Detectie van bacteriën met behulp van fluorogene DNAzymes

We hebben onlangs melding gemaakt van een nieuwe benadering voor het genereren van fluorogene DNAzyme probes die kan worden toegepast op het opzetten van een eenvoudige, "mix-and-lezen" TL-test voor bacteriële detectie. Deze speciale DNA probes katalyseren de splitsing van een chromofoor gemodificeerde DNA-RNA chimère substraat in aanwezigheid van ruwe extracellulaire mengsel (CEM) door een bepaald bacterie, waardoor vertaling bacteriële detectie in fluorescentiesignaal generatie. In dit rapport beschrijven we de belangrijkste experimentele procedures waar een specifieke DNAzyme probe aangeduid "RFD-EC1" wordt gebruikt voor de detectie van het model bacterie, Escherichia coli (E. coli).