Een snelle en kwantitatieve methode voor de posttranslationele wijziging en Variant ingeschakeld toewijzing van peptiden aan Genomes

10.8K weergaven

Geciteerd door 3

09:10 min.

22 mei 2018

10.3791/57633-v

22 mei 2018

10.8K weergaven
 ,  ,  ,  , 

Hier presenteren we de proteogenomic tool PoGo en protocollen voor snelle, kwantitatieve, posttranslationele modificaties en variant ingeschakeld toewijzing van peptiden vastgesteld door middel van de Spectrometrie van de massa op referentie genomen. Dit hulpprogramma is van nut om te integreren en proteogenomic en persoonlijke proteomic studies interfacing met orthogonale genomics gegevens visualiseren.

Meer video's verkennen

PoGo Software

Chapters in this video

0:05

Titel

0:51

Mapping van peptiden met PoGoGUI

2:36

Visualiseren in de Integrative Genomics Viewer

3:57

Mapping van peptiden geïdentificeerd via een aangepaste variantdatabase naar een referentiegenoom

4:44

Mapping van peptiden uit meerdere bestanden met PoGoGUI

5:48

Het genereren van een Track Hub van gemapte peptiden en het visualiseren van een Track Hub in de UCSC Genome Browser

6:50

Resultaten: Mapping van peptiden naar genomen mogelijk gemaakt door posttranslationele modificaties en varianten

8:21

Conclusie

Related Videos