Kleine extracellulaire blaasjes (sEV's), doorgaans variërend van 30 tot 200 nm in diameter, worden van nature door cellen afgescheiden in biologische vloeistoffen en dragen eiwitten, lipiden en nucleïnezuren die hun cel van oorsprong 1,2,3 aangeven. Als niet-invasieve biomarkers aanwezig in speeksel, urine en andere lichaamsvloeistoffen4, bieden ze veelbelovend voor vroege ziektediagnose, prognose en therapeutische monitoring, vooral in oncologie 5,6,7. Hun klinische vertaling wordt echter belemmerd door hun hoge heterogeniteit en lage abundantie in complexe biologische matrices8. Om dergelijke uitdagingen te overwinnen, maakt dit protocol gebruik van oppervlakte-versterkte Raman-spectroscopie (SERS), een krachtige analytische methode die Ramanverstrooiing met maximaal 1010-10 11 keer kan versterken via plasmonische substraten 9,10,11. SERS vangt intrinsieke moleculaire "vingerafdruk"-spectra van individuele sEV's binnen enkele seconden, waardoor ultragevoelige enkelblaasanalyse mogelijk wordt terwijl lange assay-tijden worden vermeden.
Onze methode combineert synergetisch labelvrije SERS om snelle, ultrasensitieve karakterisering van individuele sEV's te bereiken 12,13,14,15,16. Labelvrije SERS vangt intrinsieke biochemische signaturen op en, in combinatie met machine learning-modellen zoals LDA en SVC, is aangetoond dat het sEV's van gezonde versus zieke cellen met hoge specificiteit13 onderscheidt. Om de reproduceerbaarheid en kwantitatieve capaciteit van ons platform verder te verbeteren, is onze methode volledig compatibel met grafeenbedekte Raman-substraten16. Enkellaags grafeen biedt een chemisch uniform oppervlak dat plasmonische hotspots stabiliseert en de moleculaire adsorptieversterkt 17,18, en belangrijker nog, enkellaags grafeen dient als de "ingebouwde" meter van SERS-signalen12,19, wat de kwantificatiemogelijkheid van gedetecteerde moleculen mogelijk maakt. Ondanks dat de diameter van de Raman-laserstraal (~ 1 μm) groter is dan die van de typische sEV, bereikt ons platform effectieve enkelvoudige blaasresolutie dankzij de unieke wisselwerking van fysieke en statistische mechanismen. Het quasi-periodieke gouden nanopiramidesubstraat genereert sterk gelokaliseerde plasmonische "hot spots" van een grootte kleiner dan 100 nm die Raman-signalen op een superlineaire manier versterken12. Daardoor domineert het signaal van de sEV, stochastisch dicht bij het meest intense hotspot binnen de bundel, het spectrum. Daarnaast bevestigt SEM-beeldvorming dat sEV's goed uit elkaar liggen (> 1 μm uit elkaar, waardoor spectrale overlap wordt geminimaliseerd, terwijl Raman-intensiteitskaarten signaallokalisatie tonen die overeenkomt met de grootte van individuele blaasjes13,14. Samen zorgen deze kenmerken ervoor dat elk verzameld spectrum voornamelijk overeenkomt met één enkele sEV, waardoor statistisch robuuste, labelvrije enkelblaasanalyse mogelijk is. In vergelijking met conventionele benaderingen, zoals western blot, massaspectrometrie of reguliere Ramanverstrooiing die grote monstervolumes vereisen en geen enkele blaasjes20 kunnen onderscheiden, biedt ons single-vesicle SERS-platform superieure gevoeligheid, doorvoer en moleculaire resolutie. Deze workflow is geschikt voor onderzoekers die minimaal invasieve, hoogresolutie diagnostische hulpmiddelen willen ontwikkelen of de sEV-heterogeniteit en de efficiëntie van het inladen van medicijnen willen onderzoeken in geïndividualiseerde therapeutische studies. In dit protocol laten we zien hoe ons SERS-platform enkele sEV's gebruikt om ziektedetectie en therapeutische toepassingen mogelijk te maken, met name bij kanker, waaronder de volledige workflow van vesikelisolatie, plasmonische substraatvoorbereiding, Raman-acquisitie en data-analyse met machine learning.