Vier patiënten met GBM en één met LGG werden geïncludeerd na pathologische bevestiging door een ervaren neuropatholoog (CMM). De meerderheid van de patiënten had een niet-gemethyleerde MGMT-promotor en alle GBM-patiënten waren IDH1- en IDH2-wildtype (tabel 1). Gemiddeld duurde het productieproces 88,8 min (+/- 6,3 min) in de C-benadering en 322 min (+/- 17,2 min) in de M-benadering. Het totale slagingspercentage was 87% in de handleiding en 93% in de chopper-aanpak na 4 weken kweek (n = 5). Bovendien bereikten BOB's afgeleid van de C-groep binnen 1 week de gewenste afgeronde vorm en waren ze volwassen genoeg om te worden gebruikt in in vitro experimenten, terwijl de BOB's van de M-groep meestal scherp en ongedefinieerd bleven (Figuur 2). Het tumorweefsel dat met de C-benadering werd verwerkt, resulteerde in totaal 281 BOB's (gemiddelde per patiënt = 56 +/- 43) na de eerste kweekweek, terwijl 250 BOB's (gemiddelde per patiënt = 50 +/- 41) zich ontwikkelden met de M-benadering. Tijdens de tweede kweekweek leverde het weefsel van alle vijf patiënten hogere BOB-getallen op wanneer ze werden gegenereerd met de C-benadering (801; Gemiddelde per patiënt = 130 +/- 38) vergeleken met de M-benadering (601; Gemiddelde per patiënt = 76 +/- 44; P = 0,018). Tijdens de derde kweekweek verzamelde de C-benadering in totaal 1105 BOB's van alle patiënten (gemiddelde per patiënt = 221 +/- 32) vergeleken met 771 BOB's (gemiddelde per patiënt = 155 +/- 34) in de M-benadering (P = 0,032). Bovendien vormden zich in totaal 1195 BOB's (gemiddelde per patiënt = 239 +/- 50) na vier weken kweek wanneer ze werden gegenereerd met de C-benadering vergeleken met 784 (gemiddelde per patiënt = 157 +/- 36) met behulp van de M-benadering (P < 0,01). Daarom liet de C-methode vanaf de tweede week een significant hoger aantal BOB's zien (figuur 3). Verder werden de relatieve fluctuaties in het aantal BOB's geëvalueerd om de dynamische trends tussen opeenvolgende weken te onderzoeken. Uit de analyse bleek dat het aantal BOB's tijdens de eerste overgang van de eerste naar de tweede week in de C-benadering indrukwekkend sterk toenam (265%), wat wijst op snelle vooruitgang. Vervolgens was er een lagere stijging van het aantal tellingen in de derde week (75%), als gevolg van een tijdelijke aanpassing. De M-benadering daarentegen liet een consistente en gestage toename van het aantal BOB's zien (92% in de tweede week, respectievelijk 67% in de derde week), wat bijdroeg tot een opmerkelijke stabiliteit van de tellingen in de vierde week. Deze consistente opwaartse trend in het aantal BOB's onderstreept de betrouwbaarheid en veerkracht van de C-benadering gedurende de hele observatieperiode.
Twee GBM-patiënten en één LGG-patiënt werden geïncludeerd voor de analyse van astrocytenaantallen (GFAP) in BOB's, PDO-celproliferatie (Ki67) en apoptose (CC3). Het vastgestelde aantal astrocyten vertoonde geen significante verschillen tussen de twee verwerkingsmethoden met een gemiddelde van 43% in de C-benadering en 45% in de M-benadering (Figuur 4 en Figuur 5, Aanvullende Figuur 1 en Aanvullende Figuur 2). Evenzo waren de proliferatiepercentages binnen de BOB's vergelijkbaar tussen de C-benadering (3%) en de M-benadering (1%). Alleen BOB's gegenereerd met de C-benadering van patiënt 5 vertoonden een proliferatiepercentage van 26% vergeleken met 1% met de M-benadering (P = 0,001; Figuur 4C). Over het algemeen werden lage apoptosepercentages gedetecteerd in BOB's die werden verwerkt met de C-benadering (3%) vergeleken met 2% van de M-benadering voor alle patiënten, die niet significant verschilden (figuur 5C). Bovendien was er geen significant verschil tussen de twee methoden met betrekking tot het aantal astrocyten dat apoptose onderging (Figuur 5D).

Figuur 1: Grafisch overzicht van het productieproces van patiënt-afgeleide organoïden (PDO's) met behulp van een geautomatiseerde hakselaar versus een handmatige aanpak. De illustratie toont de verschillende betrokken stappen, waaronder (A) monsterafname, (B) dissectie van tumormateriaal, (C) wassen en (D) incubatie. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.

Figuur 2: BOB-morfologie tijdens de eerste kweekweek. Vergelijking van de vorming van BOB's na dissectie met behulp van zowel de geautomatiseerde hakselaar als de handmatige methode. Schaalbalken = 1000 μm. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.

Figuur 3: Aantal BOB's tijdens de eerste vier weken van de kweek. De x-as geeft de tijd in weken (W) weer, en de y-as het aantal BOB's van de C (blauw) en M (rood) benadering (n = 5). Elk gegevenspunt vertegenwoordigt het gemiddelde aantal, met foutbalken die de standaardfout van het gemiddelde aangeven. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.

Figuur 4: Celproliferatiesnelheden binnen BOB's. (A) Representatieve immunofluorescentiebeelden (n = 3) van GFAP-positieve cellen (groen), Ki67-positieve cellen (rood) en DAPI (blauw) in BOB's van patiënten 3, 4 en 5 (tabel 1). Alle BOB's werden verwerkt met behulp van de hakselaar (C) en handmatige (M) methode. Schaalbalken = 100 μm. (B) Vergelijking van de twee methoden met betrekking tot het relatieve aantal GFAP-positieve cellen, (C) Ki67-positieve cellen en (D) Ki67/GFAP-dubbel positieve cellen. Niet-significante resultaten worden aangeduid met "ns". Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.

Figuur 5: Apoptosepercentages binnen BOB's. (A) Representatieve immunofluorescentiebeelden (n = 3) van GFAP-positieve cellen (groen), CC3-positieve cellen (rood) en DAPI (blauw) in BOB's van patiënten 3, 4 en 5 (tabel 1). Alle BOB's werden verwerkt met behulp van de hakselaar (C) en handmatige (M) methode. Schaalbalken = 100 μm. (B) Vergelijking van de twee methoden met betrekking tot het relatieve aantal GFAP-positieve cellen, (C) CC3-positieve cellen en (D) CC3/GFAP-dubbel positieve cellen. Niet-significante resultaten worden aangeduid met "ns". Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.
Tabel 1: Kenmerken van patiënten en klinische parameters. GBM = glioblastoom, IDH-wildtype, CZS WHO graad 4; LGG = laaggradig glioom; KPS = Karnofsky-prestatiescore; MGMT = O 6-methylguanine-DNA-methyltransferase; IDH1 = isocitraatdehydrogenase 1, IDH2 = isocitraatdehydrogenase 2, ATRX = α-thalassemie/mentale retardatie, X-gebonden gen; M = morfologie; CC = celgetal; p = proliferatie; A = apoptose. Klik hier om deze tabel te downloaden.
Tabel 2: Gemiddelde composities. H-GPSA = Overwinteren A-Glutamax potloodlijn streptomycine amfotericine B. BOB = Patiënt-afgeleide organoïden DMEM: Dulbecco's Modified Eagle's Medium. NEAA: niet-essentiële aminozuren. Penstreptokokken: Penicilline/Streptomycine Klik hier om deze tabel te downloaden.
Tabel 3: Overzicht van de gebruikte technieken om celkweekmodellen te genereren. Klik hier om deze tabel te downloaden.
Aanvullende figuur 1: Individuele kanalen voor proliferatiekleuring van BOB's. (A) DAPI (blauw), (B) GFAP-positieve cellen (groen), (C) Ki67-positieve cellen (rood) en (D) overlay-kanaal in BOB's van patiënten 3, 4 en 5. Schaalbalken = 100 μm. Klik hier om dit bestand te downloaden.
Aanvullende figuur 2: Individuele kanalen voor apoptosekleuring van BOB's. (A) DAPI (blauw), (B) GFAP-positieve cellen (groen), (C) CC3-positieve cellen (rood) en (D) overlaykanaal in BOB's van patiënten 3, 4 en 5. Schaalbalken = 100 μm. Klik hier om dit bestand te downloaden.