Het verband tussen leeftijd bij de eerste geslachtsgemeenschap en het risico op hiv-infectie beoordelen met behulp van een twee-steekproef Mendeliaans randomisatiekader

Samenvatting

Deze studie paste Mendeliaanse randomisatie toe om de potentiële associatie tussen leeftijd bij eerste geslachtsgemeenschap en het risico op hiv-infectie te evalueren, waarbij genetische instrumentele variabelen worden gebruikt om confounding te verminderen en causale inferentie te versterken.

Samenvatting

Deze studie paste een twee-steekproef Mendeliaans randomisatiekader toe om de mogelijke relatie te onderzoeken tussen leeftijd bij eerste geslachtsgemeenschap (AFS) en het risico op infectie met het humaan immunodeficiëntievirus (HIV). Samenvattende gegevens van de Genome-Wide Association Study (GWAS) uit Europese populaties werden geanalyseerd, waaronder 214.547 individuen voor AFS en 357 hiv-gevallen met 218.435 controles uit de FinnGen R5-dataset. Onafhankelijke enkel-nucleotidepolymorfismen die significant geassocieerd zijn met AFS werden geselecteerd als instrumentele variabelen na koppelingsdisevenwicht, klontering en instrumentsterktebeoordeling. Causale schattingen werden geëvalueerd met inverse variantieweging (IVW), MR-Egger-regressie, gewogen mediaan, gewogen modus en eenvoudige modus. Cochran's Q-test, MR-Egger intercept-analyse, MR-PRESSO-beoordeling en leave-one-out sensitiviteitsanalyses werden uitgevoerd om heterogeniteit, pleiotropie en robuustheid te evalueren. De IVW-analyse suggereerde dat genetisch voorspelde latere AFS geassocieerd was met een lager risico op hiv-infectie (OR = 0,192, 95% BI = 0,062–0,592, P = 0,004), terwijl eerdere seksuele debuut correspondeerde met een verhoogde hiv-vatbaarheid. Directioneel consistente bevindingen over meerdere Mendeliaanse randomisatiemethoden ondersteunden de stabiliteit van de waargenomen associatie. De bevindingen moeten echter met voorzichtigheid worden geïnterpreteerd, omdat de hiv-uitkomstanalyse gebaseerd was op één dataset met een beperkt aantal hiv-gevallen. Deze resultaten ondersteunen een mogelijke associatie tussen een vroegere seksuele debuut en hiv-vatbaarheid en tonen het nut van Mendeliaanse randomisatie aan voor het onderzoeken van gedragsrisicofactoren die samenhangen met uitkomsten van infectieziekten.

Inleiding

Menselijke voortplantingsgedragingen, waaronder leeftijd bij eerste geslachtsgemeenschap (AFS), aantal seksuele partners en leeftijd bij de eerste bevalling, zijn nauw verbonden met sociale, gedragsmatige en gezondheidsuitkomsten ^1,2. Eerdere studies hebben een trend naar vroegere AFS onder adolescenten^{aangetoond 3}. In het Verenigd Koninkrijk is bijvoorbeeld de mediane leeftijd bij het eerste heteroseksuele geslachtsverkeer ongeveer 17 jaar, en een groeiend deel van de adolescenten meldt een seksueel debuut vóór de leeftijd van¹⁶....

Protocol

Alle oorspronkelijke Genome-Wide Association Study (GWAS) onderzoeken die in deze analyse zijn opgenomen, verkregen schriftelijke geïnformeerde toestemming van deelnemers en kregen goedkeuring van hun respectievelijke institutionele ethische commissies. Omdat de huidige studie gebruikmaakte van openbaar toegankelijke, gedeïdentificeerde GWAS-samenvattende statistieken, was aanvullende goedkeuring van de institutionele beoordelingscommissie niet vereist. De onderzoeksinstrumenten die in dit protocol worden gebruikt, zijn vermeld in de Materiaaloverzicht.

1. Data

Resultaten

De Mendeliaanse randomisatieanalyses (MR) suggereerden een mogelijke associatie tussen genetisch voorspelde leeftijd bij de eerste seksuele gemeenschap (AFS) en het risico op hiv-infectie. De waargenomen associatie bleef richtingend consistent na gevoeligheidsanalyses en uitschietersevaluatie met de MR-PRESSO-benadering. De analyse van inverse variantieweging (IVW) toonde aan dat genetisch voorspelde latere AFS geassocieerd was met een lager risico op hiv-infectie (OR = 0,192, 95% BI = 0.......

Discussie

Deze studie maakte gebruik van openbaar beschikbare GWAS-samenvattende statistieken en paste een twee-steekproef Mendelian randomisatie (MR) kader toe om de mogelijke relatie te evalueren tussen genetisch voorspelde leeftijd bij de eerste geslachtsgemeenschap (AFS) en het risico op hiv-infectie. De bevindingen suggereerden dat genetisch voorspelde eerdere AFS geassocieerd was met een verhoogde hiv-vatbaarheid, wat wijst op een mogelijk omgekeerd verband tussen AFS- en hiv-infectierisico........

Materialen

Lijst van materialen gebruikt in dit artikel

Naam	Bedrijf	Catalogusnummer	Opmerkingen
devtools Pakket	R Foundation for Statistical Computing, Wenen, Oostenrijk	R-pakket	Gebruikt voor het installeren van pakketten, gegevensverwerking en voorbereiding van de Mendeliaanse randomisatie workflow.
FinnGen GWAS-dataset	FinnGen Consortium	N/A	Outcome GWAS-resource gebruikt voor samenvattende statistieken van HIV-infectie.
GWAS-samenvattingsgegevens	UK Biobank Consortium, FinnGen Consortium	Openbare GWAS-datasets	Openbaar toegankelijke GWAS-samenvattingsstatistieken gebruikt voor SNP-extractie en Mendeliaanse randomisatieanalyses.
LDlinkR Pakket	National Cancer Institute (NCI), National Institutes of Health (NIH), VS	R-pakket	Gebruikt voor beoordeling van koppelingsonevenwichtigheid en SNP-validatie.
mRnd Calculator	Web-based tool	https://shiny.cnsgenomics.com/mRnd/	Gebruikt voor berekening van statistische kracht in Mendeliaanse randomisatieanalyse.
MR-PRESSO Pakket	GitHub-repository	N/A	Gebruikt voor beoordeling van pleiotropisme en uitzonderingscorrectie in Mendeliaanse randomisatieanalyse.
R Software	R Foundation for Statistical Computing, Wenen, Oostenrijk	Versie 4.1.0; RRID:SCR_001905	Gebruikt voor statistische analyse en uitvoering van de Mendeliaanse randomisatie workflow.
SNP-gegevens	UK Biobank Consortium, FinnGen Consortium	Openbare SNP-datasets	SNP's gebruikt als instrumentele variabelen voor Mendeliaanse randomisatieanalyse.
TwoSampleMR Pakket	MR-Base-platform	RRID:SCR_018317	Gebruikt voor Mendeliaanse randomisatieanalyse met twee steekproeven, harmonisatie en gevoeligheidstests.
UK Biobank GWAS-dataset	UK Biobank Consortium	N/A	Exposure GWAS-resource gebruikt voor samenvattende statistieken van leeftijd bij eerste seksuele omgang (AFS).