De rekrutering van immuuncellen naar de tumoromgeving (TME) is een belangrijk onderdeel van de immuunregulatie en tumorprogressie. Het bestuderen van de ruimtelijke en temporele relaties tussen immuuncellen en tumorcellen in vivo kan inzicht bieden in interacties binnen de TME. Het visualiseren en kwantificeren van deze interacties in intacte organismen blijft echter uitdagend met conventionele beeldvormings- en histologische benaderingen. Zebravissen vormen een waardevol model voor kankeronderzoek vanwege hun genetische hanteerbaarheid, snelle ontwikkeling en optische transparantie tijdens vroege ontwikkelingsstadia, waardoor visualisatie van fluorescentiegelabelde cellen mogelijk is. in vivoHier presenteren wij een protocol voor het genereren, identificeren, beelden en kwantificeren van immuun- en tumorcellen die differentieel zijn gelabeld met fluorescente markers in een zebravismodel van neuroblastoom. Het protocol omvat het fokken en screenen van samengestelde transgene zebravisjes, live-imaging van larven, de preparatie en beeldvorming van volwassen tumordragende vissen, en de kwantificering van immuuncellen rondom en binnen tumorregio's. Met behulp van transgene reporterlijnen, CD4+ immuuncellen en MYCN-gestuurde neuroblastoomcellen kunnen worden gevisualiseerd en geanalyseerd in verschillende ontwikkelingsstadia. De workflow maakt het mogelijk om de lokalisatie van immuuncellen ten opzichte van tumoren in zowel larvale als volwassen vissen te beoordelen en kan worden gebruikt om de abundantie van immuuncellen in verschillende ziektestadia te vergelijken. Dit protocol biedt een reproduceerbare aanpak voor het imagen en kwantificeren van immuuncellen binnen de TME in vivo met gebruik van zebravis en kan studies naar immuun-tumorinteracties in andere kankermodellen faciliteren.