Name: Identificatie van Mycobacterium-soorten door middel van DNA-microarray-chipmethode (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2025-06-24T14:30:00.000+00:00
Duration: 6 min 27 s
Description: Leer de DNA-microarray-chipmethode voor snelle identificatie van Mycobacterium-soorten in de klinische microbiologie. Deze techniek biedt hoge gevoeligheid en specificiteit voor vroege diagnose van mycobacteriële infecties.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

<ol><li>Primm, T. P., Lucero, C. A., Falkinham, J. O. III <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Health+impacts+of+environmental+mycobacteria%5BTitle%5D)+AND+%22Trends+Genet%22%5BJournal%5D)">Health impacts of environmental mycobacteria.</a> Trends Genet. 38 (8), 821-830 (2004).</li>
<li>Sawyer, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Mycobacterium+bovis+and+its+impact+on+human+and+animal+tuberculosis%5BTitle%5D)+AND+%22Trends+Genet%22%5BJournal%5D)">Mycobacterium bovis and its impact on human and animal tuberculosis.</a> Trends Genet. 39 (8), 587-592 (2023).</li>
<li>Zhao, Q., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+impact+of+DNA+microarray+chip+technology+on+the+diagnosis+and+management+of+non-tuberculous+mycobacterial+infections+in+immunocompromised+patients%5BTitle%5D)+AND+%22Antimicrob+Agents+Chemother%22%5BJournal%5D)">The impact of DNA microarray chip technology on the diagnosis and management of non-tuberculous mycobacterial infections in immunocompromised patients.</a> Antimicrob Agents Chemother. 65 (12), e01500-e01500 (2021).</li>
<li>Liu, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((DNA+microarray-based+detection+of+drug-resistant+Mycobacterium+strains%3A+a+single-center+experience%5BTitle%5D)+AND+%22Clin+Microbiol+Infect%22%5BJournal%5D)">DNA microarray-based detection of drug-resistant Mycobacterium strains: a single-center experience.</a> Clin Microbiol Infect. 26 (10), 1400-1407 (2020).</li>
<li>Li, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Comparative+evaluation+of+DNA+microarray+and+next-generation+sequencing+for+Mycobacterium+identification%5BTitle%5D)+AND+%22Int+J+Infect+Dis%22%5BJournal%5D)">Comparative evaluation of DNA microarray and next-generation sequencing for Mycobacterium identification.</a> Int J Infect Dis. 118, 250-258 (2022).</li>
<li>Chen, K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Optimizing+probe+design+for+DNA+microarray-based+Mycobacterium+identification%3A+a+computational+biology+approach%5BTitle%5D)+AND+%22BMC+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Optimizing probe design for DNA microarray-based Mycobacterium identification: a computational biology approach.</a> BMC Microbiol. 19 (2), 120-129 (2019).</li>
<li>Michelet, L., Boschiroli, M. L. Mycobacterium uberis. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aMichelet%2C+L+%22Microorganisms%22">Microorganisms</a>. 8 (11), 1701(2020).</li>
<li>Imran, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((DNA+microarray+technology+for+the+detection+and+identification+of+Mycobacterium+species%3A+a+review%5BTitle%5D)+AND+%22J+Microbiol+Biotechnol+Res%22%5BJournal%5D)">DNA microarray technology for the detection and identification of Mycobacterium species: a review.</a> J Microbiol Biotechnol Res. 6 (2), 275-285 (2020).</li>
<li>Garcia-Sanchez, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Advances+in+DNA+microarray+technology+for+Mycobacterium+detection+and+characterization%5BTitle%5D)+AND+%22J+Mol+Diagn%22%5BJournal%5D)">Advances in DNA microarray technology for Mycobacterium detection and characterization.</a> J Mol Diagn. 24 (5), 650-662 (2022).</li>
<li>Wang, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Machine+learning+analysis+of+SERS+fingerprinting+for+the+rapid+determination+of+Mycobacterium+tuberculosis+infection+and+drug+resistance%5BTitle%5D)+AND+%22Comput+Struct+Biotechnol+J%22%5BJournal%5D)">Machine learning analysis of SERS fingerprinting for the rapid determination of Mycobacterium tuberculosis infection and drug resistance.</a> Comput Struct Biotechnol J. 26 (20), 5364-5377 (2022).</li>
<li>Wang, X., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Integration+of+DNA+microarray+data+with+clinical+outcomes+in+tuberculosis+patients%3A+implications+for+personalized+medicine%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Diagn%22%5BJournal%5D)">Integration of DNA microarray data with clinical outcomes in tuberculosis patients: implications for personalized medicine.</a> Mol Diagn. 16 (3), 150-160 (2024).</li>
<li>Wang, X., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Rapid+identification+of+Mycobacterium+tuberculosis+complex+and+common+non-tuberculous+Mycobacteria+by+DNA+microarray+chip%5BTitle%5D)+AND+%22BMC+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Rapid identification of Mycobacterium tuberculosis complex and common non-tuberculous Mycobacteria by DNA microarray chip.</a> BMC Microbiol. 21 (1), 242(2021).</li>
<li>Smith, J. D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((DNA+microarray+insights+into+Mycobacterium+epidemiology+and+control+strategies%5BTitle%5D)+AND+%22J+Clin+Microbiol%22%5BJournal%5D)">DNA microarray insights into Mycobacterium epidemiology and control strategies.</a> J Clin Microbiol. 60, e02033-e02121 (2022).</li>
<li>Garcia, L. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Tracking+Mycobacterial+spread+via+DNA+microarray%3A+a+community-based+study%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+One%22%5BJournal%5D)">Tracking Mycobacterial spread via DNA microarray: a community-based study.</a> PLoS One. 18 (3), e0282123(2023).</li>
<li>Li, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Economic+evaluation+of+DNA+microarray+chip+technology+in+Mycobacterium+diagnosis%5BTitle%5D)+AND+%22Diagnostics%22%5BJournal%5D)">Economic evaluation of DNA microarray chip technology in Mycobacterium diagnosis.</a> Diagnostics. 11 (12), 2235(2021).</li>
<li>Wang, Z., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cost-benefit+analysis+of+implementing+DNA+microarray+chip+for+Mycobacterium+detection+in+clinical+settings%5BTitle%5D)+AND+%22J+Med+Econ%22%5BJournal%5D)">Cost-benefit analysis of implementing DNA microarray chip for Mycobacterium detection in clinical settings.</a> J Med Econ. 25 (1), 113-122 (2022).</li>
<li>Liu, Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((False+positives+and+false+negatives+in+DNA+microarray+chip+detection+of+Mycobacteria%3A+a+comprehensive+analysis%5BTitle%5D)+AND+%22Microb+Pathog%22%5BJournal%5D)">False positives and false negatives in DNA microarray chip detection of Mycobacteria: a comprehensive analysis.</a> Microb Pathog. 149, 104671(2020).</li>
<li>Chen, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Validation+and+improvement+of+DNA+microarray+chip+for+Mycobacterium+identification%3A+coping+with+genetic+variants%5BTitle%5D)+AND+%22Front+Cell+Infect+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Validation and improvement of DNA microarray chip for Mycobacterium identification: coping with genetic variants.</a> Front Cell Infect Microbiol. 11, 627923(2021).</li>
</ol>

<table><tbody><tr><td>0.9% Sodium Chloride Injection (NaCl)</td><td>FuZhou HAIWANGFUYAO</td><td>H35020289</td><td></td></tr><tr><td>Applied Biosystems amplification apparatus</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td>Veriti 96-Well Thermal Cycler</td><td></td></tr><tr><td>CapitalBio LuxScan10K/B</td><td>CapitalBio</td><td>LuxScan10K/B</td><td></td></tr><tr><td>CapitalBio SlideWasher 24&nbsp;</td><td>CapitalBio</td><td>SlideWasher 24&nbsp;</td><td></td></tr><tr><td>&nbsp;Centrifuge&nbsp;</td><td>Eppendorf</td><td>5424R</td><td>MaX.speed 15000 min-1</td></tr><tr><td>Hybridization buffer</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>HybSet gene microarray chip and cover</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>Mycobacterium species identification kit</td><td>CapitalBio</td><td>301030</td><td></td></tr><tr><td>Negative controls, positive controls</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>Nucleic acid extractor</td><td>TIANLONG</td><td>GeneRotex 96</td><td></td></tr><tr><td>PCR amplification reagent</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>pH 6.8 phosphate buffer</td><td>ShangHai yuanye Bio-Technology</td><td>R20029-10</td><td></td></tr><tr><td>pipettors and tips</td><td>Thermo Scientific</td><td>0.1 - 10 &mu;L, 2 - 20 &mu;L, and 20 - 200 &mu;L, 100-1000 &mu;L</td><td></td></tr><tr><td>qEx-DNA/RNA Nucleic acid extraction or purification kit</td><td>TIANLONG</td><td>qEx-DNA/RNA</td><td></td></tr><tr><td>SDS</td><td>CapitalBio</td><td>441060</td><td></td></tr><tr><td>Sodium hydroxide(NaOH)</td><td>XILONGS&nbsp; Scientific</td><td>XK13-011-00027</td><td></td></tr><tr><td>SSC</td><td>CapitalBio</td><td>441050</td><td></td></tr><tr><td>thermostatic water bath</td><td>SURUI</td><td>HH-W600</td><td></td></tr></tbody></table>

identificatie van mycobacterium-soorten door middel van dna-microarray-chipmethode

Identification of Mycobacterium Species by DNA Microarray Chip Method

Identificatie van Mycobacterium-soorten door middel van DNA-microarray-chipmethode

This study presents a DNA microarray chip method designed for the accurate identification of Mycobacterium species. By leveraging asymmetric PCR ...

identification-of-mycobacterium-species-by-dna-microarray-chip-method

Research

JoVE Journal

Medicine

Geneeskunde

This video demonstrates a method to detect the Cyanobacterial strains in an environmental sample using an antibody microarray chip. Samples carrying various bacteria interact with printed antibodies, and immunostaining with fluorophore-labeled anti-cyanobacterial-strain antibodies reveals the presence of specific cyanobacterial strains through fluorescence in distinct spots.

A Technique to Detect Cyanobacterial Strains Using an Antibody Microarray Chip

Een amplificatie microarray combineert asymmetrische PCR-amplificatie en microarray hybridisatie in een enkele kamer, die aanzienlijk stroomlijnt microarray workflow voor de eindgebruiker. Vereenvoudiging microarray workflow is een noodzakelijke eerste stap voor het maken van microarray-gebaseerde diagnostiek die routinematig kan worden gebruikt in een lagere-resource-omgevingen.

Aantonen van een multiresistente<em&gt; Mycobacterium tuberculosis</em&gt; Versterking Microarray

Microdissectie is uitgebreid toegepast voor de behandeling van DNA, RNA en eiwitten in weefsel. Laser capture microscopie (LCM) is de meest gebruikte methode, maar een nieuwe frees-techniek, mesodissection, is sinds kort beschikbaar. We tonen RNA extractie uit mesodissected formaline gefixeerd paraffine-ingebed weefsel slides van Mycobacterium tuberculosis granulomen.

A Novel Microdissection aanpak voor het herstellen<em&gt; Mycobacterium tuberculosis</em&gt; Specifieke Afschriften van formaline gefixeerde in paraffine ingebedde Lung Granulomen

Deze video artikel beschrijft een in vitro microarray gebaseerde methode om het gen doelstellingen en bindingsplaatsen bepalen voor twee componenten systeem respons toezichthouders.

DNA-affiniteit-gezuiverd Chip (DAP-chip) methode om Gene Doelen bepalen voor bacteriële Twee componenten Regulatory Systems

Matrix-ondersteunde laserdesorptie/ionisatie tijd-van-vlucht massaspectrometrie (MALDI-TOF MS) en moleculaire technieken (16S rRNA gen sequencing) maken de identificatie van zeldzame bacteriële pathogenen in routine diagnostische mogelijkheden. Het doel van dit protocol ligt in de combinatie van beide technieken, wat leidt tot meer nauwkeurige en betrouwbare gegevens.

Identificatie van bijzondere bacteriële pathogenen door 16S rRNA Gene Sequencing en MALDI-TOF MS

De aanwezigheid van cyanobacteriëntoxines in zoetwaterreservoirs voor menselijke consumptie is een grote zorg voor waterbeheerautoriteiten. Om het risico van waterverontreiniging te evalueren, beschrijft dit artikel een protocol voor de detectie op locatie van cyanobacteriënstammen in vloeibare en vaste monsters door gebruik te maken van een antilichaam-microarray-chip.

Experimenteel protocol voor het opsporen Cyanobacteriën In vloeibare en vaste monsters met een antilichaam Microarray Chip

EUCAST heeft een protocol voor directe antimicrobiële gevoeligheidstests (AST) ontwikkeld voor geautomatiseerde bloedculturen. De afhankelijkheid van op massaspectrometrie gebaseerde microbiële identificatie kan echter worden vermeden door gebruik te maken van een direct protocol voor de bereiding van inoculum in een geautomatiseerd microbieel identificatiesysteem. Deze aanpak kan AST-rapporten opleveren binnen 24 uur na monsterafname.

Directe microbiële identificatie met behulp van een geautomatiseerd microbieel identificatiesysteem om de EUCAST RAST-methode zonder massaspectrometrie te vergemakkelijken

De iChip-techniek maakt gebruik van een goedkoop en eenvoudig in-situ isolatieapparaat dat de snelheid van de ontdekking van nieuwe micro-organismen uit de bodem verhoogt. Nieuwe micro-organismen kunnen worden gebruikt voor verder onderzoek met betrekking tot onder meer het bodemmicrobioom of de ontdekking van natuurlijke producten.

Isolatie van bodemmicro-organismen met behulp van iChip-technologie

Dit protocol beschrijft de CTAB-methode om hoogwaardige DNA uit mycobacteriën te extraheren, waarbij de uitdagingen van hun harde, mycolinezuurrijke celwanden worden overwonnen. Het proces omvat enzymatische vertering, cellysie met CTAB en DNA-zuivering door organische extractie en ethanolprecipitatie. Deze methode produceert DNA dat geschikt is voor moleculaire studies en is betrouwbaar voor mycobacterieel onderzoek.

Extractie van het volledige genoom van deoxyribonucleïnezuur uit Mycobacterium-soorten via de Cetyltrimethylammoniumbromide-techniek

Hier hebben we voorstellen eenvoudige methoden voor het testen en evalueren van de aanwezigheid van reactieve zuurstofradicalen in de cellen.

Productie en detectie van reactive oxygen species (ROS) in kanker

Leer de DNA-microarray-chipmethode voor snelle identificatie van Mycobacterium-soorten in de klinische microbiologie. Deze techniek biedt hoge gevoeligheid en specificiteit voor vroege diagnose van mycobacteriële infecties.

Identificatie van Mycobacterium-soorten door middel van DNA-microarray-chipmethode

Meer video's verkennen