De neocortex verwijst naar de buitenste laag van de hersenhelften en is een structuur die uniek is voor zoogdieren. De neocortex vertegenwoordigt de zetel van hogere cognitieve functies 1,2,3,4,5. Tijdens de ontwikkeling geven neurale stam- en voorlopercellen aanleiding tot neuronen in een proces dat neurogenese wordt genoemd. Functionele studies die de ontwikkeling van de menselijke neocortex onderzoeken, vormen de basis voor het ophelderen van de mechanismen die ten grondslag liggen aan de regulatie van menselijke neurale stamcellen, neurale pathologieën en de evolutie van het menselijk brein 2,6,7.
Historisch gezien waren studies naar de ontwikkeling van de menselijke hersenen gebaseerd op beschrijvende histologische benaderingen met behulp van post-mortem weefsel, met recentere vrij zwevende weefselkweeksystemen die functioneel onderzoek met menselijk foetaal weefsel mogelijk maakten 8,9. Bovendien werd aangetoond dat menselijk foetaal hersenweefsel het vermogen heeft om zichzelf te organiseren tot langdurig expanderende organoïden10. Onderzoek naar foetaal weefsel heeft belangrijke inzichten opgeleverd in de menselijke ontwikkeling11,12, maar de beperkte beschikbaarheid van weefsel en ethische overwegingen beperken de wijdverbreide toepassing ervan voor mechanistische studies van de ontwikkeling van de menselijke hersenen. In het afgelopen decennium zijn protocollen ontwikkeld die het mogelijk maken om driedimensionale neurale organoïden te genereren uit menselijke pluripotente stamcellen (hPSC), waaronder door mensen geïnduceerde PSC (hiPSC)13,14.
Cerebrale organoïden vertonen belangrijke kenmerken van de zich ontwikkelende hersenen, zoals de vorming van ventrikelachtige structuren, apicobasale polariteit, corticale cytoarchitectuur, interkinetische nucleaire migratie tijdens radiale gliadeling en neuronale migratie. Belangrijk is dat deze nieuwe humane organoïdemodellen kenmerken van de zich ontwikkelende hersenen van de mens recapituleren die niet goed zijn gemodelleerd in de muis, inclusief evolutionair relevante belangrijke neurale voorlopertypen, in het bijzonder basale radiale glia (of buitenste radiale glia)7,14,15. Verschillende beperkingen van vroege cerebrale organoïde-protocollen - zoals problemen met de heterogeniteit van organoïden, beperkte toevoer van voedingsstoffen naar de binnenkern en gevarieerde regionale identiteit - zijn aangepakt in recente protocolverbeteringen en verdere verbeteringen kunnen worden verwacht in de komende jaren 15,16,17,18,19. Menselijke cerebrale en corticale organoïden zijn snel sleutelmodellen geworden om de ontwikkeling van de menselijke corticale te bestuderen20, neurologische aandoeningen 21,22,23,24 en hersenevolutie 25,26,27,28,29, en om grootschalige screeningbenaderingen uit te voeren 30,31,32.
Voor acute genetische manipulatie zijn twee methoden voornamelijk gebruikt in diermodellen van de ontwikkeling van neocortex: virale afgifte door infectie van doelwitcellen33 en in utero of in vitro elektroporatie34,35. Injectie van DNA - en, meer recentelijk, CRISPR/Cas9 ribonucleoproteïne (RNP) complexen36 - in de laterale ventrikels, gevolgd door elektroporatie, biedt het voordeel dat specifieke delen van de hersenen kunnen worden aangevallen op basis van de oriëntatie van de elektroporatie-elektroden. Elektroporatie omvat korte elektrische pulsen die de permeabiliteit van het celmembraan tijdelijk verhogen, waardoor DNA en andere geladen moleculen in cellen kunnen worden geïntroduceerd. In utero werd elektroporatie voor het eerst uitgevoerd bij de muis37, waar het al snel een algemeen toegepaste methodologie werd voor ontwikkelingsneurobiologie. De methode werd vervolgens ook toegepast op andere soorten, zoals de rat38,39 en de fret 40,41,42, een gyrencephalische soort die wordt gebruikt om neocortexexpansie en corticale vouwing te bestuderen 3,43,44,45.
Elektroporatie is ook een belangrijke methode geworden in het onderzoek naar organoïden van de menselijke hersenen46. In cerebrale organoïden is elektroporatie toegepast om celmorfologie en neuronale axonen te visualiseren14,47, om gen-knockdown-reagentia af te leveren 22,48,49 en voor onderzoek naar genfunctie door overexpressie50. De methode is niet beperkt tot menselijke modellen, maar is ook toegepast voor genetische modificatie van cerebrale organoïden van primaten50,51. Bovendien is de elektroporatie van corticale organoïden gegenereerd in een Spin Ω draaiende bioreactor beschreven52.
In dit protocol schetsen we de elektroporatie van gesneden menselijke corticale organoïden15 voor studies naar de genfunctie in de corticale ontwikkeling. Hersenregio-specifieke organoïden verhogen de reproduceerbaarheid en consistentie, die cruciaal zijn voor het succes van kwantitatieve analyse, bijvoorbeeld bij ziektemodellering. In het gesneden humane corticale organoïde protocol15 worden krachtige patroonsignalen toegepast tijdens iPSC-differentiatie om een homogene populatie van dorsale voorhersenvoorlopers te verkrijgen, gevolgd door de toepassing van kweekmedia die weefselgroei bevorderen met minder instructieve signalen53,54. Het is aangetoond dat het snijden van corticale organoïden de celdood vermindert als gevolg van een verminderde beschikbaarheid van voedingsstoffen en zuurstof in de organoïdekern15. Bovendien ondersteunt slicing de ontwikkeling van ventrikelachtige structuren die overvloedige basale radiale glia bevatten, met aanhoudende neurogenese die leidt tot de vorming van een geëxpandeerd corticaal plaatachtig gebied15. Het herhaalde snijden in dit protocol maakt deze corticale organoïden ook bijzonder geschikt voor elektroporatie, omdat de lumen van het ventrikel gemakkelijk kunnen worden geïdentificeerd en aangepakt door middel van injectie. Elektroporatie van gesneden corticale organoïden is toegepast om genregulerende regio's en corticale evolutie te bestuderen26,55.
Tijdens de elektroporatieprocedure wordt het injectiemengsel afgeleverd in het lumen van ventrikelachtige structuren. Bij toepassing van een gepulseerd elektrisch veld wordt het mengsel opgenomen door apicale radiale glia die langs het ventrikel lopen. Naarmate apicale radiale glia zich delen en aanleiding geven tot meer toegewijde celtypen4, worden de geëlektroporiseerde middelen doorgegeven aan basale voorlopercellen en neuronen. Geëlektroporeerde nakomelingen worden na 3 dagen verdeeld in de ventriculaire zone (VZ) en subventriculaire zone (SVZ) en beslaan het grootste deel van de corticale wand, inclusief de corticale plaat (CP)-achtige regio, 7 dagen na elektroporatie tijdens mid-neurogene stadia26,55.
Hier beschrijven we CRISPR/Cas9-gemedieerde genverstoring56 door elektroporatie in gesneden menselijke corticale organoïden26. Daarnaast kan de elektroporatiemethode ook worden toegepast voor genoverexpressie, visualisatie van celmorfologie en cellulaire processen door expressie van fluorescerende eiwitten, levering van plasmidebibliotheken voor Massive Parallel Reporter Assays (MPRA), levering van hulpmiddelen voor het bewerken van epigenoom en labeling van cellen voor live beeldvorming.