Multimodale longbeeldvorming: complementaire informatie van CT en hypergepolariseerde 129Xe MRI gebruiken om de longstructuur-functie te evalueren
April 12th, 2024
CT en 129Xe MRI bieden aanvullende informatie over de longstructuur-functie die kan worden benut voor regionale analyse met behulp van beeldregistratie. Hier bieden we een protocol dat voortbouwt op de bestaande literatuur voor 129Xe MR naar CT-beeldregistratie met behulp van open-sourceplatforms.
Open om te beginnen afbeeldingen gevolgd door maskers in de gewenste beeldvisualisatiesoftware om te controleren of de afbeelding en maskeroriëntatie overeenkomen voor alle CT-, Proton- en Xenon-bestanden. Sla vervolgens de afbeeldings-DICOMS en maskers met één label op als NIfTI-bestanden in dezelfde map als het reg. py-bestand.
Voor CT Xenon MRI-registratie opent u het reg. py-bestand in de gewenste instelling van de Python-computeromgeving. Als u een virtuele omgeving gebruikt, stelt u het aantal centrale verwerkingseenheden, het aantal threads en het RAM-geheugen in zoals gewenst of zoals beschikbaar in de computeromgeving.
Stel vervolgens de gewenste transformatie en interpolatie in, gevolgd door het vaste en bewegende beeld. Voer reg. py uit in de Python-computeromgeving.
Zodra de registratie is voltooid, gaat u verder met evaluatie. Met behoud van de ct. nii-afbeelding als basisafbeelding, open ventilatie warp.nii.
gz als een andere afbeelding en leg deze over de CT-afbeelding met de gewenste kleurenkaart. Bekijk de overlap van het xenon MR-beeld met het CT-beeld in alle beeldvlakken om de visuele uitlijning van oriëntatiepunten zoals de carina- en longgrenzen te evalueren. De registratieresultaten toonden een goede uitlijning van alle longgrenzen voor de gezonde deelnemer.
Bij de drie deelnemers met chronische obstructieve longziekte was er een goede uitlijning van de longgrenzen beschikbaar, variërend van diffuse ventilatieafwijkingen, ventilatieafwijkingen van de bovenkwab met afwezige apicale longgrenzen en afwijkingen van de onderkwabventilatie met afwezige diafragmatische longgrenzen.
Overzicht
Dit artikel presenteert een protocol voor het registreren van 129 Xe MRI met CT-beelden om de analyse van longstructuur-functie te verbeteren. De methode maakt gebruik van open-source platforms voor beeldregistratie, waardoor regionale analyse mogelijk wordt.
Belangrijke studiecomponenten
Wetenschapsgebied
- Neurowetenschappen
- Medische beeldvorming
- Radiologie
Achtergrond
- CT en 129 Xe MRI leveren complementaire informatie over longstructuur en -functie.
- Beeldregistratie is essentieel voor nauwkeurige regionale analyse.
- Bestaande literatuur over 129 Xe MR-technieken informeert dit protocol.
- Open-source platforms verhogen de toegankelijkheid voor onderzoekers.
Doel van de studie
- Om een robuust protocol te ontwikkelen voor CT en 129 Xe MRI beeldregistratie.
- Om de analyse van longfunctie te verbeteren door middel van verbeterde beeldtechnieken.
- Om een reproduceerbare methode te bieden voor onderzoekers in het veld.
Gebruikte methoden
- Open afbeeldingen en maskers in beeldafbeeldsoftware.
- Controleer de oriëntatie van CT-, Proton- en Xenon-bestanden.
- Sla afbeeldingen en maskers op als NIfTI-bestanden.
- Gebruik een Python-computingomgeving voor registratie.
Belangrijkste resultaten
- Het protocol maakt effectieve registratie van CT en 129 Xe MRI-beelden mogelijk.
- Maakt gedetailleerde regionale analyse van longstructuur en -functie mogelijk.
- Toont de nuttigheid van open-source tools in medische beeldvorming.
- Biedt een basis voor toekomstig onderzoek in longbeeldvorming.
Conclusies
- Het ontwikkelde protocol verbetert de nauwkeurigheid van longbeeldanalyse.
- Combinatie van CT en 129 Xe MRI biedt uitgebreide inzichten in longfunctie.
- Open-source platforms bevorderen samenwerking en innovatie in onderzoek.
