De evaluatie van de eindopbrengst is afhankelijk van het zuiverheidsniveau en de hoeveelheid geïsoleerde cellen en kan worden bepaald door RT-qPCR, celtelling en eiwitkwantificering. De zuiverheid van de geïsoleerde magnetische cellen uit de hypothalamus werd bevestigd door de genexpressieanalyse van CD11b, C1qa, Gad1 en GFAP met RT-qPCR (Figuur 1). CD11b en C1qa worden voornamelijk tot expressie gebracht door microglia in een steady-state CNS16 en Gad1 en GFAP dienen respectievelijk als een neuronale en astrocytaire marker. Het totale cDNA van één hypothalamus varieerde van 55 tot 98 ng. Het is opmerkelijk dat alleen de positieve fractie CD11b- en C1qa-expressie vertoonde, wat wijst op de afwezigheid van enig potentieel verlies van microgliacellen in de negatieve fractie. Primers zijn opgenomen in tabel 2.
Bovendien zorgen de kleine niveaus van de neuronale en astrocytaire markers ervoor dat de overgrote meerderheid van de geïsoleerde cellen microglia zijn, aangezien residente macrofagen en monocyten slechts 10% van het totale immuuncellandschap van een gezond brein uitmaken10,11. Deze resultaten bewijzen de doeltreffendheid van de magnetische selectie en maken de weg vrij voor de toepassing van RT-qPCR om de expressieniveaus van alle genen die van belang zijn in vers gesorteerde hypothalamische microgliacellen te beoordelen. Op dezelfde manier kan een RNAseq-analyse worden uitgevoerd op hypothalamus-gesorteerde microglia om een uitgebreid beeld te krijgen van hun transcriptoom.
De hoeveelheid van de geïsoleerde cellen werd bepaald door het tellen van cellen en bleek ~15.000 cellen per hypothalamus te zijn (vermeld in protocolstap 4.10). Bovendien werd de eiwitconcentratie in gesorteerde microglia gekwantificeerd, wat een gemiddelde concentratie van 0,5 μg/μL onthulde in CD11b+- cellen geïsoleerd uit twee gepoolde hypothalami (Figuur 2). Deze kennis maakt het mogelijk om verschillende testen uit te voeren, afhankelijk van een minimale eiwitdrempel. Bovendien kan door meer hypothalami te bundelen, een hogere concentratie worden bereikt, waardoor de reikwijdte van potentiaalanalyses wordt uitgebreid. De geëxtraheerde eiwitten uit hypothalamische microglia maken diverse technieken mogelijk, waaronder AlphaLISA-immunoassays en kinase-activiteitstests.
Bovendien stelt het beschreven protocol onderzoekers in staat om verschillende ex vivo-analyses uit te voeren, waardoor de microgliale activiteit en hun rol in de hypothalamus in zowel fysiologische als pathologische contexten kunnen worden geëxploreerd. De kwantificering van de ROS-productie vertegenwoordigt een cruciaal aspect van de microgliale immuunrespons17. Daarom kunnen microglia na scheiding worden behandeld met in de handel verkrijgbare reagentia die de detectie van ROS in levende cellen mogelijk maken door bij oxidatie een verhoogd fluorescerend signaal te vertonen. Microglia magnetisch geïsoleerd uit drie gepoolde hypothalami is voldoende om ROS door FACS te detecteren, zoals weergegeven in figuur 3A, hoewel onze resultaten een vrij hoge variabiliteit van de cel-ROS-productie laten zien onder de aandoeningen die we hebben geanalyseerd. Het is opmerkelijk dat we met de bovengenoemde commerciële kit (zie de Materiaaltabel) ook in staat waren om de levensvatbaarheid van gesorteerde Cd11b+ cellen te beoordelen, dankzij een cel-ondoorbedoelde dode celkleuring die een toename van fluorescentie vertoont bij het binden van DNA. Concreet tonen onze gegevens aan dat 99% van de cellen in leven is (Figuur 3B). Poortstrategieën werden gebruikt om onderscheid te maken tussen levende en dode cellen, evenals oxidatief gestreste en niet-gestreste cellen, op basis van hun fluorescentie-eigenschappen.
Een ander belangrijk kenmerk van microgliale activiteit is fagocytose, een dynamisch en strak gereguleerd proces dat een sleutelrol speelt bij immuunbewaking, weefselherstel en de algehele homeostase van het centrale zenuwstelsel18. Opmerkelijk is dat Cd11b+- cellen gesorteerd met magnetisch gekoppelde kralen gedurende 24 uur kunnen worden gekweekt en vervolgens op verschillende tijdstippen kunnen worden geïncubeerd met fluorescerende latexmicrobeads om, hetzij door FACS of door fluorescentiemicroscopie, veranderingen in de fagocytische activiteit onder verschillende omstandigheden te evalueren. Vers gesorteerde microglia kunnen ook worden blootgesteld aan fluorescerende parels of elk type pHrodo-gekoppelde deeltjes (bijv. synaptosomen) direct in de buis, en fagocytose kan worden beoordeeld door FACS-analyse.
In het bijzonder hebben we rechtstreeks geïncubeerd in de buis met gesorteerde celsuspensie, microglia geïsoleerd uit twee gepoolde hypothalami of een heel brein met fluorescerende latexkralen. Microglia die ten minste één fluorescerende kraal hebben gefagocyteerd, kunnen door flowcytometrie worden onderscheiden van niet-fagocytische cellen, aangezien fagocytische microglia een verbeterde fluorescentie zullen vertonen. Negatieve controles, niet geïncubeerd met kralen, werden gebruikt voor gating. In onze beide experimentele omstandigheden (muizen gevoed met chow versus vetrijk dieet (HFD)) zagen we een zeer laag percentage fagocytische microglia (Figuur 4A). Dit resultaat wordt hier echter getoond om de werkzaamheid van deze methode aan te tonen, die opmerkelijk genoeg ook onderscheid maakt tussen cellen die 1 kralen, 2 kralen, 3 kralen, enzovoort hebben gefagocyteerd (Figuur 4B). Ten slotte kunnen alle omics-benaderingen worden toegepast op geïsoleerde hypothalamische microglia. We stellen voor om drie hypothalami samen te voegen om voldoende cellen te hebben om deze tests uit te voeren.

Figuur 1: Evaluatie van de zuiverheid van CD11b+- cellen door RT-qPCR. Kwantificering in gesorteerde cellen van de mRNA-expressie van de integrine CD11b, complement C1q subcomponent subeenheid A C1q, glutaminezuurdecarboxylase Gad1 en gliaal fibrillair zuur eiwit GFAP genormaliseerd op mRNA-niveaus van huishoudgenen Eef1a1 en Sdha. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.

Figuur 2: Kwantificering van eiwitten uit hypothalamische cellen na celsortering. Kwantificering van de eiwitconcentratie in CD11b+ en CD11b- cellen. Zowel CD11b+ als CD11b- cellen werden gelyseerd in 20 μL lysisbuffer. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.

Figuur 3: Detectie van ROS in levende microgliacellen. Kwantificering van (A) oxidatief gestreste cellen en (B) levende cellen in een populatie van gesorteerde Cd11b+ cellen, met relatieve FACS contourplots. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.

Figuur 4: Kwantificering van microgliale fagocytische activiteit. (A) Kwantificering van fagocytische cellen in Cd11b+ cellen gesorteerd uit twee hypothalami of één hersenen, met relatieve FACS contourplot. (B) Percentage fagocytische cellen volgens het aantal gefagocyteerde parels met relatieve FACS-contourplot. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.
| Enzym mix 2 | | |
| Enzym A | Buffer Y | Enzym P | |
| 10 μL | 20 μL | 50 μL | |
| D-PBS | Oplossing voor het verwijderen van puin | Overlay D-PBS |
| 15-100 mg structuur | 1000 μL | 450 μL | 2 ml |
Tabel 1: Bereiding van het dissociatiemengsel (de volumes hebben betrekking op een enkel monster) en de gradiëntoverlagen.
| Genen | Eiwit | Voorwaarts | Omkeren |
| Itgam | Integrine alfa M (CD11b) | CTCATCACTGCTGGCCTATACAA | GCAGCTTCATTCATCATGTCCTT |
| Sdha | Succinaatdehydrogenase Complex Flavoproteïne Subeenheid A | CCCTCTCATATGTGGACATCAA | CAAGGTCTTGTCGATAACAGGT |
| C1qa | Complementcomponent 1, q-subcomponent, alfa-polypeptide | CGAGGTGTGGATCGAAAAGG | GAAGATGCTGTCGGCTTCAGT |
| Gad1 zei: | glutamaat decarboxylase 1 | GACCAATCTCTGTGACTCGCTTAG | CTGGTCAGTGTATCGGAGGTCTT |
| Gfap | glial fibrillair zuur eiwit | AGGTCCGCTTCCTGGAACA | GGGCTCCTTGGCTCGAA |
Tabel 2: RT-qPCR primer sequenties.
| Flowcytometrie cellen sorteren (FACS) | Magnetisch geactiveerde celsortering (MACS) |
| Fluorescerend gelabelde biochemische antilichamen | Magnetische kralen geconjugeerd aan antilichamen |
| Differentiatie voorbij markers op het celoppervlak | Differentiatie alleen volgens markers op het celoppervlak |
| Aanzienlijk aanvangsrendement | Bescheiden aanvangsopbrengst |
| Langzamer dan MACS voor gelijktijdige verwerking van veel monsters | Sneller dan FACS voor gelijktijdige verwerking van veel monsters |
| Minder zacht dan MACS | Zachter dan FACS |
Tabel 3: Weergave van FACS- en MACS-kenmerken en -beperkingen