Name: Zeewater Bemonstering en Collection (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2009-06-17T19:00:00.000+00:00
Duration: 8 min 23 s
Description: Leer zeewaterbemonstering voor marien onderzoek met behulp van go-flow- en kin-waterapparaten. Deze methode ondersteunt analyse van biomassa, nucleïnezuren en celabundantie.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

playerTrialDesktop

We willen graag de Canadese Stichting voor Innovatie, de British Columbia Kennis Ontwikkelingsfonds en de National Sciences and Engineering Research Council (NSERC) van Canada te bedanken voor de ondersteuning van lopende studies op een laag zuurstofgehalte regio&#39;s van kust-en open water van de oceaan. Daarnaast werd DAW gesteund door fellowships van NSERC, Killam en de TULA basis gefinancierd Centrum voor Microbiële diversiteit en evolutie.

Deel 1: Water Collection <ol><li> Diepten worden toegewezen aan elke cast. </li><li> Diepten te bemonsteren en het totale volume te worden verzameld voor de huidige cast worden bepaald. </li><li> Het is ervoor gezorgd dat de Go-Flo en Niskin flessen open zijn, en dat hun kleppen en spie-einden zijn gesloten. </li><li> De CTD is geladen onderkant van de lijn en lager in het water. </li><li> Een fles voor de diepste diepte bemonsterd in gegoten eerste is geladen op de regel na de CTD, het is ervoor gezorgd dat de lijn goed is ingepast in beugel en de schroeven worden aangedraaid. </li><li> Een boodschapper is aan elke fles (met uitzondering van het diepste een) voordat verlagen. </li><li> De lijn wordt verlaagd de afstand tussen de eerste diepte en de volgende, een ander fles wordt dan geladen. Opgemerkt moet worden dat voor diepten waar 20L worden verzameld voor filtratie, een totaal van twee 12L flessen achter elkaar zijn geplaatst ongeveer 0,75 m uit elkaar. </li><li> Als alle flessen op de lijn, is de lijn verlaagd tot de gewenste diepte en 2 minuten worden doorgelaten. </li><li> Een boodschapper is nedergezonden en een paar minuten mogen geven aan dat alle flessen dicht te verzekeren. </li><li> De lijn is reeled in en de flessen worden gelost als ze komen op de rekken. </li><li> Voor dieptes die 20L monsters voor DNA en RNA vereisen, zijn twee Niskin flessen verzameld. Een fles wordt gebruikt om de chemische parameters (zie hieronder) monster, terwijl de andere wordt afgevoerd in de mandfles. RNA is direct afkomstig van de tweede Niskin. De rest van de eerste wordt ook afgevoerd naar de mandfles tot ~ 20L eindvolume te geven. Voor een lage resolutie monsters alleen 1L water is gereserveerd voor filtratie in steriele Nalgene flessen. </li></ol> Deel 2: Gas monstername <ol><li> Als er zuurstof monsters nodig zijn, worden ze eerst verzameld. </li><li> Een stuk van de dunne slang is verbonden met de Niskin / Go-Flo kraan en het andere uiteinde van de slang is geplaatst plek in het glas serum flessen. </li><li> Het serum fles is gespoeld drie keer met het monster water, en overvol, zodat er geen luchtbellen aanwezig zijn. </li><li> 50μl kwik chloride (HgCl 2) worden toegevoegd aan de serum fles op een manier die geen luchtbellen te introduceren in het monster. </li><li> De fles is afgesloten met een rubberen stop en geplooide met een aluminium dop, en wordt vervolgens opgeslagen op ijs in een koeler. </li></ol> Deel 3: Nutrient monstername <ol><li> Een 60 cc spuit is gespoeld met monster water, is een (0,2 micrometer) verbonden in-lijn en wat water wordt geduwd door de Acrodisc. </li><li> Een polyethyleen flesje wordt gespoeld met ~ 10 ml gefilterd water 3 keer (schudden fles bij het spoelen). </li><li> Gefiltreerde monster water wordt toegevoegd aan de flessen, ongeveer ¾ vol. </li><li> Het monster wordt opgeslagen op ijs in de koeler. </li></ol> Deel 4: Ammoniak monstername <ol><li> Monsterbuizen worden gespoeld met monster water. </li><li> Monsterbuizen zijn volledig gevuld met monster water. </li><li> 5 ml van het monster water worden genomen met behulp van een 10 ml pipet, de rest van het water in de buis is verwijderd en de 5 ml pipet in de top worden vervangen in het monster buis. </li><li> 7.5ml van ammonium werken reagens wordt toegevoegd aan elke buis een keer monsters van alle diepten zijn verzameld. </li></ol> Deel 5: Voorbeeld collectie voor cel-telling <ol><li> Een pre-label 50 ml Falcon buis met 5,4 ml 37% formaldehyde is gevuld tot de top voor een uiteindelijke concentratie van 4%. Er wordt op gelet niet te morsen. </li></ol> Deel 6: Monsterneming voor zwavelwaterstof metingen <ol><li> Een pre-label 50 ml Falcon buis met 20% zink-acetaat (Zn (O 2 CCH 3) 2) is gevuld tot de top. Er wordt op gelet niet te morsen. </li></ol> Deel 7: Kleine volume collectie voor biomassa-concentratie <ol><li> 1-liter flessen zijn gevuld tot de top. </li></ol> Deel 8: Groot volume collectie voor biomassa-concentratie <ol><li> 20-liter jerrycans gevuld zijn. </li></ol> Deel 9: representatieve resultaten Het uiteindelijke resultaat van zeewater bemonstering resulteert in ongeveer 12 opgeloste zuurstof monsters, 32-48 gasmonsters, 16 voedingsstoffen samples, 32 ammonium monsters, 16 waterstofsulfide monsters, 16 monsters voor celtellingen, 6 20-liter Flessen, 16 1-liter flessen en 4 Sterivex 0.22μm filters met daarin microbiële biomassa geconserveerd met RNA later.

<ol><li>Cline, J. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Spectrophotometric+determination+of+hydrogen+sulfide+in+natural+waters%5BTitle%5D)+AND+%22Limnology+%26+Oceanography%22%5BJournal%5D)">Spectrophotometric determination of hydrogen sulfide in natural waters.</a> Limnology & Oceanography. 14, 454-458 (1969).</li>
<li>Holmes, R. M., Aminot, A., Kerouel, R., Hooker, B. A., Peterson, B. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+simple+and+precise+method+for+measuring+ammonium+in+marine+and+freshwater+ecosystems%5BTitle%5D)+AND+%22Canadian+Journal+of+fisheries+and+Aquatic+Science%22%5BJournal%5D)">A simple and precise method for measuring ammonium in marine and freshwater ecosystems.</a> Canadian Journal of fisheries and Aquatic Science. 56, 1801-1808 (1999).</li>
</ol>

De auteurs hebben niets te melden.

Over het algemeen is er een groot deel van de voorbereiding en planning die nodig zijn voor dit type van bemonstering, zodat de begroting 2 dagen voor de reis naar achteraf dingen in orde zijn en een dag voor het reinigen van alles op. In het algemeen, laat zout water in contact komt met de peristaltische pomp of in de aluminium Zarges box gebruikt om het veld materiaal te vervoeren. Behandel het materiaal met respect en het zal goed presteren voor een lange tijd te komen.

<table><tbody><tr><td>20L Canisters</td><td></td><td>Fisher Scientific</td><td>02-960-15</td><td></td></tr><tr><td>3/8&quot; Tygon</td><td></td><td>Cole-Parmer</td><td>06429-36</td><td></td></tr><tr><td>Sterivex-filters</td><td></td><td>Fisher Scientific</td><td>SVG010RS</td><td></td></tr><tr><td>Behuizing van de voorfilterunit</td><td></td><td>AMD</td><td>501200</td><td></td></tr><tr><td>Luer-koppeling</td><td></td><td>Cole-Parmer</td><td>31507-27</td><td></td></tr><tr><td>1/4&quot; Tygon-slangen</td><td></td><td>Cole-Parmer</td><td>06429-24</td><td></td></tr><tr><td>1/4&quot; Tygon-slangen</td><td></td><td>Cole-Parmer</td><td>06429-24</td><td></td></tr><tr><td>1/4&quot; Tygon-slangen</td><td></td><td>Cole-Parmer</td><td>06429-24</td><td></td></tr><tr><td>Plastic buizen van 50 ml</td><td></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>Glazen serumflesjes</td><td></td><td></td><td></td><td>Collectie van glasmonsters</td></tr><tr><td>Septa en aluminium doppen voor glazen serumflesjes</td><td></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>Handcrimptang</td><td></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>20-200 µl pipette en tips</td><td></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>Glazen buisjes</td><td></td><td></td><td></td><td>Monstername van ammonium</td></tr><tr><td>Plastic flesjes van 30 ml</td><td></td><td></td><td></td><td>Nutriëntenverzameling</td></tr><tr><td>Acrodisc-filters</td><td></td><td>EMD Millipore</td><td></td><td></td></tr><tr><td>5 ml buisjes</td><td></td><td></td><td></td><td>Afname van nitrietmonsters</td></tr><tr><td>37% Formaldehyde</td><td>Reagens</td><td></td><td></td><td>Voor celtellingmonsters</td></tr><tr><td>20% zinkacetaat</td><td>Reagens</td><td></td><td></td><td>Voor sulfide-monsters</td></tr><tr><td>Kwik(II)chloride</td><td>Reagens</td><td></td><td></td><td>Voor gasmonsters</td></tr><tr><td>milliQ-water</td><td>Reagens</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>Werkreagens voor ammonium</td><td>Reagens</td><td></td><td></td><td>boraatbuffer, natriumsulfiet, orthoftalaldehyde</td></tr><tr><td>Sulfanilamide</td><td>Reagens</td><td></td><td></td><td>5 g in 450 ml water en 50 ml HCl</td></tr><tr><td>N-(1-naftyletyleendiamine-dihydrochloride-oplossing</td><td>Reagens</td><td></td><td></td><td>0,5 g in 500 ml water</td></tr></tbody></table>

zeewater bemonstering en collection

Seawater Sampling and Collection

Deze video documenten methoden voor het verzamelen van kust-zee watermonsters en de behandeling daarvan voor verschillende downstream-toepassingen, waaronder biomassa-concentratie, nucleïnezuur zuivering, cel overvloed, nutriënten-en trace gas analyses. Voor de demonstratie van vandaag monsters werden verzameld vanaf het dek van de HMS John Strickland die actief zijn in Saanich Inlet. Een A-frame Derrick, met een multi-purpose lier en kabel-systeem wordt gebruikt in combinatie met Niskin of Go-Flo flessen water sampling. Geleidbaarheid, temperatuur en diepte (CTD) sensoren worden ook gebruikt om de onderliggende watermassa monster. Te minimaliseren outgassing, zijn sporen gas monsters eerst verzameld. Vervolgens worden voedingsstoffen, water chemie, en de cellen bepaald. Tot slot worden de wateren verzameld voor biomassa filtratie. De set-up en het verzamelen voor een enkele cast is ~ 1,5 uur bij een maximale diepte van 215 meter. Daarom is een totaal van zes uur over het algemeen nodig is om de collectie serie hier beschreven compleet.

Deze video documenten methoden voor het verzamelen van kust-zee watermonsters en de behandeling daarvan voor verschillende downstream-toepassingen, waaronder biomassa-concentratie, nucleïnezuur zuivering, cel overvloed, nutriënten-en trace gas analyses.

Zeewater Bemonstering en Collection

Deze video documenteert methoden voor het verzamelen van kustwatermonsters en het verwerken ervan voor diverse downstream-toepassingen, waaronder biomassa ...

Hallo, ik ben Elena Kova van het laboratorium van Stephen Hallam van de afdeling Microbiologie en Immunologie aan de University of British Columbia. Vandaag laten we u een procedure zien voor het verzamelen van zeewater voor fysieke, chemische en biologische analyse. We gebruiken deze procedure in ons laboratorium om oceanografische parameters van mariene wateren te bestuderen.Laten we beginnen. Eerst worden het aantal worpen en de dieptes per worp toegewezen, waarna de te bemonsteren dieptes en het totale volume dat voor de huidige worp moet worden verzameld, worden bepaald. Zorg ervoor dat de Go-Flow en Kin waterbemonsteringsapparaten in de open stand staan en dat alle kleppen en kranen gesloten zijn.Bevestig de CTD aan de voet van de lijn en laat deze in het water zakken tot de grootste diepte van het profiel. Bevestig direct onder de CTD een bemonsteringsapparaat aan de lijn. Zorg ervoor dat de lijn correct in de beugel van het apparaat is geplaatst en dat de schroeven zijn vastgedraaid.Bevestig een verzwaarde messenger aan elk apparaat, behalve aan dat voor de grootste bemonsteringsdiepte, voordat u deze in het water laat zakken. Laat de lijn zakken over de afstand tussen de e

Research

JoVE Journal

Biology

Biologie

Deze video documenten groot volume (≥ 20 L) filtratie van microbiële biomassa, variërend van 0.22μm en 2.7μm in diameter, uit het water kolom.

Grote Volume (20L +) Filtratie van Coastal Zeewater Monsters

Deze video documenten klein volume (~ 1 L) filtratie van microbiële biomassa uit de waterkolom.

Klein volume (1-3L) Filtratie van Coastal Zeewater Monsters

Source: Villela, H. D. M., et al. Prospecting Microbial Strains for Bioremediation and Probiotics Development for Metaorganism Research and Preservation. J. Vis. Exp. (2019)This video demonstrates the selective isolation of oil-degrading marine bacteria by enriching seawater samples on oil-based media, enabling the recovery of pure strains with potential applications in crude oil bioremediation and environmental cleanup.

Selective Enrichment and Isolation of Oil-Degrading Marine Bacteria from Seawater Samples

Hier presenteren we een uitgebreid protocol om de beschikbaarheid van organische en anorganische voedingsstoffen en de abundantie en structuur van microbiële en virale gemeenschappen in afgelegen mariene omgevingen te beoordelen.

Het ontrafelen van de Unseen Spelers in de Oceaan - A Field Guide to Water chemie en Mariene Microbiologie

Speciale zorg met behulp van "schone technieken" is vereist om watermonsters correct te verzamelen en te verwerken voor sporenmetaalstudies in aquatische omgevingen. Er wordt een protocol gepresenteerd voor bemonstering, verwerking en analytische procedures met als doel betrouwbare gegevens voor milieubewaking en resultaten met hoge gevoeligheid voor gedetailleerde sporenmetaalstudies te verkrijgen.

Clean monsterneming en analyse van de rivier en estuariene Waters voor Trace Metal Studies

Met de vooruitgang van de technologie en de stijging van de verwachtingen van de eindgebruiker, de noodzaak en het gebruik van hogere temporele resolutie gegevens voor verontreinigende lading schatting toegenomen. Dit protocol beschrijft een methode voor het continu in situ Waterkwaliteit monitoring hogere temporele resolutie om gegevens te verkrijgen voor op de hoogte van de water resource managementbeslissingen.

Continu Instream bewaking van voedingsstoffen en Sediment in agrarische waterscheidingen

Plankton en zwevende deeltjes een belangrijke rol spelen in de biogeochemische cycli in de Oceaan. Hier bieden we een Ultra-Clean, lage stress-methode voor het verzamelen van verschillende maten van deeltjes en plankton op zee met de mogelijkheid van het verwerken van grote hoeveelheden zeewater.

Een Ultra-Clean gelaagde apparaat voor het verzamelen van grootte gefractioneerde mariene Plankton en zwevende deeltjes

Meeste microplastic onderzoek tot op heden heeft plaatsgevonden in mariene systemen waar gesuspendeerde vaste niveaus relatief laag zijn. Focus verschuift nu naar zoetwatersystemen, die over een hoge sediment ladingen en zwevend puin beschikken kunnen. Dit protocol adressen verzamelen en analyseren van microplastic monsters van aquatische milieus waarin hoge gesuspendeerde vaste lasten.

Bemonstering, sorteren en karakteriseren van Microplastics in aquatische milieus met hoge zwevende sedimenten ladingen en grote zwevend puin

Hier presenteren we een nieuw protocol om marien eDNA op te halen door het verzamelen en filteren van zeewatermonsters van operationele veerboten en andere commerciële schepen.

Het drijvende laboratorium: standaard operationele procedure voor het verzamelen en filteren van zeewatermonsters van operationele veerboten voor milieu-DNA-analyse

Hier beschrijven we methoden voor bemonstering uit de eufotische zones van mariene en zoetwaterecosystemen om cyanofagen (en hun gastheren) te isoleren en post-bemonsteringsprocessen die afzonderlijke genotypen verrijken en de dynamiek van virus-gastheerinteractie karakteriseren.

Milieubemonstering van fotosynthetische microben en hun virussen: van veld tot laboratorium

Dit protocol beschrijft een gestandaardiseerde workflow voor het verzamelen van ececa DNA (eDNA)-monsters van walvisobservatievaartuigen. De haalbaarheid voor onderzoekers en getrainde burgerwetenschappers wordt vooropgesteld, terwijl omgevingsomstandigheden, filtratietijd, troebelheid en logistiek aan boord de praktische grenzen van de toepassing bepalen.

Milieu-DNA-monsters van walviskijkvaartuigen voor walvisachtige monitoring

Leer zeewaterbemonstering voor marien onderzoek met behulp van go-flow- en kin-waterapparaten. Deze methode ondersteunt analyse van biomassa, nucleïnezuren en celabundantie.

Zeewater Bemonstering en Collection

Meer video's verkennen