Integratieve analyse van gerichte genomische profilering en immuuncelinfiltratie in de prognose van longadenocarcinoom

Xuechun Wang; Wei Luo; Xuehong Gu; Teng Hu; Guping Shi; Jia Jia; Hongmei Qiu; Yangfan Guo

doi:10.3791/69843

Een abonnement op JoVE is vereist om deze inhoud te bekijken. Log in of start vandaag met uw gratis proefperiode.

Onderzoeksartikel

Integratieve analyse van gerichte genomische profilering en immuuncelinfiltratie in de prognose van longadenocarcinoom

2.6K weergaven

⸱

DOI:

10.3791/69843

⸱

14 april 2026

Xuechun Wang^*¹ , Wei Luo^*²^,³ , Xuehong Gu¹ , Teng Hu⁴ , Guping Shi¹ , Jia Jia⁴ , Hongmei Qiu¹ , Yangfan Guo²^,³^,⁵

¹Department of Blood Transfusion, Jiaxing First Hospital, ²Central Laboratory, Yan'an Hospital Affiliated to Kunming Medical University, ³Precision Medicine Center, Kunming Yan'an Hospital, ⁴Shanghai Fujun Genetics Co., Ltd, ⁵Yunnan Key Laboratory of Tumor Immunological Prevention and Control

^* These authors contributed equally

In dit artikel

Samenvatting

Dit protocol maakt de integratie van next-generation sequencing en multicolor immunofluorescentie mogelijk om longadenocarcinoom te profileren. Het heeft als doel de relatie te analyseren tussen genomische heterogeniteit en tumor-infiltrerende immuunceldichtheid. Deze multidimensionale aanpak faciliteert een uitgebreide evaluatie van de tumormicro-omgeving voor postoperatieve prognostische beoordeling.

Samenvatting

De prognose van longadenocarcinoom (LUAD) wordt traditioneel beoordeeld via tumor-node-metastasis (TNM) stadiering, die geen rekening houdt met de immuunstatus van de patiënt. Dit protocol integreert genomische profilering en immuno-microomgevingsanalyse om een meer uitgebreide postoperatieve prognostische evaluatie mogelijk te maken. De methode omvat een retrospectieve analyse van paraffine-ingebedde tumorweefsels met behulp van twee primaire technieken. Ten eerste wordt next-generation sequencing (NGS) uitgevoerd met een aangepast paneel van 37 genen om mutaties in drivergenen en varianten van onzekere betekenis te identificeren. Ten tweede wordt multiplex immunofluorescentie (mIF) gebruikt om markers zoals HLA-DR, CD68, CD163, CD206, PD-L1 en PanCK te targeten. Dit maakt het mogelijk om de ruimtelijke verspreiding en dichtheid van specifieke immuuncelsubpopulaties over verschillende tumorregio's te kwantificeren. Deze geïntegreerde aanpak maakt gelijktijdige beoordeling van genomische heterogeniteit en tumor-infiltrerende immuuncelkenmerken mogelijk. De resulterende gegevens identificeren specifieke combinaties van mutatieprofielen—zoals EGFR-status —en dichtheden van immuuncellen. Deze geïntegreerde combinaties maken het mogelijk hun gezamenlijke impact op de overleving van patiënten te bestuderen en bieden een veelbelovende benadering voor de ontwikkeling van toekomstige prognostische modellen voor longkanker. Dit protocol demonstreert een robuuste methode om de complexe biologische kenmerken van de LUAD-tumormicro-omgeving te karakteriseren.

Inleiding

LUAD is het meest voorkomende subtype longkanker, maar de gemiddelde overlevingskans van 5 jaar blijft laag van ongeveer 15^%. De huidige prognostische evaluatie is voornamelijk gebaseerd op het TNM-stadieringssysteem; deze methode negeert echter vaak de algehele immuunstatus van de patiënt, wat de voorspellende nauwkeurigheid kan beperken. Bewijs suggereert dat zowel genomische heterogeniteit als de tumormicro-omgeving (TME) een cruciale rol spelen in de tumorvorming en ziekteprogressie^van LUAD ^2,3.

In de afgelopen jaren heef....