze van onschatbare waarde om de moleculaire basis van menselijke ontwikkeling en ziekte te bestuderen; Deze voordelen omvatten: grote eicel- en embryogrootte, hoge vruchtbaarheid, gemak van huisvesting, snelle externe ontwikkeling en gemak van genomische manipulatie. Xenopus deelt naar schatting ~ 80% van de geïdentificeerde menselijke ziektegenen7.
Vergeleken met populaire zoogdiermodellen is Xenopus een snel, kosteneffectief model, met het gemak van morpholino knock-down en beschikbaarheid van efficiënte transgenen en gerichte genmutaties met behulp van CRISPR8. Kwantitatieve massaspectrometrie en eencellige transcriptomica zijn met succes toegepast op Xenopus-embryo's9,10, maar een recente celatlas van Xenopus laevis laat zien dat de samenstelling van de meeste weefsels wordt gedomineerd door bloedceltypen 11. Door een techniek te ontwikkelen die weefsel in een snel tempo exsanguineert en gekoelde media gebruikt, wordt de versheid van het monster minimaal beïnvloed door perfusie. Dit is vooral belangrijk voor toepassingen waarbij het doel is om fysiologisch onverstoorbaar mRNA of eiwitexpressie te profileren.
Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.
Alle experimenten werden uitgevoerd in overeenstemming met de regels en voorschriften van de Harvard Medical School IACUC (Institutional Animal Care and Use Committee) (IS 00001365_3).
OPMERKING: Hoewel de beschreven primaire methode van euthanasie door de American Veterinary Medical Association als een aanvaardbare techniek voor euthanasie wordt beschouwd12, is niet gebleken dat deze leidt tot het stoppen van een hartslag13. Zelfs de vaak gebruikte secundaire methode van dubbel pithing voorkomt dit niet, evenmin als het verwijderen van het hart van het dier. Exsanguinatie van verdoofde dieren wordt beschouwd als een humane en effectieve methode voor succesvolle euthanasie12. Omdat het in stand houden van vers weefsel door middel van euthanasie het doel is van dit protocol, is het gunstig dat het hart blijft kloppen door primaire euthanasie met MS-222, en dat perfusie zelf een secundaire euthanasiemethode is door exsanguinatie.
1. Voorbereiding
2. Perfusie
Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.
Na succesvolle perfusie zullen alle weefsels (met uitzondering van de lever in gepigmenteerde Xenopus) duidelijk lichter en minder verzadigd met bloed zijn. Grote bloedvaten zullen minder opvallen (figuur 10) en weefsels (met uitzondering van de lever) zullen na bemonstering schoon in de buffer spoelen. Hoewel de succesvolle uitvoering van het protocol uiteindelijk alleen kan worden bevestigd door de kwaliteit van de gegevens van geëxsanguineerde weefselmonsters, worden verschillend...
Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.
Dit protocol beschrijft traditionele dissectietechnieken voor toegang tot de coelomic holte. Andere technieken zijn ook acceptabel, op voorwaarde dat ze minimale schade aan de weefsels veroorzaken, het hart toegankelijk is en de long en maag zichtbaar zijn. Evenzo kunnen de meeste vermelde dissectietools gemakkelijk worden vervangen door vergelijkbare items.
Hoewel er pogingen zijn gedaan om de werkzaamheid van deze procedure te optimaliseren, kunnen de resultaten variëren, afhankelijk van iem...
Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.
De auteurs verklaren geen tegenstrijdige belangen te hebben.
Dit werk werd ondersteund door NIH's OD R24 grant OD031956 en NICHD R01 grant HD073104. We danken Darcy Kelly voor de nuttige discussies en de eerste input over dit protocol. We willen ook Samantha Jalbert, Jill Ralston en Wil Ratzan bedanken voor hun hulp en steun, evenals onze drie anonieme peer reviewers voor hun feedback.
Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.
| Naam | Bedrijf | Catalogusnummer | Opmerkingen |
|---|---|---|---|
| 5x Vergrootglas met LED-licht en standaard | amazon.com | B08QJ6J8P1 | licht mag geen warmte produceren |
| Wegneembare transferpipetten | VWR | 414004-036 | |
| Dissectietang met fijne punt | Fisher Scinetific | 08-875 | |
| Dissectie schaar met scherpe punt, recht 6,5" | VWR | 76457-374 | |
| Dissectielade | Fisher Scinetific | 14-370-284 | piepschuim platen zijn een acceptabele alternatief |
| Euthanasiecontainer | US Plastic | Item 2860 | alternatieve ondoorzichtige containers zijn acceptabel |
| Euthanasiecontainer deksel | US Plastic | Item 3047 | |
| Fijne dissectiepins | Living Systems Instrumentation | PIN-#3 | |
| Hypodermische naalden voor algemeen gebruik, 22 G | Fisher Scientific | 14-826-5A | voor X. laevis |
| Hypodermische naalden voor algemeen gebruik, 25 G | Fisher Scientific | 14-826AA | voor X. tropicalis |
| Heparine, varkensdarm mucosa | MilliporeSigma | 37-505-410MG | |
| Iridectome schaar 6" | vwr | 470018-938 | iris schaar is een acceptabel alternatief |
| Luer-naar-barb adapter mannelijke Luer met vergrendelingsring | amazon.com | B09PTX6M2Z | maat is afhankelijk van de slang van de gebruikte pomp |
| Mayo-Hegar naaldhouder | Fisher Scinetific | 08-966 | muggentang is een acceptabel alternatief |
| MS-222: Syncaine (voorheen tricaine) | Pentair AES | TRS1 | |
| PBS 1x | Corning | 21-040-CV | |
| Peristaltiek vloeistofpomp doseringspomp 5–100 mL/min | amazon.com | B07PWY4SM6 | elke peristaltische pomp die in staat is om 5-10mL/min te pompen is acceptabel |
| Slijpsteen | VWR | 470150-112 | optioneel; voor het doven van naalden |
| Natriumbicarbonaat, poeder, USP | Fisher Scientific | 18-606-333 | |
| Specimentang, gekarteld | VWR | 82027-442 | |
| T-Pins voor dissectie | Fisher Scinetific | S99385 | |
| Ultra-fijne korte insulinespuiten, 31 G | VWR | BD328438 | |
| Draaddriehoekige snijders, 6-inch ultrascherpe & krachtige zijsnijder | amazon.com | B087P191LP |
Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.