Name: Het gebruik van kunstmatige Sputum Middelgrote tot antibiotica werkzaamheid te testen tegen Pseudomonas aeruginosa In Voorwaarden relevanter voor de Cystic Fibrosis Lung (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2012-06-05T12:00:00.000+00:00
Duration: 7 min 46 s
Description: Leer hoe u antibiotica-effectiviteit test tegen Pseudomonas aeruginosa-biofilmen met kunstmatig sputummedium. Deze methode bootst cystic fibrosis-longomstandigheden na voor nauwkeurigere resistentiebepaling.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

playerTrialDesktop

Wij erkennen de steun van het Verenigd Koninkrijk Nationaal Instituut voor Gezondheidsonderzoek, de Dr Hadwen Trust for Humane Research, toonaangevende medische van het Verenigd Koninkrijk onderzoek liefdadigheidsinstelling die uitsluitend niet-dierlijke onderzoekstechnieken ter vervanging van dierproeven, en de Wellcome Trust (Grant 089215). We hebben ook erkennen Novartis Pharmaceuticals Ltd Verenigd Koninkrijk (onbeperkte educatieve subsidie).

1. Voorbereiding van Kunstmatige Sputum Medium (ASM) <ol><li> Voeg 4 g DNA van vis sperma 250 ml steriel water langzaam over een periode van verschillende uren. De DNA duurt verscheidene uren volledig oplossen en onmiddellijk kan worden bij kamertemperatuur geroerd. </li><li> Voeg 5 g mucine van varkens maag (type II) langzaam naar 250 ml steriel water tot de mucine volledig is opgelost. De oplossing kan een nacht te roeren bij 4 ° C. </li><li> Los 0,25 g per essentiële en niet-essentiële L-aminozuur, met uitzondering van L-tyrosine en L-cysteïne, in 100 ml steriel water. Los 0,25 g L-cysteïne in 25 ml 0,5 M kaliumhydroxide (M r 56,11 g / mol) en 0,25 g L-tyrosine in 25 ml steriel water. </li><li> Los 5,9 mg diethyleentriaminepenta-azijnzuur (DTPA), 5 g NaCl en 2,2 g KCl in 100 ml steriel water. </li><li> Meng de DNA mucine, L-aminozuren, DTPA, NaCl en KCl in een fles van 1 liter. </li><li> Voeg 5 ml eigeel emulsion en vullen tot ongeveer 850 ml met steriel water. </li><li> Pas de pH tot 6,9 met 1 M Tris (pH 8,5; M r 121,14) toe en breng het volume op 1 liter met steriel water. </li><li> Steriliseer de ASM door middel van filtratie met behulp van een Vacuubrand ME 2 membraan vacuümpomp en Millipore Steritop filter units met een porie en nek afmeting van 0,22 pm en 45 mm, respectievelijk. Elke Steritop filter unit kan onmiddellijk worden hergebruikt tot drie keer, maar de filters moeten twee keer worden gespoeld met steriel water voor hergebruik. Het filtratieproces is langzaam en kan worden uitgevoerd gedurende 2 dagen. Andere versies van ASM ontwikkeld die gebruik maken van de toevoeging van antibiotica in plaats van filtratie 11 echter, als gevolg van mogelijke interacties tussen geneesmiddelen, raden wij de methode voor deze specifieke toepassing. </li><li> Ongefilterde en gefiltreerd ASM worden bewaard bij 4 ° C in het donker. Het gebruik van vers ASM wordt echter aanbevolen kan worden gehouden onder deze omstandigheden maximaal een maand. </li&gt; </ol> 2. Bepaling van de Planktonische Wintereik Cell Minimum Metabolic remmende concentratie (PSMIC) <ol><li> Om de minimale metabole remmende concentratie (PSMIC) waarden voor 15 planktonically gegroeid P. vast te stellen aeruginosa isolaten, de microverdunningsplaten methode moet worden uitgevoerd, zoals beschreven in de richtlijnen van de British Society for Antimicrobial Chemotherapie BSAC 12. De keuze antibioticum, in dit geval tobramycine sulfaat wordt serieel verdund in Luria-Bertani (LB) medium in een 96-wells microtiterplaat met een breed scala van antibioticaconcentraties voorzien. </li><li> Verdun &#39;s nachts culturen van P. aeruginosa in LB een OD 600 0,05 (± 0,01) en voeg 100 ul volume aan de putjes van de 96-well microtiter plaat met 100 ul van de serieel verdunde antibioticum. In dit geval, de eindconcentraties van tobramycine sulfaat varieerde tussen 512 tot 0,5 ug / ml. Acht herhalingen van elke ANTIBiotic concentratie moet worden uitgevoerd. </li><li> Putjes voor negatieve controle voor elk isolaat moeten worden opgezet, waarin geen antibioticum wordt toegevoegd. Ook moet acht putjes bestaan ​​LB gebruikt als blanco stroomafwaarts (sectie 2.6). </li><li> Incubeer de 96-well microtiter platen 1-2 dagen bij 37 ° C zonder schudden onder aërobe en Microaërofiele (5% O2, 10% CO2 en 85% N2) omstandigheden. Microaërofiele voorwaarden wordt verkregen met behulp van CampyGen gas generatie verpakkingen in grote anaerobe pot. </li><li> Na incubatie wordt bacteriële groei bepaald door de absorptie van de bacteriecultuur in elk putje met een golflengte van 600 nm met een Omega Fluostar microplaat lezer en de MARS Gegevensanalyse Software. </li><li> Absorptie van antibiotica behandelde planktonische culturen (A antibiotica behandeld planktonische cellen) en absorptie van de negatieve controles (A negatieve controle) moet worden gecorrigeerd door af te trekkenion van de achtergrond extinctie van de putjes met LB alleen (A blanco). Het percentage remming van de levensvatbaarheid wordt vervolgens berekend als (gemiddeld een antibioticum behandeld planktonische cellen /: een negatieve controle) x 100%. De PSMIC 90 wordt gedefinieerd als de concentratie die antibioticum 90% remming van planktonische bacteriële groei. </li><li> Om bacteriële leefbaarheid bepalen na behandeling met het antibioticum keuze 10 ul 0,02% (v / v) resazurin (opgelost in gedestilleerd water) toegevoegd aan elk putje en de platen geïncubeerd onder aerobe omstandigheden voor 1-2 uur bij 37 ° C onder schudden bij 150 rpm. Levensvatbare cellen vermindert de blauwe resazurin kleurstof aan de roze fluorescerende resorufin vorm. </li><li> Na incubatie met resazurin, toezicht houden op de fluorescentie van elk putje met een golflengte van 540 nm en een emissie golflengte van 590 nm in een Fluostar Omega microplaat lezer. De gegevens worden geanalyseerd zoals beschreven islaag. </li></ol> 3. Bepaling van de Biofilm Wintereik Cell Minimaal Remmende Concentratie (BSMIC) <ol><li> Overnachting culturen van P. aeruginosa (in dit geval 15 isolaten van P. aeruginosa worden) worden verdund in LB met een OD van 0,05 600 (± 0,01) en verder verdund 1:100 in verse ASM (totaal volume 1,8 ml). </li><li> De verdunde cultures (1,8 ml) worden toegevoegd aan elk putje van een 24-wells weefselkweekplaten behandeld plaat. Drie putjes ASM bestaan ​​voor gebruik als een blanco stroomafwaarts analyse (punt 3.9). </li><li> Zet de 24-well platen met laboratorium parafilm en incubeer 3 dagen onder aërobe en Microaërofiele omstandigheden bij 37 ° C onder schudden bij 75 rpm. Microaërofiele voorwaarden dienen te worden verkregen met behulp van CampyGen gas generatie verpakkingen in grote anaerobe pot. </li><li> Verdun het antibioticum keuze, in dit geval tobramycine sulfaat, een passende concentratiebereik voorzien in versASM. In dit geval eindconcentraties varieerde 512-1 ug / ml. Voeg elke concentratie van het antibioticum, in hoeveelheden van 200 pi, de geschikte putjes van platen met 24 putjes. Vier herhalingen van elke antibiotica concentratie moet worden uitgevoerd. Biofilms niet blootgesteld aan de antibiotische keuze werden gebruikt als negatieve controle. </li><li> Zet de 24-well platen met laboratorium parafilm en incubeer onder aërobe en Microaërofiele voorwaarden voor een verdere 24 uur bij 37 ° C onder schudden bij 75 rpm. </li><li> Na incubatie in de aanwezigheid van het antibioticum keuze, kan het bacteriële biofilms met 100 ul van 100 mg / ml cellulase (verdund in 0,05 M citraatbuffer [9,6 g / l Citrate.H 2 0 in water en pH 4,6 met NaOH] ) en incubeer de 24-well platen onder aërobe omstandigheden bij 37 ° C onder schudden bij 150 rpm gedurende 1 uur. Indien nodig, kunnen biofilms verder worden verstoord door het manueel pipetteren in dit stadium. </li><li> Om de metabolische activiteiten te bepalenvan de bacteriecellen vrijkomt uit de verstoord biofilm, 100 ul 0.02% (v / v) resazurin (opgelost in gedestilleerd water) worden toegevoegd aan elk putje van de 24 putjes en geïncubeerd voor 1-2 uur bij 37 ° C onder schudden bij 150 rpm. </li><li> Na incubatie met resazurin, het meten van de fluorescentie van elk putje met een golflengte van 540 nm en een emissie golflengte van 590 nm in een Fluostar Omega microplaat lezer en de MARS data analyse software. </li><li> Fluorescentie van het antibioticum behandelde biofilms (F antibiotica behandelde biofilms) en fluorescentie van de negatieve controles (F negatieve controle) wordt gecorrigeerd door aftrekking van de achtergrond fluorescentie verkregen uit de putjes die ASM alleen (F blanco). Het percentage remming van de levensvatbaarheid wordt vervolgens berekend als (gemiddelde van F antibiotica behandeld biofilms / gemiddelde F negatieve controle) x 100%. De BSMIC 90 wordt gedefinieerd als de antibiotic concentratie die 90% remming van de metabole activiteit. </li></ol> 4. Representatieve resultaten ASM biofilmvorming kan in kleine (2 ml) en de toevoeging biofilms volledig gevormd binnen de 3 dagen (figuur 1A). Dit kan worden aangetoond door streng pipetteren de biofilm, dat moet moeilijk te verstoren. De microkolonies zijn vergelijkbaar met die gekweekt in grotere hoeveelheden 4 (figuur 1b). Figuur 2 grote verschillen tussen cellen planktonically en in een biofilm gekweekt zoals gedetecteerd door elektronenmicroscopische afbeelding analyse. Biofilm culturen duidelijk aanzienlijke niveaus van extracellulaire matrix rondom de cellen en de individuele structuren binnen de biofilm zijn moeilijk te identificeren. Verschillende studies suggereren dat de biofilm levensstijl kan antimicrobiële gevoeligheid 13, 14 beïnvloeden. De kleine schaal ASM assay kan worden zonnepaneel zelfsrmine de BSMIC van meerdere antibiotica meerdere isolaten tegelijk. De werkstroom van de test is in figuur 3. Het effect van antibiotica op de bacteriële levensvatbaarheid van de cellen kan worden gemeten met behulp van de resazurin test. Antibiotica, in dit geval tobramycine, worden toegevoegd aan de bekende biofilm en gedurende 24 uur. Hierna wordt de biofilm wordt verstoord en resazurin wordt toegevoegd. Metabolisch actieve cellen kan de kleurstof resazurin resulteert in een kleurverandering van blauw (resazurin) naar roze (resorufin) 15. Figuur 4A toont een voorbeeld assay waarin P. aeruginosa werd geïncubeerd met verschillende concentraties tobramycine voor biofilm verstoring en toevoeging van resazurin in een microtiterplaat. De blauwe niet-fluorescerende kleur geeft aan niet-levensvatbare cellen, terwijl levensvatbare cellen de kleurstof te reduceren tot de roze tl-vorm, resorufin. De SMIC kan dan worden berekend door het omzetten van fluorescentie in percentageresterende bacteriële leefbaarheid. Figuur 4B toont de verandering in% levensvatbaarheid bij toenemende tobramycine. 10% levensvatbaarheid werd gekozen als een cut-off om het minimumloon verdienen 90 te berekenen. Onder aërobe omstandigheden, de tobramycine SMIC 90 waarden zijn hoger voor de cellen gekweekt als een biofilm dan die van planktonische culturen. Tabel 1 toont de variatie in PSMIC 90 en 90 BSMIC alle geteste stammen. Uit tabel 2 blijkt dat onder aërobe omstandigheden een dramatische toename in resistentie tegen tobramycine (2&gt; 32-voudige toename in SMIC) werd waargenomen voor de meeste isolaten wanneer gekweekt in ASM (biofilm) vergeleken met LB (plankton mode). Bovendien biofilms gekweekt onder omstandigheden Microaërofiele vertoonden een verhoogd SMIC tussen 2 en&gt; 128-voudige opzichte van biofilm gekweekt onder aërobe omstandigheden. <img alt="Figuur 1" src="/files/ftp_upload/3857/3857fig1.jpg" /> Figuur1. Biofilmvorming van P. aeruginosa in ASM P. aeruginosa stam PAO1 vormt macroscopisch zichtbaar pollen (microkolonies) wanneer ze groeien in ASM. A, vorming van biofilm in 30 ml ASM culturen (grootschalige) na 7 dagen de groei in de schroefdop glas Duran kolven. B, biofilmvorming in 2 ml ASM culturen ( kleinschalige) na 3 dagen groei in 24-well polystyreenplaten. <img alt="Figuur 2" src="/files/ftp_upload/3857/3857fig2.jpg" /> Figuur 2. TEM microfoto van ASM biofilms A / C TEM microscoop (x; 27.000) van PAO1 gegroeid planktonically en in ASM, respectievelijk, B / D TEM microfoto (x57, 000) van PAO1grown planktonische en in ASM, respectievelijk. Planktonically gegroeid bacteriën werden gedurende de nacht gekweekt in LB-bouillon. Biofilms werden gekweekt gedurende 7 dagen in 30 ml ASM culturen. Zwarte pijlen verwijzen naar cellen in de biofilm en de sterren verwijzen naar extracellulaire ruimtes. Schaal bars = 1urn. <img alt="Figuur 3" src="/files/ftp_upload/3857/3857fig3.jpg" /> Figuur 3. Workflow van de ASM biofilm antimicrobiële gevoeligheid test. <img alt="Figuur 4" src="/files/ftp_upload/3857/3857fig4.jpg" /> Figuur 4. Gebruik van resazurin voor het bepalen van antibiotica gevoeligheid Bacteriële cellen werden geïncubeerd met verschillende concentraties van het antibioticum de resterende metabolische activiteit werd bepaald met behulp resazurin. A De blauwe niet fluorescerende geoxideerde vorm van resazurin geeft niet-levensvatbare cellen en gereduceerd door metabolische actieve cellen tot roze fluorescerende resorufin. B, wordt fluorescentie-intensiteit omgezet in percentage van de resterende bacteriële levensvatbaarheid. 10% levensvatbaarheid werd gekozen als cut-off om de MSMIC90 te berekenen. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/3857/3857fig4large.jpg" target="_blank">Klik hier om lar te bekijken</a>ger figuur. </span&gt; <table border="1"><tbody><tr><td rowspan="2"> Stammen </td><td colspan="2"> PSMIC 90 (ug / ml) 1 </td><td colspan="2"> BSMIC 90 (ug / ml) 1 </td></tr><tr><td> Aerobic </td><td> Microaërofiele 2 </td><td> Aerobic </td><td> Microaërofiele 2 </td></tr><tr><td> PAO1 </td><td> 4 </td><td> 4 </td><td> 8 </td><td> &gt; 512 </td></tr><tr><td colspan="5"> Liverpool Epidemic Strain (LES) isoleert </td></tr><tr><td> LESB58 21 </td><td> 8 </td><td> 64 </td><td> 64 </td><td> 128 </td></tr><tr><td> LES400 22 </td><td> 32 </td><td> 128 </td><td> 8 </td><td> 256 </td></tr><tr><td> LESB25 </td><td> 16 </td><td> 32 </td><td> 256 </td><td> 512 </td></tr><tr><td> LESB55 </td><td> 16 </td><td> 64 </td><td> 64 </td><td> &gt; 512 </td></tr><tr><td> LESB64 </td><td> 16 </td><td> 64 </td><td> &gt; 512 </td><td> &gt; 512 </td></tr><tr><td> LES431 22 </td><td> 4 </td><td> 8 </td><td> 32 </td><td> &gt; 512 </td></tr><tr><td> LESB49 </td><td> 16 </td><td> 64 </td><td> 64 </td><td> 256 </td></tr><tr><td> LES109 </td><td> 32 </td><td> 128 </td><td> 32 </td><td> &gt; 512 </td></tr><tr><td colspan="5"> Niet-LES isolaten </td></tr><tr><td> 49461 </td><td> 16 </td><td> 32 </td><td> 16 </td><td> &gt; 512 </td></tr><tr><td> 59032 </td><td> 0,5 </td><td> 2 </td><td> 4 </td><td> &gt; 512 </td></tr><tr><td> 59073 </td><td> &gt; 512 </td><td> &gt; 512 </td><td> &gt; 512 </td><td> &gt; 512 </td></tr><tr><td> 59076 </td><td> 16 </td><td> 32 </td><td> 32 </td><td> &gt; 512 &lt;/ Td&gt; </tr><tr><td> 27 </td><td> 8 </td><td> 16 </td><td> 4 </td><td> &gt; 512 </td></tr><tr><td> 45 </td><td> 16 </td><td> 32 </td><td> 4 </td><td> &gt; 512 </td></tr></tbody></table> Tabel 1. Gevoeligheid van P. aeruginosa voor tobramycine. 1 Voor de bepaling van PSMICs en BSMICs tobramycine werd gebruikt in 2-voudige seriële verdunningen variërend 512 tot 0,5 pg / ml (n = 8 voor elke concentratie) en 512-1 pg / ml (n = 4 voor elk concentratie), respectievelijk; PSMICs werden bepaald met behulp van de standaard microverdunningsplaten methode 1. 2 Microaërofiele omstandigheden waren 5% O 2, 10% CO2 en 85% N2. <table border="1"><tbody><tr><td rowspan="2"> Spannen </td><td colspan="4"> PSMIC 90 / BSMIC 90 voudige verandering 1 </td></tr><tr><td> PSMIC aërobe → PSMIC Microaërofiele </td><td> BSMIC aërobe → BSMIC Microaërofiele </td><td> PSMIC aërobe → BSMIC aërobe </td><td> PSMIC Microaërofiele → BSMIC Microaërofiele </td></tr><tr><td> PAO1 </td><td> 0 </td><td> &gt; 64 </td><td> 2 </td><td> 128 </td></tr><tr><td colspan="5"> LES isoleert </td></tr><tr><td> LESB58 </td><td> 8 </td><td> 2 </td><td> 8 </td><td> 2 </td></tr><tr><td> LES400 </td><td> 4 </td><td> 32 </td><td> 0,25 </td><td> 2 </td></tr><tr><td> LESB25 </td><td> 2 </td><td> 2 </td><td> 16 </td><td> 16 </td></tr><tr><td> LESB55 </td><td> 4 </td><td> &gt; 8 </td&gt; <td> 4 </td><td> &gt; 8 </td></tr><tr><td> LESB64 </td><td> 4 </td><td> ND </td><td> &gt; 32 </td><td> &gt; 8 </td></tr><tr><td> LES431 </td><td> 2 </td><td> &gt; 16 </td><td> 8 </td><td> &gt; 64 </td></tr><tr><td> LESB49 </td><td> 4 </td><td> 4 </td><td> 4 </td><td> 4 </td></tr><tr><td> LES109 </td><td> 4 </td><td> 16 </td><td> 0 </td><td> &gt; 4 </td></tr><tr><td colspan="5"> Niet-LES isolaten </td></tr><tr><td> 49461 </td><td> 2 </td><td> &gt; 32 </td><td> 0 </td><td> &gt; 16 </td></tr><tr><td> 59032 </td><td> 4 </td><td> &gt; 128 </td><td> 8 </td><td> &gt; 256 </td></tr><tr><td> 59073 </td><td> ND </td><td> ND </td><td> ND </td><td> ND </td></tr><tr><td> 59076 </td><td> 2 </td><td> &gt; 16 </td&gt; <td> 2 </td><td> &gt; 16 </td></tr><tr><td> 27 </td><td> 2 </td><td> &gt; 128 </td><td> 0,5 </td><td> &gt; 32 </td></tr><tr><td> 45 </td><td> 2 </td><td> &gt; 128 </td><td> 0,25 </td><td> &gt; 16 </td></tr></tbody></table> Tabel 2. Vouw de verandering van PSMICs en BSMICs voor tobramycine. 1 ND, niet bepaald; waarden in vet geven aan SMIC fold change van&gt; 10.

<ol><li>Andrews, J. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((BSAC+standardized+disc+susceptibility+testing+method+%28version+8%29%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Antimicrob.+Chemother%22%5BJournal%5D)">BSAC standardized disc susceptibility testing method (version 8).</a> J. Antimicrob. Chemother. 64, 454-489 (2009).</li>
<li>Worlitzsch, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Effects+of+reduced+mucus+oxygen+concentration+in+airway+Pseudomonas+infections+of+cystic+fibrosis+patients%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Clin.+Invest%22%5BJournal%5D)">Effects of reduced mucus oxygen concentration in airway Pseudomonas infections of cystic fibrosis patients.</a> J. Clin. Invest. 109, 317-325 (2002).</li>
<li>Smith, A. L., Fiel, S. B., Mayer-Hamblett, N., Ramsey, B., Burns, J. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Susceptibility+testing+of+Pseudomonas+aeruginosa+isolates+and+clinical+response+to+parenteral+antibiotic+administration%3A+lack+of+association+in+cystic+fibrosis%5BTitle%5D)+AND+%22Chest%22%5BJournal%5D)">Susceptibility testing of Pseudomonas aeruginosa isolates and clinical response to parenteral antibiotic administration: lack of association in cystic fibrosis.</a> Chest. 123, 1495-1502 (2003).</li>
<li>Sriramulu, D. D., Lunsdorf, H., Lam, J. S., Romling, U. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Microcolony+formation%3A+a+novel+biofilm+model+of+Pseudomonas+aeruginosa+for+the+cystic+fibrosis+lung%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Med.+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Microcolony formation: a novel biofilm model of Pseudomonas aeruginosa for the cystic fibrosis lung.</a> J. Med. Microbiol. 54, 667-676 (2005).</li>
<li>Garbe, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Characterization+of+JG024%2C+a+pseudomonas+aeruginosa+PB1-like+broad+host+range+phage+under+simulated+infection+conditions%5BTitle%5D)+AND+%22BMC+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Characterization of JG024, a pseudomonas aeruginosa PB1-like broad host range phage under simulated infection conditions.</a> BMC Microbiol. 10, 301(2010).</li>
<li>Naughton, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Pseudomonas+aeruginosa+AES-1+exhibits+increased+virulence+gene+expression+during+chronic+infection+of+cystic+fibrosis+lung%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+One%22%5BJournal%5D)">Pseudomonas aeruginosa AES-1 exhibits increased virulence gene expression during chronic infection of cystic fibrosis lung.</a> PLoS One. 6, e24526(2011).</li>
<li>Moskowitz, S. M., Foster, J. M., Emerson, J. C., Gibson, R. L., Burns, J. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Use+of+Pseudomonas+biofilm+susceptibilities+to+assign+simulated+antibiotic+regimens+for+cystic+fibrosis+airway+infection%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Antimicrob.+Chemother%22%5BJournal%5D)">Use of Pseudomonas biofilm susceptibilities to assign simulated antibiotic regimens for cystic fibrosis airway infection.</a> J. Antimicrob. Chemother. 56, 879-886 (2005).</li>
<li>Field, T. R., White, A., Elborn, J. S., Tunney, M. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Effect+of+oxygen+limitation+on+the+in+vitro+antimicrobial+susceptibility+of+clinical+isolates+of+Pseudomonas+aeruginosa+grown+planktonically+and+as+biofilms%5BTitle%5D)+AND+%22Eur.+J.+Clin.+Microbiol.+Infect.+Dis%22%5BJournal%5D)">Effect of oxygen limitation on the in vitro antimicrobial susceptibility of clinical isolates of Pseudomonas aeruginosa grown planktonically and as biofilms.</a> Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. 24, 677-687 (2005).</li>
<li>Bjarnsholt, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Pseudomonas+aeruginosa+biofilms+in+the+respiratory+tract+of+cystic+fibrosis+patients%5BTitle%5D)+AND+%22Pediatr.+Pulmonol%22%5BJournal%5D)">Pseudomonas aeruginosa biofilms in the respiratory tract of cystic fibrosis patients.</a> Pediatr. Pulmonol. 44, 547-558 (2009).</li>
<li>Hill, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Antibiotic+susceptibilities+of+Pseudomonas+aeruginosa+isolates+derived+from+patients+with+cystic+fibrosis+under+aerobic%2C+anaerobic%2C+and+biofilm+conditions%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Clin.+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Antibiotic susceptibilities of Pseudomonas aeruginosa isolates derived from patients with cystic fibrosis under aerobic, anaerobic, and biofilm conditions.</a> J. Clin. Microbiol. 43, 5085-5090 (2005).</li>
<li>Fung, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Gene+expression+of+Pseudomonas+aeruginosa+in+a+mucin-containing+synthetic+growth+medium+mimicking+cystic+fibrosis+lung+sputum%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Med.+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Gene expression of Pseudomonas aeruginosa in a mucin-containing synthetic growth medium mimicking cystic fibrosis lung sputum.</a> J. Med. Microbiol. 59, 1089-1100 (2010).</li>
<li>Andrews, J. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((BSAC+standardized+disc+susceptibility+testing+method+%28version+8%29%5BTitle%5D)+AND+%22The+Journal+of+antimicrobial+chemotherapy%22%5BJournal%5D)">BSAC standardized disc susceptibility testing method (version 8).</a> The Journal of antimicrobial chemotherapy. 64, 454-489 (2009).</li>
<li>Rybtke, M. T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+implication+of+Pseudomonas+aeruginosa+biofilms+in+infections%5BTitle%5D)+AND+%22Inflamm+Allergy+Drug+Targets%22%5BJournal%5D)">The implication of Pseudomonas aeruginosa biofilms in infections.</a> Inflamm Allergy Drug Targets. 10, 141-157 (2011).</li>
<li>Moreau-Marquis, S., Stanton, B. A., O'Toole, G. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Pseudomonas+aeruginosa+biofilm+formation+in+the+cystic+fibrosis+airway%5BTitle%5D)+AND+%22Pulm.+Pharmacol.+Ther%22%5BJournal%5D)">Pseudomonas aeruginosa biofilm formation in the cystic fibrosis airway.</a> Pulm. Pharmacol. Ther. 21, 595-599 (2008).</li>
<li>Ahmed, S. A., Gogal, R. M., Walsh, J. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+new+rapid+and+simple+non-radioactive+assay+to+monitor+and+determine+the+proliferation+of+lymphocytes%3A+an+alternative+to+%5B3H%5Dthymidine+incorporation+assay%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Immunol.+Methods%22%5BJournal%5D)">A new rapid and simple non-radioactive assay to monitor and determine the proliferation of lymphocytes: an alternative to [3H]thymidine incorporation assay.</a> J. Immunol. Methods. 170, 211-224 (1994).</li>
<li>Fothergill, J. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Effect+of+antibiotic+treatment+on+bacteriophage+production+by+a+cystic+fibrosis+epidemic+strain+of+Pseudomonas+aeruginosa%5BTitle%5D)+AND+%22Antimicrob.+Agents+Chemother%22%5BJournal%5D)">Effect of antibiotic treatment on bacteriophage production by a cystic fibrosis epidemic strain of Pseudomonas aeruginosa.</a> Antimicrob. Agents Chemother. 55, 426-428 (2011).</li>
<li>Singh, P. K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Quorum-sensing+signals+indicate+that+cystic+fibrosis+lungs+are+infected+with+bacterial+biofilms%5BTitle%5D)+AND+%22Nature%22%5BJournal%5D)">Quorum-sensing signals indicate that cystic fibrosis lungs are infected with bacterial biofilms.</a> Nature. 407, 762-764 (2000).</li>
<li>Mowat, E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Pseudomonas+Aeruginosa+Population+Diversity+and+Turnover+in+Cystic+Fibrosis+Chronic+Infections%5BTitle%5D)+AND+%22Am.+J.+Respir.+Crit.+Care.+Med%22%5BJournal%5D)">Pseudomonas Aeruginosa Population Diversity and Turnover in Cystic Fibrosis Chronic Infections.</a> Am. J. Respir. Crit. Care. Med. , (2011).</li>
<li>Fothergill, J. L., Mowat, E., Ledson, M. J., Walshaw, M. J., Winstanley, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Fluctuations+in+phenotypes+and+genotypes+within+populations+of+Pseudomonas+aeruginosa+in+the+cystic+fibrosis+lung+during+pulmonary+exacerbations%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Med.+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Fluctuations in phenotypes and genotypes within populations of Pseudomonas aeruginosa in the cystic fibrosis lung during pulmonary exacerbations.</a> J. Med. Microbiol. 59, 472-481 (2010).</li>
<li>Fouhy, Y. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Diffusible+signal+factor-dependent+cell-cell+signaling+and+virulence+in+the+nosocomial+pathogen+Stenotrophomonas+maltophilia%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Bacteriol%22%5BJournal%5D)">Diffusible signal factor-dependent cell-cell signaling and virulence in the nosocomial pathogen Stenotrophomonas maltophilia.</a> J. Bacteriol. 189, 4964-4968 (2007).</li>
<li>Winstanley, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Newly+introduced+genomic+prophage+islands+are+critical+determinants+of+in+vivo+competitiveness+in+the+Liverpool+Epidemic+Strain+of+Pseudomonas+aeruginosa%5BTitle%5D)+AND+%22Genome+Res%22%5BJournal%5D)">Newly introduced genomic prophage islands are critical determinants of in vivo competitiveness in the Liverpool Epidemic Strain of Pseudomonas aeruginosa.</a> Genome Res. 19, 12-23 (2009).</li>
<li>Carter, M. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+subtype+of+a+Pseudomonas+aeruginosa+cystic+fibrosis+epidemic+strain+exhibits+enhanced+virulence+in+a+murine+model+of+acute+respiratory+infection%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Infect.+Dis%22%5BJournal%5D)">A subtype of a Pseudomonas aeruginosa cystic fibrosis epidemic strain exhibits enhanced virulence in a murine model of acute respiratory infection.</a> J. Infect. Dis. 202, 935-942 (2010).</li>
</ol>

Geen belangenconflicten verklaard.

In deze studie hebben we gebruik gemaakt van een nieuw in vitro model op basis van ASM aan P. repliceren aeruginosa biofilm omstandigheden binnen de CF long 4. Het model is met succes aangepast voor kleinschalige, high-throughput testen van antimicrobiële middelen. De kritische stappen van deze test zijn: <ol><li> Consistente voorbereiding van de ASM media en het onderhoud van steriliteit. We hebben besteed vele uren op een optimale manier waarop elke component wordt toegevoegd om reproduceerbare resultaten. Filtratie van de ASM is traag, maar is te verkiezen boven autoclaveren, die de mucine component kan beschadigen. Wij raden de toevoeging van antibiotica, zoals voorgesteld door anderen 11, omdat dit kan opleggen aanzienlijke selectieve druk, aandrijving mutaties, braken profaag lysis 16 en een significante verandering van de expressie van meerdere bacteriële genen. </li><li> De test worden geoptimaliseerd het volume of ASM gebruikt. Shaking snelheden worden verhoogd voor kleinere volumes en een kortere biofilm levenscyclus wordt waargenomen. </li></ol> Een voor de hand liggende toepassing van het kleinschalige ASM biofilm model is de meer realistische bepaling van de biofilm antimicrobiële gevoeligheid (BSMIC 90). Anaërobe en Microaërofiele niches aanwezig zijn in de CF long-en zijn er aanwijzingen dat zuurstof diep is beperkt tot volwassen biofilms 2, 17. Hier laten we zien dat de 10/14 klinische P. aeruginosa isolaten van CF-patiënt sputa vertonen een aanzienlijke (4 - ≥ 128 maal) afname van de gevoeligheid voor tobramycine onder Microaërofiele omstandigheden in ASM. De resultaten van deze studie blijkt dat antibiotica zoals tobramycine, kan minder effectief tegen P. aeruginosa infecties in de CF long dan wordt aangegeven door middel van conventionele gevoeligheid testmethoden. Deze resultaten wijzen eerdere studies over de antimicrobiële gevoeligheid van biofilms 10. Small-schaal ASM testen dus een eenvoudige high throughput platform voor het genereren van zinvolle antibiotica gevoeligheid van gegevens beter te informeren therapeutische beslissingen. De test wordt beperkt dezelfde wijze als conventioneel antibioticum gevoeligheidstests dat afzonderlijke kolonies worden opgenomen voor het screenen die niet representatief voor de gehele populatie. Toch zijn wij van mening dat een aanpak die (i) het gebruik van niet-oppervlak aangesloten biofilm groei en (ii) van toepassing zijn op Microaërofiele omstandigheden, een duidelijk alternatief en een mogelijke verbetering van bestaande methoden vertegenwoordigt. We concluderen dat deze test is een geschikt model om P. te bestuderen aeruginosa biofilm populaties. Nader onderzoek in een klinische context zou worden nagegaan of antibiotica gevoeligheden op basis van biofilm-grown P. aeruginosa kan leiden tot verschillende antibiotica keuzes met potentieel verbeterde microbiologische en klinische uitkomsten. Vergelijkbare onderzoeken met behulp van klassieke biofilm modellen hebben aangetoond dat BSMIC waarden leidenverschillende aanbevelingen voor de behandeling met antibiotica 5,17. Naast het testen van de effectiviteit van anti-infectieuze middelen, de ASM systeem is een goedkope, eenvoudige en reproduceerbare alternatief voor dierlijke modellen voor studies, zoals die gericht op het begrijpen van de diversificatie van P. aeruginosa populaties. Wij zien veel heterogeniteit in natuurlijke populaties van P. aeruginosa hersteld van CF-patiënt sputa 18, 19. Vergelijkbare fenotypische en genotypische diversificatie kunnen worden waargenomen tijdens de groei in ASM 4 (en onze niet-gepubliceerde gegevens), waardoor het een aantrekkelijk in vitro model van de CF-longaandoeningen. De relatieve eenvoud van het model ASM eenvoudig te ontwerpen langdurige aanpassing experimenten gericht, bijvoorbeeld op de effecten van de antibiotica of andere spanningen op blz. aeruginosa bevolking divergentie. Bovendien kunnen andere bacteriële pathogenen worden gekweekt inASM. Bijvoorbeeld, Fouhy et al.. 2007 gebruik hebben gemaakt van ASM om biofilmvorming te bestuderen door S. maltophillia 20.

<table border="1"><tbody><tr><td> Naam van het reagens </td><td> Vennootschap </td><td> Catalogusnummer </td></tr><tr><td> DNA van vis sperma </td><td> Sigma-Aldrich </td><td> 74782 </td></tr><tr><td> Mucine van varkens maag, type II </td><td> Sigma-Aldrich </td><td> M2378 </td></tr><tr><td> L-Alanine </td><td> Acros Organics </td><td> 102830250 </td></tr><tr><td> L-Arginine </td><td> Sigma-Aldrich </td><td> A5006 </td></tr><tr><td> L (+)-Asparagine monohydraat </td><td> Acros Organics </td><td> 175271000 </td></tr><tr><td> L (+)-asparaginezuur </td><td> Acros Organics </td><td> 105041000 </td></tr><tr><td> L-cysteïne </td><td> Sigma-Adrich </td><td> 168149 </td></tr&gt; <tr><td> L (+)-Glutaminezuur </td><td> Acros Organics </td><td> 156211000 </td></tr><tr><td> L-Glutamine </td><td> Sigma-Aldrich </td><td> G3126 </td></tr><tr><td> Glycine </td><td> Acros Organics </td><td> 220911000 </td></tr><tr><td> L-Histidine </td><td> Sigma-Adrich </td><td> H8000 </td></tr><tr><td> L-Isoleucine </td><td> Sigma-Aldrich </td><td> I2752 </td></tr><tr><td> L-Leucine </td><td> Sigma-Aldrich </td><td> L8000 </td></tr><tr><td> L (+)-Lysine monohydrochloride </td><td> Acros Organics </td><td> 125222500 </td></tr><tr><td> L-Methionine </td><td> Sigma-Aldrich </td><td> M9625 </td></tr><tr><td> L-Fenylalanine </td><td> Acros Organics </td><td> 130310250 </td></tr><tr><td> L-proline </td><td> Sigma-Aldrich </td><td> P0380 </td></tr><tr><td> L-Serine </td><td> Acros Organics </td><td> 132660250 </td></tr><tr><td> L-Threonine </td><td> Acros Organics </td><td> 138930250 </td></tr><tr><td> L (-)-tryptofaan </td><td> Acros Organics </td><td> 140590250 </td></tr><tr><td> L-Tyrosine </td><td> Acros Organics </td><td> 140641000 </td></tr><tr><td> L-Valine </td><td> Sigma-Aldrich </td><td> V0500 </td></tr><tr><td> Diethyleentriaminepentaazijnzuur </td><td> Sigma-Aldrich </td><td> 32318 </td></tr><tr><td> NaCl </td><td> Fisher Scientific </td><td> S/3160/60 </td></tr><tr><td> KCl </td><td> BDH </td><td> BDH0258 </td></tr><tr><td&gt; KOH </td><td> BDH </td><td> BDH0262 </td></tr><tr><td> Eigeel emulsie </td><td> Sigma-Aldrich </td><td> 17148 </td></tr><tr><td> ME 2 membraan vacuümpomp </td><td> Vacuubrand </td><td> 696126 </td></tr><tr><td> Steritop filters (Pore grootte: 0,22 pm, nek-maat: 45 mm) </td><td> Millipore </td><td> SCGPT10RE </td></tr><tr><td> Luria-Bertani medium </td><td> Sigma </td><td> L2897 </td></tr><tr><td> 96-wells microtiterplaten </td><td> Sarstedt </td><td> 82,1581 </td></tr><tr><td> 24-well kultuur behandeld platen </td><td> Iwaki </td><td> 3820-024 </td></tr><tr><td> CampyGen gasontwikkeling packs </td><td> Oxoid </td><td> CN0025 </td></tr><tr><td> Microaërofiele kamer </td><td> Oxoid </td><td> HP0011 </td></tr><tr><td> Tobramycine-sulfaat </td><td> Sigma-Aldrich </td><td> T1783 </td></tr><tr><td> Cellulase van Aspergillus niger </td><td> Sigma-Aldrich </td><td> 22178 </td></tr><tr><td> Resazurin </td><td> Sigma-Aldrich </td><td> 199303 </td></tr><tr><td> Citrate.H 2 0 </td><td> BDH </td><td> BDH0288 </td></tr><tr><td> Fluostar omega microplaat reader </td><td> BMG-LabTech </td><td> SPECTROstar Omega </td></tr></tbody></table>

het gebruik van kunstmatige sputum middelgrote tot antibiotica werkzaamheid te testen tegen<em&gt; pseudomonas aeruginosa</em&gt; in voorwaarden relevanter voor de cystic fibrosis lung

Use of Artificial Sputum Medium to Test Antibiotic Efficacy Against Pseudomonas aeruginosa in Conditions More Relevant to the Cystic Fibrosis Lung

Er is een groeiende bezorgdheid over de relevantie van in vitro antimicrobiële gevoeligheid testen wanneer toegepast op isolaten van P. aeruginosa bij cystic fibrosis (CF) patiënten. Bestaande methoden rekenen op enkele of een paar isolaten aëroob en planktonically gegroeid. Vooraf bepaalde cut-offs worden gebruikt om te bepalen of de bacteriën gevoelig zijn voor of tegen een bepaald antibioticum 1. Echter, tijdens chronische longinfecties bij CF, P. aeruginosa populaties bestaan ​​in biofilms en er is bewijs dat de omgeving voor een groot deel Microaërofiele 2. Het grote verschil in voorwaarden tussen bacteriën in de longen en die tijdens het diagnostisch onderzoek is in twijfel getrokken de betrouwbaarheid en ook de relevantie van deze tests 3. Kunstmatige sputum medium (ASM) is een kweekmedium dat de componenten van de CF-patiënt sputum, zoals aminozuren, mucine en gratis DNA. P. aeruginosa &lt;/ Em&gt; de groei in ASM mimiek groei in CF-infecties, met de vorming van zelf-aggregatie van biofilm structuren en de bevolking divergentie 4,5,6. Het doel van deze studie was om een microtiterplaat-plate assay voor antimicrobiële resistentie van P. te bestuderen ontwikkelen aeruginosa gebaseerd op groei in ASM, die van toepassing is zowel Microaërofiele en aërobe omstandigheden. Een ASM-test werd ontwikkeld in een microtiterplaat formaat. P. aeruginosa biofilms mochten ontwikkelen 3 dagen incubatie met antimicrobiële agentia op verschillende concentraties 24 uur. Na de biofilm verstoring, werd levensvatbaarheid van de cellen gemeten door kleuring met resazurin. Deze test werd gebruikt om de vastzittende cel minimale remmende concentratie (SMIC) van tobramycine vast te stellen voor 15 verschillende P. aeruginosa isolaten onder aërobe en Microaërofiele voorwaarden en SMIC waarden werden vergeleken met die verkregen met standaard bouillon groei. Hoewel erenig bewijs voor een hogere MIC-waarden voor isolaten gekweekt in ASM in vergelijking met hun planktonische tegenhangers, werden de grootste verschillen gevonden met bacteriën getest in Microaërofiele voorwaarden, die een veel grotere weerstand toonde aan tot een&gt; 128 maal, in de richting tobramycine in de ASM-systeem bij het opzichte assays in aërobe omstandigheden plaatsvinden. Het gebrek aan samenhang tussen de huidige gevoeligheid testmethoden en de klinische uitkomst heeft vraagtekens gezet bij de validiteit van de huidige methoden 3. Verschillende in vitro modellen eerder gebruikt P. bestuderen aeruginosa biofilms 7, 8. Echter, deze methoden vertrouwen op het oppervlak van bijgevoegde biofilms, terwijl de ASM biofilms lijken op die waargenomen in de CF long 9. Bovendien is verminderd zuurstofconcentratie in het slijm is weergegeven het gedrag van P. veranderen aeruginosa 2 invloed antibiotica gevoeligheid 10. Daarom using ASM onder Microaërofiele omstandigheden kunnen zorgen voor een meer realistische omgeving om in te antimicrobiële gevoeligheid te bestuderen.

De huidige diagnostische antimicrobiële gevoeligheid testen is gebaseerd op de groei van plankton isolaten in voedselrijk, aërobe omstandigheden. Hier maken we gebruik van een alternatieve kunstmatige sputum medium om antimicrobiële gevoeligheid van Pseudomonas aeruginosa biofilms te bestuderen onder zowel aërobe en Microaërofiele voorwaarden meer representatief zijn voor de cystic fibrosis long.

Het gebruik van kunstmatige Sputum Middelgrote tot antibiotica werkzaamheid te testen tegen<em&gt; Pseudomonas aeruginosa</em&gt; In Voorwaarden relevanter voor de Cystic Fibrosis Lung

Er is een groeiende bezorgdheid over de relevantie van in vitro antimicrobiële gevoeligheidstests wanneer deze worden toegepast op P. aeruginosa-isolaten uit cystische...

Het doel van dit experiment is om de effectiviteit van antibiotica tegen pseudomonas Aerogen-biofilms te beoordelen onder omstandigheden die representatief zijn voor chronische infecties in de long bij cystische fibrose, gebruikmakend van een gedefinieerd kunstmatig sputummedium. Bacteriële biofilms worden gekweekt in microtiterplaten met 24 putjes.De biofilms worden vervolgens blootgesteld aan antibiotica. Daarna worden de met antibiotica behandelde culturen afgebroken met cellulase en geïncubeerd met een metabole kleurstof, srin, die door levensvatbare cellen van blauw naar roze wordt gereduceerd. Door de absorptie van de wells te meten, kan de minimale inhiberende concentratie van de biofilm, B-S-M-I-C, worden bepaald om de antibioticagevoeligheid onder bijna fysiologische omstandigheden te kwantificeren.Het belangrijkste voordeel van deze techniek ten opzichte van bestaande methoden, zoals de bepaling van minimale inhiberende concentraties op basis van planktonische culturen, is dat de bacteriën groeien in een gespecialiseerd medium dat alle componenten van sputum bevat, waardoor de vorming van biofilms wordt gestimuleerd. Deze biofilms zijn veel resistenter tegen antibiotica. Om het medium te maken, bereid eerst twee flessen voor met 250 milliliters steriel water in de eerste fles.Voeg geleidelijk de roerder toe en voeg vervolgens vier gram DNA van vissperma toe aan 250 milliliters steriel water. Roer de oplossing bij kamertemperatuur en laat het DNA oplossen in de tweede fles. Voeg geleidelijk vijf gram mucine type twee uit varkensmaag toe en roer.Zodra de DNA- en mucinesoluties klaar zijn, worden de aminozuren opgelost in 100 milliliter steriel water, met uitzondering van L tyrosine en L cysteine, die respectievelijk moeten worden opgelost in 25 milliliter water of 25 milliliter 0,5 molair kaliumhydroxide. Los vervolgens 5,9 milligram DTPA, vijf gram natriumchloride en 2,2 gram kaliumchloride op in 100 milliliter water. Combineer alle verschillende oplossingen in een fles van één liter, voeg daarna vijf milliliter eigeel-emulsie toe en vul het mengsel aan met water tot 850 milliliter.Gebruik 1 M Tris om de pH op 6,9 in te stellen en vul het uiteindelijke volume aan tot 1 liter met water. Om het medium te steriliseren, wordt dit gefiltreerd met een vacuümpomp met twee membranen van het merk Vacuumbrand ME en een Millipore Stericup-filtereenheid met een hals van 45 mm en een poriegrootte van 0,2 µm. Het filtratieproces kan over twee dagen worden uitgevoerd. Het ASM-medium kan tot een maand worden bewaard bij 4 °C.Begin met het verdunnen van overnight-culturen van Pseudomonas arosa in LB-medium om een OD van 0,05 te verkrijgen. Verdun de bacteriën vervolgens verder in een verhouding van 1:100 in een SM-mediumplaat; breng 1,8 milliliter van de verdunde bacteriecultuur per well aan in 21 wells van een 24-wells tissuekweekplaat. Verdeel hetzelfde volume SM-medium over de drie overgebleven wells, die dienen als blanco negatieve controles. Sluit de 24-wells plaat af en plaats deze onder micro-aerofiele omstandigheden om biofilmvorming mogelijk te maken; dit kan worden bereikt met behulp van CampiGen-gasgeneratiepacks in grote anaerobe potten.Incubeer de cultuur op een schudder ingesteld op 75 RPM gedurende drie dagen bij 37 °C; na drie dagen zullen biofilms verschijnen als een gelatineuze massa die bacteriële cellen bevat en die niet door pipetteren kan worden verbroken. Zodra de biofilms zijn gevormd, voegt u per well 200 µL antibioticum toe in seriële verdunningsconcentraties. Zorg ervoor dat u ten minste vier replica's opstelt voor elke te testen drugconcentratie en laat vier wells met biofilms onbehandeld, zodat deze als negatieve controles kunnen dienen.Incubeer de platen vervolgens nogmaals 24 uur na de incubatie met antibiotica. Gebruik 100 µL cellulase per well, verdund tot 100 mg/mL in citraatbuffer om de biofilms af te breken; incubeer de platen op een shaker ingesteld op 150 RPM onder aerobe omstandigheden bij 37 °C gedurende één uur. Na deze incubatie kan handmatig pipetteren worden gebruikt om de biofilms verder te desaggregeren als er cellenklonten in het medium zichtbaar zijn.Voeg vervolgens 100 µL rezin per well toe om de levensvatbaarheid van de uit de biofilms vrijgekomen cellen te kwantificeren en incubeer de cellen gedurende één tot twee uur. Bij 37 °C zijn alleen levensvatbare cellen in staat om de blauwe zarin-kleurstof te metaboliseren naar de roze fluorescerende vorm. Breng de monsters na de incubatie over naar een 96-wells plaat en meet de fluorescentie van de wells met een excitatiegolflengte van 540 nm en een emissiegolflengte van 590 nm.Om de bacteriële levensvatbaarheid en druggevoeligheid te kwantificeren, trekt u eerst de achtergrondfluorescentie van de blanco controle af van de overige wells. Bereken vervolgens het inhibitiepercentage door de gemiddelde fluorescentie voor elke concentratie te delen door de gemiddelde fluorescentie van de onbehandelde controles en dit met 100 te vermenigvuldigen. De B-S-M-Y-C wordt gedefinieerd als de antibioticaconcentratie die een inhibitie van 90% van de metabole activiteit veroorzaakt; zoals te zien is in deze elektronenmicrografieën, verschillen cellen die in biofilms zijn gegroeid aanzienlijk van bacteriën die in planktonische culturen zijn gegroeid.In het bijzonder omringen grote hoeveelheden extracellulaire matrix, in het geel weergegeven, de cellen in de biofilm in het groen, maar niet in planktonische kolonies. Daarnaast zijn bacteriën in biofilms in dit experiment doorgaans resistenter tegen antibiotica. De minimale inhiberende concentratie van tobramycine voor de planktonische cultuur van Pseudomonas aerogenos in het blauw werd bepaald op ongeveer 4 µg/mL.Daarentegen overleefde, zoals in het rood wordt weergegeven, 100% van de bacteriën in biofilms concentraties tot 512 micrograms per milliliter antibioticum. Na het bekijken van deze video zou u een goed begrip moeten hebben van hoe bacteriën gekweekt kunnen worden in een gedefinieerd kunstmatig sputummedium. U zou ook in staat moeten zijn om een antibioticagevoeligheidstest uit te voeren om de minimale inhiberende concentratie te bepalen die nodig is om de bacteriële groei te remmen in een omgeving die meer representatief is voor de long bij cystische fibrose.

use-artificial-sputum-medium-to-test-antibiotic-efficacy-against

Research

JoVE Journal

Immunology and Infection

Immunologie en Infectie

Source: Vieira, J., et al. Design and Development of a Model to Study the Effect of Supplemental Oxygen on the Cystic Fibrosis Airway Microbiome. J. Vis. Exp. (2021).This video demonstrates the preparation of an artificial sputum medium that mimics the viscosity, nutrient composition, and pH of cystic fibrosis lung sputum. The resulting medium provides a physiologically relevant platform for ex vivo studies.

Preparation of Artificial Sputum Medium to Emulate Cystic Fibrosis Lung Sputum Ex Vivo

Source: Jackson, L., et al. Visualization of Pseudomonas aeruginosa within the Sputum of Cystic Fibrosis Patients. J. Vis. Exp. (2020)This video demonstrates the in situ visualization of Pseudomonas aeruginosa within chemically cleared cystic fibrosis sputum using fluorescent labeling and confocal microscopy to reveal bacterial localization and biofilm structure.

Visualization of Pseudomonas aeruginosa in Sputum Samples from Cystic Fibrosis Patients

De mucuspluggen van cystische fibrose (CF) patiënten zijn een ideale omgeving om microbiële pathogenen te bloeien. Het manuscript beschrijft een nieuwe methode om de CF-longmikrobiome te bestuderen in een omgeving die naboots waar ze ziekte veroorzaken en hoe veranderingen van chemische omstandigheden microbiële dynamiek kunnen veroorzaken.

De WinCF Model - Een goedkope en handelbaar microkosmos van een Slijm Plugged bronchiolus de Microbiologie van longinfecties Studie

We beschrijven een protocol voor een driedimensionaal co-cultuurmodel van geïnfecteerde luchtwegen, met CFBE41o- cellen, THP-1 macrofagen en Pseudomonas aeruginosa, gevestigd op de lucht-vloeibare interface. Dit model biedt een nieuw platform om tegelijkertijd de werkzaamheid van antibiotica, epitheelbarrièrefunctie en ontstekingsmarkers te testen.

P. aeruginosa Geïnfecteerde 3D Co-Cultuur van Bronchiale epitheelcellen en macrofagen bij Air-Liquid Interface for Preclinical Evaluation of Anti-Infectives

Dit protocol biedt methoden voor visualisatie van bacteriële cellen en polysaccharidesyntheselocus (Psl) polysaccharide in het sputum van cystische fibrosepatiënten.

Visualisatie van Pseudomonas aeruginosa in het sputum van patiënten met cystische fibrose

Deze workflow kan worden gebruikt om antibiotica gevoeligheidstests uit te voeren met behulp van een vastgesteld ex vivo model van bacteriële biofilm in de longen van personen met cystische fibrose. Het gebruik van dit model kan de klinische validiteit van MBEC-test (minimale biofilmuitroeiingsconcentratie) verbeteren.

Antibioticum werkzaamheid testen in een Ex vivo model van Pseudomonas aeruginosa en Staphylococcus aureus Biofilms in de Cystic Fibrosis Lung

Synthetisch cystic fibrosis sputum medium (SCFM2) kan worden gebruikt in combinatie met zowel confocale laserscanmicroscopie als fluorescentie-geactiveerde celsortering om bacteriële aggregaten met hoge resolutie te observeren. Dit artikel beschrijft methoden om geaggregeerde populaties te beoordelen tijdens antimicrobiële behandeling als een platform voor toekomstige studies.

Tools voor de real-time beoordeling van een Pseudomonas aeruginosa-infectiemodel

Het doel van dit protocol is om een modelsysteem te ontwikkelen voor het effect van hyperoxie op cystic fibrosis airway microbial communities.  Kunstmatig sputummedium emuleert de samenstelling van sputum en hyperoxische cultuuromstandigheden modelleren de effecten van aanvullende zuurstof op microbiële longgemeenschappen.

Ontwerp en ontwikkeling van een model om het effect van aanvullende zuurstof op het cystische fibrose-luchtwegmicrobioom te bestuderen

Dit protocol beschrijft een cystic fibrosis (CF) longrelevant vier-species polymicrobieel biofilmmodel dat kan worden gebruikt om de impact van bacteriële interacties tussen soorten te onderzoeken.

Het kweken van een cystische fibrose-relevante polymicrobiële biofilm om fenotypes van de gemeenschap te onderzoeken

Deze methodologie maakt het mogelijk om een polymicrobieel biofilmmodel in cystische fibrose op te zetten voor antimicrobiële gevoeligheidstesten in onderzoeks- en klinische laboratoria. Dit model biedt nauwkeurige en betrouwbare resultaten over een reeks outputs.

Ontwikkeling van een biofilmmodel voor polymicrobiële kolonies om antimicrobiële middelen bij cystische fibrose te testen

Deze studie schetst een raamwerk voor het ontwikkelen van een geaggregeerde polymicrobiële biofilmmodel en het optimaliseren van een RNA-extractieprotocol om de Pseudomonas aeruginosa genexpressie te beoordelen die representatief is voor de longomgeving bij cystische fibrose. Toepassingen omvatten het evalueren van antimicrobiële effecten en het bestuderen van alternatieve antibiotica onder omstandigheden die relevant zijn voor cystische fibrose.

Aggregaatbiofilmmodel van cystische fibrose om infectie-relevante genexpressie te bestuderen

Leer hoe u antibiotica-effectiviteit test tegen Pseudomonas aeruginosa-biofilmen met kunstmatig sputummedium. Deze methode bootst cystic fibrosis-longomstandigheden na voor nauwkeurigere resistentiebepaling.

Het gebruik van kunstmatige Sputum Middelgrote tot antibiotica werkzaamheid te testen tegen Pseudomonas aeruginosa In Voorwaarden relevanter voor de Cystic Fibrosis Lung (Video) | JoVE Journal

Het gebruik van kunstmatige Sputum Middelgrote tot antibiotica werkzaamheid te testen tegen

Meer video's verkennen