Elastine-achtige polypeptiden (ELP's) zijn biopolymeren die bestaan uit herhalende (VPGXG)n-motieven 1,2,3,4,5,6,7,8,9. Het gastresidu X in de pentapeptide-eenheid kan elk aminozuur zijn behalve proline. Variaties in X kunnen worden gebruikt om de hydrofobiciteit, het thermische overgangsgedrag en de functionele eigenschappen van het ELP-construct af te stemmen om modulaire biocompatibele materialen te creëren die breed zijn onderzocht in diverse biomedische toepassingen 10,11,12.
Hoewel chemische synthese kan worden gebruikt om korte peptiden te produceren, is het slecht geschikt voor hoogmolecuulgewicht ELP's of om de functionaliteit van fusie-eiwittente behouden 13,14. Om dergelijke redenen worden ELP's doorgaans recombinant uitgedrukt in E. coli, waardoor sequentie-gedefinieerde productie in grote hoeveelheden mogelijk is. Deze aanpak kan echter ook uitdagingen met zich meebrengen. Tijdens hun expressie in E. coli hopen ELP's zich vaak op in dichte inclusielichamen, wat efficiënte herstelstrategieën vereist om functioneel eiwit15 te extraheren. Bovendien introduceert bacteriële expressie ongewenste biomoleculen zoals gastheerceleiwitten, nucleïnezuren en lipopolysacchariden (endotoxines) die tijdens de zuivering van de ELP moeten worden gescheiden. Traditionele oplosbaarheidsstrategieën met detergenten (bijv. natriumdodecylsulfaat (SDS) of Triton X-100) of chaotrope middelen zoals ureum hebben beperkt succes gehad voor onze ELP-fusiesequenties. Uit onze ervaring slaagden Triton en ureum er niet in ELP's uit de pelletfase te extraheren, terwijl SDS gedeeltelijke oplosbaarheid mogelijk maakte, maar de downstream affiniteitszuivering verstoorde en moeilijk volledig uit de hydrofobe ELP-sequentie te verwijderen was.
Tot op heden blijft inverse overgangscyclus (ITC) de meest gebruikte zuiveringsmethode voor ELP's. Deze techniek maakt gebruik van hun LCST-gedrag om het ELP selectief neer te slaan en te resolubiliseren over temperatuur- en zoutgradiënten16. Echter, met eiwitten met een lager molecuulgewicht is ITC een tijdrovend meerstapsproces dat slecht geschikt is voor ELP's die vastzitten in inclusielichamen, en meerdere ITC-cycli vereisen die bij elke stap 7,16 tot eiwitverlies kunnen leiden.
Om deze beperkingen te overwinnen, hebben we een organische, oplosmiddel-gebaseerde extractie- en neerslagworkflow ingevoerd. Hoewel Yakhnin et al. in 1998 voor het eerst een hydrofobiciteitsgedreven partitioneringsstrategie voor GFP-zuivering met ethanol- en zoutgradiëntendemonstreerden, gebruikt de nieuwe methode die wij ontwikkelden organische oplosmiddelmengsels om ELP-fusie-eiwitten direct uit E. coli-cellen te extraheren. Sweet et al. en Darji et al. pasten deze benadering aan ELP-fusies en toonden aan dat organische oplosmiddelextractie een snelle terugwinning van functionele ELP's mogelijk maakt, terwijl structurele integriteit en bioactiviteitbehouden blijven 8,9. Deze methode gebruikt sonicatie en organische oplosmiddelen om bacteriële cellen te lyseren en ELP's in één bewerking te extraheren, terwijl het merendeel van de gastheereiwitten en nucleïnezuren wordt neergeslagen. Terugwinning van de ELP-rijke organische fase, gevolgd door snelle neerslag om de ELP's te isoleren uit oplosmiddelen en oplosbare onzuiverheden, levert zeer zuivere ELP's op. Deze benadering kan ook pure ELP opleveren uit E. coli-pellets met endotoxineniveaus onder 1 EU/mL in minder dan drie uur 7,8.
Studies tot nu toe tonen aan dat deze methode in staat is ELP-constructies en ELP-fusie-eiwitten met variërend molecuulgewicht en iso-elektrisch punt te zuiveren, zonder meerdere ITC-cycli of oplosbare stappen (Figuur 1). Atoomkrachtmicroscopie (AFM) en transmissie-elektronenmicroscopie (TEM) beeldvorming suggereren dat ELP-fusie-eiwitten die op deze manier worden gezuiverd, omgekeerde micelle-achtige structuren vormen (Figuur 2), waardoor de structuur en functie van ELP-fusiedomeinen behouden blijven tijdens organische oplosmiddelextractie. Deze gestroomlijnde workflow maakt snellere en betrouwbaardere ELP-zuivering mogelijk voor diverse biomedische toepassingen 7,8. Opmerkelijk is dat Aayush et al. rapporteerden dat ELP-constructies die met deze methode werden gezuiverd de epidermale groeifactor-receptorbindingsfunctie18 behouden, waarmee wordt benadrukt dat deze methode niet alleen puur ELP-materiaal produceert, maar ook de activiteit van het fusie-eiwitdomein behoudt.
Als verdere demonstratie van het nut van deze methode bij het isoleren van een ELP-enzymfusie, beschrijven we een gedetailleerde organische, oplosmiddelgebaseerde methode om een ELP-Intein-Chorismate mutase 2 (ELP-I-Cm2) constructie te zuiveren (Figuur 3). Deze methode kan nuttig zijn voor snelle zuivering van andere ELP's voor geneesmiddelafgifte en nanomaterialentoepassingen.